MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022221	TGC	2	6	367695	367700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435692
6502	NC_022221	ATT	2	6	367743	367748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435692
6503	NC_022221	GC	3	6	367834	367839	0 %	0 %	50 %	50 %	537435692
6504	NC_022221	CGGCG	2	10	367877	367886	0 %	0 %	60 %	40 %	537435692
6505	NC_022221	GCG	2	6	367962	367967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435692
6506	NC_022221	AAC	2	6	368046	368051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435692
6507	NC_022221	GCG	2	6	368061	368066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435692
6508	NC_022221	CCG	2	6	368086	368091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435692
6509	NC_022221	TTG	2	6	368110	368115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435692
6510	NC_022221	GGCT	2	8	368130	368137	0 %	25 %	50 %	25 %	537435692
6511	NC_022221	GCG	2	6	368395	368400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435693
6512	NC_022221	AGGCG	2	10	368478	368487	20 %	0 %	60 %	20 %	537435693
6513	NC_022221	GCA	2	6	368514	368519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435693
6514	NC_022221	AGA	2	6	368529	368534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435693
6515	NC_022221	CTT	2	6	368553	368558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435693
6516	NC_022221	GCA	2	6	368577	368582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435693
6517	NC_022221	GC	3	6	368620	368625	0 %	0 %	50 %	50 %	537435693
6518	NC_022221	GGC	2	6	368764	368769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435693
6519	NC_022221	GCC	2	6	368799	368804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435693
6520	NC_022221	GAT	2	6	368811	368816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435693
6521	NC_022221	CCCAA	2	10	368897	368906	40 %	0 %	0 %	60 %	537435693
6522	NC_022221	CTG	2	6	368908	368913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435693
6523	NC_022221	CGAC	2	8	368972	368979	25 %	0 %	25 %	50 %	537435693
6524	NC_022221	CGAT	2	8	368999	369006	25 %	25 %	25 %	25 %	537435693
6525	NC_022221	CAT	2	6	369120	369125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435693
6526	NC_022221	GAA	2	6	369128	369133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435693
6527	NC_022221	CAA	2	6	369535	369540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435694
6528	NC_022221	CTG	2	6	369544	369549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435694
6529	NC_022221	A	7	7	369575	369581	100 %	0 %	0 %	0 %	537435694
6530	NC_022221	T	7	7	369598	369604	0 %	100 %	0 %	0 %	537435694
6531	NC_022221	CGA	2	6	369703	369708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435695
6532	NC_022221	TCC	2	6	369744	369749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435695
6533	NC_022221	TCAT	2	8	369777	369784	25 %	50 %	0 %	25 %	537435695
6534	NC_022221	T	6	6	369784	369789	0 %	100 %	0 %	0 %	537435695
6535	NC_022221	ATA	2	6	369855	369860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435695
6536	NC_022221	CCA	2	6	369874	369879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435695
6537	NC_022221	GCCA	2	8	369891	369898	25 %	0 %	25 %	50 %	537435695
6538	NC_022221	TCAATA	2	12	370047	370058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	537435695
6539	NC_022221	TCA	2	6	370095	370100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435695
6540	NC_022221	GAAT	2	8	370110	370117	50 %	25 %	25 %	0 %	537435695
6541	NC_022221	GAC	2	6	370273	370278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435695
6542	NC_022221	GGCA	2	8	370289	370296	25 %	0 %	50 %	25 %	537435695
6543	NC_022221	TAAC	2	8	370330	370337	50 %	25 %	0 %	25 %	537435695
6544	NC_022221	AATTA	2	10	370340	370349	60 %	40 %	0 %	0 %	537435695
6545	NC_022221	TGA	2	6	370427	370432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435696
6546	NC_022221	A	6	6	370467	370472	100 %	0 %	0 %	0 %	537435696
6547	NC_022221	TTA	2	6	370480	370485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435696
6548	NC_022221	AAT	2	6	370492	370497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435696
6549	NC_022221	CG	3	6	370640	370645	0 %	0 %	50 %	50 %	537435697
6550	NC_022221	CAC	2	6	370711	370716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435697
6551	NC_022221	A	7	7	370784	370790	100 %	0 %	0 %	0 %	537435697
6552	NC_022221	GC	3	6	370857	370862	0 %	0 %	50 %	50 %	537435697
6553	NC_022221	TCA	2	6	370898	370903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435697
6554	NC_022221	CGC	2	6	370921	370926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435697
6555	NC_022221	CG	3	6	370931	370936	0 %	0 %	50 %	50 %	537435697
6556	NC_022221	T	6	6	370953	370958	0 %	100 %	0 %	0 %	537435697
6557	NC_022221	CAC	2	6	370990	370995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435697
6558	NC_022221	GCG	2	6	371001	371006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435697
6559	NC_022221	CCT	2	6	371027	371032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435697
6560	NC_022221	CTT	2	6	371040	371045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435697
6561	NC_022221	TCG	2	6	371066	371071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435697
6562	NC_022221	CCGC	2	8	371090	371097	0 %	0 %	25 %	75 %	537435697
