MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022221	TAC	2	6	634011	634016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435912
11002	NC_022221	CAA	2	6	634051	634056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435912
11003	NC_022221	CGG	2	6	634060	634065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435912
11004	NC_022221	CTG	2	6	634079	634084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435912
11005	NC_022221	CGC	2	6	634089	634094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435912
11006	NC_022221	GCC	2	6	634151	634156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435912
11007	NC_022221	ATC	2	6	634173	634178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435912
11008	NC_022221	GCTG	2	8	634210	634217	0 %	25 %	50 %	25 %	537435912
11009	NC_022221	TGG	2	6	634254	634259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435912
11010	NC_022221	ACGG	2	8	634268	634275	25 %	0 %	50 %	25 %	537435912
11011	NC_022221	GCA	2	6	634288	634293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435912
11012	NC_022221	ATG	2	6	634318	634323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435912
11013	NC_022221	GCA	2	6	634332	634337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435913
11014	NC_022221	CGG	2	6	634491	634496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435913
11015	NC_022221	TCA	2	6	634508	634513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435913
11016	NC_022221	GC	3	6	634521	634526	0 %	0 %	50 %	50 %	537435913
11017	NC_022221	ACA	2	6	634541	634546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435913
11018	NC_022221	TGGT	2	8	634558	634565	0 %	50 %	50 %	0 %	537435913
11019	NC_022221	GGC	2	6	634579	634584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435913
11020	NC_022221	GAT	2	6	634593	634598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435913
11021	NC_022221	TGG	2	6	634634	634639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435913
11022	NC_022221	GC	4	8	634675	634682	0 %	0 %	50 %	50 %	537435913
11023	NC_022221	CAG	2	6	634762	634767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435913
11024	NC_022221	GCA	2	6	634791	634796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435913
11025	NC_022221	GCTG	2	8	634842	634849	0 %	25 %	50 %	25 %	537435913
11026	NC_022221	TAT	2	6	634924	634929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435913
11027	NC_022221	GGC	2	6	634977	634982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435913
11028	NC_022221	TGA	2	6	635102	635107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435914
11029	NC_022221	GAT	2	6	635255	635260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435914
11030	NC_022221	ACG	2	6	635284	635289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435914
11031	NC_022221	ATT	2	6	635304	635309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435914
11032	NC_022221	GCGG	2	8	635340	635347	0 %	0 %	75 %	25 %	537435914
11033	NC_022221	GCG	2	6	635362	635367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435914
11034	NC_022221	CGG	2	6	635372	635377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435914
11035	NC_022221	CGG	2	6	635483	635488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435914
11036	NC_022221	TGC	2	6	635497	635502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435914
11037	NC_022221	ATG	2	6	635505	635510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435914
11038	NC_022221	CGG	2	6	635527	635532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435914
11039	NC_022221	CGG	2	6	635579	635584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435914
11040	NC_022221	AGA	2	6	635620	635625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435914
11041	NC_022221	GCC	2	6	635650	635655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435914
11042	NC_022221	GCG	2	6	635790	635795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435914
11043	NC_022221	GAA	2	6	635871	635876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435914
11044	NC_022221	GC	3	6	635955	635960	0 %	0 %	50 %	50 %	537435915
11045	NC_022221	GGT	2	6	635995	636000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435915
11046	NC_022221	GA	3	6	636075	636080	50 %	0 %	50 %	0 %	537435915
11047	NC_022221	TC	3	6	636081	636086	0 %	50 %	0 %	50 %	537435915
11048	NC_022221	TCAG	2	8	636099	636106	25 %	25 %	25 %	25 %	537435915
11049	NC_022221	GC	3	6	636213	636218	0 %	0 %	50 %	50 %	537435915
11050	NC_022221	ACTG	2	8	636226	636233	25 %	25 %	25 %	25 %	537435915
11051	NC_022221	GGC	2	6	636247	636252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435915
11052	NC_022221	TGC	2	6	636300	636305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435915
11053	NC_022221	TGG	2	6	636378	636383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435915
11054	NC_022221	TGC	2	6	636390	636395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435915
11055	NC_022221	ATCTGC	2	12	636411	636422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	537435915
11056	NC_022221	CGC	2	6	636447	636452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435915
11057	NC_022221	GAA	2	6	636515	636520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435915
