MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_022221	GTA	2	6	3000510	3000515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438181
51502	NC_022221	CGG	2	6	3000880	3000885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438182
51503	NC_022221	GTG	2	6	3000965	3000970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438182
51504	NC_022221	GC	3	6	3000975	3000980	0 %	0 %	50 %	50 %	537438182
51505	NC_022221	CAT	3	9	3001010	3001018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438182
51506	NC_022221	GACG	2	8	3001048	3001055	25 %	0 %	50 %	25 %	537438182
51507	NC_022221	GCC	2	6	3001082	3001087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438182
51508	NC_022221	GC	3	6	3001152	3001157	0 %	0 %	50 %	50 %	537438182
51509	NC_022221	GTC	2	6	3001166	3001171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438182
51510	NC_022221	TGA	2	6	3001207	3001212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438182
51511	NC_022221	ACT	2	6	3001221	3001226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438182
51512	NC_022221	TGA	2	6	3001252	3001257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438182
51513	NC_022221	AGA	2	6	3001351	3001356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438182
51514	NC_022221	A	6	6	3001392	3001397	100 %	0 %	0 %	0 %	537438182
51515	NC_022221	TTC	2	6	3001411	3001416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438182
51516	NC_022221	CAT	2	6	3001444	3001449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438182
51517	NC_022221	T	6	6	3001531	3001536	0 %	100 %	0 %	0 %	537438182
51518	NC_022221	GCGCG	2	10	3001537	3001546	0 %	0 %	60 %	40 %	537438182
51519	NC_022221	GCG	2	6	3001563	3001568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438182
51520	NC_022221	TCG	2	6	3001570	3001575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438182
51521	NC_022221	CCG	2	6	3001678	3001683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438182
51522	NC_022221	CAG	2	6	3001736	3001741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438182
51523	NC_022221	AAC	2	6	3001767	3001772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438182
51524	NC_022221	TGGAGA	2	12	3001773	3001784	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	537438182
51525	NC_022221	ATT	2	6	3001799	3001804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438182
51526	NC_022221	ATA	2	6	3001812	3001817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438182
51527	NC_022221	GCG	2	6	3001832	3001837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438182
51528	NC_022221	GCC	2	6	3001940	3001945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438182
51529	NC_022221	TTGT	2	8	3001973	3001980	0 %	75 %	25 %	0 %	537438182
51530	NC_022221	GAC	2	6	3001984	3001989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438182
51531	NC_022221	A	7	7	3002060	3002066	100 %	0 %	0 %	0 %	537438182
51532	NC_022221	GACT	2	8	3002230	3002237	25 %	25 %	25 %	25 %	537438183
51533	NC_022221	TCA	2	6	3002238	3002243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438183
51534	NC_022221	CCG	3	9	3002327	3002335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438183
51535	NC_022221	GCTG	2	8	3002386	3002393	0 %	25 %	50 %	25 %	537438183
51536	NC_022221	GCG	2	6	3002406	3002411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438183
51537	NC_022221	GGCTG	2	10	3002479	3002488	0 %	20 %	60 %	20 %	537438183
51538	NC_022221	GC	3	6	3002597	3002602	0 %	0 %	50 %	50 %	537438183
51539	NC_022221	TGC	2	6	3002661	3002666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438183
51540	NC_022221	GCA	2	6	3002788	3002793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438183
51541	NC_022221	TCG	2	6	3002847	3002852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438183
51542	NC_022221	CTG	2	6	3002891	3002896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438183
51543	NC_022221	CGC	2	6	3002923	3002928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438183
51544	NC_022221	GCC	3	9	3002937	3002945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438183
51545	NC_022221	CAA	2	6	3002990	3002995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438183
51546	NC_022221	CCG	2	6	3003037	3003042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438183
51547	NC_022221	CCG	2	6	3003085	3003090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438183
51548	NC_022221	GATCGC	2	12	3003157	3003168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	537438183
51549	NC_022221	CCCG	2	8	3003181	3003188	0 %	0 %	25 %	75 %	537438183
51550	NC_022221	GCG	2	6	3003190	3003195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438183
51551	NC_022221	TCAA	2	8	3003204	3003211	50 %	25 %	0 %	25 %	537438183
51552	NC_022221	CAT	2	6	3003218	3003223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438183
51553	NC_022221	ATCA	2	8	3003230	3003237	50 %	25 %	0 %	25 %	537438183
51554	NC_022221	ACC	2	6	3003252	3003257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438183
