MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_022221	CCA	2	6	3026519	3026524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438203
52003	NC_022221	GC	3	6	3026562	3026567	0 %	0 %	50 %	50 %	537438203
52004	NC_022221	ACA	2	6	3026597	3026602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438203
52005	NC_022221	CAA	2	6	3026685	3026690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438203
52006	NC_022221	CAC	2	6	3026823	3026828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438203
52007	NC_022221	CGC	2	6	3026871	3026876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438203
52008	NC_022221	GCT	2	6	3026885	3026890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438203
52009	NC_022221	AGG	2	6	3026917	3026922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438203
52010	NC_022221	CGG	2	6	3026945	3026950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438203
52011	NC_022221	GCT	2	6	3027002	3027007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438203
52012	NC_022221	CCG	2	6	3027071	3027076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438203
52013	NC_022221	TCA	2	6	3027119	3027124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438203
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52015	NC_022221	CCG	2	6	3027164	3027169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438203
52016	NC_022221	GGC	2	6	3027177	3027182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438203
52017	NC_022221	GCA	2	6	3027188	3027193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438203
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52020	NC_022221	CG	3	6	3027365	3027370	0 %	0 %	50 %	50 %	537438203
52021	NC_022221	CAT	2	6	3027393	3027398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438203
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52025	NC_022221	GCGGA	2	10	3027567	3027576	20 %	0 %	60 %	20 %	537438203
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52042	NC_022221	TGGC	2	8	3029058	3029065	0 %	25 %	50 %	25 %	537438205
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52117	NC_022221	GCG	2	6	3034034	3034039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438209
52118	NC_022221	CAT	2	6	3034063	3034068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438209
52119	NC_022221	GA	3	6	3034091	3034096	50 %	0 %	50 %	0 %	537438209
52120	NC_022221	AGTC	2	8	3034246	3034253	25 %	25 %	25 %	25 %	537438209
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52122	NC_022221	GTG	2	6	3034286	3034291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438209
52123	NC_022221	GCG	2	6	3034317	3034322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438209
52124	NC_022221	ATG	2	6	3034334	3034339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438209
52125	NC_022221	CTG	2	6	3034354	3034359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438209
52126	NC_022221	AGC	2	6	3034370	3034375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438209
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52130	NC_022221	TCA	2	6	3034472	3034477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438209
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52132	NC_022221	GCA	2	6	3034509	3034514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438209
52133	NC_022221	GCCA	2	8	3034547	3034554	25 %	0 %	25 %	50 %	537438209
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52137	NC_022221	A	6	6	3034667	3034672	100 %	0 %	0 %	0 %	537438209
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52142	NC_022221	CAAT	2	8	3034815	3034822	50 %	25 %	0 %	25 %	537438209
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52146	NC_022221	AAT	2	6	3034931	3034936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438209
52147	NC_022221	CAT	2	6	3034957	3034962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438209
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52152	NC_022221	CGT	2	6	3035105	3035110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438209
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52218	NC_022221	CGC	3	9	3039690	3039698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438213
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52221	NC_022221	AATAA	2	10	3040555	3040564	80 %	20 %	0 %	0 %	537438214
52222	NC_022221	ATG	2	6	3040571	3040576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438214
52223	NC_022221	ATC	3	9	3040589	3040597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438214
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52225	NC_022221	GGTAAA	2	12	3040664	3040675	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	537438214
52226	NC_022221	A	6	6	3040673	3040678	100 %	0 %	0 %	0 %	537438214
52227	NC_022221	GAT	2	6	3040699	3040704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438214
52228	NC_022221	A	6	6	3040812	3040817	100 %	0 %	0 %	0 %	537438215
52229	NC_022221	CGC	2	6	3041071	3041076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438215
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52231	NC_022221	CTT	2	6	3041107	3041112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438215
52232	NC_022221	CGC	2	6	3041125	3041130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438215
52233	NC_022221	GTT	2	6	3041183	3041188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438215
52234	NC_022221	AGC	2	6	3041193	3041198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438215
52235	NC_022221	GGC	2	6	3041216	3041221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438215
52236	NC_022221	CATC	2	8	3041242	3041249	25 %	25 %	0 %	50 %	537438215
52237	NC_022221	CAG	2	6	3041288	3041293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438215
52238	NC_022221	ACC	2	6	3041301	3041306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438215
52239	NC_022221	A	6	6	3041308	3041313	100 %	0 %	0 %	0 %	537438215
52240	NC_022221	ATG	2	6	3041385	3041390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438215
