MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63002	NC_022221	ATG	3	9	3644332	3644340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438782
63003	NC_022221	A	7	7	3644401	3644407	100 %	0 %	0 %	0 %	537438782
63004	NC_022221	A	6	6	3644845	3644850	100 %	0 %	0 %	0 %	537438783
63005	NC_022221	GAA	2	6	3644909	3644914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438783
63006	NC_022221	GCATCG	2	12	3644944	3644955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	537438783
63007	NC_022221	CTG	2	6	3644979	3644984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438783
63008	NC_022221	CAT	2	6	3645044	3645049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438783
63009	NC_022221	CGC	2	6	3645090	3645095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438783
63010	NC_022221	CG	3	6	3645138	3645143	0 %	0 %	50 %	50 %	537438783
63011	NC_022221	ACA	2	6	3645152	3645157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438783
63012	NC_022221	GCT	2	6	3645188	3645193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438783
63013	NC_022221	ATT	2	6	3645202	3645207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438783
63014	NC_022221	ACC	2	6	3645258	3645263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438783
63015	NC_022221	TCAATA	2	12	3645271	3645282	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	537438783
63016	NC_022221	CTG	2	6	3645303	3645308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438783
63017	NC_022221	GCC	2	6	3645340	3645345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438783
63018	NC_022221	GGT	2	6	3645404	3645409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438783
63019	NC_022221	GCCA	2	8	3645417	3645424	25 %	0 %	25 %	50 %	537438783
63020	NC_022221	TGA	2	6	3645536	3645541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438783
63021	NC_022221	GCC	2	6	3645549	3645554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438783
63022	NC_022221	GGC	2	6	3645570	3645575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438783
63023	NC_022221	GCT	2	6	3645620	3645625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438783
63024	NC_022221	CTGC	2	8	3645660	3645667	0 %	25 %	25 %	50 %	537438783
63025	NC_022221	GC	3	6	3645752	3645757	0 %	0 %	50 %	50 %	537438783
63026	NC_022221	GCC	2	6	3645768	3645773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438783
63027	NC_022221	GACC	2	8	3645782	3645789	25 %	0 %	25 %	50 %	537438783
63028	NC_022221	GC	3	6	3645819	3645824	0 %	0 %	50 %	50 %	537438783
63029	NC_022221	GTG	2	6	3645886	3645891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438783
63030	NC_022221	CGG	3	9	3645917	3645925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438783
63031	NC_022221	GGCCG	2	10	3645983	3645992	0 %	0 %	60 %	40 %	537438783
63032	NC_022221	CGA	2	6	3646040	3646045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438783
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63036	NC_022221	AAC	2	6	3646221	3646226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438784
63037	NC_022221	CGC	2	6	3646231	3646236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438784
63038	NC_022221	GAG	2	6	3646253	3646258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438784
63039	NC_022221	CTG	2	6	3646297	3646302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438784
63040	NC_022221	CGA	2	6	3646309	3646314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438784
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63042	NC_022221	GGCTGG	2	12	3646560	3646571	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	537438784
63043	NC_022221	CT	3	6	3646622	3646627	0 %	50 %	0 %	50 %	537438784
63044	NC_022221	GATC	2	8	3646657	3646664	25 %	25 %	25 %	25 %	537438784
63045	NC_022221	AGCC	2	8	3646672	3646679	25 %	0 %	25 %	50 %	537438784
63046	NC_022221	AGC	2	6	3646704	3646709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438784
63047	NC_022221	TGA	2	6	3646725	3646730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438784
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63049	NC_022221	CCA	2	6	3646929	3646934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438784
63050	NC_022221	CCG	2	6	3647004	3647009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438784
63051	NC_022221	GCT	3	9	3647029	3647037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438784
63052	NC_022221	GCC	2	6	3647046	3647051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438784
63053	NC_022221	GTG	2	6	3647075	3647080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438784
63054	NC_022221	CGTC	2	8	3647119	3647126	0 %	25 %	25 %	50 %	537438784
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63056	NC_022221	CGC	2	6	3647188	3647193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438784
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63058	NC_022221	GCT	2	6	3647227	3647232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438784
63059	NC_022221	GC	3	6	3647233	3647238	0 %	0 %	50 %	50 %	537438784
63060	NC_022221	CTG	2	6	3647240	3647245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438784
