MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_022221	TGG	2	6	3144121	3144126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438321
54002	NC_022221	TGC	2	6	3144149	3144154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438321
54003	NC_022221	CGT	2	6	3144256	3144261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438321
54004	NC_022221	CTG	2	6	3144274	3144279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438321
54005	NC_022221	GA	3	6	3144299	3144304	50 %	0 %	50 %	0 %	537438321
54006	NC_022221	TGA	3	9	3144309	3144317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438321
54007	NC_022221	AAT	2	6	3144355	3144360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438321
54008	NC_022221	AAT	2	6	3144383	3144388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438321
54009	NC_022221	CAGC	2	8	3144715	3144722	25 %	0 %	25 %	50 %	537438322
54010	NC_022221	ACC	2	6	3144738	3144743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438322
54011	NC_022221	GTA	2	6	3144875	3144880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438322
54012	NC_022221	CTG	2	6	3144890	3144895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438322
54013	NC_022221	GTA	2	6	3144908	3144913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438322
54014	NC_022221	GAC	2	6	3144925	3144930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438322
54015	NC_022221	TTTA	2	8	3144965	3144972	25 %	75 %	0 %	0 %	537438322
54016	NC_022221	CTCA	2	8	3145166	3145173	25 %	25 %	0 %	50 %	537438322
54017	NC_022221	TAT	2	6	3145183	3145188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438322
54018	NC_022221	CG	4	8	3145300	3145307	0 %	0 %	50 %	50 %	537438322
54019	NC_022221	TCT	2	6	3145354	3145359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438322
54020	NC_022221	AGG	2	6	3145393	3145398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438322
54021	NC_022221	GCT	2	6	3145540	3145545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438322
54022	NC_022221	ATG	2	6	3145557	3145562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438322
54023	NC_022221	ATCG	2	8	3145577	3145584	25 %	25 %	25 %	25 %	537438322
54024	NC_022221	T	6	6	3145603	3145608	0 %	100 %	0 %	0 %	537438322
54025	NC_022221	CCA	3	9	3145642	3145650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438322
54026	NC_022221	CTG	2	6	3145675	3145680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438322
54027	NC_022221	GCG	2	6	3145681	3145686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438322
54028	NC_022221	ACA	2	6	3145695	3145700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438322
54029	NC_022221	TTA	2	6	3145701	3145706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438322
54030	NC_022221	T	6	6	3145730	3145735	0 %	100 %	0 %	0 %	537438322
54031	NC_022221	TGA	2	6	3146419	3146424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438323
54032	NC_022221	CT	3	6	3146445	3146450	0 %	50 %	0 %	50 %	537438323
54033	NC_022221	T	6	6	3146450	3146455	0 %	100 %	0 %	0 %	537438323
54034	NC_022221	ATC	2	6	3146468	3146473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438323
54035	NC_022221	CCG	2	6	3146490	3146495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438323
54036	NC_022221	GGCA	2	8	3146550	3146557	25 %	0 %	50 %	25 %	537438323
54037	NC_022221	CTG	2	6	3146564	3146569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438323
54038	NC_022221	TAC	2	6	3146647	3146652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438323
54039	NC_022221	GAT	2	6	3146737	3146742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438323
54040	NC_022221	ATCA	2	8	3146840	3146847	50 %	25 %	0 %	25 %	537438323
54041	NC_022221	CCGT	2	8	3146972	3146979	0 %	25 %	25 %	50 %	537438323
54042	NC_022221	CTG	2	6	3147068	3147073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438323
54043	NC_022221	TCC	2	6	3147093	3147098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438323
54044	NC_022221	ATC	3	9	3147104	3147112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438323
54045	NC_022221	TTAA	2	8	3147171	3147178	50 %	50 %	0 %	0 %	537438323
54046	NC_022221	CCG	2	6	3147184	3147189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438323
54047	NC_022221	ATG	2	6	3147259	3147264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438323
54048	NC_022221	GAC	2	6	3147343	3147348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438323
54049	NC_022221	GA	3	6	3147360	3147365	50 %	0 %	50 %	0 %	537438323
54050	NC_022221	CAG	2	6	3147407	3147412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438323
54051	NC_022221	TGAT	2	8	3147531	3147538	25 %	50 %	25 %	0 %	537438323
54052	NC_022221	GTC	2	6	3147689	3147694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438323
54053	NC_022221	ATC	2	6	3147702	3147707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438323
54054	NC_022221	TCG	2	6	3147718	3147723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438323
54055	NC_022221	TCA	2	6	3147726	3147731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438323
54056	NC_022221	CTG	2	6	3147791	3147796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438323
54057	NC_022221	GGC	2	6	3147801	3147806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438323
54058	NC_022221	CGC	2	6	3147898	3147903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438323
54059	NC_022221	GC	4	8	3147937	3147944	0 %	0 %	50 %	50 %	537438323
54060	NC_022221	AAC	2	6	3148049	3148054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438323
54061	NC_022221	CGG	2	6	3148077	3148082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438323
54062	NC_022221	TCG	2	6	3148122	3148127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438323
54063	NC_022221	CGT	4	12	3148147	3148158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438323
54064	NC_022221	CGC	2	6	3148201	3148206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438323
