MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022221	CGA	2	6	340987	340992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435667
6002	NC_022221	GCCA	3	12	340994	341005	25 %	0 %	25 %	50 %	537435667
6003	NC_022221	CAGG	2	8	341062	341069	25 %	0 %	50 %	25 %	537435667
6004	NC_022221	ATC	2	6	341145	341150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435667
6005	NC_022221	TGCC	2	8	341162	341169	0 %	25 %	25 %	50 %	537435667
6006	NC_022221	CAG	2	6	341201	341206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435667
6007	NC_022221	CCG	2	6	341214	341219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435667
6008	NC_022221	GCA	2	6	341260	341265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435667
6009	NC_022221	CT	3	6	341277	341282	0 %	50 %	0 %	50 %	537435667
6010	NC_022221	GCT	2	6	341288	341293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435667
6011	NC_022221	CGCC	2	8	341311	341318	0 %	0 %	25 %	75 %	537435667
6012	NC_022221	CTG	2	6	341429	341434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435667
6013	NC_022221	AG	3	6	341449	341454	50 %	0 %	50 %	0 %	537435667
6014	NC_022221	ATA	2	6	341517	341522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435667
6015	NC_022221	CAG	2	6	341588	341593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435667
6016	NC_022221	GAA	2	6	341600	341605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435667
6017	NC_022221	CCGC	2	8	341665	341672	0 %	0 %	25 %	75 %	537435667
6018	NC_022221	CTG	2	6	341699	341704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435667
6019	NC_022221	CGCC	2	8	341755	341762	0 %	0 %	25 %	75 %	537435667
6020	NC_022221	GCCA	2	8	341779	341786	25 %	0 %	25 %	50 %	537435667
6021	NC_022221	GCC	2	6	341796	341801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435667
6022	NC_022221	CGG	2	6	341842	341847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435667
6023	NC_022221	AGC	2	6	341853	341858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435667
6024	NC_022221	CGG	2	6	341874	341879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435667
6025	NC_022221	TCA	2	6	341883	341888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435667
6026	NC_022221	CAG	2	6	341906	341911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435667
6027	NC_022221	ATA	2	6	341949	341954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435667
6028	NC_022221	TCA	2	6	342022	342027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435667
6029	NC_022221	AGCC	2	8	342078	342085	25 %	0 %	25 %	50 %	537435667
6030	NC_022221	TGG	2	6	342165	342170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435667
6031	NC_022221	A	6	6	342244	342249	100 %	0 %	0 %	0 %	537435667
6032	NC_022221	CG	4	8	342251	342258	0 %	0 %	50 %	50 %	537435667
6033	NC_022221	TTTC	2	8	342344	342351	0 %	75 %	0 %	25 %	537435668
6034	NC_022221	CGTC	2	8	342370	342377	0 %	25 %	25 %	50 %	537435668
6035	NC_022221	AAGG	2	8	342524	342531	50 %	0 %	50 %	0 %	537435668
6036	NC_022221	TCA	2	6	342623	342628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435668
6037	NC_022221	GCA	2	6	342638	342643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435668
6038	NC_022221	ATG	2	6	342678	342683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435668
6039	NC_022221	GC	4	8	342821	342828	0 %	0 %	50 %	50 %	537435668
6040	NC_022221	GAACAG	2	12	342867	342878	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	537435668
6041	NC_022221	T	6	6	342896	342901	0 %	100 %	0 %	0 %	537435668
6042	NC_022221	GAT	2	6	342906	342911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435668
6043	NC_022221	CATC	2	8	342962	342969	25 %	25 %	0 %	50 %	537435668
6044	NC_022221	TCTT	2	8	342976	342983	0 %	75 %	0 %	25 %	537435668
6045	NC_022221	GCCAT	2	10	343053	343062	20 %	20 %	20 %	40 %	537435668
6046	NC_022221	TCA	2	6	343229	343234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435668
6047	NC_022221	CGC	2	6	343236	343241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435668
6048	NC_022221	GTG	2	6	343282	343287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435668
6049	NC_022221	CAT	2	6	343293	343298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435668
6050	NC_022221	TTC	2	6	343317	343322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435668
6051	NC_022221	CGC	2	6	343365	343370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435668
6052	NC_022221	CAG	2	6	343371	343376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435668
6053	NC_022221	CGC	2	6	343424	343429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435668
6054	NC_022221	AATG	2	8	343493	343500	50 %	25 %	25 %	0 %	537435668
6055	NC_022221	ACA	2	6	343541	343546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435668
6056	NC_022221	TAA	2	6	343568	343573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435668
6057	NC_022221	AAAT	2	8	343693	343700	75 %	25 %	0 %	0 %	537435668
6058	NC_022221	TCA	4	12	343715	343726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435668
6059	NC_022221	TGC	2	6	343769	343774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435668
6060	NC_022221	CGA	2	6	343796	343801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435668
6061	NC_022221	CTT	2	6	343880	343885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435668
6062	NC_022221	CAG	2	6	343905	343910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435668
6063	NC_022221	GAA	2	6	343965	343970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435668
6064	NC_022221	TGC	2	6	343982	343987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435668
6065	NC_022221	GCG	2	6	344084	344089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435668
6066	NC_022221	CGC	2	6	344133	344138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435668
6067	NC_022221	GCG	2	6	344149	344154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435668
6068	NC_022221	AAG	2	6	344170	344175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435668
6069	NC_022221	CGC	2	6	344315	344320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435668
6070	NC_022221	CAG	2	6	344349	344354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435668
6071	NC_022221	TCT	2	6	344356	344361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435668
6072	NC_022221	CTT	2	6	344429	344434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435668
6073	NC_022221	TTG	2	6	344579	344584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435669
6074	NC_022221	GTT	2	6	344593	344598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435669
6075	NC_022221	GAT	2	6	344635	344640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435669
