MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_022221	TTTA	2	8	3200391	3200398	25 %	75 %	0 %	0 %	537438380
55002	NC_022221	GTA	2	6	3200404	3200409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438380
55003	NC_022221	A	6	6	3200728	3200733	100 %	0 %	0 %	0 %	537438380
55004	NC_022221	AAGA	2	8	3200767	3200774	75 %	0 %	25 %	0 %	537438380
55005	NC_022221	CGG	2	6	3200798	3200803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438380
55006	NC_022221	TTA	2	6	3200807	3200812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438380
55007	NC_022221	CGC	2	6	3200826	3200831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438380
55008	NC_022221	GCG	2	6	3200857	3200862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438380
55009	NC_022221	GCC	2	6	3200905	3200910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438380
55010	NC_022221	CGT	2	6	3200946	3200951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438380
55011	NC_022221	A	6	6	3201031	3201036	100 %	0 %	0 %	0 %	537438380
55012	NC_022221	TTA	2	6	3201061	3201066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438381
55013	NC_022221	TTC	2	6	3201189	3201194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438381
55014	NC_022221	ATCT	2	8	3201198	3201205	25 %	50 %	0 %	25 %	537438381
55015	NC_022221	GT	3	6	3201227	3201232	0 %	50 %	50 %	0 %	537438381
55016	NC_022221	GCG	2	6	3201279	3201284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438381
55017	NC_022221	GCA	2	6	3201340	3201345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438381
55018	NC_022221	CAT	2	6	3201384	3201389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438381
55019	NC_022221	CCTTT	2	10	3201451	3201460	0 %	60 %	0 %	40 %	537438381
55020	NC_022221	CAG	2	6	3201564	3201569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438381
55021	NC_022221	CAG	2	6	3201588	3201593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438381
55022	NC_022221	ATGT	2	8	3201647	3201654	25 %	50 %	25 %	0 %	537438381
55023	NC_022221	CTG	3	9	3201678	3201686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438381
55024	NC_022221	TGA	2	6	3201688	3201693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438381
55025	NC_022221	GCG	2	6	3201694	3201699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438381
55026	NC_022221	CCA	2	6	3201937	3201942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438382
55027	NC_022221	GC	5	10	3202000	3202009	0 %	0 %	50 %	50 %	537438382
55028	NC_022221	TCG	2	6	3202020	3202025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438382
55029	NC_022221	TCA	2	6	3202072	3202077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438382
55030	NC_022221	CG	3	6	3202105	3202110	0 %	0 %	50 %	50 %	537438382
55031	NC_022221	CGC	2	6	3202117	3202122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438382
55032	NC_022221	GC	3	6	3202131	3202136	0 %	0 %	50 %	50 %	537438382
55033	NC_022221	CGCA	2	8	3202196	3202203	25 %	0 %	25 %	50 %	537438382
55034	NC_022221	GCG	2	6	3202221	3202226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438382
55035	NC_022221	GGT	2	6	3202235	3202240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438382
55036	NC_022221	GTT	2	6	3202295	3202300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438382
55037	NC_022221	CCA	2	6	3202303	3202308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438382
55038	NC_022221	GCT	2	6	3202324	3202329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438382
55039	NC_022221	ACG	2	6	3202331	3202336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438382
55040	NC_022221	TCA	3	9	3202452	3202460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438382
55041	NC_022221	CTG	2	6	3202714	3202719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438383
55042	NC_022221	GC	3	6	3202782	3202787	0 %	0 %	50 %	50 %	537438383
55043	NC_022221	TGA	2	6	3202790	3202795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438383
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55045	NC_022221	CGCCC	2	10	3202839	3202848	0 %	0 %	20 %	80 %	537438383
55046	NC_022221	TCA	2	6	3202888	3202893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438383
55047	NC_022221	A	7	7	3203004	3203010	100 %	0 %	0 %	0 %	537438384
55048	NC_022221	A	7	7	3203082	3203088	100 %	0 %	0 %	0 %	537438384
55049	NC_022221	TGC	2	6	3203167	3203172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438384
55050	NC_022221	GCT	2	6	3203192	3203197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438384
55051	NC_022221	GAA	2	6	3203238	3203243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438384
55052	NC_022221	TTCTAA	2	12	3203369	3203380	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	537438385
55053	NC_022221	CTG	2	6	3203399	3203404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438385
55054	NC_022221	CTC	2	6	3203444	3203449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438385
55055	NC_022221	GC	3	6	3203516	3203521	0 %	0 %	50 %	50 %	537438385
55056	NC_022221	ATT	2	6	3203534	3203539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438385
55057	NC_022221	TTG	2	6	3203556	3203561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438385
