MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022221	CGC	2	6	660588	660593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435938
11502	NC_022221	GCC	2	6	660607	660612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435938
11503	NC_022221	GAC	2	6	660641	660646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435938
11504	NC_022221	GAA	2	6	660662	660667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435938
11505	NC_022221	GTAC	2	8	660697	660704	25 %	25 %	25 %	25 %	537435938
11506	NC_022221	TATCGC	2	12	660727	660738	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	537435938
11507	NC_022221	GTTT	2	8	660745	660752	0 %	75 %	25 %	0 %	537435938
11508	NC_022221	CTG	2	6	660755	660760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435938
11509	NC_022221	ACCT	2	8	660788	660795	25 %	25 %	0 %	50 %	537435938
11510	NC_022221	AAG	2	6	660798	660803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435938
11511	NC_022221	TCC	2	6	660827	660832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435938
11512	NC_022221	GCT	2	6	660874	660879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435938
11513	NC_022221	ATC	2	6	661022	661027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435938
11514	NC_022221	A	6	6	661088	661093	100 %	0 %	0 %	0 %	537435938
11515	NC_022221	GCG	2	6	661094	661099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435938
11516	NC_022221	CGG	3	9	661104	661112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435938
11517	NC_022221	CTT	2	6	661183	661188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435938
11518	NC_022221	GGC	2	6	661199	661204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435938
11519	NC_022221	TGA	2	6	661212	661217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435938
11520	NC_022221	GGC	2	6	661220	661225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435938
11521	NC_022221	CTG	2	6	661244	661249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435938
11522	NC_022221	TGA	2	6	661257	661262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435938
11523	NC_022221	CAT	2	6	661277	661282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435938
11524	NC_022221	TAA	2	6	661313	661318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435938
11525	NC_022221	GCG	2	6	661381	661386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435939
11526	NC_022221	GGC	2	6	661391	661396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435939
11527	NC_022221	GTG	2	6	661420	661425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435939
11528	NC_022221	TGA	2	6	661510	661515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435939
11529	NC_022221	GAC	2	6	661521	661526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435939
11530	NC_022221	GTC	2	6	661533	661538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435939
11531	NC_022221	TGAC	2	8	661564	661571	25 %	25 %	25 %	25 %	537435939
11532	NC_022221	A	6	6	661689	661694	100 %	0 %	0 %	0 %	537435939
11533	NC_022221	CAT	2	6	661842	661847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435939
11534	NC_022221	GAA	2	6	661889	661894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435939
11535	NC_022221	GCTGA	2	10	661947	661956	20 %	20 %	40 %	20 %	537435939
11536	NC_022221	GGAT	2	8	661990	661997	25 %	25 %	50 %	0 %	537435939
11537	NC_022221	CAG	2	6	662043	662048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435939
11538	NC_022221	GGCG	2	8	662321	662328	0 %	0 %	75 %	25 %	537435939
11539	NC_022221	A	7	7	662377	662383	100 %	0 %	0 %	0 %	537435939
11540	NC_022221	TAA	2	6	662548	662553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435940
11541	NC_022221	CTTC	2	8	662564	662571	0 %	50 %	0 %	50 %	537435940
11542	NC_022221	CGG	2	6	662575	662580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435940
11543	NC_022221	AAC	2	6	662771	662776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435940
11544	NC_022221	TTC	2	6	662833	662838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435940
11545	NC_022221	GCC	2	6	662858	662863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435940
11546	NC_022221	GAT	2	6	662868	662873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435940
11547	NC_022221	CAC	2	6	662881	662886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435940
11548	NC_022221	ATAC	2	8	662920	662927	50 %	25 %	0 %	25 %	537435940
11549	NC_022221	AAT	2	6	662983	662988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435940
11550	NC_022221	GAT	2	6	663030	663035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435940
11551	NC_022221	GCAGGC	2	12	663070	663081	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	537435940
11552	NC_022221	T	7	7	663122	663128	0 %	100 %	0 %	0 %	537435940
11553	NC_022221	CG	3	6	663172	663177	0 %	0 %	50 %	50 %	537435940
11554	NC_022221	CGG	3	9	663201	663209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435940
11555	NC_022221	ACG	2	6	663226	663231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435940
11556	NC_022221	CTC	3	9	663259	663267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435940
11557	NC_022221	CGG	2	6	663291	663296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435940
11558	NC_022221	CCG	2	6	663335	663340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435940
11559	NC_022221	TGCG	2	8	663516	663523	0 %	25 %	50 %	25 %	537435941
11560	NC_022221	GAAA	2	8	663548	663555	75 %	0 %	25 %	0 %	537435941
11561	NC_022221	TAT	2	6	663599	663604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435941
11562	NC_022221	T	6	6	663606	663611	0 %	100 %	0 %	0 %	537435941
11563	NC_022221	T	6	6	663613	663618	0 %	100 %	0 %	0 %	537435941
11564	NC_022221	TTA	2	6	663633	663638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435941
11565	NC_022221	TGGG	2	8	663744	663751	0 %	25 %	75 %	0 %	537435941
11566	NC_022221	CT	3	6	663780	663785	0 %	50 %	0 %	50 %	537435941
11567	NC_022221	T	6	6	663794	663799	0 %	100 %	0 %	0 %	537435941
11568	NC_022221	GCT	2	6	663842	663847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435941
11569	NC_022221	TTA	2	6	663883	663888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435941
11570	NC_022221	GCG	2	6	664062	664067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435941
11571	NC_022221	CGC	2	6	664166	664171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435941
11572	NC_022221	T	6	6	664194	664199	0 %	100 %	0 %	0 %	537435941
11573	NC_022221	GGC	3	9	664265	664273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435941
