MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_022221	CCG	3	9	805583	805591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436071
14003	NC_022221	TCA	2	6	805625	805630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436071
14004	NC_022221	TCG	2	6	805688	805693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436071
14005	NC_022221	CTG	2	6	805902	805907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436072
14006	NC_022221	AG	3	6	805951	805956	50 %	0 %	50 %	0 %	537436072
14007	NC_022221	TTA	2	6	806131	806136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436073
14008	NC_022221	CTA	2	6	806218	806223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436073
14009	NC_022221	TA	3	6	806222	806227	50 %	50 %	0 %	0 %	537436073
14010	NC_022221	ATA	3	9	806975	806983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436074
14011	NC_022221	AAT	2	6	807028	807033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436074
14012	NC_022221	ATA	2	6	807053	807058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436074
14013	NC_022221	ATT	3	9	807069	807077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436074
14014	NC_022221	TTA	2	6	807140	807145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436074
14015	NC_022221	T	6	6	807662	807667	0 %	100 %	0 %	0 %	537436075
14016	NC_022221	A	6	6	807681	807686	100 %	0 %	0 %	0 %	537436075
14017	NC_022221	AGG	2	6	807718	807723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537436075
14018	NC_022221	ACT	2	6	807851	807856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436076
14019	NC_022221	TCA	2	6	808037	808042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436076
14020	NC_022221	TTC	2	6	808072	808077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436076
14021	NC_022221	GCC	2	6	808087	808092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436076
14022	NC_022221	TCG	2	6	808177	808182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436076
14023	NC_022221	CAG	2	6	808245	808250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436076
14024	NC_022221	CGG	2	6	808274	808279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436076
14025	NC_022221	CGT	2	6	808280	808285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436076
14026	NC_022221	TAA	2	6	808324	808329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436076
14027	NC_022221	GC	3	6	808402	808407	0 %	0 %	50 %	50 %	537436076
14028	NC_022221	GC	3	6	808511	808516	0 %	0 %	50 %	50 %	537436076
14029	NC_022221	TCT	2	6	808588	808593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436076
14030	NC_022221	TCCT	2	8	808596	808603	0 %	50 %	0 %	50 %	537436076
14031	NC_022221	GGCA	2	8	808622	808629	25 %	0 %	50 %	25 %	537436076
14032	NC_022221	GCAG	2	8	808679	808686	25 %	0 %	50 %	25 %	537436076
14033	NC_022221	GC	3	6	808709	808714	0 %	0 %	50 %	50 %	537436076
14034	NC_022221	CTG	2	6	808749	808754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436076
14035	NC_022221	GA	3	6	808792	808797	50 %	0 %	50 %	0 %	537436076
14036	NC_022221	CTG	2	6	808818	808823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436076
14037	NC_022221	CGA	2	6	808955	808960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436076
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14039	NC_022221	T	7	7	809031	809037	0 %	100 %	0 %	0 %	537436076
14040	NC_022221	TTA	2	6	809092	809097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436076
14041	NC_022221	CCG	2	6	809183	809188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436076
14042	NC_022221	AAG	2	6	809193	809198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436076
14043	NC_022221	CAT	2	6	809211	809216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436076
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14045	NC_022221	GGT	2	6	809427	809432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436077
14046	NC_022221	TTA	2	6	809531	809536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436077
14047	NC_022221	CTT	2	6	809586	809591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436077
14048	NC_022221	CTTCA	2	10	809632	809641	20 %	40 %	0 %	40 %	537436077
14049	NC_022221	CAG	2	6	809650	809655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436077
14050	NC_022221	GCCA	2	8	809693	809700	25 %	0 %	25 %	50 %	537436077
14051	NC_022221	G	6	6	809855	809860	0 %	0 %	100 %	0 %	537436077
14052	NC_022221	CCG	2	6	809895	809900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436077
14053	NC_022221	CG	3	6	809899	809904	0 %	0 %	50 %	50 %	537436077
14054	NC_022221	GTA	2	6	809940	809945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436077
14055	NC_022221	GTT	2	6	809950	809955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436077
14056	NC_022221	TAT	2	6	809961	809966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436077
14057	NC_022221	CAG	2	6	809980	809985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436077
14058	NC_022221	GCG	2	6	809993	809998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436077