54065	NC_022221	AAT	2	6	3148221	3148226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438323
54066	NC_022221	TGG	2	6	3148249	3148254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438323
54067	NC_022221	GT	3	6	3149439	3149444	0 %	50 %	50 %	0 %	537438324
54068	NC_022221	GCTC	2	8	3149531	3149538	0 %	25 %	25 %	50 %	537438324
54069	NC_022221	AGGC	2	8	3149539	3149546	25 %	0 %	50 %	25 %	537438324
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54071	NC_022221	CAGC	2	8	3149684	3149691	25 %	0 %	25 %	50 %	537438324
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54074	NC_022221	CG	3	6	3149739	3149744	0 %	0 %	50 %	50 %	537438324
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54077	NC_022221	GCT	2	6	3149786	3149791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438324
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54080	NC_022221	TCG	2	6	3149921	3149926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438324
54081	NC_022221	GCCC	2	8	3149947	3149954	0 %	0 %	25 %	75 %	537438324
54082	NC_022221	CAG	2	6	3149961	3149966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438324
54083	NC_022221	A	6	6	3149997	3150002	100 %	0 %	0 %	0 %	537438324
54084	NC_022221	CCG	2	6	3150044	3150049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438324
54085	NC_022221	GCC	2	6	3150082	3150087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438324
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54087	NC_022221	T	6	6	3150233	3150238	0 %	100 %	0 %	0 %	537438325
54088	NC_022221	GAT	2	6	3150322	3150327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438325
54089	NC_022221	GAC	2	6	3150377	3150382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438325
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54098	NC_022221	CAC	3	9	3151052	3151060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438325
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54101	NC_022221	A	6	6	3151144	3151149	100 %	0 %	0 %	0 %	537438325
54102	NC_022221	CAG	2	6	3151157	3151162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438325
54103	NC_022221	AG	4	8	3151161	3151168	50 %	0 %	50 %	0 %	537438325
54104	NC_022221	GCG	2	6	3151292	3151297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438326
54105	NC_022221	CTTCGT	2	12	3151321	3151332	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	537438326
54106	NC_022221	ATG	2	6	3151335	3151340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438326
54107	NC_022221	GGCT	2	8	3151388	3151395	0 %	25 %	50 %	25 %	537438326
54108	NC_022221	CA	3	6	3151438	3151443	50 %	0 %	0 %	50 %	537438326
54109	NC_022221	ATC	2	6	3151469	3151474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438326
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54111	NC_022221	CG	3	6	3151754	3151759	0 %	0 %	50 %	50 %	537438327
54112	NC_022221	GC	3	6	3151777	3151782	0 %	0 %	50 %	50 %	537438327
54113	NC_022221	CG	3	6	3151807	3151812	0 %	0 %	50 %	50 %	537438327
54114	NC_022221	CTGC	2	8	3151828	3151835	0 %	25 %	25 %	50 %	537438327
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54116	NC_022221	ACGC	2	8	3151910	3151917	25 %	0 %	25 %	50 %	537438328
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54230	NC_022221	TAG	2	6	3157741	3157746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438333
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54233	NC_022221	TGA	2	6	3157801	3157806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438333
54234	NC_022221	TAT	2	6	3157810	3157815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438333
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54239	NC_022221	ATA	2	6	3157998	3158003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438334
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54292	NC_022221	CCAG	2	8	3160540	3160547	25 %	0 %	25 %	50 %	537438337
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54303	NC_022221	AT	3	6	3161400	3161405	50 %	50 %	0 %	0 %	537438338
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54325	NC_022221	GC	3	6	3162828	3162833	0 %	0 %	50 %	50 %	537438341
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54330	NC_022221	CGA	2	6	3162972	3162977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438341
54331	NC_022221	GGGC	2	8	3163020	3163027	0 %	0 %	75 %	25 %	537438341
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54335	NC_022221	CTG	2	6	3163228	3163233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438341
54336	NC_022221	GGC	2	6	3163251	3163256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438341
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54339	NC_022221	GGCC	2	8	3163416	3163423	0 %	0 %	50 %	50 %	537438341
54340	NC_022221	GTTAC	2	10	3163475	3163484	20 %	40 %	20 %	20 %	537438341
54341	NC_022221	GCG	2	6	3163505	3163510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438341
54342	NC_022221	TTTCGC	2	12	3163643	3163654	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	537438342
54343	NC_022221	GACCA	2	10	3163667	3163676	40 %	0 %	20 %	40 %	537438342
54344	NC_022221	GCA	2	6	3163699	3163704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438342
54345	NC_022221	TCA	2	6	3163717	3163722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438342
54346	NC_022221	GAA	2	6	3163754	3163759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438342
54347	NC_022221	GTA	2	6	3163764	3163769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438342
54348	NC_022221	ATC	2	6	3163806	3163811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438342
54349	NC_022221	ATC	2	6	3163814	3163819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438342
54350	NC_022221	GCG	2	6	3163948	3163953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438342
54351	NC_022221	CCA	2	6	3163957	3163962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438342
54352	NC_022221	CAG	2	6	3163973	3163978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438342
54353	NC_022221	TACCC	2	10	3164073	3164082	20 %	20 %	0 %	60 %	537438343