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63062	NC_022221	GCT	2	6	3647305	3647310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438784
63063	NC_022221	GCT	2	6	3647774	3647779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438785
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63065	NC_022221	ACG	2	6	3647914	3647919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438785
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63067	NC_022221	CCAC	2	8	3647977	3647984	25 %	0 %	0 %	75 %	537438785
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63071	NC_022221	GGCCA	2	10	3648165	3648174	20 %	0 %	40 %	40 %	537438785
63072	NC_022221	GATA	2	8	3648266	3648273	50 %	25 %	25 %	0 %	537438785
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63088	NC_022221	CG	3	6	3649427	3649432	0 %	0 %	50 %	50 %	537438786
63089	NC_022221	CG	3	6	3649468	3649473	0 %	0 %	50 %	50 %	537438786
63090	NC_022221	AGA	2	6	3649577	3649582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438786
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63092	NC_022221	GC	3	6	3649621	3649626	0 %	0 %	50 %	50 %	537438786
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63101	NC_022221	CGG	2	6	3650259	3650264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438788
63102	NC_022221	GA	3	6	3650273	3650278	50 %	0 %	50 %	0 %	537438788
63103	NC_022221	CAG	2	6	3650304	3650309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438788
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63116	NC_022221	GCG	2	6	3650933	3650938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438789
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63220	NC_022221	GCG	2	6	3659954	3659959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438795
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63234	NC_022221	CCG	2	6	3660493	3660498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438796
63235	NC_022221	CG	3	6	3660518	3660523	0 %	0 %	50 %	50 %	537438796
63236	NC_022221	GCT	2	6	3660540	3660545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438796
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63465	NC_022221	CAA	2	6	3672575	3672580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438814
63466	NC_022221	CCG	2	6	3672602	3672607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438814
63467	NC_022221	ACG	2	6	3672641	3672646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438814
63468	NC_022221	GAC	2	6	3672691	3672696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438814
63469	NC_022221	GCG	2	6	3672710	3672715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438814
63470	NC_022221	TAA	2	6	3672786	3672791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438814
63471	NC_022221	GGCA	2	8	3672809	3672816	25 %	0 %	50 %	25 %	537438814
63472	NC_022221	CGG	2	6	3672834	3672839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438814
63473	NC_022221	CTT	2	6	3672855	3672860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438814
63474	NC_022221	ATA	2	6	3672908	3672913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438814
63475	NC_022221	GCT	2	6	3672914	3672919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438814
63476	NC_022221	GC	3	6	3672938	3672943	0 %	0 %	50 %	50 %	537438814
63477	NC_022221	CTACG	2	10	3672980	3672989	20 %	20 %	20 %	40 %	537438814
63478	NC_022221	CTG	2	6	3673018	3673023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438814
63479	NC_022221	ACTG	2	8	3673029	3673036	25 %	25 %	25 %	25 %	537438814
63480	NC_022221	ACG	2	6	3673076	3673081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438814
63481	NC_022221	CCT	2	6	3673202	3673207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438814
63482	NC_022221	AGA	2	6	3673287	3673292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438814
63483	NC_022221	CT	3	6	3673306	3673311	0 %	50 %	0 %	50 %	537438814
63484	NC_022221	GGC	2	6	3673356	3673361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438814
63485	NC_022221	GCG	2	6	3673394	3673399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438814
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63491	NC_022221	CAC	2	6	3673816	3673821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438814
63492	NC_022221	CGG	2	6	3673830	3673835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438814
63493	NC_022221	GTT	2	6	3673845	3673850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438814
63494	NC_022221	GCA	2	6	3673862	3673867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438814
63495	NC_022221	TGC	2	6	3673877	3673882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438814
63496	NC_022221	ATG	2	6	3673912	3673917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438814
63497	NC_022221	ACC	2	6	3673999	3674004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438814
63498	NC_022221	TGC	2	6	3674106	3674111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438814
63499	NC_022221	AATATC	2	12	3674126	3674137	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	537438814
63500	NC_022221	CTG	2	6	3674152	3674157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438814

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