MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
77001	NC_022221	T	7	7	4444149	4444155	0 %	100 %	0 %	0 %	537439521
77002	NC_022221	GCA	2	6	4444183	4444188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439521
77003	NC_022221	GC	3	6	4444213	4444218	0 %	0 %	50 %	50 %	537439521
77004	NC_022221	CGG	2	6	4444286	4444291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439521
77005	NC_022221	TA	3	6	4444775	4444780	50 %	50 %	0 %	0 %	537439522
77006	NC_022221	GA	3	6	4444836	4444841	50 %	0 %	50 %	0 %	537439522
77007	NC_022221	AGC	2	6	4444844	4444849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439522
77008	NC_022221	TCT	2	6	4445009	4445014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439523
77009	NC_022221	CCA	2	6	4445109	4445114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537439523
77010	NC_022221	GCA	2	6	4445169	4445174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439523
77011	NC_022221	CAT	2	6	4445179	4445184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439523
77012	NC_022221	GCC	2	6	4445188	4445193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439523
77013	NC_022221	CGT	2	6	4445250	4445255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439523
77014	NC_022221	GCC	2	6	4445266	4445271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439523
77015	NC_022221	CCAG	2	8	4445277	4445284	25 %	0 %	25 %	50 %	537439523
77016	NC_022221	CG	3	6	4445295	4445300	0 %	0 %	50 %	50 %	537439523
77017	NC_022221	TCA	2	6	4445352	4445357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439523
77018	NC_022221	CGA	2	6	4445379	4445384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439523
77019	NC_022221	ATTC	2	8	4445394	4445401	25 %	50 %	0 %	25 %	537439523
77020	NC_022221	CGCC	2	8	4445421	4445428	0 %	0 %	25 %	75 %	537439523
77021	NC_022221	CGC	2	6	4445499	4445504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439523
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77023	NC_022221	GAT	2	6	4445569	4445574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439523
77024	NC_022221	AC	3	6	4445593	4445598	50 %	0 %	0 %	50 %	537439523
77025	NC_022221	TTC	2	6	4445633	4445638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439523
77026	NC_022221	GAT	2	6	4445671	4445676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439523
77027	NC_022221	CG	3	6	4445682	4445687	0 %	0 %	50 %	50 %	537439523
77028	NC_022221	AGA	2	6	4445695	4445700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439523
77029	NC_022221	CTTG	2	8	4445751	4445758	0 %	50 %	25 %	25 %	537439523
77030	NC_022221	CGCC	2	8	4445766	4445773	0 %	0 %	25 %	75 %	537439523
77031	NC_022221	GC	3	6	4445775	4445780	0 %	0 %	50 %	50 %	537439523
77032	NC_022221	CCA	2	6	4445787	4445792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537439523
77033	NC_022221	ATC	2	6	4445803	4445808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439523
77034	NC_022221	GTC	2	6	4445818	4445823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439523
77035	NC_022221	TGT	2	6	4445859	4445864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439523
77036	NC_022221	TGA	2	6	4445928	4445933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439523
77037	NC_022221	GA	3	6	4446026	4446031	50 %	0 %	50 %	0 %	537439523
77038	NC_022221	GCT	2	6	4446042	4446047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439523
77039	NC_022221	GGCG	2	8	4446091	4446098	0 %	0 %	75 %	25 %	537439523
77040	NC_022221	CGA	2	6	4446114	4446119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439523
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77042	NC_022221	TAA	2	6	4446232	4446237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439523
77043	NC_022221	GAA	2	6	4446286	4446291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439523
77044	NC_022221	CGT	2	6	4446517	4446522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439524
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77046	NC_022221	GTA	2	6	4446615	4446620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439524
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77049	NC_022221	GCT	2	6	4446830	4446835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439524
77050	NC_022221	TA	3	6	4446959	4446964	50 %	50 %	0 %	0 %	537439524
77051	NC_022221	T	6	6	4447140	4447145	0 %	100 %	0 %	0 %	537439524
77052	NC_022221	A	7	7	4447479	4447485	100 %	0 %	0 %	0 %	537439525
