MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022221	CGGCCA	2	12	606822	606833	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537435890
10502	NC_022221	CAG	2	6	606855	606860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435890
10503	NC_022221	TCT	2	6	606893	606898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435890
10504	NC_022221	GTC	2	6	606900	606905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435890
10505	NC_022221	CGCGC	2	10	606951	606960	0 %	0 %	40 %	60 %	537435890
10506	NC_022221	GCC	2	6	607068	607073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435890
10507	NC_022221	T	6	6	607167	607172	0 %	100 %	0 %	0 %	537435890
10508	NC_022221	CAG	2	6	607251	607256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435890
10509	NC_022221	GCG	2	6	607270	607275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435890
10510	NC_022221	GAT	2	6	607332	607337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435890
10511	NC_022221	CG	3	6	607349	607354	0 %	0 %	50 %	50 %	537435890
10512	NC_022221	CAA	2	6	607374	607379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435890
10513	NC_022221	GTT	2	6	607407	607412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435890
10514	NC_022221	TAA	2	6	607418	607423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435890
10515	NC_022221	CCG	2	6	607538	607543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435890
10516	NC_022221	CTT	2	6	607850	607855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435890
10517	NC_022221	CTT	2	6	607871	607876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435890
10518	NC_022221	CTCGAT	2	12	608905	608916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	537435891
10519	NC_022221	CTG	2	6	608917	608922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435891
10520	NC_022221	CGC	2	6	608958	608963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435891
10521	NC_022221	GGC	4	12	608964	608975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435891
10522	NC_022221	GTCA	2	8	608998	609005	25 %	25 %	25 %	25 %	537435891
10523	NC_022221	CGCC	2	8	609048	609055	0 %	0 %	25 %	75 %	537435891
10524	NC_022221	ATG	2	6	609128	609133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435891
10525	NC_022221	TCA	2	6	609142	609147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435891
10526	NC_022221	TGA	2	6	609192	609197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435891
10527	NC_022221	T	6	6	609219	609224	0 %	100 %	0 %	0 %	537435891
10528	NC_022221	AACGC	2	10	609278	609287	40 %	0 %	20 %	40 %	537435891
10529	NC_022221	TGG	2	6	609293	609298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435891
10530	NC_022221	TGG	2	6	609326	609331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435891
10531	NC_022221	GAC	2	6	609333	609338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435891
10532	NC_022221	AACC	2	8	609340	609347	50 %	0 %	0 %	50 %	537435891
10533	NC_022221	CCCA	2	8	609382	609389	25 %	0 %	0 %	75 %	537435891
10534	NC_022221	CTG	2	6	609445	609450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435891
10535	NC_022221	GGC	2	6	609512	609517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435891
10536	NC_022221	CGG	2	6	609542	609547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435891
10537	NC_022221	CG	3	6	609550	609555	0 %	0 %	50 %	50 %	537435891
10538	NC_022221	ATG	2	6	609598	609603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435891
10539	NC_022221	TGT	2	6	609668	609673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435891
10540	NC_022221	GAT	2	6	609778	609783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435891
10541	NC_022221	TGG	2	6	609791	609796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435891
10542	NC_022221	A	6	6	609976	609981	100 %	0 %	0 %	0 %	537435892
10543	NC_022221	A	6	6	610016	610021	100 %	0 %	0 %	0 %	537435892
10544	NC_022221	TTG	2	6	610031	610036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435892
10545	NC_022221	TCA	2	6	610472	610477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435893
10546	NC_022221	TCTT	2	8	610492	610499	0 %	75 %	0 %	25 %	537435893
10547	NC_022221	TGC	2	6	610518	610523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435893
10548	NC_022221	GGTT	2	8	610539	610546	0 %	50 %	50 %	0 %	537435893
10549	NC_022221	CG	3	6	610563	610568	0 %	0 %	50 %	50 %	537435893
10550	NC_022221	TCGG	2	8	610605	610612	0 %	25 %	50 %	25 %	537435893
10551	NC_022221	CCGC	2	8	610615	610622	0 %	0 %	25 %	75 %	537435893
10552	NC_022221	TTC	2	6	610659	610664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435893
10553	NC_022221	ATTTTT	2	12	610752	610763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	537435893
10554	NC_022221	CTGG	2	8	610770	610777	0 %	25 %	50 %	25 %	537435893
10555	NC_022221	TGGAC	2	10	610807	610816	20 %	20 %	40 %	20 %	537435893
10556	NC_022221	CG	3	6	610820	610825	0 %	0 %	50 %	50 %	537435893
10557	NC_022221	CGC	2	6	610830	610835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435893
10558	NC_022221	TGC	2	6	611085	611090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435894
10559	NC_022221	TGC	2	6	611152	611157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435894
10560	NC_022221	TGG	3	9	611185	611193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435894
10561	NC_022221	CGG	2	6	611294	611299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435894
10562	NC_022221	CCG	2	6	611373	611378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435894
10563	NC_022221	TGC	3	9	611407	611415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435894
10564	NC_022221	GTG	2	6	611454	611459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435894