11058	NC_022221	GAT	2	6	636536	636541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435915
11059	NC_022221	GCC	2	6	636698	636703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435915
11060	NC_022221	CGG	2	6	636720	636725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435915
11061	NC_022221	TCA	2	6	636726	636731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435915
11062	NC_022221	TCGA	2	8	636737	636744	25 %	25 %	25 %	25 %	537435915
11063	NC_022221	GCC	2	6	636779	636784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435915
11064	NC_022221	TGA	2	6	636886	636891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435915
11065	NC_022221	GC	3	6	636996	637001	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
11066	NC_022221	GGCG	2	8	637026	637033	0 %	0 %	75 %	25 %	537435916
11067	NC_022221	CTG	2	6	637072	637077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435916
11068	NC_022221	GCG	2	6	637130	637135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
11069	NC_022221	CG	3	6	637134	637139	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
11070	NC_022221	GCG	2	6	637279	637284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
11071	NC_022221	GC	3	6	637391	637396	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
11072	NC_022221	GCT	2	6	637440	637445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435916
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11075	NC_022221	GGC	2	6	637592	637597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
11076	NC_022221	GCG	2	6	637612	637617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
11077	NC_022221	CGG	2	6	637641	637646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
11078	NC_022221	GCT	2	6	637697	637702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435916
11079	NC_022221	AGG	2	6	637748	637753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435916
11080	NC_022221	TGA	2	6	637764	637769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435916
11081	NC_022221	GC	3	6	637775	637780	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
11082	NC_022221	AG	3	6	637792	637797	50 %	0 %	50 %	0 %	537435916
11083	NC_022221	TCG	2	6	637805	637810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435916
11084	NC_022221	GC	3	6	637827	637832	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
11085	NC_022221	CG	3	6	637907	637912	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
11086	NC_022221	GGC	2	6	637952	637957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
11087	NC_022221	GCG	3	9	637976	637984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
11088	NC_022221	GGA	2	6	637998	638003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435916
11089	NC_022221	TTA	2	6	638015	638020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435916
11090	NC_022221	CAA	2	6	638038	638043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435916
11091	NC_022221	TCG	2	6	638048	638053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435916
11092	NC_022221	AGA	2	6	638061	638066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435916
11093	NC_022221	CAG	2	6	638167	638172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435916
11094	NC_022221	CAG	2	6	638242	638247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435916
11095	NC_022221	GT	3	6	638251	638256	0 %	50 %	50 %	0 %	537435916
11096	NC_022221	TGGT	2	8	638378	638385	0 %	50 %	50 %	0 %	537435917
11097	NC_022221	GCG	2	6	638442	638447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435917
11098	NC_022221	GTATT	2	10	638530	638539	20 %	60 %	20 %	0 %	537435917
11099	NC_022221	CGA	2	6	638593	638598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435917
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11102	NC_022221	CAG	2	6	638762	638767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435918
11103	NC_022221	GT	3	6	638793	638798	0 %	50 %	50 %	0 %	537435918
11104	NC_022221	CAG	2	6	638811	638816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435918
11105	NC_022221	CAT	2	6	638927	638932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435918
11106	NC_022221	GAGG	2	8	638957	638964	25 %	0 %	75 %	0 %	537435918
11107	NC_022221	TAAT	2	8	639036	639043	50 %	50 %	0 %	0 %	537435919
11108	NC_022221	GGCGG	2	10	639060	639069	0 %	0 %	80 %	20 %	537435919
11109	NC_022221	GCC	2	6	639095	639100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435919
11110	NC_022221	CAG	2	6	639169	639174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435919
11111	NC_022221	CGG	2	6	639236	639241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435919
11112	NC_022221	GCTT	2	8	639269	639276	0 %	50 %	25 %	25 %	537435919
11113	NC_022221	GGGAA	2	10	639393	639402	40 %	0 %	60 %	0 %	537435920
11114	NC_022221	TAA	2	6	639446	639451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435920
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11116	NC_022221	TCG	2	6	639490	639495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435920
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11118	NC_022221	CGG	2	6	639602	639607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435920
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11120	NC_022221	CAG	2	6	639726	639731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435920