11574	NC_022221	CTG	2	6	664284	664289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435941
11575	NC_022221	TGA	2	6	664306	664311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435941
11576	NC_022221	A	6	6	664344	664349	100 %	0 %	0 %	0 %	537435941
11577	NC_022221	TGT	2	6	664361	664366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435941
11578	NC_022221	TGG	2	6	664399	664404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435941
11579	NC_022221	GCA	2	6	664423	664428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435941
11580	NC_022221	ATG	2	6	664431	664436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435941
11581	NC_022221	CGG	2	6	664445	664450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435941
11582	NC_022221	GATG	2	8	664559	664566	25 %	25 %	50 %	0 %	537435941
11583	NC_022221	ATG	2	6	664599	664604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435941
11584	NC_022221	TGG	2	6	664651	664656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435941
11585	NC_022221	A	6	6	664689	664694	100 %	0 %	0 %	0 %	537435941
11586	NC_022221	CCA	2	6	664717	664722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435941
11587	NC_022221	GCA	3	9	664771	664779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435942
11588	NC_022221	TC	3	6	664788	664793	0 %	50 %	0 %	50 %	537435942
11589	NC_022221	CAG	2	6	664924	664929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435942
11590	NC_022221	CAG	2	6	664951	664956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435942
11591	NC_022221	TG	3	6	664958	664963	0 %	50 %	50 %	0 %	537435942
11592	NC_022221	TCG	2	6	665014	665019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435943
11593	NC_022221	AACT	2	8	665057	665064	50 %	25 %	0 %	25 %	537435943
11594	NC_022221	CCAG	2	8	665102	665109	25 %	0 %	25 %	50 %	537435943
11595	NC_022221	AT	3	6	665188	665193	50 %	50 %	0 %	0 %	537435943
11596	NC_022221	ATC	2	6	665230	665235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435943
11597	NC_022221	CTG	2	6	665274	665279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435943
11598	NC_022221	CGC	2	6	665280	665285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435943
11599	NC_022221	GTC	2	6	665346	665351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435943
11600	NC_022221	CGC	2	6	665354	665359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435943
11601	NC_022221	TCA	2	6	665525	665530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435943
11602	NC_022221	T	6	6	665544	665549	0 %	100 %	0 %	0 %	537435943
11603	NC_022221	TCG	2	6	665644	665649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435943
11604	NC_022221	TAG	2	6	665650	665655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435943
11605	NC_022221	GC	3	6	665671	665676	0 %	0 %	50 %	50 %	537435943
11606	NC_022221	CCG	2	6	665717	665722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435943
11607	NC_022221	AAT	2	6	665742	665747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435943
11608	NC_022221	GTGA	2	8	665762	665769	25 %	25 %	50 %	0 %	537435943
11609	NC_022221	GCA	2	6	665831	665836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435943
11610	NC_022221	CAG	2	6	665871	665876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435943
11611	NC_022221	TGA	2	6	665897	665902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435943
11612	NC_022221	AGA	2	6	665978	665983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435943
11613	NC_022221	AG	3	6	665985	665990	50 %	0 %	50 %	0 %	537435943
11614	NC_022221	CTG	2	6	666027	666032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435943
11615	NC_022221	GTG	2	6	666109	666114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435943
11616	NC_022221	TCA	2	6	666232	666237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435944
11617	NC_022221	CAG	2	6	666376	666381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435944
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11619	NC_022221	CCA	2	6	666474	666479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435944
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11975	NC_022221	ATCA	2	8	687613	687620	50 %	25 %	0 %	25 %	537435955
11976	NC_022221	TGC	2	6	687656	687661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435955
11977	NC_022221	GTC	2	6	687694	687699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435955
11978	NC_022221	CAC	2	6	687723	687728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435955
11979	NC_022221	TCGGC	2	10	687914	687923	0 %	20 %	40 %	40 %	537435955
11980	NC_022221	TGC	2	6	687953	687958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435955
11981	NC_022221	TGG	2	6	688007	688012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435955
11982	NC_022221	TCA	2	6	688173	688178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435955
11983	NC_022221	ATG	2	6	688231	688236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435955
11984	NC_022221	TCT	2	6	688256	688261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435955
11985	NC_022221	CGC	2	6	688337	688342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435955
11986	NC_022221	TAA	2	6	688395	688400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435955
11987	NC_022221	CTG	2	6	688558	688563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435955
11988	NC_022221	GGC	2	6	688573	688578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435955
11989	NC_022221	GCC	2	6	688669	688674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435955
11990	NC_022221	TG	3	6	688722	688727	0 %	50 %	50 %	0 %	537435955
11991	NC_022221	CTG	2	6	688741	688746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435955
11992	NC_022221	ACG	2	6	688829	688834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435955
11993	NC_022221	A	7	7	688868	688874	100 %	0 %	0 %	0 %	537435955
11994	NC_022221	GCT	3	9	688884	688892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435955
11995	NC_022221	ATT	2	6	688915	688920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435955
11996	NC_022221	GCC	2	6	688936	688941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435955
11997	NC_022221	CCG	2	6	688959	688964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435955
11998	NC_022221	ATG	2	6	689030	689035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435955
11999	NC_022221	CGA	2	6	689103	689108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435955
12000	NC_022221	GCC	2	6	689116	689121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435955

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