MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_022221	CGGTG	2	10	514283	514292	0 %	20 %	60 %	20 %	537435805
9002	NC_022221	CTG	2	6	514326	514331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435805
9003	NC_022221	ACC	2	6	514339	514344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435805
9004	NC_022221	GCG	2	6	514542	514547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435805
9005	NC_022221	A	6	6	514548	514553	100 %	0 %	0 %	0 %	537435805
9006	NC_022221	GTG	2	6	514587	514592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435805
9007	NC_022221	CAG	2	6	514624	514629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435805
9008	NC_022221	CCA	2	6	514637	514642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435805
9009	NC_022221	CGG	2	6	514657	514662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435805
9010	NC_022221	GCA	2	6	514774	514779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435805
9011	NC_022221	CAA	2	6	514790	514795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435805
9012	NC_022221	CAG	2	6	514827	514832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435805
9013	NC_022221	TTCCTG	2	12	514964	514975	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	537435806
9014	NC_022221	AAT	2	6	515000	515005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435806
9015	NC_022221	CGC	2	6	515027	515032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435806
9016	NC_022221	GCAG	2	8	515073	515080	25 %	0 %	50 %	25 %	537435806
9017	NC_022221	GTT	2	6	515188	515193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435806
9018	NC_022221	CAGC	2	8	515239	515246	25 %	0 %	25 %	50 %	537435806
9019	NC_022221	ATT	2	6	515282	515287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435807
9020	NC_022221	ACGA	2	8	515334	515341	50 %	0 %	25 %	25 %	537435807
9021	NC_022221	GA	3	6	515343	515348	50 %	0 %	50 %	0 %	537435807
9022	NC_022221	AGC	2	6	515398	515403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435807
9023	NC_022221	AT	3	6	515476	515481	50 %	50 %	0 %	0 %	537435807
9024	NC_022221	CTT	2	6	515558	515563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435807
9025	NC_022221	TTC	2	6	515616	515621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435807
9026	NC_022221	A	6	6	516156	516161	100 %	0 %	0 %	0 %	537435808
9027	NC_022221	TGGCT	2	10	516263	516272	0 %	40 %	40 %	20 %	537435808
9028	NC_022221	GCC	2	6	516311	516316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435808
9029	NC_022221	ATG	2	6	516343	516348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435808
9030	NC_022221	AATG	2	8	516355	516362	50 %	25 %	25 %	0 %	537435808
9031	NC_022221	TGC	2	6	516395	516400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435808
9032	NC_022221	GC	4	8	516458	516465	0 %	0 %	50 %	50 %	537435808
9033	NC_022221	CCAA	2	8	516482	516489	50 %	0 %	0 %	50 %	537435808
9034	NC_022221	CTT	2	6	516597	516602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435808
9035	NC_022221	GGCACC	2	12	516604	516615	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537435808
9036	NC_022221	TTG	2	6	516629	516634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435808
9037	NC_022221	TAT	2	6	516682	516687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435808
9038	NC_022221	GAT	2	6	516696	516701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435808
9039	NC_022221	TTTG	2	8	517040	517047	0 %	75 %	25 %	0 %	537435808
9040	NC_022221	TGCG	2	8	517142	517149	0 %	25 %	50 %	25 %	537435808
9041	NC_022221	GT	3	6	517186	517191	0 %	50 %	50 %	0 %	537435808
9042	NC_022221	GCT	3	9	517287	517295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435808
9043	NC_022221	AT	3	6	517377	517382	50 %	50 %	0 %	0 %	537435808
9044	NC_022221	TAA	2	6	517395	517400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435808
9045	NC_022221	GCTG	2	8	517508	517515	0 %	25 %	50 %	25 %	537435808
9046	NC_022221	GAC	2	6	517584	517589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435808
9047	NC_022221	TGC	2	6	517598	517603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435808
9048	NC_022221	GCGCG	2	10	517632	517641	0 %	0 %	60 %	40 %	537435808
9049	NC_022221	CGA	2	6	517716	517721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435808
9050	NC_022221	ATG	2	6	517729	517734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435808
9051	NC_022221	CGG	2	6	517835	517840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435808
9052	NC_022221	GCT	2	6	517881	517886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435808
9053	NC_022221	TCA	2	6	517952	517957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435808
9054	NC_022221	GAA	2	6	517969	517974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435808
9055	NC_022221	TC	3	6	517982	517987	0 %	50 %	0 %	50 %	537435808
9056	NC_022221	TGA	2	6	518049	518054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435808
9057	NC_022221	CAT	2	6	518106	518111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435808
9058	NC_022221	GTT	2	6	518123	518128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435808
9059	NC_022221	GAT	2	6	518163	518168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435808
9060	NC_022221	AGCGAA	2	12	518190	518201	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	537435808
9061	NC_022221	CGT	2	6	518211	518216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435808
9062	NC_022221	TTG	2	6	518225	518230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435808
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9064	NC_022221	AAT	2	6	518501	518506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435809
9065	NC_022221	GA	3	6	518569	518574	50 %	0 %	50 %	0 %	537435809
9066	NC_022221	CAT	2	6	518600	518605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435809
