MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_022221	GCC	2	6	3258936	3258941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438431
56002	NC_022221	CGC	2	6	3258992	3258997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438431
56003	NC_022221	GCC	2	6	3259029	3259034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438431
56004	NC_022221	T	7	7	3259055	3259061	0 %	100 %	0 %	0 %	537438431
56005	NC_022221	ATG	2	6	3259062	3259067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438431
56006	NC_022221	CAA	2	6	3259099	3259104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438431
56007	NC_022221	CAT	2	6	3259322	3259327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438431
56008	NC_022221	GCC	2	6	3259334	3259339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438431
56009	NC_022221	GCC	2	6	3259355	3259360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438431
56010	NC_022221	TTGC	2	8	3259377	3259384	0 %	50 %	25 %	25 %	537438431
56011	NC_022221	GTA	2	6	3259431	3259436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438431
56012	NC_022221	TGG	2	6	3259457	3259462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438431
56013	NC_022221	GCC	3	9	3259482	3259490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438431
56014	NC_022221	CAG	2	6	3259530	3259535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438431
56015	NC_022221	CGC	2	6	3259624	3259629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438431
56016	NC_022221	CGG	2	6	3259708	3259713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438431
56017	NC_022221	CTTT	2	8	3259722	3259729	0 %	75 %	0 %	25 %	537438431
56018	NC_022221	CGT	2	6	3259852	3259857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438432
56019	NC_022221	GTA	2	6	3259890	3259895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438432
56020	NC_022221	GC	3	6	3259904	3259909	0 %	0 %	50 %	50 %	537438432
56021	NC_022221	GTC	2	6	3259914	3259919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438432
56022	NC_022221	CG	3	6	3259935	3259940	0 %	0 %	50 %	50 %	537438432
56023	NC_022221	CAT	2	6	3259950	3259955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438432
56024	NC_022221	CGG	3	9	3259964	3259972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438432
56025	NC_022221	GC	3	6	3259985	3259990	0 %	0 %	50 %	50 %	537438432
56026	NC_022221	TGC	2	6	3260105	3260110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438432
56027	NC_022221	CCG	2	6	3260119	3260124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438432
56028	NC_022221	GGC	2	6	3260193	3260198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438432
56029	NC_022221	CAC	2	6	3260268	3260273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438432
56030	NC_022221	TCA	2	6	3260291	3260296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438432
56031	NC_022221	GTA	2	6	3260301	3260306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438432
56032	NC_022221	C	6	6	3260329	3260334	0 %	0 %	0 %	100 %	537438432
56033	NC_022221	CGC	3	9	3260372	3260380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438432
56034	NC_022221	GCG	2	6	3260447	3260452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438432
56035	NC_022221	ATCA	2	8	3260466	3260473	50 %	25 %	0 %	25 %	537438432
56036	NC_022221	GAT	2	6	3260499	3260504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438432
56037	NC_022221	GCA	2	6	3260549	3260554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438432
56038	NC_022221	TGA	3	9	3260558	3260566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438432
56039	NC_022221	ACC	2	6	3260659	3260664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438432
56040	NC_022221	ATG	2	6	3260710	3260715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438432
56041	NC_022221	ATT	2	6	3260772	3260777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438433
56042	NC_022221	T	6	6	3260776	3260781	0 %	100 %	0 %	0 %	537438433
56043	NC_022221	CGG	2	6	3260870	3260875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438433
56044	NC_022221	CTG	2	6	3260953	3260958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438433
56045	NC_022221	GCG	2	6	3260996	3261001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438433
56046	NC_022221	GCG	2	6	3261047	3261052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438433
56047	NC_022221	AAT	2	6	3261097	3261102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438433
56048	NC_022221	CG	3	6	3261157	3261162	0 %	0 %	50 %	50 %	537438433
56049	NC_022221	CGC	2	6	3261177	3261182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438433
56050	NC_022221	CGG	2	6	3261193	3261198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438433
56051	NC_022221	CAA	2	6	3261243	3261248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438433
56052	NC_022221	TTGG	2	8	3261308	3261315	0 %	50 %	50 %	0 %	537438433
56053	NC_022221	GC	3	6	3261330	3261335	0 %	0 %	50 %	50 %	537438433
56054	NC_022221	GGT	2	6	3261373	3261378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438433
56055	NC_022221	CCAG	2	8	3261411	3261418	25 %	0 %	25 %	50 %	537438433
56056	NC_022221	GGT	2	6	3261445	3261450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438433
56057	NC_022221	CAG	2	6	3261473	3261478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438433
56058	NC_022221	GCC	2	6	3261497	3261502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438433
56059	NC_022221	ATT	2	6	3261824	3261829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438434
56060	NC_022221	TA	3	6	3262115	3262120	50 %	50 %	0 %	0 %	537438435
