MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022221	CG	3	6	747960	747965	0 %	0 %	50 %	50 %	537436017
13002	NC_022221	CGG	2	6	747979	747984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436017
13003	NC_022221	GCC	2	6	748235	748240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436017
13004	NC_022221	TGGC	2	8	748338	748345	0 %	25 %	50 %	25 %	537436017
13005	NC_022221	TG	3	6	748356	748361	0 %	50 %	50 %	0 %	537436017
13006	NC_022221	TCG	2	6	748407	748412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436017
13007	NC_022221	CTG	2	6	748468	748473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436017
13008	NC_022221	GC	3	6	748483	748488	0 %	0 %	50 %	50 %	537436017
13009	NC_022221	TGG	2	6	748495	748500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436017
13010	NC_022221	TCA	2	6	748509	748514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436017
13011	NC_022221	CAGTA	2	10	748536	748545	40 %	20 %	20 %	20 %	537436017
13012	NC_022221	CGG	2	6	748571	748576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436017
13013	NC_022221	GGC	2	6	748613	748618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436017
13014	NC_022221	ATG	2	6	748619	748624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436017
13015	NC_022221	GCT	2	6	748633	748638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436017
13016	NC_022221	GCC	2	6	748643	748648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436017
13017	NC_022221	AAG	2	6	749024	749029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436018
13018	NC_022221	CGC	2	6	749072	749077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436018
13019	NC_022221	CGC	2	6	749195	749200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436018
13020	NC_022221	AAAAT	2	10	749279	749288	80 %	20 %	0 %	0 %	537436018
13021	NC_022221	TTC	2	6	749437	749442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436018
13022	NC_022221	CAA	2	6	749476	749481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436018
13023	NC_022221	AAT	2	6	749515	749520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436018
13024	NC_022221	GC	3	6	749560	749565	0 %	0 %	50 %	50 %	537436018
13025	NC_022221	ACG	4	12	749590	749601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436018
13026	NC_022221	CCAG	2	8	749624	749631	25 %	0 %	25 %	50 %	537436018
13027	NC_022221	CAT	2	6	749665	749670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436018
13028	NC_022221	CTT	2	6	749748	749753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436019
13029	NC_022221	GGC	2	6	749780	749785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436019
13030	NC_022221	GTT	3	9	749888	749896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436019
13031	NC_022221	TGC	2	6	749914	749919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436019
13032	NC_022221	CTG	2	6	750012	750017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436019
13033	NC_022221	CTG	3	9	750129	750137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436019
13034	NC_022221	CGG	2	6	750221	750226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436019
13035	NC_022221	GC	3	6	750283	750288	0 %	0 %	50 %	50 %	537436019
13036	NC_022221	TGGC	2	8	750293	750300	0 %	25 %	50 %	25 %	537436019
13037	NC_022221	ATG	2	6	750312	750317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436019
13038	NC_022221	CTG	2	6	750318	750323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436019
13039	NC_022221	GGCT	2	8	750345	750352	0 %	25 %	50 %	25 %	537436019
13040	NC_022221	CTG	2	6	750396	750401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436019
13041	NC_022221	CCTG	2	8	750425	750432	0 %	25 %	25 %	50 %	537436019
13042	NC_022221	GGC	2	6	750448	750453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436019
13043	NC_022221	GC	3	6	750508	750513	0 %	0 %	50 %	50 %	537436019
13044	NC_022221	CTG	2	6	750627	750632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436019
13045	NC_022221	ATC	2	6	750639	750644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436019
13046	NC_022221	TTAT	2	8	750672	750679	25 %	75 %	0 %	0 %	537436019
13047	NC_022221	GC	3	6	750809	750814	0 %	0 %	50 %	50 %	537436019
13048	NC_022221	GC	3	6	751004	751009	0 %	0 %	50 %	50 %	537436020
13049	NC_022221	CTG	2	6	751106	751111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436020
13050	NC_022221	AATGCG	2	12	751124	751135	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	537436020
13051	NC_022221	CGT	2	6	751171	751176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436020
13052	NC_022221	GCA	3	9	751237	751245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436020
13053	NC_022221	ATTG	2	8	751336	751343	25 %	50 %	25 %	0 %	537436020
13054	NC_022221	GCG	2	6	751467	751472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436020
13055	NC_022221	AAT	2	6	751499	751504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436020
13056	NC_022221	GGT	2	6	751572	751577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436020
13057	NC_022221	TGC	2	6	751603	751608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436020
13058	NC_022221	GCG	2	6	751650	751655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436020
13059	NC_022221	CGG	2	6	751698	751703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436020
13060	NC_022221	GGC	2	6	751726	751731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436020
13061	NC_022221	TCTG	2	8	751780	751787	0 %	50 %	25 %	25 %	537436020
13062	NC_022221	CGA	2	6	751798	751803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436020
13063	NC_022221	AAG	2	6	752510	752515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436021