6563	NC_022221	GCA	2	6	371130	371135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435697
6564	NC_022221	CCA	2	6	371137	371142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435697
6565	NC_022221	CGGAG	2	10	371149	371158	20 %	0 %	60 %	20 %	537435697
6566	NC_022221	CAT	2	6	371248	371253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435697
6567	NC_022221	GCG	2	6	371262	371267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435697
6568	NC_022221	A	6	6	371296	371301	100 %	0 %	0 %	0 %	537435697
6569	NC_022221	GC	3	6	371304	371309	0 %	0 %	50 %	50 %	537435697
6570	NC_022221	CGCC	2	8	371334	371341	0 %	0 %	25 %	75 %	537435697
6571	NC_022221	TCCTG	2	10	371354	371363	0 %	40 %	20 %	40 %	537435697
6572	NC_022221	GCG	2	6	371364	371369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435697
6573	NC_022221	ATC	2	6	371401	371406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435697
6574	NC_022221	CGG	2	6	371427	371432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435697
6575	NC_022221	A	6	6	371437	371442	100 %	0 %	0 %	0 %	537435697
6576	NC_022221	GGT	2	6	371446	371451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435697
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6578	NC_022221	GCTGGC	2	12	371698	371709	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435698
6579	NC_022221	AAC	2	6	371720	371725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435698
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6581	NC_022221	AAGCG	2	10	371749	371758	40 %	0 %	40 %	20 %	537435698
6582	NC_022221	GCA	2	6	371815	371820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435698
6583	NC_022221	CGGCG	2	10	371872	371881	0 %	0 %	60 %	40 %	537435698
6584	NC_022221	TGG	2	6	372042	372047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435698
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6586	NC_022221	A	6	6	372105	372110	100 %	0 %	0 %	0 %	537435698
6587	NC_022221	CCAGC	2	10	372130	372139	20 %	0 %	20 %	60 %	537435698
6588	NC_022221	GCT	2	6	372163	372168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435698
6589	NC_022221	TC	4	8	372293	372300	0 %	50 %	0 %	50 %	537435698
6590	NC_022221	CTG	2	6	372320	372325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435698
6591	NC_022221	GC	3	6	372371	372376	0 %	0 %	50 %	50 %	537435698
6592	NC_022221	CTG	3	9	372392	372400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435698
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6594	NC_022221	GTT	2	6	372493	372498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435698
6595	NC_022221	CGGCG	2	10	372574	372583	0 %	0 %	60 %	40 %	537435698
6596	NC_022221	TTC	2	6	372603	372608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435698
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6599	NC_022221	GCT	2	6	372724	372729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435698
6600	NC_022221	GC	3	6	372777	372782	0 %	0 %	50 %	50 %	537435698
6601	NC_022221	AGCA	2	8	372791	372798	50 %	0 %	25 %	25 %	537435698
6602	NC_022221	CG	3	6	372816	372821	0 %	0 %	50 %	50 %	537435698
6603	NC_022221	CGT	2	6	372946	372951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435698
6604	NC_022221	TGC	2	6	373050	373055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435698
6605	NC_022221	A	6	6	373119	373124	100 %	0 %	0 %	0 %	537435698
6606	NC_022221	CGC	2	6	373125	373130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435698
6607	NC_022221	GC	3	6	373182	373187	0 %	0 %	50 %	50 %	537435698
6608	NC_022221	GTG	2	6	373341	373346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435698
6609	NC_022221	AGTG	2	8	373348	373355	25 %	25 %	50 %	0 %	537435698
6610	NC_022221	GCCA	2	8	373358	373365	25 %	0 %	25 %	50 %	537435698
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6618	NC_022221	CGA	2	6	373558	373563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435698
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6620	NC_022221	A	6	6	373613	373618	100 %	0 %	0 %	0 %	537435698
6621	NC_022221	TGG	2	6	373722	373727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435698
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6623	NC_022221	CGTT	2	8	373840	373847	0 %	50 %	25 %	25 %	537435698
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6989	NC_022221	TCG	2	6	391002	391007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435711
6990	NC_022221	CGG	2	6	391066	391071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435711
6991	NC_022221	TGC	2	6	391098	391103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435711
6992	NC_022221	GTC	2	6	391145	391150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435711
6993	NC_022221	TGA	2	6	391186	391191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435711
6994	NC_022221	CAA	2	6	391208	391213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435711
6995	NC_022221	ACCGA	2	10	391238	391247	40 %	0 %	20 %	40 %	537435711
6996	NC_022221	ACGGT	2	10	391284	391293	20 %	20 %	40 %	20 %	537435711
6997	NC_022221	GCT	2	6	391655	391660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435712
6998	NC_022221	GAA	2	6	391668	391673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435712
6999	NC_022221	GC	4	8	391701	391708	0 %	0 %	50 %	50 %	537435712
7000	NC_022221	CGG	2	6	391720	391725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435712

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