MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60001	NC_022221	GCC	2	6	3482791	3482796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438638
60002	NC_022221	TCG	2	6	3482813	3482818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438638
60003	NC_022221	GGC	2	6	3482850	3482855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438638
60004	NC_022221	CGCC	2	8	3482887	3482894	0 %	0 %	25 %	75 %	537438638
60005	NC_022221	AAGG	2	8	3482972	3482979	50 %	0 %	50 %	0 %	537438638
60006	NC_022221	CGCAC	2	10	3483027	3483036	20 %	0 %	20 %	60 %	537438638
60007	NC_022221	C	6	6	3483071	3483076	0 %	0 %	0 %	100 %	537438638
60008	NC_022221	CTG	2	6	3483127	3483132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438638
60009	NC_022221	CGC	2	6	3483139	3483144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438638
60010	NC_022221	GGT	2	6	3483228	3483233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438638
60011	NC_022221	GAT	2	6	3483235	3483240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438638
60012	NC_022221	TGC	2	6	3483482	3483487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438638
60013	NC_022221	AAT	2	6	3484275	3484280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438639
60014	NC_022221	GC	3	6	3484440	3484445	0 %	0 %	50 %	50 %	537438639
60015	NC_022221	A	6	6	3484478	3484483	100 %	0 %	0 %	0 %	537438639
60016	NC_022221	CAG	2	6	3484527	3484532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438639
60017	NC_022221	CGC	3	9	3484584	3484592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438639
60018	NC_022221	T	6	6	3484599	3484604	0 %	100 %	0 %	0 %	537438639
60019	NC_022221	GC	3	6	3484607	3484612	0 %	0 %	50 %	50 %	537438639
60020	NC_022221	GCA	2	6	3484616	3484621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438639
60021	NC_022221	GCC	3	9	3484650	3484658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438639
60022	NC_022221	T	6	6	3484688	3484693	0 %	100 %	0 %	0 %	537438639
60023	NC_022221	GAT	2	6	3484695	3484700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438639
60024	NC_022221	AGC	2	6	3484714	3484719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438639
60025	NC_022221	CGCC	2	8	3484724	3484731	0 %	0 %	25 %	75 %	537438639
60026	NC_022221	CGC	2	6	3484742	3484747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438639
60027	NC_022221	CAT	2	6	3484767	3484772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438639
60028	NC_022221	CTT	2	6	3484775	3484780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438639
60029	NC_022221	CAG	2	6	3484796	3484801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438639
60030	NC_022221	GAA	2	6	3484812	3484817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438639
60031	NC_022221	CGGGGC	2	12	3484823	3484834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438639
60032	NC_022221	CAT	3	9	3484878	3484886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438639
60033	NC_022221	ACT	2	6	3484949	3484954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438640
60034	NC_022221	TCA	2	6	3484960	3484965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438640
60035	NC_022221	GC	3	6	3484976	3484981	0 %	0 %	50 %	50 %	537438640
60036	NC_022221	CGT	2	6	3485099	3485104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438640
60037	NC_022221	CGG	2	6	3485118	3485123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438640
60038	NC_022221	TCA	2	6	3485134	3485139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438640
60039	NC_022221	CCG	2	6	3485194	3485199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438640
60040	NC_022221	CGA	2	6	3485231	3485236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438640
60041	NC_022221	CG	3	6	3485284	3485289	0 %	0 %	50 %	50 %	537438640
60042	NC_022221	TGC	2	6	3485314	3485319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438640
60043	NC_022221	ATGA	2	8	3485346	3485353	50 %	25 %	25 %	0 %	537438640
60044	NC_022221	CGC	2	6	3485456	3485461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438640
60045	NC_022221	CAT	2	6	3485546	3485551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438640
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60047	NC_022221	ACG	2	6	3485730	3485735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438640
60048	NC_022221	GCAG	2	8	3485779	3485786	25 %	0 %	50 %	25 %	537438640
60049	NC_022221	TAG	2	6	3485818	3485823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438640
60050	NC_022221	ACG	2	6	3485854	3485859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438640
60051	NC_022221	ACGT	2	8	3485862	3485869	25 %	25 %	25 %	25 %	537438640
60052	NC_022221	GTTT	2	8	3485873	3485880	0 %	75 %	25 %	0 %	537438640
60053	NC_022221	CCA	2	6	3485906	3485911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438640
60054	NC_022221	TCG	2	6	3485923	3485928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438640
60055	NC_022221	GCC	2	6	3485986	3485991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438640
60056	NC_022221	GC	3	6	3486015	3486020	0 %	0 %	50 %	50 %	537438640
60057	NC_022221	GAT	2	6	3486057	3486062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438640
60058	NC_022221	TCGG	2	8	3486146	3486153	0 %	25 %	50 %	25 %	537438640
60059	NC_022221	AAT	2	6	3486201	3486206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438640
60060	NC_022221	GTG	2	6	3486217	3486222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438640
60061	NC_022221	TCG	2	6	3486223	3486228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438640
60062	NC_022221	CGGA	2	8	3486300	3486307	25 %	0 %	50 %	25 %	537438640
60063	NC_022221	GAT	2	6	3486377	3486382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438640
60064	NC_022221	CAG	2	6	3486423	3486428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438640
60065	NC_022221	GCT	3	9	3486467	3486475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438640
60066	NC_022221	CGC	3	9	3486501	3486509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438640
60067	NC_022221	TCA	2	6	3486545	3486550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438640
60068	NC_022221	ACG	3	9	3486568	3486576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438640