13064	NC_022221	GC	3	6	752556	752561	0 %	0 %	50 %	50 %	537436021
13065	NC_022221	GGC	2	6	752569	752574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436021
13066	NC_022221	GTG	2	6	752627	752632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436021
13067	NC_022221	TGA	2	6	752682	752687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436021
13068	NC_022221	GCC	2	6	752786	752791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436021
13069	NC_022221	GC	3	6	752810	752815	0 %	0 %	50 %	50 %	537436021
13070	NC_022221	GGT	2	6	752830	752835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436021
13071	NC_022221	TAT	2	6	752888	752893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436021
13072	NC_022221	GACT	2	8	752899	752906	25 %	25 %	25 %	25 %	537436021
13073	NC_022221	CTG	2	6	753005	753010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436021
13074	NC_022221	ACG	2	6	753047	753052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436021
13075	NC_022221	GATG	2	8	753145	753152	25 %	25 %	50 %	0 %	537436021
13076	NC_022221	CGATG	2	10	753205	753214	20 %	20 %	40 %	20 %	537436021
13077	NC_022221	ATA	2	6	753246	753251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436021
13078	NC_022221	ATC	2	6	753253	753258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436021
13079	NC_022221	CGGTA	2	10	753325	753334	20 %	20 %	40 %	20 %	537436021
13080	NC_022221	CAA	2	6	753346	753351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436021
13081	NC_022221	CGT	2	6	755224	755229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436022
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13083	NC_022221	T	6	6	755272	755277	0 %	100 %	0 %	0 %	537436022
13084	NC_022221	TAT	3	9	755323	755331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436022
13085	NC_022221	CGG	2	6	755379	755384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
13086	NC_022221	GGC	2	6	755401	755406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
13087	NC_022221	GGC	2	6	755413	755418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
13088	NC_022221	CAAT	2	8	755429	755436	50 %	25 %	0 %	25 %	537436022
13089	NC_022221	CAA	2	6	755446	755451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436022
13090	NC_022221	CAT	3	9	755539	755547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436022
13091	NC_022221	TTA	2	6	755571	755576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436022
13092	NC_022221	GAT	2	6	755590	755595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436022
13093	NC_022221	GGC	2	6	755807	755812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
13094	NC_022221	GGC	2	6	755821	755826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
13095	NC_022221	CTG	2	6	755858	755863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436022
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13098	NC_022221	TATG	2	8	755953	755960	25 %	50 %	25 %	0 %	537436022
13099	NC_022221	CGTG	2	8	755979	755986	0 %	25 %	50 %	25 %	537436022
13100	NC_022221	GCG	2	6	756006	756011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
13101	NC_022221	GTG	2	6	756032	756037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436022
13102	NC_022221	TCA	2	6	756060	756065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436022
13103	NC_022221	TA	3	6	756080	756085	50 %	50 %	0 %	0 %	537436022
13104	NC_022221	GGC	2	6	756119	756124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
13105	NC_022221	CG	3	6	756163	756168	0 %	0 %	50 %	50 %	537436022
13106	NC_022221	AAG	2	6	756170	756175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436022
13107	NC_022221	T	6	6	756283	756288	0 %	100 %	0 %	0 %	537436023
13108	NC_022221	CAG	2	6	756340	756345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436023
13109	NC_022221	GCG	2	6	756375	756380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436023
13110	NC_022221	TGA	2	6	756410	756415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436023
13111	NC_022221	CCG	2	6	756416	756421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436023
13112	NC_022221	CCG	2	6	756510	756515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436023
13113	NC_022221	ATA	2	6	756518	756523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436023
13114	NC_022221	ATC	2	6	756542	756547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436023
13115	NC_022221	TCT	2	6	756605	756610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436023
13116	NC_022221	GTC	2	6	756641	756646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436023
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13119	NC_022221	GCC	2	6	756706	756711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436023
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13227	NC_022221	AAAG	2	8	762341	762348	75 %	0 %	25 %	0 %	537436030
13228	NC_022221	GCT	2	6	762364	762369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436030
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13237	NC_022221	CAGT	2	8	762761	762768	25 %	25 %	25 %	25 %	537436030
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13239	NC_022221	TCA	2	6	762999	763004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436030
13240	NC_022221	AATTTC	2	12	763067	763078	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	537436030
13241	NC_022221	ACG	2	6	763229	763234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436031
13242	NC_022221	ATC	2	6	763290	763295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436031
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13244	NC_022221	CCG	2	6	763333	763338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436031