14059	NC_022221	CGC	2	6	810076	810081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436077
14060	NC_022221	ACG	2	6	810187	810192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436077
14061	NC_022221	TGC	2	6	810218	810223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436077
14062	NC_022221	CCA	2	6	810250	810255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436077
14063	NC_022221	TCA	2	6	810293	810298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436077
14064	NC_022221	AAG	2	6	810299	810304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436077
14065	NC_022221	TTG	2	6	810308	810313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436077
14066	NC_022221	AACTT	2	10	810314	810323	40 %	40 %	0 %	20 %	537436077
14067	NC_022221	CCA	2	6	810526	810531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436077
14068	NC_022221	AT	3	6	810647	810652	50 %	50 %	0 %	0 %	537436077
14069	NC_022221	GCA	2	6	810738	810743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436077
14070	NC_022221	CCT	2	6	810816	810821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436077
14071	NC_022221	GAT	2	6	810834	810839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436077
14072	NC_022221	TCC	2	6	810851	810856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436077
14073	NC_022221	CCAG	2	8	810900	810907	25 %	0 %	25 %	50 %	537436077
14074	NC_022221	GCC	3	9	810947	810955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436077
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14076	NC_022221	GGC	3	9	811018	811026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436077
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14078	NC_022221	CACG	2	8	811082	811089	25 %	0 %	25 %	50 %	537436077
14079	NC_022221	GC	3	6	811142	811147	0 %	0 %	50 %	50 %	537436077
14080	NC_022221	GAA	2	6	811237	811242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436077
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14085	NC_022221	CCT	2	6	812174	812179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436078
14086	NC_022221	TGA	2	6	812180	812185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436078
14087	NC_022221	TGC	2	6	812278	812283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436078
14088	NC_022221	CAA	2	6	812321	812326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436078
14089	NC_022221	GCA	3	9	812360	812368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436078
14090	NC_022221	GCA	2	6	812426	812431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436078
14091	NC_022221	TAA	2	6	812465	812470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436078
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14093	NC_022221	ACC	2	6	812653	812658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436078
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14098	NC_022221	GC	3	6	812765	812770	0 %	0 %	50 %	50 %	537436078
14099	NC_022221	TAT	2	6	812774	812779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436078
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14102	NC_022221	T	6	6	812948	812953	0 %	100 %	0 %	0 %	537436078
14103	NC_022221	AGTTT	2	10	813004	813013	20 %	60 %	20 %	0 %	537436078
14104	NC_022221	TTCC	2	8	813023	813030	0 %	50 %	0 %	50 %	537436078
14105	NC_022221	GAAA	2	8	813037	813044	75 %	0 %	25 %	0 %	537436078
14106	NC_022221	GTA	2	6	813096	813101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436078
14107	NC_022221	GCCA	2	8	813130	813137	25 %	0 %	25 %	50 %	537436078
14108	NC_022221	GAT	2	6	813219	813224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436078
14109	NC_022221	CGC	2	6	813272	813277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436078
14110	NC_022221	GTT	2	6	813278	813283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436078
14111	NC_022221	A	6	6	813293	813298	100 %	0 %	0 %	0 %	537436078
14112	NC_022221	TAT	2	6	813324	813329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436078
14113	NC_022221	CG	3	6	813688	813693	0 %	0 %	50 %	50 %	537436079
14114	NC_022221	CAC	2	6	813772	813777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436079
14115	NC_022221	GTC	2	6	813784	813789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436079
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14118	NC_022221	A	6	6	813819	813824	100 %	0 %	0 %	0 %	537436079
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14120	NC_022221	CTG	3	9	813949	813957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436079
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14231	NC_022221	AAATT	2	10	819958	819967	60 %	40 %	0 %	0 %	537436081
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14235	NC_022221	TCATT	2	10	820007	820016	20 %	60 %	0 %	20 %	537436081
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14238	NC_022221	GGC	3	9	820188	820196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436081
14239	NC_022221	TGG	2	6	820205	820210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436081