54354	NC_022221	GCGCG	2	10	3164092	3164101	0 %	0 %	60 %	40 %	537438343
54355	NC_022221	GCA	3	9	3164149	3164157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438343
54356	NC_022221	GCC	2	6	3164166	3164171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438343
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54360	NC_022221	ACC	2	6	3164298	3164303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438343
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54362	NC_022221	CGA	2	6	3164377	3164382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438343
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54366	NC_022221	TGA	2	6	3164542	3164547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438343
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54376	NC_022221	GCA	2	6	3165101	3165106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438345
54377	NC_022221	A	6	6	3165106	3165111	100 %	0 %	0 %	0 %	537438345
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54380	NC_022221	ATT	2	6	3165216	3165221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438345
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54384	NC_022221	GCG	2	6	3165311	3165316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438345
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54433	NC_022221	GCC	2	6	3167625	3167630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438347
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54435	NC_022221	ATG	2	6	3167850	3167855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438347
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54440	NC_022221	T	6	6	3167949	3167954	0 %	100 %	0 %	0 %	537438347
54441	NC_022221	T	6	6	3168014	3168019	0 %	100 %	0 %	0 %	537438348
54442	NC_022221	TCG	2	6	3168252	3168257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438349
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54448	NC_022221	GGC	2	6	3168473	3168478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438349
54449	NC_022221	CGC	2	6	3168508	3168513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438349
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54451	NC_022221	ACGG	2	8	3168527	3168534	25 %	0 %	50 %	25 %	537438349
54452	NC_022221	CGG	2	6	3168562	3168567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438349
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54458	NC_022221	CGA	3	9	3169150	3169158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438349
54459	NC_022221	GCC	2	6	3169169	3169174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438349
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54462	NC_022221	GCA	2	6	3169245	3169250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438349
54463	NC_022221	GCG	2	6	3169349	3169354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438349
54464	NC_022221	CAT	2	6	3169462	3169467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438350
54465	NC_022221	AGCA	2	8	3169537	3169544	50 %	0 %	25 %	25 %	537438350
54466	NC_022221	ATCG	2	8	3169590	3169597	25 %	25 %	25 %	25 %	537438350
54467	NC_022221	GAA	2	6	3169625	3169630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438350
54468	NC_022221	AGC	2	6	3169651	3169656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438350
54469	NC_022221	A	6	6	3169745	3169750	100 %	0 %	0 %	0 %	537438350
54470	NC_022221	CGCC	2	8	3170100	3170107	0 %	0 %	25 %	75 %	537438350
54471	NC_022221	GTC	2	6	3170144	3170149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438350
54472	NC_022221	CGG	2	6	3170284	3170289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438350
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54474	NC_022221	A	6	6	3172105	3172110	100 %	0 %	0 %	0 %	537438351
54475	NC_022221	CCG	2	6	3172138	3172143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438351
54476	NC_022221	TTC	2	6	3172231	3172236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438351
54477	NC_022221	GTC	2	6	3172362	3172367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438351
54478	NC_022221	TGA	3	9	3172386	3172394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438351
54479	NC_022221	GGC	2	6	3172410	3172415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438351
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54481	NC_022221	AAC	2	6	3172733	3172738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438352
54482	NC_022221	TAT	2	6	3172742	3172747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438352
54483	NC_022221	AAT	3	9	3172769	3172777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438352
54484	NC_022221	CTT	2	6	3173013	3173018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438353
54485	NC_022221	CGGG	2	8	3173073	3173080	0 %	0 %	75 %	25 %	537438353
54486	NC_022221	GCA	2	6	3173228	3173233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438353
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54489	NC_022221	TCA	2	6	3173552	3173557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438353
54490	NC_022221	CTT	2	6	3173573	3173578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438353
54491	NC_022221	GCC	2	6	3173607	3173612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438353
54492	NC_022221	ATG	2	6	3173616	3173621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438353
54493	NC_022221	TCT	2	6	3173650	3173655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438353
54494	NC_022221	GCG	2	6	3173721	3173726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438353
54495	NC_022221	TCG	2	6	3173738	3173743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438353
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54497	NC_022221	GCA	2	6	3173834	3173839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438353
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54499	NC_022221	ATG	2	6	3173953	3173958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438353
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