MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
73001	NC_022221	TCG	2	6	4207809	4207814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439305
73002	NC_022221	GGT	2	6	4207897	4207902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537439305
73003	NC_022221	GCT	2	6	4207993	4207998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439305
73004	NC_022221	GAT	3	9	4208214	4208222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439306
73005	NC_022221	CGG	2	6	4208233	4208238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439306
73006	NC_022221	AGC	2	6	4208296	4208301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439306
73007	NC_022221	CTG	2	6	4208457	4208462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439306
73008	NC_022221	TTA	2	6	4209178	4209183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537439307
73009	NC_022221	CAG	2	6	4209205	4209210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439307
73010	NC_022221	T	6	6	4209277	4209282	0 %	100 %	0 %	0 %	537439307
73011	NC_022221	CAA	2	6	4209312	4209317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537439307
73012	NC_022221	GAC	2	6	4209379	4209384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439307
73013	NC_022221	CGTAA	2	10	4209410	4209419	40 %	20 %	20 %	20 %	537439307
73014	NC_022221	CCG	2	6	4209443	4209448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439307
73015	NC_022221	CGG	2	6	4209463	4209468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439307
73016	NC_022221	GAA	2	6	4209491	4209496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439307
73017	NC_022221	AAT	2	6	4209520	4209525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439307
73018	NC_022221	TAA	2	6	4209582	4209587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439307
73019	NC_022221	GAA	2	6	4209742	4209747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439308
73020	NC_022221	TAA	2	6	4209780	4209785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439308
73021	NC_022221	CAT	2	6	4209858	4209863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439308
73022	NC_022221	ACGA	2	8	4209868	4209875	50 %	0 %	25 %	25 %	537439308
73023	NC_022221	AAT	2	6	4209883	4209888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439308
73024	NC_022221	GGC	2	6	4209896	4209901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439308
73025	NC_022221	CGA	2	6	4210008	4210013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439308
73026	NC_022221	TGG	2	6	4210050	4210055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537439308
73027	NC_022221	CTG	2	6	4210057	4210062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439308
73028	NC_022221	T	6	6	4210138	4210143	0 %	100 %	0 %	0 %	537439308
73029	NC_022221	TCA	2	6	4210187	4210192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439308
73030	NC_022221	CTC	2	6	4210234	4210239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537439308
73031	NC_022221	A	6	6	4210270	4210275	100 %	0 %	0 %	0 %	537439308
73032	NC_022221	GCG	2	6	4210310	4210315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439308
73033	NC_022221	GTT	2	6	4210317	4210322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439308
73034	NC_022221	GCC	3	9	4210390	4210398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439308
73035	NC_022221	ATG	2	6	4210406	4210411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439308
73036	NC_022221	AGA	2	6	4210482	4210487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439308
73037	NC_022221	TAG	2	6	4210628	4210633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439308
73038	NC_022221	TAC	2	6	4210639	4210644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439308
73039	NC_022221	GACT	2	8	4210650	4210657	25 %	25 %	25 %	25 %	537439308
73040	NC_022221	GAT	2	6	4210749	4210754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439308
73041	NC_022221	ACC	2	6	4211027	4211032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537439308
73042	NC_022221	GTT	2	6	4211041	4211046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439308
73043	NC_022221	TCA	2	6	4211109	4211114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439308
73044	NC_022221	TCA	2	6	4211131	4211136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439309
73045	NC_022221	CTT	2	6	4211137	4211142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439309
73046	NC_022221	TTAGC	2	10	4211145	4211154	20 %	40 %	20 %	20 %	537439309
73047	NC_022221	CTT	2	6	4211172	4211177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439309
73048	NC_022221	CGC	2	6	4211178	4211183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439309
73049	NC_022221	TGATC	2	10	4211265	4211274	20 %	40 %	20 %	20 %	537439309
73050	NC_022221	TTC	2	6	4211281	4211286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439309
73051	NC_022221	ATCGCG	2	12	4211389	4211400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	537439309
73052	NC_022221	CAG	2	6	4211461	4211466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439309
73053	NC_022221	CTG	2	6	4211479	4211484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439309
73054	NC_022221	CGC	2	6	4211487	4211492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439309
73055	NC_022221	GTT	2	6	4211580	4211585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439309
73056	NC_022221	CCG	2	6	4211648	4211653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439309
73057	NC_022221	GGCGC	2	10	4211654	4211663	0 %	0 %	60 %	40 %	537439309
73058	NC_022221	GAG	2	6	4211691	4211696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537439309
73059	NC_022221	AAGCC	2	10	4211852	4211861	40 %	0 %	20 %	40 %	537439309
73060	NC_022221	GTGTG	2	10	4211873	4211882	0 %	40 %	60 %	0 %	537439309
73061	NC_022221	AAT	2	6	4211929	4211934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439309
73062	NC_022221	TG	3	6	4211945	4211950	0 %	50 %	50 %	0 %	537439309
73063	NC_022221	GC	3	6	4211998	4212003	0 %	0 %	50 %	50 %	537439309
