MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_022221	CAG	2	6	857375	857380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436113
15002	NC_022221	AGCC	2	8	857398	857405	25 %	0 %	25 %	50 %	537436113
15003	NC_022221	CCT	2	6	857462	857467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436114
15004	NC_022221	TTC	2	6	857491	857496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436114
15005	NC_022221	GC	3	6	857504	857509	0 %	0 %	50 %	50 %	537436114
15006	NC_022221	CGG	2	6	857563	857568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436114
15007	NC_022221	GT	3	6	857637	857642	0 %	50 %	50 %	0 %	537436114
15008	NC_022221	GCG	2	6	857655	857660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436114
15009	NC_022221	CGG	2	6	857671	857676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436114
15010	NC_022221	GGT	2	6	857750	857755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436114
15011	NC_022221	GGC	2	6	857766	857771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436114
15012	NC_022221	TG	3	6	857811	857816	0 %	50 %	50 %	0 %	537436114
15013	NC_022221	CGG	2	6	857867	857872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436114
15014	NC_022221	GC	3	6	857974	857979	0 %	0 %	50 %	50 %	537436114
15015	NC_022221	ATTG	2	8	858084	858091	25 %	50 %	25 %	0 %	537436114
15016	NC_022221	ACA	2	6	858148	858153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436114
15017	NC_022221	A	6	6	858176	858181	100 %	0 %	0 %	0 %	537436114
15018	NC_022221	TGG	2	6	858187	858192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436114
15019	NC_022221	ATA	2	6	858358	858363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436114
15020	NC_022221	CGT	2	6	858404	858409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436114
15021	NC_022221	TTAAA	2	10	858442	858451	60 %	40 %	0 %	0 %	537436114
15022	NC_022221	TCC	2	6	858507	858512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436114
15023	NC_022221	GCA	2	6	858587	858592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436114
15024	NC_022221	GCT	2	6	858707	858712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436114
15025	NC_022221	ATG	2	6	859014	859019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436115
15026	NC_022221	TGCC	2	8	859066	859073	0 %	25 %	25 %	50 %	537436115
15027	NC_022221	TCG	2	6	859105	859110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436115
15028	NC_022221	CTT	2	6	859239	859244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436115
15029	NC_022221	AGC	2	6	859246	859251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436115
15030	NC_022221	ATCT	2	8	859283	859290	25 %	50 %	0 %	25 %	537436115
15031	NC_022221	GC	3	6	859360	859365	0 %	0 %	50 %	50 %	537436115
15032	NC_022221	ATT	2	6	859410	859415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436115
15033	NC_022221	GAT	2	6	859419	859424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436115
15034	NC_022221	CCG	2	6	859429	859434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436115
15035	NC_022221	GCG	2	6	859455	859460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436115
15036	NC_022221	TGG	2	6	859462	859467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436115
15037	NC_022221	GAACC	2	10	859693	859702	40 %	0 %	20 %	40 %	537436115
15038	NC_022221	A	6	6	859752	859757	100 %	0 %	0 %	0 %	537436115
15039	NC_022221	A	7	7	859806	859812	100 %	0 %	0 %	0 %	537436115
15040	NC_022221	AAG	2	6	859858	859863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436115
15041	NC_022221	AGC	2	6	859888	859893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436115
15042	NC_022221	TTA	2	6	860294	860299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436116
15043	NC_022221	TGT	2	6	860328	860333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436116
15044	NC_022221	ATT	2	6	860341	860346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436116
15045	NC_022221	CAG	2	6	860561	860566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436116
15046	NC_022221	TCG	2	6	860585	860590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436116
15047	NC_022221	CTT	2	6	860602	860607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436116
15048	NC_022221	A	8	8	860647	860654	100 %	0 %	0 %	0 %	537436116
15049	NC_022221	TCA	2	6	860667	860672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436116
15050	NC_022221	TGA	2	6	860682	860687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436116
15051	NC_022221	TGA	2	6	860712	860717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436116
15052	NC_022221	AAC	2	6	860754	860759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436116
15053	NC_022221	GGC	2	6	860825	860830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436116
15054	NC_022221	TAA	2	6	860868	860873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436116
15055	NC_022221	GGAA	2	8	860931	860938	50 %	0 %	50 %	0 %	537436116
15056	NC_022221	AGA	2	6	860991	860996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436116
15057	NC_022221	CG	3	6	861004	861009	0 %	0 %	50 %	50 %	537436116
15058	NC_022221	AAGGC	2	10	861029	861038	40 %	0 %	40 %	20 %	537436116
15059	NC_022221	TGG	2	6	861057	861062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436116
15060	NC_022221	GAA	2	6	861072	861077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436116
15061	NC_022221	CTG	2	6	861109	861114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436116
15062	NC_022221	CTT	2	6	861137	861142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436116
15063	NC_022221	TCG	2	6	861186	861191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436116
15064	NC_022221	AGAAC	2	10	861342	861351	60 %	0 %	20 %	20 %	537436116
15065	NC_022221	GCA	3	9	861549	861557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436117
15066	NC_022221	CCA	2	6	861613	861618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436117
15067	NC_022221	AGC	2	6	861638	861643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436117
15068	NC_022221	ATT	2	6	861670	861675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436117
15069	NC_022221	CGC	2	6	861736	861741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436117
15070	NC_022221	ATCTT	2	10	861805	861814	20 %	60 %	0 %	20 %	537436117
15071	NC_022221	AAT	2	6	861846	861851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436117
15072	NC_022221	TCA	2	6	861901	861906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436117