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52243	NC_022221	GCG	2	6	3041814	3041819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438216
52244	NC_022221	GCA	2	6	3041885	3041890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438216
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52246	NC_022221	T	6	6	3041913	3041918	0 %	100 %	0 %	0 %	537438216
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52304	NC_022221	TCG	2	6	3045374	3045379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438220
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52337	NC_022221	ACGCC	2	10	3047313	3047322	20 %	0 %	20 %	60 %	537438221
52338	NC_022221	CGCC	2	8	3047325	3047332	0 %	0 %	25 %	75 %	537438221
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52342	NC_022221	CG	3	6	3047514	3047519	0 %	0 %	50 %	50 %	537438221
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52349	NC_022221	CGG	2	6	3047838	3047843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438221
52350	NC_022221	CCG	2	6	3047850	3047855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438221
52351	NC_022221	TCA	2	6	3047858	3047863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438221
52352	NC_022221	CGA	2	6	3047873	3047878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438221
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52434	NC_022221	GCG	2	6	3053418	3053423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438230
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52447	NC_022221	CTG	2	6	3053956	3053961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438230
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52453	NC_022221	TGC	2	6	3054282	3054287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438230
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52457	NC_022221	AGA	3	9	3054532	3054540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438230
52458	NC_022221	GCA	2	6	3054543	3054548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438230
52459	NC_022221	ACG	2	6	3054552	3054557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438230
52460	NC_022221	GC	3	6	3054577	3054582	0 %	0 %	50 %	50 %	537438230
52461	NC_022221	A	6	6	3054599	3054604	100 %	0 %	0 %	0 %	537438230
52462	NC_022221	CAC	2	6	3054673	3054678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438230
52463	NC_022221	TCGCGT	2	12	3054746	3054757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438230
52464	NC_022221	AAG	2	6	3054758	3054763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438230
52465	NC_022221	TTGG	2	8	3054908	3054915	0 %	50 %	50 %	0 %	537438231
52466	NC_022221	GAA	2	6	3054940	3054945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438231
52467	NC_022221	CAA	2	6	3055002	3055007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438231
52468	NC_022221	TTA	2	6	3055031	3055036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438231
52469	NC_022221	T	6	6	3055057	3055062	0 %	100 %	0 %	0 %	537438231
52470	NC_022221	ATT	2	6	3055075	3055080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438231
52471	NC_022221	AAT	2	6	3055241	3055246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438231
52472	NC_022221	AGTG	2	8	3055255	3055262	25 %	25 %	50 %	0 %	537438231
52473	NC_022221	TCC	2	6	3055270	3055275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438231
52474	NC_022221	GTA	2	6	3055323	3055328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438231
52475	NC_022221	TGA	2	6	3055565	3055570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438231
52476	NC_022221	CGG	2	6	3055596	3055601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438231
52477	NC_022221	TAA	2	6	3055603	3055608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438231
52478	NC_022221	TTCC	2	8	3055611	3055618	0 %	50 %	0 %	50 %	537438231
52479	NC_022221	ACC	2	6	3055630	3055635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438231
52480	NC_022221	ATT	2	6	3055678	3055683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438231
52481	NC_022221	CATT	2	8	3055704	3055711	25 %	50 %	0 %	25 %	537438231
52482	NC_022221	ATT	2	6	3055754	3055759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438231
52483	NC_022221	CAT	2	6	3056267	3056272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438232
52484	NC_022221	GCG	2	6	3056381	3056386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438232
52485	NC_022221	GCATC	2	10	3056459	3056468	20 %	20 %	20 %	40 %	537438232
52486	NC_022221	TCT	2	6	3056611	3056616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438232
52487	NC_022221	CAT	2	6	3056766	3056771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438232
52488	NC_022221	CAC	2	6	3056865	3056870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438232
52489	NC_022221	CCG	3	9	3056935	3056943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438232
52490	NC_022221	CCG	2	6	3057058	3057063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438232
52491	NC_022221	CA	3	6	3057080	3057085	50 %	0 %	0 %	50 %	537438232
52492	NC_022221	TTC	2	6	3057099	3057104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438232
52493	NC_022221	GTGG	2	8	3057114	3057121	0 %	25 %	75 %	0 %	537438232
52494	NC_022221	ATG	2	6	3057136	3057141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438232
52495	NC_022221	AG	3	6	3057144	3057149	50 %	0 %	50 %	0 %	537438232
52496	NC_022221	GCA	2	6	3057154	3057159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438232
52497	NC_022221	TGT	2	6	3057160	3057165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438232
52498	NC_022221	ACC	4	12	3057220	3057231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438232
52499	NC_022221	CAG	2	6	3057342	3057347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438232
52500	NC_022221	CGT	2	6	3057395	3057400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438232

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