14240	NC_022221	CCT	2	6	820253	820258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436082
14241	NC_022221	GCC	2	6	820362	820367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
14242	NC_022221	CGC	2	6	820446	820451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
14243	NC_022221	TCA	2	6	820460	820465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436082
14244	NC_022221	GCA	2	6	820481	820486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436082
14245	NC_022221	CG	3	6	820508	820513	0 %	0 %	50 %	50 %	537436082
14246	NC_022221	GCG	2	6	820537	820542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
14247	NC_022221	ATC	2	6	820555	820560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436082
14248	NC_022221	ATG	2	6	820561	820566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436082
14249	NC_022221	TTC	2	6	820573	820578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436082
14250	NC_022221	AAT	2	6	820596	820601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436082
14251	NC_022221	ATA	2	6	820615	820620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436082
14252	NC_022221	GAT	2	6	820638	820643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436082
14253	NC_022221	CAG	2	6	820650	820655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436082
14254	NC_022221	CGCC	2	8	820664	820671	0 %	0 %	25 %	75 %	537436082
14255	NC_022221	GA	3	6	820684	820689	50 %	0 %	50 %	0 %	537436082
14256	NC_022221	GGAT	2	8	820699	820706	25 %	25 %	50 %	0 %	537436082
14257	NC_022221	CCA	2	6	820745	820750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436082
14258	NC_022221	CGG	2	6	820751	820756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
14259	NC_022221	TGC	2	6	820775	820780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
14260	NC_022221	GCC	2	6	820786	820791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
14261	NC_022221	TAC	2	6	820805	820810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436082
14262	NC_022221	CTG	2	6	820832	820837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
14263	NC_022221	T	6	6	820850	820855	0 %	100 %	0 %	0 %	537436082
14264	NC_022221	TGAT	2	8	820945	820952	25 %	50 %	25 %	0 %	537436082
14265	NC_022221	GAGCG	2	10	820956	820965	20 %	0 %	60 %	20 %	537436082
14266	NC_022221	GCT	2	6	820970	820975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
14267	NC_022221	GCC	2	6	821007	821012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
14268	NC_022221	GCC	2	6	821044	821049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
14269	NC_022221	TAT	2	6	821069	821074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436082
14270	NC_022221	ACG	2	6	821083	821088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436082
14271	NC_022221	AG	3	6	821256	821261	50 %	0 %	50 %	0 %	537436082
14272	NC_022221	CGT	2	6	821322	821327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
14273	NC_022221	TGCG	2	8	821350	821357	0 %	25 %	50 %	25 %	537436082
14274	NC_022221	TCG	2	6	821420	821425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
14275	NC_022221	CGG	2	6	821429	821434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
14276	NC_022221	CTG	2	6	821454	821459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
14277	NC_022221	TCA	2	6	821467	821472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436082
14278	NC_022221	GC	3	6	821505	821510	0 %	0 %	50 %	50 %	537436082
14279	NC_022221	CAA	2	6	821543	821548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436082
14280	NC_022221	GTC	2	6	821551	821556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
14281	NC_022221	CCG	2	6	821567	821572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
14282	NC_022221	TCCGC	2	10	821585	821594	0 %	20 %	20 %	60 %	537436082
14283	NC_022221	GCG	2	6	821639	821644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
14284	NC_022221	CTG	2	6	821865	821870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
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14286	NC_022221	CAT	2	6	821889	821894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436082
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14294	NC_022221	AAT	2	6	822261	822266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436082
14295	NC_022221	AGAT	2	8	822292	822299	50 %	25 %	25 %	0 %	537436082
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14300	NC_022221	GC	3	6	822587	822592	0 %	0 %	50 %	50 %	537436082
14301	NC_022221	GAT	2	6	822606	822611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436082
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14303	NC_022221	CCGC	2	8	822665	822672	0 %	0 %	25 %	75 %	537436082
14304	NC_022221	GCG	2	6	822757	822762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
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14314	NC_022221	CGA	2	6	823098	823103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436082