6076	NC_022221	GCA	2	6	344799	344804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435669
6077	NC_022221	CCG	2	6	344858	344863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435669
6078	NC_022221	ATG	2	6	344873	344878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435669
6079	NC_022221	ATC	2	6	344888	344893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435669
6080	NC_022221	CAG	2	6	344920	344925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435669
6081	NC_022221	T	6	6	344929	344934	0 %	100 %	0 %	0 %	537435669
6082	NC_022221	CGT	2	6	344982	344987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435669
6083	NC_022221	GGC	2	6	344989	344994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435669
6084	NC_022221	CAT	2	6	345019	345024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435669
6085	NC_022221	CAGG	2	8	345043	345050	25 %	0 %	50 %	25 %	537435669
6086	NC_022221	GCG	2	6	345075	345080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435669
6087	NC_022221	CAGCC	2	10	345081	345090	20 %	0 %	20 %	60 %	537435669
6088	NC_022221	GC	3	6	345123	345128	0 %	0 %	50 %	50 %	537435669
6089	NC_022221	GAT	2	6	345190	345195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435669
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6091	NC_022221	AACG	2	8	345289	345296	50 %	0 %	25 %	25 %	537435669
6092	NC_022221	GCAGA	2	10	345304	345313	40 %	0 %	40 %	20 %	537435669
6093	NC_022221	GTCG	2	8	345337	345344	0 %	25 %	50 %	25 %	537435669
6094	NC_022221	CCCA	2	8	345472	345479	25 %	0 %	0 %	75 %	537435669
6095	NC_022221	TAA	2	6	345486	345491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435669
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6100	NC_022221	CCA	2	6	345782	345787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435669
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6102	NC_022221	CAT	2	6	345829	345834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435669
6103	NC_022221	ACG	2	6	345845	345850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435669
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6105	NC_022221	TAA	2	6	346532	346537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435670
6106	NC_022221	T	7	7	346572	346578	0 %	100 %	0 %	0 %	537435670
6107	NC_022221	TGT	2	6	346622	346627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435670
6108	NC_022221	TAA	2	6	346692	346697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435670
6109	NC_022221	CGC	2	6	346740	346745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435670
6110	NC_022221	GC	3	6	346759	346764	0 %	0 %	50 %	50 %	537435670
6111	NC_022221	GCG	2	6	346794	346799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435670
6112	NC_022221	GTT	2	6	346815	346820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435670
6113	NC_022221	ATC	2	6	346876	346881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435670
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6121	NC_022221	TAA	2	6	347209	347214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435670
6122	NC_022221	ACC	2	6	347246	347251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435670
6123	NC_022221	ACC	2	6	347267	347272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435670
6124	NC_022221	GCG	2	6	347315	347320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435670
6125	NC_022221	GGCG	2	8	347362	347369	0 %	0 %	75 %	25 %	537435670
6126	NC_022221	TCG	2	6	347412	347417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435670
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6132	NC_022221	AAT	2	6	347635	347640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435670
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6134	NC_022221	GAC	2	6	347730	347735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435670
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6147	NC_022221	GCC	2	6	348725	348730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435671
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6152	NC_022221	CCG	2	6	348937	348942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435671
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6229	NC_022221	TCGGG	2	10	352684	352693	0 %	20 %	60 %	20 %	537435675
6230	NC_022221	GAC	2	6	352774	352779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435675
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6232	NC_022221	CGG	2	6	352938	352943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435675
6233	NC_022221	TGA	2	6	352954	352959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435675
6234	NC_022221	CG	3	6	352992	352997	0 %	0 %	50 %	50 %	537435675
6235	NC_022221	GCT	2	6	353005	353010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435675
6236	NC_022221	T	6	6	353019	353024	0 %	100 %	0 %	0 %	537435675
6237	NC_022221	AAAGGC	2	12	353092	353103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	537435675
6238	NC_022221	TGT	2	6	353150	353155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435675
6239	NC_022221	GAT	2	6	353167	353172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435675
6240	NC_022221	ATC	3	9	353219	353227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435675
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6242	NC_022221	GCG	2	6	353303	353308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435675
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6362	NC_022221	CTG	2	6	361199	361204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435683
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6364	NC_022221	TGA	2	6	361252	361257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435683
6365	NC_022221	GGC	2	6	361289	361294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435683
6366	NC_022221	GCG	2	6	361302	361307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435683
6367	NC_022221	CAA	2	6	361366	361371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435683
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6486	NC_022221	TAA	2	6	367037	367042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435692
6487	NC_022221	GCG	2	6	367098	367103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435692
6488	NC_022221	GTT	2	6	367168	367173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435692
6489	NC_022221	CCGTA	2	10	367211	367220	20 %	20 %	20 %	40 %	537435692
6490	NC_022221	ATT	2	6	367275	367280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435692
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6493	NC_022221	CTG	2	6	367356	367361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435692
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