56061	NC_022221	ATT	2	6	3262148	3262153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438435
56062	NC_022221	ACTG	2	8	3262204	3262211	25 %	25 %	25 %	25 %	537438435
56063	NC_022221	ATC	2	6	3262268	3262273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438435
56064	NC_022221	CG	3	6	3262314	3262319	0 %	0 %	50 %	50 %	537438435
56065	NC_022221	CGA	2	6	3262330	3262335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438435
56066	NC_022221	GCC	2	6	3262360	3262365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438435
56067	NC_022221	GCC	2	6	3262408	3262413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438435
56068	NC_022221	ACC	2	6	3262487	3262492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438435
56069	NC_022221	TG	3	6	3262502	3262507	0 %	50 %	50 %	0 %	537438435
56070	NC_022221	GCG	2	6	3262608	3262613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438435
56071	NC_022221	CGG	3	9	3262629	3262637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438435
56072	NC_022221	ATA	2	6	3262659	3262664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438435
56073	NC_022221	GGC	2	6	3262685	3262690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438435
56074	NC_022221	GCT	2	6	3262738	3262743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438435
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56076	NC_022221	CGA	2	6	3262837	3262842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438435
56077	NC_022221	CCAGCG	2	12	3262882	3262893	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537438435
56078	NC_022221	GTC	2	6	3262919	3262924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438435
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56080	NC_022221	CGG	2	6	3262974	3262979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438435
56081	NC_022221	CTG	2	6	3262997	3263002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438435
56082	NC_022221	GCG	2	6	3263010	3263015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438435
56083	NC_022221	TCT	2	6	3263062	3263067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438435
56084	NC_022221	CGC	2	6	3263070	3263075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438435
56085	NC_022221	GC	3	6	3263074	3263079	0 %	0 %	50 %	50 %	537438435
56086	NC_022221	CTG	2	6	3263105	3263110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438435
56087	NC_022221	CAA	2	6	3263182	3263187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438435
56088	NC_022221	A	6	6	3263186	3263191	100 %	0 %	0 %	0 %	537438435
56089	NC_022221	GGC	2	6	3263192	3263197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438435
56090	NC_022221	CGT	2	6	3263206	3263211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438435
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56094	NC_022221	CGCC	2	8	3263316	3263323	0 %	0 %	25 %	75 %	537438435
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56100	NC_022221	CGC	2	6	3264096	3264101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438436
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56104	NC_022221	A	6	6	3264395	3264400	100 %	0 %	0 %	0 %	537438436
56105	NC_022221	GC	3	6	3264623	3264628	0 %	0 %	50 %	50 %	537438436
56106	NC_022221	GAAA	2	8	3264878	3264885	75 %	0 %	25 %	0 %	537438437
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56112	NC_022221	ACG	2	6	3265335	3265340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438437
56113	NC_022221	CGAC	2	8	3265342	3265349	25 %	0 %	25 %	50 %	537438437
56114	NC_022221	GTTCCG	2	12	3265389	3265400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438437
56115	NC_022221	GCT	2	6	3265479	3265484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438437
56116	NC_022221	ATT	2	6	3265569	3265574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438437
56117	NC_022221	GGC	2	6	3265589	3265594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438437
56118	NC_022221	AAC	2	6	3265792	3265797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438437
56119	NC_022221	TGA	2	6	3265820	3265825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438437
56120	NC_022221	A	6	6	3265854	3265859	100 %	0 %	0 %	0 %	537438437
56121	NC_022221	TAC	2	6	3265860	3265865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438437
56122	NC_022221	AAC	2	6	3265983	3265988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438437
56123	NC_022221	ATTA	2	8	3266006	3266013	50 %	50 %	0 %	0 %	537438437
56124	NC_022221	CGC	2	6	3266068	3266073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438437
56125	NC_022221	ATT	2	6	3266082	3266087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438437
56126	NC_022221	GC	3	6	3266108	3266113	0 %	0 %	50 %	50 %	537438437
56127	NC_022221	AAT	2	6	3266147	3266152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438437
56128	NC_022221	TGG	2	6	3266280	3266285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438438
56129	NC_022221	CTAT	2	8	3266376	3266383	25 %	50 %	0 %	25 %	537438438
56130	NC_022221	GAT	2	6	3266423	3266428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438438
56131	NC_022221	ATC	2	6	3266453	3266458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438438
56132	NC_022221	CGG	2	6	3266478	3266483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438438
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56135	NC_022221	ATA	2	6	3266626	3266631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438438
56136	NC_022221	GCGGT	2	10	3266685	3266694	0 %	20 %	60 %	20 %	537438439
