MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
62501	NC_022221	GCGG	2	8	3618886	3618893	0 %	0 %	75 %	25 %	537438753
62502	NC_022221	AAT	2	6	3618968	3618973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438753
62503	NC_022221	TCG	2	6	3618975	3618980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438753
62504	NC_022221	AAT	2	6	3619005	3619010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438753
62505	NC_022221	AAAT	2	8	3619078	3619085	75 %	25 %	0 %	0 %	537438753
62506	NC_022221	ACG	2	6	3619156	3619161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438753
62507	NC_022221	TCA	2	6	3619170	3619175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438753
62508	NC_022221	GCT	2	6	3619297	3619302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438753
62509	NC_022221	T	6	6	3619306	3619311	0 %	100 %	0 %	0 %	537438753
62510	NC_022221	AAT	2	6	3619496	3619501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438753
62511	NC_022221	GCC	2	6	3619532	3619537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438753
62512	NC_022221	CA	3	6	3619625	3619630	50 %	0 %	0 %	50 %	537438753
62513	NC_022221	TGAC	2	8	3619689	3619696	25 %	25 %	25 %	25 %	537438754
62514	NC_022221	T	6	6	3619712	3619717	0 %	100 %	0 %	0 %	537438754
62515	NC_022221	GTA	2	6	3619740	3619745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438754
62516	NC_022221	A	6	6	3619757	3619762	100 %	0 %	0 %	0 %	537438754
62517	NC_022221	ATA	2	6	3619930	3619935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438755
62518	NC_022221	GAA	2	6	3619962	3619967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438755
62519	NC_022221	CTA	2	6	3619994	3619999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438755
62520	NC_022221	AGCG	2	8	3620028	3620035	25 %	0 %	50 %	25 %	537438755
62521	NC_022221	CTG	2	6	3620067	3620072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438755
62522	NC_022221	TAT	2	6	3620093	3620098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438755
62523	NC_022221	TGC	2	6	3620185	3620190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438755
62524	NC_022221	GCC	2	6	3620235	3620240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438755
62525	NC_022221	CTG	2	6	3620274	3620279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438755
62526	NC_022221	CAA	2	6	3620343	3620348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438755
62527	NC_022221	CGG	2	6	3620369	3620374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438755
62528	NC_022221	TAT	2	6	3620429	3620434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438755
62529	NC_022221	CGC	2	6	3620440	3620445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438755
62530	NC_022221	GC	3	6	3620447	3620452	0 %	0 %	50 %	50 %	537438755
62531	NC_022221	ATC	2	6	3620453	3620458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438755
62532	NC_022221	GCC	2	6	3620532	3620537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438755
62533	NC_022221	AAC	2	6	3620611	3620616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438755
62534	NC_022221	T	7	7	3620660	3620666	0 %	100 %	0 %	0 %	537438755
62535	NC_022221	ATT	2	6	3620682	3620687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438755
62536	NC_022221	AATT	2	8	3620710	3620717	50 %	50 %	0 %	0 %	537438755
62537	NC_022221	CGG	2	6	3620768	3620773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438755
62538	NC_022221	TAT	2	6	3620792	3620797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438755
62539	NC_022221	AAT	2	6	3620858	3620863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438755
62540	NC_022221	A	6	6	3622579	3622584	100 %	0 %	0 %	0 %	537438756
62541	NC_022221	GAA	2	6	3622592	3622597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438756
62542	NC_022221	CGT	2	6	3622664	3622669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438756
62543	NC_022221	TAC	2	6	3622672	3622677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438756
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62545	NC_022221	T	6	6	3622726	3622731	0 %	100 %	0 %	0 %	537438756
62546	NC_022221	GGAA	2	8	3622763	3622770	50 %	0 %	50 %	0 %	537438756
62547	NC_022221	TAA	2	6	3622835	3622840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438756
62548	NC_022221	TTA	2	6	3622867	3622872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438756
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62551	NC_022221	TGA	2	6	3623049	3623054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438757
62552	NC_022221	ACC	2	6	3623142	3623147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438757
62553	NC_022221	CCCG	2	8	3623172	3623179	0 %	0 %	25 %	75 %	537438758
62554	NC_022221	CCA	2	6	3623206	3623211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438758
62555	NC_022221	CAG	2	6	3623212	3623217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438758
62556	NC_022221	A	6	6	3623219	3623224	100 %	0 %	0 %	0 %	537438758
62557	NC_022221	GAT	2	6	3623288	3623293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438758
62558	NC_022221	GGA	2	6	3623299	3623304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438758
62559	NC_022221	GTCT	2	8	3623515	3623522	0 %	50 %	25 %	25 %	537438759
62560	NC_022221	GGC	2	6	3623547	3623552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438759