15073	NC_022221	GC	3	6	862068	862073	0 %	0 %	50 %	50 %	537436117
15074	NC_022221	CTGA	2	8	862095	862102	25 %	25 %	25 %	25 %	537436117
15075	NC_022221	CTGA	2	8	862236	862243	25 %	25 %	25 %	25 %	537436117
15076	NC_022221	ACG	2	6	862251	862256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436117
15077	NC_022221	GAAATG	2	12	862307	862318	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	537436118
15078	NC_022221	ATT	2	6	862334	862339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436118
15079	NC_022221	G	6	6	862345	862350	0 %	0 %	100 %	0 %	537436118
15080	NC_022221	GTAA	2	8	862385	862392	50 %	25 %	25 %	0 %	537436118
15081	NC_022221	GAT	2	6	862420	862425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436118
15082	NC_022221	GGCA	2	8	862453	862460	25 %	0 %	50 %	25 %	537436118
15083	NC_022221	ATC	2	6	862475	862480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436118
15084	NC_022221	CGC	2	6	862497	862502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436118
15085	NC_022221	CAA	2	6	862508	862513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436118
15086	NC_022221	CTG	2	6	862514	862519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436118
15087	NC_022221	TAT	2	6	862594	862599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436118
15088	NC_022221	ATG	2	6	862620	862625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436118
15089	NC_022221	TCT	2	6	862653	862658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436118
15090	NC_022221	TAA	2	6	862696	862701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436118
15091	NC_022221	GTG	2	6	862707	862712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436118
15092	NC_022221	GGA	2	6	862795	862800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537436118
15093	NC_022221	ATA	2	6	862854	862859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436118
15094	NC_022221	GTG	2	6	862862	862867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436118
15095	NC_022221	TGTC	2	8	862953	862960	0 %	50 %	25 %	25 %	537436118
15096	NC_022221	ATG	2	6	862964	862969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436118
15097	NC_022221	CTGG	2	8	862984	862991	0 %	25 %	50 %	25 %	537436118
15098	NC_022221	GAA	2	6	863045	863050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436118
15099	NC_022221	A	6	6	863146	863151	100 %	0 %	0 %	0 %	537436118
15100	NC_022221	TGA	2	6	863196	863201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436119
15101	NC_022221	T	6	6	863273	863278	0 %	100 %	0 %	0 %	537436119
15102	NC_022221	CAG	2	6	863291	863296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436119
15103	NC_022221	AG	3	6	863388	863393	50 %	0 %	50 %	0 %	537436119
15104	NC_022221	AGTT	2	8	863412	863419	25 %	50 %	25 %	0 %	537436119
15105	NC_022221	ATCT	2	8	863502	863509	25 %	50 %	0 %	25 %	537436119
15106	NC_022221	ATT	2	6	863604	863609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436119
15107	NC_022221	ATG	2	6	863643	863648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436119
15108	NC_022221	TGC	2	6	863704	863709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436119
15109	NC_022221	ATT	2	6	863761	863766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436120
15110	NC_022221	AG	3	6	863800	863805	50 %	0 %	50 %	0 %	537436120
15111	NC_022221	AATC	2	8	863810	863817	50 %	25 %	0 %	25 %	537436120
15112	NC_022221	TGC	2	6	863823	863828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436120
15113	NC_022221	CATC	2	8	863841	863848	25 %	25 %	0 %	50 %	537436120
15114	NC_022221	TTG	2	6	863896	863901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436120
15115	NC_022221	GTT	2	6	863911	863916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436120
15116	NC_022221	CTG	3	9	863961	863969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436120
15117	NC_022221	T	7	7	864003	864009	0 %	100 %	0 %	0 %	537436120
15118	NC_022221	GACA	2	8	864023	864030	50 %	0 %	25 %	25 %	537436120
15119	NC_022221	A	8	8	864030	864037	100 %	0 %	0 %	0 %	537436120
15120	NC_022221	CAC	2	6	864104	864109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436120
15121	NC_022221	CTTC	2	8	864126	864133	0 %	50 %	0 %	50 %	537436120
15122	NC_022221	TGA	2	6	864195	864200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436120
15123	NC_022221	CT	3	6	864252	864257	0 %	50 %	0 %	50 %	537436120
15124	NC_022221	T	6	6	864316	864321	0 %	100 %	0 %	0 %	537436120
15125	NC_022221	GTC	2	6	864416	864421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436120
15126	NC_022221	ATCTAC	2	12	864427	864438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436120
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15129	NC_022221	TGA	2	6	864534	864539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436120
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15131	NC_022221	CAT	2	6	864571	864576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436120
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15134	NC_022221	AT	4	8	864614	864621	50 %	50 %	0 %	0 %	537436120
15135	NC_022221	TGA	2	6	864638	864643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436120
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15138	NC_022221	ATA	2	6	864723	864728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436120
15139	NC_022221	CTGG	2	8	864757	864764	0 %	25 %	50 %	25 %	537436121
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15153	NC_022221	CTGA	2	8	865604	865611	25 %	25 %	25 %	25 %	537436122
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15162	NC_022221	TA	3	6	866265	866270	50 %	50 %	0 %	0 %	537436122
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15363	NC_022221	TCG	2	6	875254	875259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436130
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15483	NC_022221	CAT	2	6	881011	881016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436134
15484	NC_022221	TGG	2	6	881021	881026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436134
15485	NC_022221	TTCC	2	8	881039	881046	0 %	50 %	0 %	50 %	537436134
15486	NC_022221	TTG	2	6	881081	881086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436134
15487	NC_022221	ATT	2	6	881179	881184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436134
15488	NC_022221	TGA	2	6	881282	881287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436134
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15492	NC_022221	TCCC	2	8	881409	881416	0 %	25 %	0 %	75 %	537436134
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