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56138	NC_022221	CGT	2	6	3266860	3266865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438439
56139	NC_022221	A	6	6	3266913	3266918	100 %	0 %	0 %	0 %	537438439
56140	NC_022221	AAT	2	6	3266956	3266961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438440
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56142	NC_022221	CTG	2	6	3267026	3267031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438440
56143	NC_022221	TGGTC	2	10	3267094	3267103	0 %	40 %	40 %	20 %	537438440
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56145	NC_022221	GTG	2	6	3267296	3267301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438440
56146	NC_022221	TGC	2	6	3267339	3267344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438440
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56153	NC_022221	ATTC	2	8	3267871	3267878	25 %	50 %	0 %	25 %	537438440
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56175	NC_022221	GC	3	6	3269356	3269361	0 %	0 %	50 %	50 %	537438441
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56183	NC_022221	TGCC	2	8	3269892	3269899	0 %	25 %	25 %	50 %	537438442
56184	NC_022221	TGG	2	6	3269934	3269939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438442
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56187	NC_022221	GCACG	2	10	3269977	3269986	20 %	0 %	40 %	40 %	537438442
56188	NC_022221	GCG	2	6	3270096	3270101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438442
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56192	NC_022221	CTG	2	6	3270447	3270452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438443
56193	NC_022221	TTC	2	6	3270481	3270486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438443
56194	NC_022221	CTG	2	6	3270500	3270505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438443
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56197	NC_022221	AGC	2	6	3270544	3270549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438443
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56202	NC_022221	GC	3	6	3270677	3270682	0 %	0 %	50 %	50 %	537438443
56203	NC_022221	CAC	2	6	3270723	3270728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438443
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56219	NC_022221	GTC	2	6	3271413	3271418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438444
56220	NC_022221	GCA	2	6	3271526	3271531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438444
56221	NC_022221	GAT	2	6	3271539	3271544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438444
56222	NC_022221	CTG	2	6	3271581	3271586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438444
56223	NC_022221	AAG	2	6	3271588	3271593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438444
56224	NC_022221	CAG	2	6	3271602	3271607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438444
56225	NC_022221	CAAC	2	8	3271622	3271629	50 %	0 %	0 %	50 %	537438444
56226	NC_022221	TTA	2	6	3271671	3271676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438444
56227	NC_022221	GC	3	6	3271714	3271719	0 %	0 %	50 %	50 %	537438444
56228	NC_022221	GCCA	2	8	3271797	3271804	25 %	0 %	25 %	50 %	537438444
56229	NC_022221	GGC	2	6	3271859	3271864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438444
56230	NC_022221	A	7	7	3271876	3271882	100 %	0 %	0 %	0 %	537438444
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56232	NC_022221	GCTG	2	8	3271972	3271979	0 %	25 %	50 %	25 %	537438444
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56335	NC_022221	GCCA	2	8	3276697	3276704	25 %	0 %	25 %	50 %	537438450
56336	NC_022221	GT	3	6	3276722	3276727	0 %	50 %	50 %	0 %	537438450
56337	NC_022221	GTATCT	2	12	3276795	3276806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	537438451
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56349	NC_022221	CAC	2	6	3277415	3277420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438452
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56465	NC_022221	GCC	2	6	3283278	3283283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438459
56466	NC_022221	CAG	2	6	3283335	3283340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438459
56467	NC_022221	AGCGCC	2	12	3283354	3283365	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537438459
56468	NC_022221	TCA	2	6	3283424	3283429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438459
56469	NC_022221	TCA	2	6	3283481	3283486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438459
56470	NC_022221	AAC	2	6	3283528	3283533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438459
56471	NC_022221	GAA	2	6	3283575	3283580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438459
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56473	NC_022221	ATG	2	6	3283722	3283727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438459
56474	NC_022221	ATC	2	6	3283885	3283890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438459
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56492	NC_022221	ACC	2	6	3284322	3284327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438460
56493	NC_022221	ACG	2	6	3284331	3284336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438460
56494	NC_022221	CGC	2	6	3284339	3284344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438460
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56497	NC_022221	CGC	2	6	3284405	3284410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438460
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56500	NC_022221	GCT	2	6	3284565	3284570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438460

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