MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022221	GTG	2	6	578573	578578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435862
10002	NC_022221	TCG	2	6	578611	578616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435862
10003	NC_022221	TTA	2	6	578653	578658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435862
10004	NC_022221	AAAAT	2	10	580165	580174	80 %	20 %	0 %	0 %	537435863
10005	NC_022221	AAAT	2	8	580192	580199	75 %	25 %	0 %	0 %	537435863
10006	NC_022221	GAA	2	6	580212	580217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435863
10007	NC_022221	CTG	2	6	580239	580244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435863
10008	NC_022221	AGC	2	6	580248	580253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435863
10009	NC_022221	TG	3	6	580293	580298	0 %	50 %	50 %	0 %	537435863
10010	NC_022221	CGG	2	6	580322	580327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435863
10011	NC_022221	A	7	7	580365	580371	100 %	0 %	0 %	0 %	537435863
10012	NC_022221	CCTG	2	8	580393	580400	0 %	25 %	25 %	50 %	537435863
10013	NC_022221	GGT	2	6	580472	580477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435863
10014	NC_022221	AAG	2	6	580495	580500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435863
10015	NC_022221	TGG	2	6	580537	580542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435863
10016	NC_022221	A	6	6	580688	580693	100 %	0 %	0 %	0 %	537435863
10017	NC_022221	GCC	2	6	580716	580721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435863
10018	NC_022221	CGG	2	6	580752	580757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435863
10019	NC_022221	CTG	2	6	580788	580793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435863
10020	NC_022221	ATC	2	6	580822	580827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435863
10021	NC_022221	CGG	2	6	580835	580840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435863
10022	NC_022221	TGAA	2	8	580882	580889	50 %	25 %	25 %	0 %	537435863
10023	NC_022221	CAC	2	6	580893	580898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435863
10024	NC_022221	ATC	2	6	580953	580958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435863
10025	NC_022221	TG	3	6	581097	581102	0 %	50 %	50 %	0 %	537435863
10026	NC_022221	CGA	2	6	581108	581113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435863
10027	NC_022221	TGG	2	6	581152	581157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435863
10028	NC_022221	GTC	2	6	581170	581175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435863
10029	NC_022221	CAA	2	6	581352	581357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435864
10030	NC_022221	CAG	2	6	581365	581370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435864
10031	NC_022221	GCG	2	6	581387	581392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435864
10032	NC_022221	GAA	2	6	581399	581404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435864
10033	NC_022221	CTG	2	6	581412	581417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435864
10034	NC_022221	ATG	2	6	581418	581423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435864
10035	NC_022221	GGC	2	6	581430	581435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435864
10036	NC_022221	TTAT	2	8	581451	581458	25 %	75 %	0 %	0 %	537435864
10037	NC_022221	AGC	2	6	581478	581483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435864
10038	NC_022221	CGG	2	6	581491	581496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435864
10039	NC_022221	CGA	2	6	581539	581544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435864
10040	NC_022221	TGGC	2	8	581645	581652	0 %	25 %	50 %	25 %	537435864
10041	NC_022221	TA	3	6	581740	581745	50 %	50 %	0 %	0 %	537435864
10042	NC_022221	GCGAAT	2	12	581809	581820	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	537435864
10043	NC_022221	GCGG	2	8	581868	581875	0 %	0 %	75 %	25 %	537435864
10044	NC_022221	CGC	2	6	582043	582048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435864
10045	NC_022221	ATT	2	6	582051	582056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435864
10046	NC_022221	TGA	2	6	582217	582222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435864
10047	NC_022221	CCG	2	6	582238	582243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435864
10048	NC_022221	GGCG	2	8	582299	582306	0 %	0 %	75 %	25 %	537435864
10049	NC_022221	CGG	3	9	582341	582349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435864
10050	NC_022221	TTG	2	6	582381	582386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435864
10051	NC_022221	TTTA	2	8	582430	582437	25 %	75 %	0 %	0 %	537435864
10052	NC_022221	ATCG	2	8	582556	582563	25 %	25 %	25 %	25 %	537435864
10053	NC_022221	GTTG	2	8	582656	582663	0 %	50 %	50 %	0 %	537435864
10054	NC_022221	GCG	2	6	582798	582803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435865
10055	NC_022221	TTA	2	6	582830	582835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435865
10056	NC_022221	TGA	2	6	582876	582881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435865
10057	NC_022221	GGC	2	6	582886	582891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435865
10058	NC_022221	CGCTGG	2	12	582900	582911	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435865
10059	NC_022221	GC	3	6	582965	582970	0 %	0 %	50 %	50 %	537435865