60069	NC_022221	CAA	2	6	3486591	3486596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438640
60070	NC_022221	GCC	3	9	3486624	3486632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438640
60071	NC_022221	GAC	2	6	3486642	3486647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438640
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60073	NC_022221	CAATC	2	10	3486855	3486864	40 %	20 %	0 %	40 %	537438641
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60075	NC_022221	ACGCCG	2	12	3486885	3486896	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537438641
60076	NC_022221	CGC	2	6	3487006	3487011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438641
60077	NC_022221	TAA	2	6	3487089	3487094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438641
60078	NC_022221	AT	3	6	3487098	3487103	50 %	50 %	0 %	0 %	537438641
60079	NC_022221	TCG	2	6	3487122	3487127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438641
60080	NC_022221	CCAG	2	8	3487162	3487169	25 %	0 %	25 %	50 %	537438641
60081	NC_022221	CCA	2	6	3487379	3487384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438641
60082	NC_022221	AGT	2	6	3487555	3487560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438641
60083	NC_022221	GAT	2	6	3487616	3487621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438641
60084	NC_022221	CAT	2	6	3487642	3487647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438641
60085	NC_022221	CTT	2	6	3487666	3487671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438641
60086	NC_022221	TGGC	2	8	3487699	3487706	0 %	25 %	50 %	25 %	537438641
60087	NC_022221	AAC	2	6	3487707	3487712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438641
60088	NC_022221	GCTGGA	2	12	3487983	3487994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	537438642
60089	NC_022221	CAA	2	6	3488028	3488033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438642
60090	NC_022221	GAT	2	6	3488040	3488045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438642
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60098	NC_022221	GCC	2	6	3488450	3488455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438643
60099	NC_022221	TATTT	2	10	3488456	3488465	20 %	80 %	0 %	0 %	537438643
60100	NC_022221	TGG	2	6	3488556	3488561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438643
60101	NC_022221	GCT	2	6	3488563	3488568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438643
60102	NC_022221	AGA	2	6	3488619	3488624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438643
60103	NC_022221	CTG	2	6	3488630	3488635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438643
60104	NC_022221	CCG	2	6	3488643	3488648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438643
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60106	NC_022221	TAT	2	6	3488670	3488675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438643
60107	NC_022221	AAT	2	6	3488690	3488695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438643
60108	NC_022221	GAT	2	6	3488758	3488763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438643
60109	NC_022221	TGGC	2	8	3488795	3488802	0 %	25 %	50 %	25 %	537438643
60110	NC_022221	GCG	2	6	3488820	3488825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438643
60111	NC_022221	AAG	2	6	3488912	3488917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438643
60112	NC_022221	GGC	2	6	3489058	3489063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438643
60113	NC_022221	GCT	2	6	3489085	3489090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438643
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60115	NC_022221	GCG	2	6	3489280	3489285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438643
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60347	NC_022221	GCT	2	6	3502020	3502025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438656
60348	NC_022221	CGGTCT	2	12	3502086	3502097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438656
60349	NC_022221	CG	3	6	3502124	3502129	0 %	0 %	50 %	50 %	537438656
60350	NC_022221	AATA	2	8	3502144	3502151	75 %	25 %	0 %	0 %	537438656
60351	NC_022221	GTA	2	6	3502178	3502183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438656
60352	NC_022221	TCG	2	6	3502184	3502189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438656
60353	NC_022221	CGT	2	6	3502204	3502209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438656
60354	NC_022221	CGTT	2	8	3502249	3502256	0 %	50 %	25 %	25 %	537438656
60355	NC_022221	TGGCCG	2	12	3502319	3502330	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537438656
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60363	NC_022221	GC	3	6	3502604	3502609	0 %	0 %	50 %	50 %	537438656
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60402	NC_022221	ACG	2	6	3504109	3504114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438658
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60451	NC_022221	TGC	2	6	3505632	3505637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438659
60452	NC_022221	AGG	2	6	3505719	3505724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438659
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60463	NC_022221	GAT	2	6	3507326	3507331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438661
60464	NC_022221	CAAAAT	2	12	3507356	3507367	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	537438661
60465	NC_022221	AG	3	6	3507368	3507373	50 %	0 %	50 %	0 %	537438661
60466	NC_022221	GA	3	6	3507403	3507408	50 %	0 %	50 %	0 %	537438661
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60483	NC_022221	AAT	2	6	3507899	3507904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438661
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60490	NC_022221	CAG	2	6	3508244	3508249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438661
60491	NC_022221	GCCC	2	8	3508259	3508266	0 %	0 %	25 %	75 %	537438661
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60494	NC_022221	T	6	6	3508370	3508375	0 %	100 %	0 %	0 %	537438661
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60499	NC_022221	GCT	2	6	3508887	3508892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438662
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