55058	NC_022221	TCA	2	6	3203563	3203568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438385
55059	NC_022221	ACG	2	6	3203703	3203708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438386
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55061	NC_022221	CGTT	2	8	3203876	3203883	0 %	50 %	25 %	25 %	537438387
55062	NC_022221	GAT	2	6	3203904	3203909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438387
55063	NC_022221	CTTT	2	8	3203928	3203935	0 %	75 %	0 %	25 %	537438387
55064	NC_022221	GC	3	6	3203939	3203944	0 %	0 %	50 %	50 %	537438387
55065	NC_022221	GTC	2	6	3204037	3204042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438387
55066	NC_022221	CTG	3	9	3204130	3204138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438387
55067	NC_022221	CGG	2	6	3204249	3204254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438387
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55069	NC_022221	CGC	2	6	3204276	3204281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438387
55070	NC_022221	CTG	2	6	3204343	3204348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438387
55071	NC_022221	A	6	6	3204373	3204378	100 %	0 %	0 %	0 %	537438387
55072	NC_022221	GAT	2	6	3204472	3204477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438388
55073	NC_022221	CAT	2	6	3204494	3204499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438388
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55084	NC_022221	AGCA	2	8	3205370	3205377	50 %	0 %	25 %	25 %	537438388
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55087	NC_022221	GC	4	8	3205513	3205520	0 %	0 %	50 %	50 %	537438388
55088	NC_022221	ACG	2	6	3205523	3205528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438388
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55090	NC_022221	CCG	2	6	3205580	3205585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438388
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55112	NC_022221	CG	3	6	3207034	3207039	0 %	0 %	50 %	50 %	537438389
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55114	NC_022221	CG	3	6	3207093	3207098	0 %	0 %	50 %	50 %	537438389
55115	NC_022221	TACC	2	8	3207152	3207159	25 %	25 %	0 %	50 %	537438389
55116	NC_022221	CGCC	2	8	3207164	3207171	0 %	0 %	25 %	75 %	537438389
55117	NC_022221	CGC	2	6	3207213	3207218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438389
55118	NC_022221	CGC	2	6	3207225	3207230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438389
55119	NC_022221	CAT	2	6	3207266	3207271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438389
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55121	NC_022221	GCG	2	6	3207302	3207307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438389
55122	NC_022221	GCA	2	6	3207320	3207325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438389
55123	NC_022221	CAG	2	6	3207465	3207470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438389
55124	NC_022221	CGCC	2	8	3207527	3207534	0 %	0 %	25 %	75 %	537438389
55125	NC_022221	GC	3	6	3207537	3207542	0 %	0 %	50 %	50 %	537438389
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55128	NC_022221	CGAT	2	8	3207608	3207615	25 %	25 %	25 %	25 %	537438389
55129	NC_022221	CTT	2	6	3207671	3207676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438389
55130	NC_022221	GCT	2	6	3207695	3207700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438389
55131	NC_022221	GC	5	10	3207797	3207806	0 %	0 %	50 %	50 %	537438389
55132	NC_022221	TCA	2	6	3207811	3207816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438389
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55135	NC_022221	GC	4	8	3208129	3208136	0 %	0 %	50 %	50 %	537438390
55136	NC_022221	GGT	2	6	3208189	3208194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438390
55137	NC_022221	TCA	2	6	3208200	3208205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438390
55138	NC_022221	GTG	2	6	3208212	3208217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438390
55139	NC_022221	GCGCCT	2	12	3208231	3208242	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	537438390
55140	NC_022221	TCA	2	6	3208383	3208388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438390
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55142	NC_022221	CG	3	6	3208483	3208488	0 %	0 %	50 %	50 %	537438390
55143	NC_022221	CGT	2	6	3208490	3208495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438390
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55146	NC_022221	CGC	2	6	3208646	3208651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438390
55147	NC_022221	GGA	2	6	3208694	3208699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438390
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55154	NC_022221	GCCA	2	8	3208980	3208987	25 %	0 %	25 %	50 %	537438390
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55208	NC_022221	GCT	2	6	3211078	3211083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438391
55209	NC_022221	TTCAAT	2	12	3211109	3211120	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	537438391
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55212	NC_022221	T	7	7	3211286	3211292	0 %	100 %	0 %	0 %	537438391