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13247	NC_022221	GC	3	6	763438	763443	0 %	0 %	50 %	50 %	537436031
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13250	NC_022221	TCG	2	6	763643	763648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436031
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13252	NC_022221	TGGC	2	8	763739	763746	0 %	25 %	50 %	25 %	537436031
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13254	NC_022221	CTG	2	6	763797	763802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436031
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13262	NC_022221	CCCA	2	8	764337	764344	25 %	0 %	0 %	75 %	537436031
13263	NC_022221	CGG	2	6	764414	764419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436031
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13267	NC_022221	CGG	2	6	764476	764481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436031
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13276	NC_022221	CCG	2	6	764800	764805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436032
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13331	NC_022221	TGA	2	6	767450	767455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436035
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13341	NC_022221	CCCG	2	8	767782	767789	0 %	0 %	25 %	75 %	537436035
13342	NC_022221	CCT	2	6	767812	767817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436035
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13347	NC_022221	GCGACG	2	12	767980	767991	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	537436035
13348	NC_022221	GCA	2	6	767993	767998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436035
13349	NC_022221	CGC	2	6	768083	768088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436035
13350	NC_022221	CTG	2	6	768114	768119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436035
13351	NC_022221	AGG	2	6	768136	768141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537436035
13352	NC_022221	AGA	2	6	768179	768184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436035
13353	NC_022221	AG	3	6	768269	768274	50 %	0 %	50 %	0 %	537436036
13354	NC_022221	T	7	7	768293	768299	0 %	100 %	0 %	0 %	537436036
13355	NC_022221	GCT	2	6	768368	768373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436036
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13357	NC_022221	GCT	2	6	768431	768436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436036
13358	NC_022221	TGGC	2	8	768540	768547	0 %	25 %	50 %	25 %	537436036
13359	NC_022221	CGC	2	6	768554	768559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436036
13360	NC_022221	GTG	2	6	768618	768623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436036
13361	NC_022221	GCG	4	12	768631	768642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436036
13362	NC_022221	GCG	2	6	768751	768756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436036
13363	NC_022221	GCA	2	6	768785	768790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436036
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13474	NC_022221	GCG	2	6	774213	774218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436043
13475	NC_022221	TGG	2	6	774268	774273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436043
13476	NC_022221	GGC	2	6	774404	774409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436043
13477	NC_022221	GCCAGC	2	12	774411	774422	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537436043
13478	NC_022221	TCG	2	6	774521	774526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436044
13479	NC_022221	GTTG	2	8	774586	774593	0 %	50 %	50 %	0 %	537436044
13480	NC_022221	CCG	2	6	774660	774665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436044
13481	NC_022221	C	6	6	774675	774680	0 %	0 %	0 %	100 %	537436044
13482	NC_022221	TTC	2	6	774734	774739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436044
13483	NC_022221	TGA	2	6	774752	774757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436044
13484	NC_022221	CGG	2	6	774817	774822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436044
13485	NC_022221	GCG	2	6	774850	774855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436044
13486	NC_022221	TCA	2	6	774890	774895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436044
13487	NC_022221	CGC	2	6	774919	774924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436044
13488	NC_022221	CAG	2	6	774927	774932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436044
13489	NC_022221	TGC	2	6	774957	774962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436044
13490	NC_022221	CTT	2	6	774963	774968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436044
13491	NC_022221	GAA	2	6	774982	774987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436044
13492	NC_022221	A	6	6	775006	775011	100 %	0 %	0 %	0 %	537436044
13493	NC_022221	TTCA	2	8	775012	775019	25 %	50 %	0 %	25 %	537436044
13494	NC_022221	CAG	2	6	775063	775068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436044
13495	NC_022221	ATG	2	6	775069	775074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436044
13496	NC_022221	CGG	2	6	775105	775110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436044
13497	NC_022221	CG	3	6	775147	775152	0 %	0 %	50 %	50 %	537436044
13498	NC_022221	CGGA	2	8	775165	775172	25 %	0 %	50 %	25 %	537436044
13499	NC_022221	GCATC	2	10	775191	775200	20 %	20 %	20 %	40 %	537436044
13500	NC_022221	ATC	2	6	775256	775261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436044

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