MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75001	NC_022221	AATT	2	8	4323263	4323270	50 %	50 %	0 %	0 %	537439407
75002	NC_022221	GCCTG	2	10	4323666	4323675	0 %	20 %	40 %	40 %	537439408
75003	NC_022221	CTG	2	6	4323764	4323769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439408
75004	NC_022221	CTG	2	6	4323774	4323779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439408
75005	NC_022221	TCG	2	6	4323810	4323815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439408
75006	NC_022221	CAC	2	6	4323919	4323924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537439408
75007	NC_022221	CGG	2	6	4324032	4324037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439408
75008	NC_022221	ATC	2	6	4324097	4324102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439408
75009	NC_022221	TGC	2	6	4324125	4324130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439408
75010	NC_022221	GTC	2	6	4324168	4324173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439408
75011	NC_022221	TGC	2	6	4324347	4324352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439408
75012	NC_022221	TCT	2	6	4324371	4324376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439408
75013	NC_022221	TGG	2	6	4324383	4324388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537439408
75014	NC_022221	GC	3	6	4324403	4324408	0 %	0 %	50 %	50 %	537439408
75015	NC_022221	TGC	2	6	4324494	4324499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439408
75016	NC_022221	ACCG	2	8	4324561	4324568	25 %	0 %	25 %	50 %	537439408
75017	NC_022221	CGC	2	6	4324612	4324617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439408
75018	NC_022221	GTG	2	6	4324733	4324738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537439408
75019	NC_022221	TGG	2	6	4324839	4324844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537439408
75020	NC_022221	A	6	6	4324898	4324903	100 %	0 %	0 %	0 %	537439408
75021	NC_022221	CAT	2	6	4325241	4325246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439409
75022	NC_022221	GGC	2	6	4325307	4325312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439409
75023	NC_022221	TCA	2	6	4325317	4325322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439409
75024	NC_022221	CGG	2	6	4325324	4325329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439409
75025	NC_022221	GCA	2	6	4325417	4325422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439409
75026	NC_022221	GCC	2	6	4325515	4325520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439409
75027	NC_022221	CAGC	2	8	4325525	4325532	25 %	0 %	25 %	50 %	537439409
75028	NC_022221	TGATTT	2	12	4325570	4325581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	537439409
75029	NC_022221	GC	3	6	4325591	4325596	0 %	0 %	50 %	50 %	537439409
75030	NC_022221	GGCGTC	2	12	4325598	4325609	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537439409
75031	NC_022221	CGG	2	6	4325618	4325623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439409
75032	NC_022221	CAAC	2	8	4325667	4325674	50 %	0 %	0 %	50 %	537439409
75033	NC_022221	CTG	2	6	4325714	4325719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439409
75034	NC_022221	ACA	2	6	4325777	4325782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537439409
75035	NC_022221	AAG	2	6	4325790	4325795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439409
75036	NC_022221	AGG	2	6	4328487	4328492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537439410
75037	NC_022221	AGC	2	6	4328519	4328524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439410
75038	NC_022221	AG	3	6	4328551	4328556	50 %	0 %	50 %	0 %	537439410
75039	NC_022221	TTTTTC	2	12	4328562	4328573	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	537439410
75040	NC_022221	TGC	2	6	4328594	4328599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439410
75041	NC_022221	TCG	2	6	4328646	4328651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439410
75042	NC_022221	GGC	2	6	4328663	4328668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439410
75043	NC_022221	ATA	2	6	4328751	4328756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439410
75044	NC_022221	TCG	2	6	4328799	4328804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439410
75045	NC_022221	GTC	2	6	4328867	4328872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439410
75046	NC_022221	CGC	2	6	4328969	4328974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439410
75047	NC_022221	CCG	2	6	4329028	4329033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439410
75048	NC_022221	CGT	2	6	4329106	4329111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439410
75049	NC_022221	GCT	2	6	4329226	4329231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439410
75050	NC_022221	GTTTTT	2	12	4329313	4329324	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	537439410
75051	NC_022221	ATA	2	6	4329357	4329362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439410
75052	NC_022221	TGC	2	6	4329380	4329385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439410
75053	NC_022221	CTT	3	9	4329771	4329779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439411
75054	NC_022221	T	6	6	4329807	4329812	0 %	100 %	0 %	0 %	537439411
75055	NC_022221	CGG	2	6	4329823	4329828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439411
75056	NC_022221	ACC	2	6	4329833	4329838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537439411
75057	NC_022221	ATG	2	6	4329868	4329873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439411
75058	NC_022221	GCG	2	6	4329965	4329970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439411
75059	NC_022221	TGT	2	6	4330051	4330056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439411
75060	NC_022221	ATC	2	6	4330266	4330271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439412
75061	NC_022221	AAT	2	6	4330426	4330431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439412
75062	NC_022221	TCA	2	6	4330459	4330464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439412
75063	NC_022221	CCG	3	9	4330552	4330560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439412
75064	NC_022221	G	6	6	4330562	4330567	0 %	0 %	100 %	0 %	537439412
75065	NC_022221	ATA	2	6	4330619	4330624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439412
75066	NC_022221	AG	3	6	4330655	4330660	50 %	0 %	50 %	0 %	537439412
75067	NC_022221	ATG	2	6	4330677	4330682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439412
75068	NC_022221	TTC	2	6	4330892	4330897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439413
75069	NC_022221	CAG	2	6	4330978	4330983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439413
75070	NC_022221	A	7	7	4331613	4331619	100 %	0 %	0 %	0 %	537439414
75071	NC_022221	CAT	2	6	4331648	4331653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439414