62561	NC_022221	TAA	2	6	3623631	3623636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438759
62562	NC_022221	AAG	2	6	3623689	3623694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438759
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62564	NC_022221	CG	5	10	3623810	3623819	0 %	0 %	50 %	50 %	537438759
62565	NC_022221	GCGCG	3	15	3623815	3623829	0 %	0 %	60 %	40 %	537438759
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62567	NC_022221	ATA	2	6	3623962	3623967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438759
62568	NC_022221	GCTG	2	8	3624053	3624060	0 %	25 %	50 %	25 %	537438759
62569	NC_022221	CTG	2	6	3624087	3624092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438759
62570	NC_022221	GAT	2	6	3624096	3624101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438759
62571	NC_022221	A	6	6	3624102	3624107	100 %	0 %	0 %	0 %	537438759
62572	NC_022221	CGG	2	6	3624286	3624291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438760
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62574	NC_022221	CAGTAT	2	12	3624346	3624357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	537438760
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62576	NC_022221	ACA	2	6	3624407	3624412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438760
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62582	NC_022221	CCA	2	6	3624565	3624570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438760
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62585	NC_022221	AAT	2	6	3624632	3624637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438760
62586	NC_022221	GCC	3	9	3624678	3624686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438760
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62589	NC_022221	GC	3	6	3624745	3624750	0 %	0 %	50 %	50 %	537438760
62590	NC_022221	CGC	2	6	3624758	3624763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438760
62591	NC_022221	GCA	2	6	3624781	3624786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438760
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62593	NC_022221	GGC	2	6	3624809	3624814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438760
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62600	NC_022221	GCA	2	6	3625027	3625032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438760
62601	NC_022221	ATG	2	6	3625041	3625046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438760
62602	NC_022221	ATC	2	6	3625064	3625069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438760
62603	NC_022221	GTC	2	6	3625128	3625133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438760
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62606	NC_022221	CGG	3	9	3625204	3625212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438760
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62608	NC_022221	TTTTG	2	10	3625234	3625243	0 %	80 %	20 %	0 %	537438760
62609	NC_022221	ATG	2	6	3625254	3625259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438760
62610	NC_022221	GAAA	2	8	3625302	3625309	75 %	0 %	25 %	0 %	537438761
62611	NC_022221	CAG	2	6	3625406	3625411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438761
62612	NC_022221	CAG	2	6	3625448	3625453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438761
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62614	NC_022221	CGA	2	6	3625489	3625494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438761
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62966	NC_022221	AAT	2	6	3642667	3642672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438781
62967	NC_022221	ATC	2	6	3642711	3642716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438781
62968	NC_022221	CTG	2	6	3642806	3642811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438781
62969	NC_022221	GCA	2	6	3642814	3642819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438781
62970	NC_022221	CTG	2	6	3642839	3642844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438781
62971	NC_022221	TAAT	2	8	3642895	3642902	50 %	50 %	0 %	0 %	537438781
62972	NC_022221	TCG	2	6	3642939	3642944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438781
62973	NC_022221	TCA	2	6	3642970	3642975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438781
62974	NC_022221	ATTC	2	8	3643070	3643077	25 %	50 %	0 %	25 %	537438781
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62976	NC_022221	ATC	2	6	3643131	3643136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438781
62977	NC_022221	GCA	2	6	3643189	3643194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438781
62978	NC_022221	CGC	2	6	3643252	3643257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438781
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62980	NC_022221	TCA	2	6	3643395	3643400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438781
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62989	NC_022221	GTTG	2	8	3643905	3643912	0 %	50 %	50 %	0 %	537438782
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62999	NC_022221	GCA	2	6	3644124	3644129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438782
63000	NC_022221	AC	3	6	3644242	3644247	50 %	0 %	0 %	50 %	537438782

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