55213	NC_022221	CAG	2	6	3211297	3211302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438391
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55218	NC_022221	TCG	2	6	3211608	3211613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438391
55219	NC_022221	TC	3	6	3211732	3211737	0 %	50 %	0 %	50 %	537438391
55220	NC_022221	GCG	2	6	3211738	3211743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438391
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55222	NC_022221	CAG	2	6	3211814	3211819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438391
55223	NC_022221	GC	3	6	3211842	3211847	0 %	0 %	50 %	50 %	537438391
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55229	NC_022221	CGGC	2	8	3212133	3212140	0 %	0 %	50 %	50 %	537438391
55230	NC_022221	CAC	2	6	3212173	3212178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438391
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55232	NC_022221	CTGG	2	8	3212246	3212253	0 %	25 %	50 %	25 %	537438391
55233	NC_022221	ATG	2	6	3212258	3212263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438391
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55344	NC_022221	TCG	2	6	3218606	3218611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438399
55345	NC_022221	TCCAT	2	10	3218670	3218679	20 %	40 %	0 %	40 %	537438399
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55348	NC_022221	GAA	2	6	3218809	3218814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438399
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55461	NC_022221	GC	3	6	3224618	3224623	0 %	0 %	50 %	50 %	537438403
55462	NC_022221	TGA	2	6	3224631	3224636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438403
55463	NC_022221	TG	3	6	3224683	3224688	0 %	50 %	50 %	0 %	537438403
55464	NC_022221	ACG	2	6	3224780	3224785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438403
55465	NC_022221	TGAT	2	8	3224810	3224817	25 %	50 %	25 %	0 %	537438403
55466	NC_022221	CG	3	6	3224818	3224823	0 %	0 %	50 %	50 %	537438403
55467	NC_022221	CGCGGA	2	12	3224870	3224881	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	537438404
55468	NC_022221	GTTC	2	8	3224915	3224922	0 %	50 %	25 %	25 %	537438404
55469	NC_022221	CGC	2	6	3224928	3224933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438404
55470	NC_022221	GGC	2	6	3224934	3224939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438404
55471	NC_022221	TTG	2	6	3224967	3224972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438404
55472	NC_022221	GGC	2	6	3224976	3224981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438404
55473	NC_022221	CATC	2	8	3225065	3225072	25 %	25 %	0 %	50 %	537438404
55474	NC_022221	CCA	2	6	3225086	3225091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438404
55475	NC_022221	CCA	2	6	3225119	3225124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438404
55476	NC_022221	TCAA	2	8	3225160	3225167	50 %	25 %	0 %	25 %	537438404
55477	NC_022221	CG	4	8	3225258	3225265	0 %	0 %	50 %	50 %	537438404
55478	NC_022221	CCG	2	6	3225275	3225280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438404
55479	NC_022221	TGA	2	6	3225329	3225334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438404
55480	NC_022221	TCA	2	6	3225392	3225397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438404
55481	NC_022221	GGC	2	6	3225423	3225428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438404
55482	NC_022221	AG	3	6	3225435	3225440	50 %	0 %	50 %	0 %	537438404
55483	NC_022221	CGC	2	6	3225504	3225509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438404
55484	NC_022221	TTC	2	6	3225513	3225518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438404
55485	NC_022221	CGC	2	6	3225546	3225551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438404
55486	NC_022221	GCC	2	6	3225580	3225585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438404
55487	NC_022221	AGT	2	6	3225667	3225672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438404
55488	NC_022221	GGT	2	6	3225696	3225701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438404
55489	NC_022221	TCA	2	6	3225754	3225759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438404
55490	NC_022221	CGG	2	6	3225806	3225811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438404
55491	NC_022221	ATT	2	6	3225849	3225854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438404
55492	NC_022221	CGCT	2	8	3225878	3225885	0 %	25 %	25 %	50 %	537438404
55493	NC_022221	TGCACC	2	12	3225946	3225957	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	537438404
55494	NC_022221	TCA	2	6	3225965	3225970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438404
55495	NC_022221	GCC	2	6	3225982	3225987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438404
55496	NC_022221	ATT	2	6	3225993	3225998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438404
55497	NC_022221	GC	3	6	3226047	3226052	0 %	0 %	50 %	50 %	537438404
55498	NC_022221	TTCT	2	8	3226155	3226162	0 %	75 %	0 %	25 %	537438404
55499	NC_022221	GCT	2	6	3226205	3226210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438404
55500	NC_022221	GAT	2	6	3226215	3226220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438404

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