MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_022221	CG	3	6	832167	832172	0 %	0 %	50 %	50 %	537436091
14502	NC_022221	CGCTG	2	10	832202	832211	0 %	20 %	40 %	40 %	537436091
14503	NC_022221	TCA	2	6	832335	832340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436091
14504	NC_022221	CGC	2	6	832388	832393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436091
14505	NC_022221	TGA	2	6	832413	832418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436091
14506	NC_022221	ATA	2	6	832439	832444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436091
14507	NC_022221	ATG	2	6	832535	832540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436091
14508	NC_022221	AGG	2	6	832790	832795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537436091
14509	NC_022221	AGC	2	6	832880	832885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436091
14510	NC_022221	TCCAG	2	10	832904	832913	20 %	20 %	20 %	40 %	537436091
14511	NC_022221	CAT	2	6	832942	832947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436091
14512	NC_022221	GCG	2	6	832967	832972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436091
14513	NC_022221	TCGCG	2	10	833018	833027	0 %	20 %	40 %	40 %	537436091
14514	NC_022221	GCC	2	6	833037	833042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436091
14515	NC_022221	CGG	2	6	833066	833071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436091
14516	NC_022221	CGA	2	6	833129	833134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436091
14517	NC_022221	GA	3	6	833195	833200	50 %	0 %	50 %	0 %	537436091
14518	NC_022221	GGAAA	2	10	833390	833399	60 %	0 %	40 %	0 %	537436091
14519	NC_022221	GAAT	2	8	833435	833442	50 %	25 %	25 %	0 %	537436091
14520	NC_022221	GCA	2	6	833457	833462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436091
14521	NC_022221	GCG	3	9	833477	833485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436091
14522	NC_022221	GCA	2	6	833490	833495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436091
14523	NC_022221	CGA	2	6	833577	833582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436091
14524	NC_022221	TCT	2	6	833596	833601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436091
14525	NC_022221	GGC	2	6	833680	833685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436091
14526	NC_022221	GAA	2	6	833880	833885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436091
14527	NC_022221	CTG	2	6	833887	833892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436091
14528	NC_022221	CACC	2	8	834085	834092	25 %	0 %	0 %	75 %	537436092
14529	NC_022221	AAT	2	6	834138	834143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436092
14530	NC_022221	TCC	2	6	834204	834209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436092
14531	NC_022221	TTC	2	6	834249	834254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436092
14532	NC_022221	GGCG	2	8	834265	834272	0 %	0 %	75 %	25 %	537436092
14533	NC_022221	GCAG	2	8	834411	834418	25 %	0 %	50 %	25 %	537436092
14534	NC_022221	CGC	2	6	834481	834486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436092
14535	NC_022221	TTG	2	6	834494	834499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436092
14536	NC_022221	GAC	2	6	834518	834523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436092
14537	NC_022221	CAG	2	6	834587	834592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436092
14538	NC_022221	ATG	2	6	834654	834659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436092
14539	NC_022221	ATC	2	6	834699	834704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436092
14540	NC_022221	GTC	2	6	834734	834739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436092
14541	NC_022221	CGG	2	6	834757	834762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436092
14542	NC_022221	T	6	6	834788	834793	0 %	100 %	0 %	0 %	537436092
14543	NC_022221	GAAA	2	8	834852	834859	75 %	0 %	25 %	0 %	537436092
14544	NC_022221	CGG	3	9	834861	834869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436092
14545	NC_022221	GTTG	2	8	834883	834890	0 %	50 %	50 %	0 %	537436092
14546	NC_022221	ATC	2	6	834900	834905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436092
14547	NC_022221	AAACC	2	10	834951	834960	60 %	0 %	0 %	40 %	537436092
14548	NC_022221	CCA	2	6	834967	834972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436092
14549	NC_022221	TGG	2	6	835018	835023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436092
14550	NC_022221	GTT	2	6	835028	835033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436092
14551	NC_022221	AGC	2	6	835062	835067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436092
14552	NC_022221	GCC	2	6	835092	835097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436092
14553	NC_022221	CGG	2	6	835129	835134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436092
14554	NC_022221	GA	3	6	835148	835153	50 %	0 %	50 %	0 %	537436092
14555	NC_022221	CAC	2	6	835169	835174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436092
14556	NC_022221	ACC	2	6	835185	835190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436092
14557	NC_022221	CGTT	2	8	835248	835255	0 %	50 %	25 %	25 %	537436092
14558	NC_022221	TGG	2	6	835264	835269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436092
14559	NC_022221	GAA	2	6	835283	835288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436092
14560	NC_022221	GCC	2	6	835289	835294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436092
14561	NC_022221	CAG	4	12	835385	835396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436092
14562	NC_022221	ATC	2	6	835404	835409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436092
14563	NC_022221	GC	4	8	835430	835437	0 %	0 %	50 %	50 %	537436092
14564	NC_022221	CGG	2	6	835451	835456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436092
14565	NC_022221	TCCAT	2	10	835561	835570	20 %	40 %	0 %	40 %	537436092
14566	NC_022221	AAT	2	6	836022	836027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436093
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14568	NC_022221	TAT	2	6	836091	836096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436093
14569	NC_022221	T	8	8	836124	836131	0 %	100 %	0 %	0 %	537436093
14570	NC_022221	ATG	2	6	836136	836141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436093
