MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_022221	TAAT	2	8	3710664	3710671	50 %	50 %	0 %	0 %	537438841
64003	NC_022221	TCG	2	6	3710720	3710725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438841
64004	NC_022221	CACG	2	8	3710736	3710743	25 %	0 %	25 %	50 %	537438841
64005	NC_022221	TGA	2	6	3710778	3710783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438841
64006	NC_022221	CCA	2	6	3710787	3710792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438841
64007	NC_022221	CAG	2	6	3710797	3710802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438841
64008	NC_022221	AGT	2	6	3710845	3710850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438841
64009	NC_022221	ATG	2	6	3710851	3710856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438841
64010	NC_022221	CGC	3	9	3710872	3710880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438841
64011	NC_022221	GCG	2	6	3710895	3710900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438841
64012	NC_022221	CAAC	2	8	3710955	3710962	50 %	0 %	0 %	50 %	537438841
64013	NC_022221	TAA	2	6	3711060	3711065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438841
64014	NC_022221	GCA	2	6	3711179	3711184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438841
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64016	NC_022221	TTA	2	6	3711460	3711465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438842
64017	NC_022221	TGA	2	6	3711471	3711476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438842
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64019	NC_022221	GC	4	8	3711678	3711685	0 %	0 %	50 %	50 %	537438842
64020	NC_022221	CAG	2	6	3711748	3711753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438842
64021	NC_022221	GGCT	2	8	3711797	3711804	0 %	25 %	50 %	25 %	537438842
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64042	NC_022221	CAC	2	6	3712558	3712563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438843
64043	NC_022221	GGC	2	6	3712564	3712569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438843
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64046	NC_022221	GC	3	6	3712621	3712626	0 %	0 %	50 %	50 %	537438843
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64050	NC_022221	GGC	2	6	3712786	3712791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438843
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64053	NC_022221	CGA	2	6	3712986	3712991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438843
64054	NC_022221	CAGCGC	2	12	3713023	3713034	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537438843
64055	NC_022221	GGC	2	6	3713035	3713040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438843
64056	NC_022221	CGA	2	6	3713070	3713075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438843
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64068	NC_022221	TCTT	2	8	3713557	3713564	0 %	75 %	0 %	25 %	537438844
64069	NC_022221	CGC	2	6	3713579	3713584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438844
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64102	NC_022221	CG	3	6	3715166	3715171	0 %	0 %	50 %	50 %	537438845
64103	NC_022221	ACC	2	6	3715205	3715210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438845
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64107	NC_022221	GCGTT	2	10	3715571	3715580	0 %	40 %	40 %	20 %	537438846
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64116	NC_022221	CGG	2	6	3715957	3715962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438846
64117	NC_022221	ATC	2	6	3715982	3715987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438846
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64229	NC_022221	CAT	2	6	3722017	3722022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438850
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64233	NC_022221	TGA	2	6	3722188	3722193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438850
64234	NC_022221	GCA	2	6	3722372	3722377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438851
64235	NC_022221	GCG	2	6	3722384	3722389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438851
64236	NC_022221	TTA	2	6	3722464	3722469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438851
64237	NC_022221	GCG	2	6	3722642	3722647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438851
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64239	NC_022221	ATT	3	9	3723196	3723204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438852
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64243	NC_022221	CGAT	2	8	3723386	3723393	25 %	25 %	25 %	25 %	537438852
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64245	NC_022221	TGA	2	6	3723521	3723526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438852
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64248	NC_022221	GCG	2	6	3723680	3723685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438852
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64261	NC_022221	CG	3	6	3724341	3724346	0 %	0 %	50 %	50 %	537438852
64262	NC_022221	CCG	2	6	3724352	3724357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438852
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64268	NC_022221	CGAACG	2	12	3724587	3724598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438852
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64309	NC_022221	CTG	2	6	3727220	3727225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438857
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64321	NC_022221	TGG	2	6	3727827	3727832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438858