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14317	NC_022221	AAC	2	6	823200	823205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436082
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14323	NC_022221	TGC	2	6	823346	823351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
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14325	NC_022221	T	6	6	823412	823417	0 %	100 %	0 %	0 %	537436083
14326	NC_022221	GGT	2	6	823427	823432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436083
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14328	NC_022221	CAC	2	6	823526	823531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436083
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14330	NC_022221	TCG	2	6	823584	823589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436083
14331	NC_022221	CA	3	6	823599	823604	50 %	0 %	0 %	50 %	537436083
14332	NC_022221	CCG	2	6	823630	823635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436083
14333	NC_022221	GGCA	2	8	823637	823644	25 %	0 %	50 %	25 %	537436083
14334	NC_022221	ATTG	2	8	823693	823700	25 %	50 %	25 %	0 %	537436083
14335	NC_022221	GC	3	6	823730	823735	0 %	0 %	50 %	50 %	537436083
14336	NC_022221	AC	3	6	823789	823794	50 %	0 %	0 %	50 %	537436083
14337	NC_022221	GAC	2	6	823934	823939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436083
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14339	NC_022221	GC	3	6	824047	824052	0 %	0 %	50 %	50 %	537436083
14340	NC_022221	GC	3	6	824165	824170	0 %	0 %	50 %	50 %	537436083
14341	NC_022221	ACG	2	6	824177	824182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436083
14342	NC_022221	AGCGT	2	10	824193	824202	20 %	20 %	40 %	20 %	537436083
14343	NC_022221	CTGG	2	8	824249	824256	0 %	25 %	50 %	25 %	537436083
14344	NC_022221	CAG	2	6	824270	824275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436083
14345	NC_022221	CTG	2	6	824291	824296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436083
14346	NC_022221	CGG	2	6	824362	824367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436083
14347	NC_022221	GGTCGC	2	12	824411	824422	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537436083
14348	NC_022221	GCG	3	9	824469	824477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436083
14349	NC_022221	GCG	2	6	824482	824487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436083
14350	NC_022221	GCG	2	6	824493	824498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436083
14351	NC_022221	CGGCG	2	10	824504	824513	0 %	0 %	60 %	40 %	537436083
14352	NC_022221	CCAGAA	2	12	824537	824548	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	537436083
14353	NC_022221	GCG	3	9	824550	824558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436083
14354	NC_022221	ATT	2	6	824715	824720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436084
14355	NC_022221	GGC	2	6	824800	824805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436084
14356	NC_022221	ATC	2	6	825106	825111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436085
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14358	NC_022221	T	6	6	825154	825159	0 %	100 %	0 %	0 %	537436085
14359	NC_022221	GCC	2	6	825181	825186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436085
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14470	NC_022221	GCTG	2	8	830461	830468	0 %	25 %	50 %	25 %	537436088
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14478	NC_022221	ACTA	2	8	830885	830892	50 %	25 %	0 %	25 %	537436089
14479	NC_022221	GAA	2	6	831028	831033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436089
14480	NC_022221	ATT	2	6	831038	831043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436089
14481	NC_022221	CG	3	6	831070	831075	0 %	0 %	50 %	50 %	537436089
14482	NC_022221	CGC	2	6	831114	831119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436089
14483	NC_022221	CG	3	6	831270	831275	0 %	0 %	50 %	50 %	537436089
14484	NC_022221	CTGG	2	8	831457	831464	0 %	25 %	50 %	25 %	537436090
14485	NC_022221	CGG	2	6	831570	831575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436090
14486	NC_022221	GCG	2	6	831614	831619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436090
14487	NC_022221	TGA	2	6	831630	831635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436090
14488	NC_022221	GCTG	2	8	831694	831701	0 %	25 %	50 %	25 %	537436090
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14490	NC_022221	GCTG	2	8	831741	831748	0 %	25 %	50 %	25 %	537436090
14491	NC_022221	CTC	2	6	831757	831762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436090
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14493	NC_022221	CCGGC	2	10	831918	831927	0 %	0 %	40 %	60 %	537436090
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14498	NC_022221	TGG	2	6	832091	832096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436091
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14500	NC_022221	GCA	2	6	832155	832160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436091

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