77053	NC_022221	CT	3	6	4447499	4447504	0 %	50 %	0 %	50 %	537439525
77054	NC_022221	TGA	2	6	4447555	4447560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439525
77055	NC_022221	CGG	2	6	4447714	4447719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439525
77056	NC_022221	CG	3	6	4447720	4447725	0 %	0 %	50 %	50 %	537439525
77057	NC_022221	GCC	2	6	4447890	4447895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439525
77058	NC_022221	TGA	2	6	4447978	4447983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439525
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77061	NC_022221	CGC	2	6	4448154	4448159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439525
77062	NC_022221	TGGGG	2	10	4448182	4448191	0 %	20 %	80 %	0 %	537439525
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77064	NC_022221	CGT	2	6	4448223	4448228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439525
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77069	NC_022221	TGA	2	6	4448541	4448546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439525
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77071	NC_022221	GC	3	6	4448713	4448718	0 %	0 %	50 %	50 %	537439525
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77089	NC_022221	CG	3	6	4449509	4449514	0 %	0 %	50 %	50 %	537439526
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77111	NC_022221	CCGC	2	8	4450841	4450848	0 %	0 %	25 %	75 %	537439526
77112	NC_022221	CTGT	2	8	4450867	4450874	0 %	50 %	25 %	25 %	537439526
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77457	NC_022221	GC	3	6	4467998	4468003	0 %	0 %	50 %	50 %	537439545
77458	NC_022221	CCAG	2	8	4468014	4468021	25 %	0 %	25 %	50 %	537439545
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77460	NC_022221	GGA	2	6	4468078	4468083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537439545
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77462	NC_022221	ATC	2	6	4468161	4468166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439545
77463	NC_022221	CGCGTC	2	12	4468179	4468190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	537439545
77464	NC_022221	GA	3	6	4468212	4468217	50 %	0 %	50 %	0 %	537439545
77465	NC_022221	GACC	2	8	4468237	4468244	25 %	0 %	25 %	50 %	537439545
77466	NC_022221	GCA	2	6	4468261	4468266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439545
77467	NC_022221	TC	3	6	4468350	4468355	0 %	50 %	0 %	50 %	537439545
77468	NC_022221	AGG	2	6	4468464	4468469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537439545
77469	NC_022221	GCG	2	6	4468490	4468495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439545
77470	NC_022221	CTA	2	6	4468511	4468516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439545
77471	NC_022221	GCTG	2	8	4468557	4468564	0 %	25 %	50 %	25 %	537439545
77472	NC_022221	GCC	2	6	4468577	4468582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439545
77473	NC_022221	GAT	2	6	4468622	4468627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439545
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77475	NC_022221	GAT	2	6	4468735	4468740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439545
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77479	NC_022221	TGC	2	6	4468896	4468901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439545
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77490	NC_022221	GAA	2	6	4469431	4469436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439545
77491	NC_022221	GGT	2	6	4469440	4469445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537439545
77492	NC_022221	CGC	2	6	4469460	4469465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439545
77493	NC_022221	T	7	7	4469502	4469508	0 %	100 %	0 %	0 %	537439545
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77495	NC_022221	TCC	2	6	4470109	4470114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537439547
77496	NC_022221	TGTT	2	8	4470189	4470196	0 %	75 %	25 %	0 %	537439547
77497	NC_022221	CGGT	2	8	4470201	4470208	0 %	25 %	50 %	25 %	537439547
77498	NC_022221	CAAA	2	8	4470240	4470247	75 %	0 %	0 %	25 %	537439547
77499	NC_022221	ATG	2	6	4470269	4470274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439548
77500	NC_022221	TGC	2	6	4470286	4470291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439548

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