MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_022221	GCC	2	6	3362419	3362424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438536
58002	NC_022221	CAC	2	6	3362433	3362438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438536
58003	NC_022221	AG	3	6	3362469	3362474	50 %	0 %	50 %	0 %	537438536
58004	NC_022221	CAC	3	9	3362493	3362501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438536
58005	NC_022221	TGA	2	6	3362546	3362551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438536
58006	NC_022221	CGC	2	6	3362552	3362557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438536
58007	NC_022221	TTTG	2	8	3362562	3362569	0 %	75 %	25 %	0 %	537438536
58008	NC_022221	AAC	2	6	3362584	3362589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438536
58009	NC_022221	TAAGG	2	10	3362769	3362778	40 %	20 %	40 %	0 %	537438536
58010	NC_022221	AAT	2	6	3363054	3363059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438537
58011	NC_022221	TCA	2	6	3363091	3363096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438537
58012	NC_022221	CTT	2	6	3363155	3363160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438537
58013	NC_022221	CATTTT	2	12	3363210	3363221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	537438537
58014	NC_022221	T	6	6	3363218	3363223	0 %	100 %	0 %	0 %	537438537
58015	NC_022221	CCG	2	6	3363281	3363286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438537
58016	NC_022221	GC	3	6	3363392	3363397	0 %	0 %	50 %	50 %	537438537
58017	NC_022221	ACC	2	6	3363442	3363447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438537
58018	NC_022221	TTA	2	6	3363454	3363459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438537
58019	NC_022221	CCG	2	6	3363482	3363487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438537
58020	NC_022221	CTA	2	6	3363572	3363577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438537
58021	NC_022221	GCA	2	6	3363602	3363607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438537
58022	NC_022221	AAG	2	6	3363633	3363638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438537
58023	NC_022221	ATT	2	6	3363695	3363700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438538
58024	NC_022221	AG	3	6	3363709	3363714	50 %	0 %	50 %	0 %	537438538
58025	NC_022221	TCA	2	6	3363743	3363748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438538
58026	NC_022221	CGC	2	6	3363749	3363754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438538
58027	NC_022221	T	6	6	3363811	3363816	0 %	100 %	0 %	0 %	537438538
58028	NC_022221	CTG	2	6	3363856	3363861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438538
58029	NC_022221	TCT	2	6	3363935	3363940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438538
58030	NC_022221	CAGC	2	8	3363945	3363952	25 %	0 %	25 %	50 %	537438538
58031	NC_022221	AGG	2	6	3363968	3363973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438538
58032	NC_022221	CGG	2	6	3364011	3364016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438538
58033	NC_022221	A	6	6	3364103	3364108	100 %	0 %	0 %	0 %	537438538
58034	NC_022221	GCT	2	6	3364164	3364169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438538
58035	NC_022221	TTC	2	6	3364192	3364197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438538
58036	NC_022221	ACG	2	6	3364283	3364288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438538
58037	NC_022221	TTAT	2	8	3364404	3364411	25 %	75 %	0 %	0 %	537438539
58038	NC_022221	TAA	2	6	3364412	3364417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438539
58039	NC_022221	T	6	6	3364440	3364445	0 %	100 %	0 %	0 %	537438539
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58042	NC_022221	CCA	2	6	3364595	3364600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438539
58043	NC_022221	CG	3	6	3364645	3364650	0 %	0 %	50 %	50 %	537438539
58044	NC_022221	AG	3	6	3364665	3364670	50 %	0 %	50 %	0 %	537438539
58045	NC_022221	CCG	3	9	3364681	3364689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438539
58046	NC_022221	CGA	2	6	3364700	3364705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438539
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58048	NC_022221	CAG	2	6	3364785	3364790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438539
58049	NC_022221	AACTTC	2	12	3364830	3364841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438539
58050	NC_022221	GAT	2	6	3364887	3364892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438539
58051	NC_022221	GTTT	2	8	3364916	3364923	0 %	75 %	25 %	0 %	537438539
58052	NC_022221	T	6	6	3364941	3364946	0 %	100 %	0 %	0 %	537438539
58053	NC_022221	CCG	2	6	3364955	3364960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438539
58054	NC_022221	GGT	2	6	3364971	3364976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438539
58055	NC_022221	CACG	2	8	3365001	3365008	25 %	0 %	25 %	50 %	537438539
58056	NC_022221	CTG	2	6	3365031	3365036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438539
58057	NC_022221	CGTTAA	2	12	3365060	3365071	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	537438539
58058	NC_022221	TAC	2	6	3365124	3365129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438539
58059	NC_022221	T	6	6	3365278	3365283	0 %	100 %	0 %	0 %	537438539
58060	NC_022221	ACC	2	6	3365310	3365315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438539
58061	NC_022221	AGC	2	6	3365316	3365321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438539
58062	NC_022221	CTC	2	6	3365805	3365810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438540
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58069	NC_022221	CG	3	6	3366080	3366085	0 %	0 %	50 %	50 %	537438540
58070	NC_022221	CTG	2	6	3366087	3366092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438540
58071	NC_022221	CGA	2	6	3366137	3366142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438540
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58073	NC_022221	CGC	2	6	3366654	3366659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438541