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14572	NC_022221	ATG	2	6	836245	836250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436094
14573	NC_022221	ATT	2	6	836274	836279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436094
14574	NC_022221	CGT	2	6	836649	836654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436095
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14579	NC_022221	CGT	2	6	836880	836885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436095
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14584	NC_022221	TGC	2	6	837320	837325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436095
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14586	NC_022221	TG	3	6	837413	837418	0 %	50 %	50 %	0 %	537436096
14587	NC_022221	CGG	2	6	837441	837446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436096
14588	NC_022221	GC	3	6	837501	837506	0 %	0 %	50 %	50 %	537436096
14589	NC_022221	GCG	3	9	837530	837538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436096
14590	NC_022221	CG	3	6	837595	837600	0 %	0 %	50 %	50 %	537436096
14591	NC_022221	CGC	2	6	837649	837654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436096
14592	NC_022221	AGCG	2	8	837713	837720	25 %	0 %	50 %	25 %	537436096
14593	NC_022221	GCG	2	6	837859	837864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436097
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14599	NC_022221	CGG	2	6	838332	838337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436097
14600	NC_022221	GC	3	6	838343	838348	0 %	0 %	50 %	50 %	537436097
14601	NC_022221	GCCA	2	8	838361	838368	25 %	0 %	25 %	50 %	537436097
14602	NC_022221	TAA	2	6	838464	838469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436097
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14604	NC_022221	TCGAT	2	10	838760	838769	20 %	40 %	20 %	20 %	537436097
14605	NC_022221	CTG	2	6	838861	838866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436097
14606	NC_022221	CGGG	2	8	838908	838915	0 %	0 %	75 %	25 %	537436097
14607	NC_022221	CAG	2	6	838936	838941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436097
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14610	NC_022221	CAG	2	6	839008	839013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436097
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14615	NC_022221	GC	3	6	839263	839268	0 %	0 %	50 %	50 %	537436097
14616	NC_022221	CTG	2	6	839317	839322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436097
14617	NC_022221	CCGA	2	8	839335	839342	25 %	0 %	25 %	50 %	537436097
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14619	NC_022221	AAT	2	6	839407	839412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436097
14620	NC_022221	TTTG	2	8	839455	839462	0 %	75 %	25 %	0 %	537436097
14621	NC_022221	GGC	2	6	839472	839477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436097
14622	NC_022221	TCA	2	6	839480	839485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436097
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14625	NC_022221	GCC	2	6	839667	839672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436097
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14733	NC_022221	TATT	2	8	844520	844527	25 %	75 %	0 %	0 %	537436102
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14739	NC_022221	TGC	2	6	844728	844733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436103
14740	NC_022221	CGA	2	6	844834	844839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436103
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14742	NC_022221	CGC	2	6	844954	844959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436103
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14847	NC_022221	TGG	3	9	849940	849948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436108
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14849	NC_022221	GACG	2	8	850029	850036	25 %	0 %	50 %	25 %	537436108
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14851	NC_022221	CCGT	2	8	850067	850074	0 %	25 %	25 %	50 %	537436108
14852	NC_022221	GGGA	2	8	850141	850148	25 %	0 %	75 %	0 %	537436108
14853	NC_022221	GTG	3	9	850188	850196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436108
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14857	NC_022221	CGGG	2	8	850382	850389	0 %	0 %	75 %	25 %	537436108
14858	NC_022221	GCG	2	6	850635	850640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436109
14859	NC_022221	GCTGGC	2	12	850669	850680	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537436109
14860	NC_022221	CGG	2	6	850774	850779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436109
14861	NC_022221	GCCA	2	8	850793	850800	25 %	0 %	25 %	50 %	537436109
14862	NC_022221	GCCC	2	8	850844	850851	0 %	0 %	25 %	75 %	537436109
14863	NC_022221	GCG	2	6	850857	850862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436109
14864	NC_022221	CCG	2	6	850910	850915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436109
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14866	NC_022221	CGGCG	2	10	851041	851050	0 %	0 %	60 %	40 %	537436109
14867	NC_022221	GC	3	6	851075	851080	0 %	0 %	50 %	50 %	537436109
14868	NC_022221	GC	3	6	851094	851099	0 %	0 %	50 %	50 %	537436109
14869	NC_022221	TCA	2	6	851109	851114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436109
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14872	NC_022221	GCT	2	6	851253	851258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436109
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14979	NC_022221	CGC	2	6	856339	856344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436113
14980	NC_022221	GGC	2	6	856363	856368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436113
14981	NC_022221	GCG	2	6	856457	856462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436113
14982	NC_022221	GC	3	6	856530	856535	0 %	0 %	50 %	50 %	537436113
14983	NC_022221	AGCC	2	8	856541	856548	25 %	0 %	25 %	50 %	537436113
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14987	NC_022221	TCG	2	6	856717	856722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436113
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14998	NC_022221	GGCT	2	8	857246	857253	0 %	25 %	50 %	25 %	537436113
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15000	NC_022221	CG	3	6	857340	857345	0 %	0 %	50 %	50 %	537436113

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