10060	NC_022221	GCC	2	6	582977	582982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435865
10061	NC_022221	CGG	2	6	583008	583013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435865
10062	NC_022221	CG	3	6	583088	583093	0 %	0 %	50 %	50 %	537435865
10063	NC_022221	GCG	2	6	583114	583119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435865
10064	NC_022221	TG	4	8	583131	583138	0 %	50 %	50 %	0 %	537435865
10065	NC_022221	CGC	2	6	583146	583151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435865
10066	NC_022221	GCC	2	6	583210	583215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435865
10067	NC_022221	ATC	2	6	583230	583235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435865
10068	NC_022221	GAT	2	6	583250	583255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435865
10069	NC_022221	GCC	2	6	583437	583442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435866
10070	NC_022221	TTA	2	6	583505	583510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435866
10071	NC_022221	GTAT	2	8	583625	583632	25 %	50 %	25 %	0 %	537435867
10072	NC_022221	GAA	2	6	583633	583638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435867
10073	NC_022221	CGG	2	6	583680	583685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435867
10074	NC_022221	CGC	2	6	583693	583698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435867
10075	NC_022221	ACC	2	6	583730	583735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435867
10076	NC_022221	TCA	2	6	583748	583753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435867
10077	NC_022221	A	7	7	583880	583886	100 %	0 %	0 %	0 %	537435867
10078	NC_022221	ATT	2	6	583895	583900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435867
10079	NC_022221	CT	3	6	583907	583912	0 %	50 %	0 %	50 %	537435867
10080	NC_022221	CGG	2	6	583962	583967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435867
10081	NC_022221	GAAAG	2	10	584023	584032	60 %	0 %	40 %	0 %	537435867
10082	NC_022221	TGC	2	6	584043	584048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435867
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10084	NC_022221	CCG	2	6	584148	584153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435867
10085	NC_022221	GTC	2	6	584154	584159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435867
10086	NC_022221	CGC	2	6	584185	584190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435867
10087	NC_022221	AGC	2	6	584208	584213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435867
10088	NC_022221	A	6	6	584258	584263	100 %	0 %	0 %	0 %	537435867
10089	NC_022221	GACGG	2	10	584273	584282	20 %	0 %	60 %	20 %	537435867
10090	NC_022221	TGT	2	6	585617	585622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435868
10091	NC_022221	GTG	2	6	585685	585690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435868
10092	NC_022221	TCG	2	6	585710	585715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435868
10093	NC_022221	ACC	2	6	585772	585777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435868
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10096	NC_022221	AGAT	2	8	585875	585882	50 %	25 %	25 %	0 %	537435868
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10099	NC_022221	GGC	2	6	585990	585995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435868
10100	NC_022221	CGG	2	6	586030	586035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435868
10101	NC_022221	GAT	2	6	586050	586055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435868
10102	NC_022221	GCT	2	6	586122	586127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435868
10103	NC_022221	GTC	2	6	586141	586146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435868
10104	NC_022221	ACC	2	6	586228	586233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435868
10105	NC_022221	TGC	2	6	586247	586252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435868
10106	NC_022221	CTTG	2	8	586254	586261	0 %	50 %	25 %	25 %	537435868
10107	NC_022221	CTG	2	6	586332	586337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435869
10108	NC_022221	GTT	2	6	586382	586387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435869
10109	NC_022221	GGT	2	6	586397	586402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435869
10110	NC_022221	TCT	2	6	586412	586417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435869
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10112	NC_022221	CGC	2	6	586504	586509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435869
10113	NC_022221	GTAC	2	8	586511	586518	25 %	25 %	25 %	25 %	537435869
10114	NC_022221	TCT	2	6	586574	586579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435869
10115	NC_022221	TTCG	2	8	586672	586679	0 %	50 %	25 %	25 %	537435869
10116	NC_022221	ATT	2	6	586746	586751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435869
10117	NC_022221	TGCC	2	8	586777	586784	0 %	25 %	25 %	50 %	537435869
10118	NC_022221	TGC	2	6	586807	586812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435869
10119	NC_022221	TTG	2	6	586851	586856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435869
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10363	NC_022221	CGG	2	6	599953	599958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435883
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