58074	NC_022221	ATCGG	2	10	3366700	3366709	20 %	20 %	40 %	20 %	537438541
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58077	NC_022221	CT	3	6	3367004	3367009	0 %	50 %	0 %	50 %	537438542
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58083	NC_022221	TCA	2	6	3367334	3367339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438543
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58085	NC_022221	GAAC	2	8	3367389	3367396	50 %	0 %	25 %	25 %	537438543
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58089	NC_022221	CGG	2	6	3367893	3367898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438544
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58116	NC_022221	GCC	2	6	3369050	3369055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438544
58117	NC_022221	CTT	2	6	3369090	3369095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438544
58118	NC_022221	CCT	2	6	3369171	3369176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438544
58119	NC_022221	ATCG	2	8	3369182	3369189	25 %	25 %	25 %	25 %	537438544
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58121	NC_022221	AGC	2	6	3369275	3369280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438544
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58152	NC_022221	TAAA	2	8	3370663	3370670	75 %	25 %	0 %	0 %	537438546
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58224	NC_022221	GCGT	2	8	3374555	3374562	0 %	25 %	50 %	25 %	537438549
58225	NC_022221	GTA	2	6	3374581	3374586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438549
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58336	NC_022221	TGA	2	6	3379922	3379927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438552
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58342	NC_022221	CGG	2	6	3380255	3380260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438553
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58344	NC_022221	CAG	3	9	3380381	3380389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438553
58345	NC_022221	GC	3	6	3380442	3380447	0 %	0 %	50 %	50 %	537438553
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58455	NC_022221	TA	3	6	3386312	3386317	50 %	50 %	0 %	0 %	537438557
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58460	NC_022221	GC	3	6	3386531	3386536	0 %	0 %	50 %	50 %	537438557
58461	NC_022221	ACC	2	6	3386623	3386628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438557
58462	NC_022221	ATC	2	6	3386687	3386692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438557
58463	NC_022221	GCT	2	6	3386763	3386768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438557
58464	NC_022221	TCGCT	2	10	3386792	3386801	0 %	40 %	20 %	40 %	537438557
58465	NC_022221	T	6	6	3386892	3386897	0 %	100 %	0 %	0 %	537438558
58466	NC_022221	GC	3	6	3387028	3387033	0 %	0 %	50 %	50 %	537438558
58467	NC_022221	ATT	2	6	3387048	3387053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438558
58468	NC_022221	CGC	2	6	3387064	3387069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438558
58469	NC_022221	GTT	2	6	3387153	3387158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438558
58470	NC_022221	GCTG	2	8	3387206	3387213	0 %	25 %	50 %	25 %	537438558
58471	NC_022221	CGT	2	6	3387291	3387296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438558
58472	NC_022221	GCGTT	2	10	3387397	3387406	0 %	40 %	40 %	20 %	537438558
58473	NC_022221	GTG	2	6	3387423	3387428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438558
58474	NC_022221	A	6	6	3387846	3387851	100 %	0 %	0 %	0 %	537438559
58475	NC_022221	GAA	2	6	3387867	3387872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438559
58476	NC_022221	GAA	2	6	3387906	3387911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438559
58477	NC_022221	GCA	2	6	3387959	3387964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438559
58478	NC_022221	GCG	2	6	3387972	3387977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438559
58479	NC_022221	GAT	2	6	3387980	3387985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438559
58480	NC_022221	GCA	2	6	3387986	3387991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438559
58481	NC_022221	TGGT	2	8	3388087	3388094	0 %	50 %	50 %	0 %	537438559
58482	NC_022221	ATG	2	6	3388194	3388199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438559
58483	NC_022221	GTC	2	6	3388284	3388289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438559
58484	NC_022221	TTC	2	6	3388358	3388363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438560
58485	NC_022221	CCGT	2	8	3388471	3388478	0 %	25 %	25 %	50 %	537438560
58486	NC_022221	CTTTAT	2	12	3388605	3388616	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	537438560
58487	NC_022221	A	6	6	3388678	3388683	100 %	0 %	0 %	0 %	537438560
58488	NC_022221	CGA	2	6	3388725	3388730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438560
58489	NC_022221	ATC	2	6	3388777	3388782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438560
58490	NC_022221	CGG	5	15	3388791	3388805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438560
58491	NC_022221	CTAT	2	8	3388973	3388980	25 %	50 %	0 %	25 %	537438560
58492	NC_022221	CCA	2	6	3389013	3389018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438560
58493	NC_022221	GAA	2	6	3389029	3389034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438560
58494	NC_022221	GCGT	2	8	3389095	3389102	0 %	25 %	50 %	25 %	537438560
58495	NC_022221	CGG	2	6	3389255	3389260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438560
58496	NC_022221	CA	3	6	3389277	3389282	50 %	0 %	0 %	50 %	537438560
58497	NC_022221	GGC	2	6	3389389	3389394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438560
58498	NC_022221	GCC	2	6	3389439	3389444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438560
58499	NC_022221	CAT	2	6	3389577	3389582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438560
58500	NC_022221	A	6	6	3389632	3389637	100 %	0 %	0 %	0 %	537438560

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