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11235	NC_022221	GCGCG	2	10	644995	645004	0 %	0 %	60 %	40 %	537435924
11236	NC_022221	ACG	2	6	645127	645132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435924
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11238	NC_022221	CTGCG	2	10	645179	645188	0 %	20 %	40 %	40 %	537435924
11239	NC_022221	GGC	2	6	645191	645196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435924
11240	NC_022221	GCG	2	6	645197	645202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435924
11241	NC_022221	GCG	2	6	645246	645251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435924
11242	NC_022221	GC	3	6	645304	645309	0 %	0 %	50 %	50 %	537435924
11243	NC_022221	TCC	2	6	645311	645316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435924
11244	NC_022221	GAC	2	6	645398	645403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435924
11245	NC_022221	CGG	2	6	645571	645576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435924
11246	NC_022221	GC	3	6	645577	645582	0 %	0 %	50 %	50 %	537435924
11247	NC_022221	ATCGAC	2	12	645668	645679	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	537435924
11248	NC_022221	TCG	2	6	645753	645758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435924
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11250	NC_022221	ATTG	2	8	645829	645836	25 %	50 %	25 %	0 %	537435924
11251	NC_022221	CGC	2	6	645854	645859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435924
11252	NC_022221	GTT	2	6	645885	645890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435924
11253	NC_022221	CAT	2	6	645974	645979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435924
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11255	NC_022221	ATGC	2	8	646165	646172	25 %	25 %	25 %	25 %	537435925
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11258	NC_022221	TTA	2	6	646342	646347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435926
11259	NC_022221	GGC	2	6	646415	646420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435926
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11264	NC_022221	A	7	7	646659	646665	100 %	0 %	0 %	0 %	537435926
11265	NC_022221	TCAA	2	8	646695	646702	50 %	25 %	0 %	25 %	537435926
11266	NC_022221	A	6	6	646775	646780	100 %	0 %	0 %	0 %	537435926
11267	NC_022221	GCG	2	6	646786	646791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435926
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11272	NC_022221	TCG	2	6	647022	647027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435927
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11284	NC_022221	A	7	7	647632	647638	100 %	0 %	0 %	0 %	537435928
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11350	NC_022221	TG	3	6	650930	650935	0 %	50 %	50 %	0 %	537435931
11351	NC_022221	GGT	2	6	650965	650970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435931
11352	NC_022221	CGG	2	6	651073	651078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435931
11353	NC_022221	TGG	2	6	651141	651146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435931
11354	NC_022221	CTG	2	6	651193	651198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435931
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11357	NC_022221	AACGC	2	10	651315	651324	40 %	0 %	20 %	40 %	537435931
11358	NC_022221	GAT	2	6	651334	651339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435931
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11360	NC_022221	GTTG	2	8	651422	651429	0 %	50 %	50 %	0 %	537435931
11361	NC_022221	GCG	2	6	651432	651437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435931
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11364	NC_022221	TGG	2	6	651489	651494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435931
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11481	NC_022221	GCA	2	6	659522	659527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435937
11482	NC_022221	CCA	2	6	659573	659578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435937
11483	NC_022221	GC	3	6	659600	659605	0 %	0 %	50 %	50 %	537435937
11484	NC_022221	CTTG	2	8	659659	659666	0 %	50 %	25 %	25 %	537435937
11485	NC_022221	GC	3	6	659990	659995	0 %	0 %	50 %	50 %	537435938
11486	NC_022221	GCG	2	6	660002	660007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435938
11487	NC_022221	TAT	2	6	660077	660082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435938
11488	NC_022221	CG	3	6	660231	660236	0 %	0 %	50 %	50 %	537435938
11489	NC_022221	GCA	2	6	660266	660271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435938
11490	NC_022221	TGT	2	6	660276	660281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435938
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11492	NC_022221	GCC	2	6	660370	660375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435938
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11494	NC_022221	GCG	2	6	660417	660422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435938
11495	NC_022221	CGG	3	9	660457	660465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435938
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11500	NC_022221	ATG	2	6	660575	660580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435938

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