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75074	NC_022221	TTG	2	6	4331737	4331742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439414
75075	NC_022221	CGG	2	6	4331843	4331848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439414
75076	NC_022221	AGA	2	6	4331887	4331892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439414
75077	NC_022221	CGA	2	6	4331959	4331964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439414
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75080	NC_022221	GTG	2	6	4332144	4332149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537439414
75081	NC_022221	CGA	2	6	4332160	4332165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439414
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75083	NC_022221	ATT	2	6	4332234	4332239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537439414
75084	NC_022221	GGA	2	6	4332263	4332268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537439414
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75087	NC_022221	TGT	2	6	4332382	4332387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439414
75088	NC_022221	CCA	2	6	4332409	4332414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537439414
75089	NC_022221	CTA	2	6	4332422	4332427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439414
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75096	NC_022221	GGC	3	9	4332767	4332775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439414
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75098	NC_022221	GGC	2	6	4332818	4332823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439414
75099	NC_022221	CTGG	2	8	4332824	4332831	0 %	25 %	50 %	25 %	537439414
75100	NC_022221	TGA	2	6	4332850	4332855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439414
75101	NC_022221	TAT	2	6	4332864	4332869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537439414
75102	NC_022221	GCG	2	6	4332954	4332959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439414
75103	NC_022221	ATA	2	6	4333003	4333008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439414
75104	NC_022221	CGA	2	6	4333022	4333027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439414
75105	NC_022221	CGCTT	2	10	4333420	4333429	0 %	40 %	20 %	40 %	537439415
75106	NC_022221	TCA	2	6	4333448	4333453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439415
75107	NC_022221	ATA	2	6	4333481	4333486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439415
75108	NC_022221	CCA	2	6	4333554	4333559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537439415
75109	NC_022221	GCA	3	9	4333566	4333574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439415
75110	NC_022221	CCG	2	6	4333611	4333616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439415
75111	NC_022221	GCA	2	6	4333626	4333631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439415
75112	NC_022221	AGG	2	6	4333677	4333682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537439415
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75114	NC_022221	CAG	2	6	4333699	4333704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439415
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75116	NC_022221	CAT	2	6	4333780	4333785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439415
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75228	NC_022221	GCGG	2	8	4338722	4338729	0 %	0 %	75 %	25 %	537439419
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75462	NC_022221	GGC	2	6	4355462	4355467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439429
75463	NC_022221	GCCGC	2	10	4355480	4355489	0 %	0 %	40 %	60 %	537439429
75464	NC_022221	CGT	2	6	4355539	4355544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439429
75465	NC_022221	TGCG	2	8	4355574	4355581	0 %	25 %	50 %	25 %	537439429
75466	NC_022221	TGC	3	9	4355589	4355597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439429
75467	NC_022221	CGG	2	6	4355637	4355642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439429
75468	NC_022221	GCG	2	6	4355648	4355653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439429
75469	NC_022221	CGG	2	6	4355656	4355661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439429
75470	NC_022221	CGC	2	6	4355697	4355702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439429
75471	NC_022221	GGC	2	6	4355725	4355730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439429
75472	NC_022221	AGT	2	6	4355740	4355745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439429
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75474	NC_022221	ATG	2	6	4355819	4355824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439429
75475	NC_022221	TTGA	2	8	4355837	4355844	25 %	50 %	25 %	0 %	537439429
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75478	NC_022221	TGA	2	6	4355952	4355957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439429
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75481	NC_022221	GTG	2	6	4356038	4356043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537439429
75482	NC_022221	GC	4	8	4356048	4356055	0 %	0 %	50 %	50 %	537439429
75483	NC_022221	TGG	2	6	4356093	4356098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537439429
75484	NC_022221	CGG	2	6	4356105	4356110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439429
75485	NC_022221	TAC	2	6	4356280	4356285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439430
75486	NC_022221	GTT	2	6	4356312	4356317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439430
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75488	NC_022221	GAT	3	9	4356403	4356411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439430
75489	NC_022221	GTT	2	6	4356435	4356440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439430
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75492	NC_022221	CTG	2	6	4356625	4356630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439430
75493	NC_022221	GGC	2	6	4356648	4356653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439430
75494	NC_022221	CTG	2	6	4356676	4356681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439430
75495	NC_022221	TGC	2	6	4356707	4356712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439430
75496	NC_022221	CGT	2	6	4356750	4356755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439430
75497	NC_022221	CAG	2	6	4356781	4356786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439430
75498	NC_022221	GTT	2	6	4356816	4356821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439430
75499	NC_022221	TCAGCA	2	12	4356941	4356952	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	537439431
75500	NC_022221	CGC	2	6	4357007	4357012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439431

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