10565	NC_022221	ATC	2	6	611703	611708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435895
10566	NC_022221	TGA	2	6	611710	611715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435895
10567	NC_022221	GTT	2	6	611792	611797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435895
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10569	NC_022221	CGC	2	6	611923	611928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435895
10570	NC_022221	ACC	2	6	611946	611951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435895
10571	NC_022221	CAT	2	6	612118	612123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435895
10572	NC_022221	GC	4	8	612170	612177	0 %	0 %	50 %	50 %	537435895
10573	NC_022221	ACC	2	6	612315	612320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435895
10574	NC_022221	TAT	2	6	612343	612348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435895
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10576	NC_022221	TCG	2	6	612372	612377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435895
10577	NC_022221	CAC	2	6	612401	612406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435895
10578	NC_022221	A	6	6	612417	612422	100 %	0 %	0 %	0 %	537435895
10579	NC_022221	GCGA	2	8	612426	612433	25 %	0 %	50 %	25 %	537435895
10580	NC_022221	ACCG	2	8	612461	612468	25 %	0 %	25 %	50 %	537435895
10581	NC_022221	GGT	2	6	612482	612487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435895
10582	NC_022221	CTG	2	6	612605	612610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435895
10583	NC_022221	TCT	2	6	612654	612659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435895
10584	NC_022221	ACCG	2	8	612668	612675	25 %	0 %	25 %	50 %	537435895
10585	NC_022221	TGG	2	6	612693	612698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435895
10586	NC_022221	CGG	2	6	612742	612747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435895
10587	NC_022221	CG	3	6	612765	612770	0 %	0 %	50 %	50 %	537435895
10588	NC_022221	CTG	2	6	612782	612787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435895
10589	NC_022221	GC	3	6	612934	612939	0 %	0 %	50 %	50 %	537435895
10590	NC_022221	ACGT	2	8	612957	612964	25 %	25 %	25 %	25 %	537435895
10591	NC_022221	ACTTTG	2	12	612993	613004	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	537435895
10592	NC_022221	GCG	3	9	613017	613025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435895
10593	NC_022221	TTC	2	6	613086	613091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435895
10594	NC_022221	CGC	3	9	613149	613157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435895
10595	NC_022221	TGG	2	6	613254	613259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435895
10596	NC_022221	CGA	2	6	613263	613268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435895
10597	NC_022221	TAC	2	6	613283	613288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435895
10598	NC_022221	GCA	2	6	613302	613307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435895
10599	NC_022221	GCA	2	6	613354	613359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435895
10600	NC_022221	GTA	2	6	613413	613418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435895
10601	NC_022221	CAA	2	6	613465	613470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435896
10602	NC_022221	CAC	2	6	613531	613536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435896
10603	NC_022221	GCG	2	6	613552	613557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435896
10604	NC_022221	AGC	2	6	613586	613591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435896
10605	NC_022221	GCGA	2	8	613648	613655	25 %	0 %	50 %	25 %	537435896
10606	NC_022221	CGGT	2	8	613700	613707	0 %	25 %	50 %	25 %	537435896
10607	NC_022221	GTG	2	6	613735	613740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435896
10608	NC_022221	A	7	7	613781	613787	100 %	0 %	0 %	0 %	537435896
10609	NC_022221	GAC	2	6	613809	613814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435896
10610	NC_022221	GCT	2	6	613833	613838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435896
10611	NC_022221	CTG	2	6	613845	613850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435896
10612	NC_022221	ATG	2	6	613879	613884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435896
10613	NC_022221	TGA	2	6	613887	613892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435896
10614	NC_022221	ACT	2	6	613932	613937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435896
10615	NC_022221	CTGG	2	8	614021	614028	0 %	25 %	50 %	25 %	537435897
10616	NC_022221	GC	3	6	614059	614064	0 %	0 %	50 %	50 %	537435897
10617	NC_022221	GCG	3	9	614134	614142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435897
10618	NC_022221	CTG	2	6	614208	614213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435897
10619	NC_022221	CTG	2	6	614256	614261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435897
10620	NC_022221	AAC	2	6	614266	614271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435897
10621	NC_022221	CTG	2	6	614280	614285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435897
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10980	NC_022221	GC	3	6	633135	633140	0 %	0 %	50 %	50 %	537435912
10981	NC_022221	ATGA	2	8	633182	633189	50 %	25 %	25 %	0 %	537435912
10982	NC_022221	GGTCT	2	10	633194	633203	0 %	40 %	40 %	20 %	537435912
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10984	NC_022221	TGG	2	6	633224	633229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435912
10985	NC_022221	CGT	2	6	633316	633321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435912
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10988	NC_022221	GCA	2	6	633478	633483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435912
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