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64329	NC_022221	CTG	2	6	3728087	3728092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438859
64330	NC_022221	CGAC	2	8	3728132	3728139	25 %	0 %	25 %	50 %	537438859
64331	NC_022221	A	6	6	3728146	3728151	100 %	0 %	0 %	0 %	537438859
64332	NC_022221	ATC	2	6	3728173	3728178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438859
64333	NC_022221	CAAA	2	8	3728186	3728193	75 %	0 %	0 %	25 %	537438859
64334	NC_022221	CGC	2	6	3728194	3728199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438859
64335	NC_022221	AGCAG	2	10	3728229	3728238	40 %	0 %	40 %	20 %	537438859
64336	NC_022221	GGCGCA	2	12	3728256	3728267	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	537438859
64337	NC_022221	ATC	2	6	3728353	3728358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438859
64338	NC_022221	GCT	2	6	3728377	3728382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438859
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64340	NC_022221	AGC	2	6	3728474	3728479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438860
64341	NC_022221	GCC	2	6	3728538	3728543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438860
64342	NC_022221	GAAC	2	8	3728555	3728562	50 %	0 %	25 %	25 %	537438860
64343	NC_022221	TC	3	6	3728576	3728581	0 %	50 %	0 %	50 %	537438860
64344	NC_022221	GC	3	6	3728584	3728589	0 %	0 %	50 %	50 %	537438860
64345	NC_022221	CGCT	2	8	3728602	3728609	0 %	25 %	25 %	50 %	537438860
64346	NC_022221	GAT	2	6	3728669	3728674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438860
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64348	NC_022221	GCC	2	6	3728736	3728741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438860
64349	NC_022221	AGC	2	6	3728794	3728799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438860
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64450	NC_022221	CTTTT	2	10	3733951	3733960	0 %	80 %	0 %	20 %	537438865
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64457	NC_022221	A	7	7	3734317	3734323	100 %	0 %	0 %	0 %	537438866
64458	NC_022221	TGC	2	6	3734611	3734616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438867
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64463	NC_022221	T	6	6	3734808	3734813	0 %	100 %	0 %	0 %	537438867
64464	NC_022221	CGA	2	6	3734816	3734821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438867
64465	NC_022221	GGT	2	6	3734904	3734909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438867
64466	NC_022221	TTA	2	6	3734916	3734921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438867
64467	NC_022221	TGA	2	6	3735011	3735016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438867
64468	NC_022221	AAT	2	6	3735102	3735107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438867
64469	NC_022221	ATC	2	6	3735135	3735140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438867
64470	NC_022221	AGGA	2	8	3735154	3735161	50 %	0 %	50 %	0 %	537438867
64471	NC_022221	CGC	2	6	3735170	3735175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438867
64472	NC_022221	ACGG	2	8	3735201	3735208	25 %	0 %	50 %	25 %	537438867
64473	NC_022221	CTG	2	6	3735273	3735278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438867
64474	NC_022221	ATC	2	6	3735369	3735374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438867
64475	NC_022221	ATT	2	6	3735423	3735428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438867
64476	NC_022221	GTG	2	6	3735474	3735479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438867
64477	NC_022221	TGAAA	2	10	3735578	3735587	60 %	20 %	20 %	0 %	537438867
64478	NC_022221	A	6	6	3735585	3735590	100 %	0 %	0 %	0 %	537438867
64479	NC_022221	ACCT	2	8	3735627	3735634	25 %	25 %	0 %	50 %	537438867
64480	NC_022221	ATG	2	6	3735694	3735699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438867
64481	NC_022221	CGA	2	6	3735728	3735733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438867
64482	NC_022221	TGG	2	6	3735760	3735765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438867
64483	NC_022221	CCA	2	6	3735790	3735795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438867
64484	NC_022221	CGC	2	6	3735797	3735802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438867
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64486	NC_022221	TG	3	6	3736095	3736100	0 %	50 %	50 %	0 %	537438868
64487	NC_022221	TTG	2	6	3736104	3736109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438868
64488	NC_022221	CGT	2	6	3736157	3736162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438868
64489	NC_022221	GTG	2	6	3736199	3736204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438868
64490	NC_022221	GAA	2	6	3736271	3736276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438868
64491	NC_022221	GGC	2	6	3736289	3736294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438868
64492	NC_022221	TGG	2	6	3736377	3736382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438868
64493	NC_022221	CAT	2	6	3736393	3736398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438868
64494	NC_022221	GTG	2	6	3736554	3736559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438868
64495	NC_022221	GGC	2	6	3736606	3736611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438868
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64498	NC_022221	GAT	2	6	3736952	3736957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438868
64499	NC_022221	TGT	2	6	3736959	3736964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438868
64500	NC_022221	TGA	2	6	3737121	3737126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438868

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