MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_022221	TTC	2	6	428141	428146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435726
7502	NC_022221	ATA	2	6	428151	428156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435726
7503	NC_022221	CGT	2	6	428160	428165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435726
7504	NC_022221	TTCAG	2	10	428166	428175	20 %	40 %	20 %	20 %	537435726
7505	NC_022221	TCG	2	6	428196	428201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435726
7506	NC_022221	TTA	2	6	428205	428210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435726
7507	NC_022221	TCAA	2	8	428238	428245	50 %	25 %	0 %	25 %	537435726
7508	NC_022221	CCG	2	6	428260	428265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435726
7509	NC_022221	CGTT	2	8	428280	428287	0 %	50 %	25 %	25 %	537435726
7510	NC_022221	TTCT	2	8	428306	428313	0 %	75 %	0 %	25 %	537435726
7511	NC_022221	AT	3	6	428316	428321	50 %	50 %	0 %	0 %	537435726
7512	NC_022221	TAT	2	6	428525	428530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435727
7513	NC_022221	GCG	2	6	428550	428555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435727
7514	NC_022221	GAC	2	6	428559	428564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435727
7515	NC_022221	CCAG	2	8	428571	428578	25 %	0 %	25 %	50 %	537435727
7516	NC_022221	GCG	2	6	428579	428584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435727
7517	NC_022221	ATC	2	6	428674	428679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435727
7518	NC_022221	GCC	2	6	428728	428733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435727
7519	NC_022221	CTC	2	6	428773	428778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435727
7520	NC_022221	GCA	2	6	428829	428834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435727
7521	NC_022221	CAG	2	6	428851	428856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435727
7522	NC_022221	GTA	2	6	428863	428868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435727
7523	NC_022221	CTTCG	2	10	429094	429103	0 %	40 %	20 %	40 %	537435727
7524	NC_022221	CAC	2	6	429151	429156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435727
7525	NC_022221	ATT	2	6	429164	429169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435727
7526	NC_022221	TGA	2	6	429203	429208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435728
7527	NC_022221	CGGAG	2	10	429270	429279	20 %	0 %	60 %	20 %	537435728
7528	NC_022221	CGC	2	6	429299	429304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435728
7529	NC_022221	GGTAC	2	10	429312	429321	20 %	20 %	40 %	20 %	537435728
7530	NC_022221	CGG	2	6	429344	429349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435728
7531	NC_022221	GAC	2	6	429385	429390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435728
7532	NC_022221	ATTA	2	8	429393	429400	50 %	50 %	0 %	0 %	537435728
7533	NC_022221	CG	3	6	429425	429430	0 %	0 %	50 %	50 %	537435728
7534	NC_022221	GCC	3	9	429447	429455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435728
7535	NC_022221	GAT	2	6	429539	429544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435728
7536	NC_022221	CTTCC	2	10	429555	429564	0 %	40 %	0 %	60 %	537435728
7537	NC_022221	AAT	2	6	429600	429605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435728
7538	NC_022221	GAT	2	6	429693	429698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435728
7539	NC_022221	CCG	2	6	429773	429778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435728
7540	NC_022221	CGC	2	6	429782	429787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435728
7541	NC_022221	GC	3	6	429794	429799	0 %	0 %	50 %	50 %	537435728
7542	NC_022221	GCAG	2	8	429809	429816	25 %	0 %	50 %	25 %	537435728
7543	NC_022221	GGC	2	6	429843	429848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435728
7544	NC_022221	CCA	2	6	429938	429943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435728
7545	NC_022221	CGT	2	6	429959	429964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435728
7546	NC_022221	GCG	2	6	430098	430103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435728
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7549	NC_022221	T	8	8	430310	430317	0 %	100 %	0 %	0 %	537435729
7550	NC_022221	GCT	2	6	430332	430337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435729
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7552	NC_022221	CTG	2	6	430726	430731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435730
7553	NC_022221	A	7	7	430819	430825	100 %	0 %	0 %	0 %	537435730
7554	NC_022221	GC	3	6	430845	430850	0 %	0 %	50 %	50 %	537435730
7555	NC_022221	ATG	2	6	430861	430866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435730
7556	NC_022221	GC	3	6	430892	430897	0 %	0 %	50 %	50 %	537435730
7557	NC_022221	TGA	2	6	430977	430982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435730
7558	NC_022221	TCG	2	6	430997	431002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435730
7559	NC_022221	CGG	2	6	431019	431024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435730
7560	NC_022221	CTG	2	6	431047	431052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435730
7561	NC_022221	A	6	6	431053	431058	100 %	0 %	0 %	0 %	537435730
7562	NC_022221	AGC	2	6	431068	431073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435730
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7564	NC_022221	CGC	2	6	431094	431099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435730
7565	NC_022221	GCG	2	6	431113	431118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435730
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7570	NC_022221	TAC	2	6	431564	431569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435731
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7572	NC_022221	TAT	2	6	431610	431615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435731
7573	NC_022221	GCG	2	6	431618	431623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435731
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7577	NC_022221	GGCT	2	8	431668	431675	0 %	25 %	50 %	25 %	537435731
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7580	NC_022221	CGG	2	6	431747	431752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435731
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7591	NC_022221	GGC	3	9	432294	432302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435731
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7593	NC_022221	GCT	2	6	432342	432347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435731
7594	NC_022221	ATCGA	2	10	432388	432397	40 %	20 %	20 %	20 %	537435731
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7603	NC_022221	CT	3	6	432731	432736	0 %	50 %	0 %	50 %	537435732
7604	NC_022221	GAC	2	6	432755	432760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435732
7605	NC_022221	CT	3	6	432796	432801	0 %	50 %	0 %	50 %	537435732
7606	NC_022221	AT	3	6	432844	432849	50 %	50 %	0 %	0 %	537435732
7607	NC_022221	TGC	2	6	432888	432893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435732
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7609	NC_022221	GT	3	6	433007	433012	0 %	50 %	50 %	0 %	537435732
7610	NC_022221	GT	3	6	433027	433032	0 %	50 %	50 %	0 %	537435732
7611	NC_022221	GC	3	6	433483	433488	0 %	0 %	50 %	50 %	537435733
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7618	NC_022221	CAC	2	6	433702	433707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435733
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7622	NC_022221	GC	4	8	434003	434010	0 %	0 %	50 %	50 %	537435734
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7987	NC_022221	GCT	2	6	456325	456330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435749
7988	NC_022221	TTG	2	6	456351	456356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435749
7989	NC_022221	ATG	2	6	456417	456422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435749
7990	NC_022221	GCG	2	6	456525	456530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435749
7991	NC_022221	CGTA	2	8	456550	456557	25 %	25 %	25 %	25 %	537435749
7992	NC_022221	GCT	2	6	456575	456580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435749
7993	NC_022221	CGC	2	6	456599	456604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435749
7994	NC_022221	A	6	6	456629	456634	100 %	0 %	0 %	0 %	537435749
7995	NC_022221	CG	3	6	456646	456651	0 %	0 %	50 %	50 %	537435749
7996	NC_022221	GC	3	6	456715	456720	0 %	0 %	50 %	50 %	537435749
7997	NC_022221	CGC	2	6	456776	456781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435749
7998	NC_022221	CGG	2	6	456816	456821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435749
7999	NC_022221	GCC	2	6	456911	456916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435749
8000	NC_022221	CGG	2	6	456967	456972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435749

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