9067	NC_022221	AGA	2	6	518701	518706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435809
9068	NC_022221	AACC	2	8	518745	518752	50 %	0 %	0 %	50 %	537435809
9069	NC_022221	CGC	2	6	518813	518818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435809
9070	NC_022221	GAA	2	6	518870	518875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435809
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9072	NC_022221	CGC	2	6	519065	519070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435809
9073	NC_022221	ACA	2	6	519202	519207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435809
9074	NC_022221	GAA	3	9	519305	519313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435809
9075	NC_022221	GAA	2	6	519437	519442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435809
9076	NC_022221	T	7	7	519496	519502	0 %	100 %	0 %	0 %	537435809
9077	NC_022221	GCT	2	6	519509	519514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435809
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9080	NC_022221	TGA	2	6	521227	521232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435810
9081	NC_022221	GAT	2	6	521258	521263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435810
9082	NC_022221	GAT	2	6	521327	521332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435810
9083	NC_022221	CCA	2	6	521349	521354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435810
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9085	NC_022221	AGT	2	6	521420	521425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435810
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9087	NC_022221	GCC	2	6	521524	521529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435810
9088	NC_022221	GCC	2	6	521706	521711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435811
9089	NC_022221	TCT	2	6	521745	521750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435811
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9091	NC_022221	CG	3	6	521847	521852	0 %	0 %	50 %	50 %	537435811
9092	NC_022221	TTCA	2	8	521858	521865	25 %	50 %	0 %	25 %	537435811
9093	NC_022221	CGG	2	6	521890	521895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435811
9094	NC_022221	CGC	2	6	521930	521935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435811
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9096	NC_022221	GCG	2	6	521992	521997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435811
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9098	NC_022221	TGA	2	6	522084	522089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435811
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9100	NC_022221	GCG	2	6	522226	522231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435811
9101	NC_022221	TCGGGA	2	12	522234	522245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	537435811
9102	NC_022221	TGG	2	6	522373	522378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435811
9103	NC_022221	GAT	2	6	522380	522385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435811
9104	NC_022221	TCA	2	6	522390	522395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435811
9105	NC_022221	A	6	6	522405	522410	100 %	0 %	0 %	0 %	537435811
9106	NC_022221	CGG	3	9	522452	522460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435811
9107	NC_022221	ATT	2	6	522467	522472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435811
9108	NC_022221	CG	3	6	522506	522511	0 %	0 %	50 %	50 %	537435811
9109	NC_022221	GCA	2	6	522514	522519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435811
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9111	NC_022221	CGA	2	6	522612	522617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435811
9112	NC_022221	TG	3	6	522626	522631	0 %	50 %	50 %	0 %	537435811
9113	NC_022221	AATA	2	8	522683	522690	75 %	25 %	0 %	0 %	537435812
9114	NC_022221	ACC	2	6	522959	522964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435813
9115	NC_022221	TGGG	2	8	522976	522983	0 %	25 %	75 %	0 %	537435813
9116	NC_022221	CGC	2	6	523002	523007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435813
9117	NC_022221	GC	3	6	523027	523032	0 %	0 %	50 %	50 %	537435813
9118	NC_022221	CAC	2	6	523056	523061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435813
9119	NC_022221	TCG	2	6	523136	523141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435813
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9121	NC_022221	GCA	2	6	523161	523166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435813
9122	NC_022221	CGCA	2	8	523314	523321	25 %	0 %	25 %	50 %	537435813
9123	NC_022221	CAT	2	6	523332	523337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435813
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9232	NC_022221	CAAAC	2	10	529737	529746	60 %	0 %	0 %	40 %	537435818
9233	NC_022221	T	7	7	529756	529762	0 %	100 %	0 %	0 %	537435818
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9241	NC_022221	TTC	2	6	530107	530112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435818
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9243	NC_022221	ACGCCA	2	12	530255	530266	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	537435818
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9487	NC_022221	A	6	6	550365	550370	100 %	0 %	0 %	0 %	537435834
9488	NC_022221	GCA	2	6	550434	550439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435834
9489	NC_022221	GC	4	8	550460	550467	0 %	0 %	50 %	50 %	537435834
9490	NC_022221	GC	3	6	550507	550512	0 %	0 %	50 %	50 %	537435834
9491	NC_022221	A	6	6	550538	550543	100 %	0 %	0 %	0 %	537435834
9492	NC_022221	GCC	2	6	550561	550566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435834
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9494	NC_022221	GCG	2	6	550611	550616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435834
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