73064	NC_022221	CTG	2	6	4212037	4212042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439309
73065	NC_022221	TTAA	2	8	4212068	4212075	50 %	50 %	0 %	0 %	537439309
73066	NC_022221	CAGC	2	8	4212123	4212130	25 %	0 %	25 %	50 %	537439309
73067	NC_022221	GGA	2	6	4212140	4212145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537439309
73068	NC_022221	GCT	2	6	4212201	4212206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439309
73069	NC_022221	GCG	2	6	4212330	4212335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439309
73070	NC_022221	CGA	2	6	4212366	4212371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439309
73071	NC_022221	TGC	2	6	4212388	4212393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439309
73072	NC_022221	TTGTT	2	10	4212407	4212416	0 %	80 %	20 %	0 %	537439309
73073	NC_022221	T	6	6	4212415	4212420	0 %	100 %	0 %	0 %	537439309
73074	NC_022221	TAAAA	2	10	4212429	4212438	80 %	20 %	0 %	0 %	537439309
73075	NC_022221	T	6	6	4212545	4212550	0 %	100 %	0 %	0 %	537439310
73076	NC_022221	TCG	2	6	4212616	4212621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439310
73077	NC_022221	GACG	2	8	4212665	4212672	25 %	0 %	50 %	25 %	537439310
73078	NC_022221	CCAG	2	8	4212706	4212713	25 %	0 %	25 %	50 %	537439310
73079	NC_022221	GA	4	8	4212765	4212772	50 %	0 %	50 %	0 %	537439310
73080	NC_022221	CTT	3	9	4212787	4212795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439310
73081	NC_022221	GTT	2	6	4212865	4212870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439310
73082	NC_022221	TTA	2	6	4212912	4212917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537439310
73083	NC_022221	TCT	2	6	4212936	4212941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439310
73084	NC_022221	CATC	2	8	4212994	4213001	25 %	25 %	0 %	50 %	537439310
73085	NC_022221	GCGCC	3	15	4213057	4213071	0 %	0 %	40 %	60 %	537439310
73086	NC_022221	AGC	2	6	4213080	4213085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439310
73087	NC_022221	TTC	2	6	4213250	4213255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439310
73088	NC_022221	CTG	2	6	4213300	4213305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439310
73089	NC_022221	ATA	2	6	4213401	4213406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439310
73090	NC_022221	GTT	2	6	4213489	4213494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439311
73091	NC_022221	GCG	2	6	4213501	4213506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439311
73092	NC_022221	AAT	2	6	4213510	4213515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439311
73093	NC_022221	GAT	2	6	4213537	4213542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439311
73094	NC_022221	GC	3	6	4213615	4213620	0 %	0 %	50 %	50 %	537439311
73095	NC_022221	GC	3	6	4213638	4213643	0 %	0 %	50 %	50 %	537439311
73096	NC_022221	GC	3	6	4213653	4213658	0 %	0 %	50 %	50 %	537439311
73097	NC_022221	GACA	2	8	4213671	4213678	50 %	0 %	25 %	25 %	537439311
73098	NC_022221	CTT	2	6	4213681	4213686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439311
73099	NC_022221	TCG	2	6	4213743	4213748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439311
73100	NC_022221	GAT	2	6	4213772	4213777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439311
73101	NC_022221	TGG	2	6	4213782	4213787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537439311
73102	NC_022221	CTT	2	6	4213819	4213824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439311
73103	NC_022221	ATC	2	6	4213847	4213852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439311
73104	NC_022221	CTT	2	6	4213879	4213884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439311
73105	NC_022221	TTTG	2	8	4215195	4215202	0 %	75 %	25 %	0 %	537439312
73106	NC_022221	ACAT	2	8	4215205	4215212	50 %	25 %	0 %	25 %	537439312
73107	NC_022221	GCT	2	6	4215303	4215308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439312
73108	NC_022221	GAA	2	6	4215607	4215612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439312
73109	NC_022221	TGC	2	6	4215638	4215643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439312
73110	NC_022221	CGGA	2	8	4215826	4215833	25 %	0 %	50 %	25 %	537439313
73111	NC_022221	GTGCTG	2	12	4215882	4215893	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	537439313
73112	NC_022221	CAGT	2	8	4215926	4215933	25 %	25 %	25 %	25 %	537439313
73113	NC_022221	GAAAA	2	10	4216143	4216152	80 %	0 %	20 %	0 %	537439313
73114	NC_022221	AAT	2	6	4216225	4216230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537439314
73115	NC_022221	CGC	2	6	4216251	4216256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439314
73116	NC_022221	CTG	2	6	4216357	4216362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439314
73117	NC_022221	AAC	2	6	4216370	4216375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537439314
73118	NC_022221	GCC	2	6	4216405	4216410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439314
73119	NC_022221	TGA	2	6	4216437	4216442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439314
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73121	NC_022221	GTTT	2	8	4216503	4216510	0 %	75 %	25 %	0 %	537439314
73122	NC_022221	CGC	2	6	4216529	4216534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439314
73123	NC_022221	ACCA	2	8	4216576	4216583	50 %	0 %	0 %	50 %	537439314
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73130	NC_022221	TCA	2	6	4216855	4216860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439315
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73222	NC_022221	GCGCG	2	10	4227153	4227162	0 %	0 %	60 %	40 %	537439323
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73229	NC_022221	GCAGT	2	10	4227463	4227472	20 %	20 %	40 %	20 %	537439323
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73232	NC_022221	CAG	2	6	4227687	4227692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439323
73233	NC_022221	CGA	2	6	4227702	4227707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439323
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