51555	NC_022221	ATG	2	6	3003287	3003292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438183
51556	NC_022221	GCTG	2	8	3003301	3003308	0 %	25 %	50 %	25 %	537438183
51557	NC_022221	TCC	2	6	3003348	3003353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438183
51558	NC_022221	CGC	2	6	3003398	3003403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438183
51559	NC_022221	GCC	2	6	3003495	3003500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438183
51560	NC_022221	AGC	2	6	3003501	3003506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438183
51561	NC_022221	GGT	3	9	3003515	3003523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438183
51562	NC_022221	CGG	3	9	3003577	3003585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438183
51563	NC_022221	A	6	6	3003686	3003691	100 %	0 %	0 %	0 %	537438183
51564	NC_022221	GC	3	6	3003692	3003697	0 %	0 %	50 %	50 %	537438183
51565	NC_022221	CGTT	2	8	3003705	3003712	0 %	50 %	25 %	25 %	537438183
51566	NC_022221	CAC	2	6	3003714	3003719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438183
51567	NC_022221	CGC	2	6	3003742	3003747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438183
51568	NC_022221	CGC	2	6	3003772	3003777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438183
51569	NC_022221	CCG	2	6	3003784	3003789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438183
51570	NC_022221	CCT	2	6	3003865	3003870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438183
51571	NC_022221	CGTTAA	2	12	3003872	3003883	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	537438183
51572	NC_022221	AC	3	6	3003899	3003904	50 %	0 %	0 %	50 %	537438183
51573	NC_022221	AGC	2	6	3003930	3003935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438183
51574	NC_022221	GCC	2	6	3003939	3003944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438183
51575	NC_022221	CGG	2	6	3003952	3003957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438183
51576	NC_022221	TCG	2	6	3003960	3003965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438183
51577	NC_022221	CCT	2	6	3004059	3004064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438184
51578	NC_022221	ATC	2	6	3004087	3004092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438184
51579	NC_022221	TTAA	2	8	3004100	3004107	50 %	50 %	0 %	0 %	537438184
51580	NC_022221	CGC	3	9	3004108	3004116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438184
51581	NC_022221	CTG	2	6	3004138	3004143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438184
51582	NC_022221	AGAT	2	8	3004175	3004182	50 %	25 %	25 %	0 %	537438184
51583	NC_022221	CGC	2	6	3004185	3004190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438184
51584	NC_022221	CGC	2	6	3004306	3004311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438184
51585	NC_022221	GCG	2	6	3004322	3004327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438184
51586	NC_022221	CCAG	2	8	3004338	3004345	25 %	0 %	25 %	50 %	537438184
51587	NC_022221	CTG	2	6	3004452	3004457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438184
51588	NC_022221	CGA	2	6	3004472	3004477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438184
51589	NC_022221	CGG	2	6	3004497	3004502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438184
51590	NC_022221	CCAG	2	8	3004614	3004621	25 %	0 %	25 %	50 %	537438184
51591	NC_022221	GCG	2	6	3004770	3004775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438184
51592	NC_022221	CCG	2	6	3004791	3004796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438184
51593	NC_022221	GCG	2	6	3004811	3004816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438184
51594	NC_022221	GCT	2	6	3004863	3004868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438184
51595	NC_022221	AC	3	6	3004996	3005001	50 %	0 %	0 %	50 %	537438184
51596	NC_022221	TCG	2	6	3005009	3005014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438184
51597	NC_022221	CATC	2	8	3005049	3005056	25 %	25 %	0 %	50 %	537438184
51598	NC_022221	GC	3	6	3005085	3005090	0 %	0 %	50 %	50 %	537438184
51599	NC_022221	TC	3	6	3005106	3005111	0 %	50 %	0 %	50 %	537438184
51600	NC_022221	ACG	2	6	3005125	3005130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438184
51601	NC_022221	GCG	2	6	3005139	3005144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438184
51602	NC_022221	CT	3	6	3005240	3005245	0 %	50 %	0 %	50 %	537438184
51603	NC_022221	ACCAG	2	10	3005337	3005346	40 %	0 %	20 %	40 %	537438184
51604	NC_022221	GCTG	2	8	3005421	3005428	0 %	25 %	50 %	25 %	537438184
51605	NC_022221	TGC	2	6	3005456	3005461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438184
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51607	NC_022221	CCG	2	6	3005562	3005567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438184
51608	NC_022221	CAG	2	6	3005572	3005577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438184
51609	NC_022221	GC	3	6	3005593	3005598	0 %	0 %	50 %	50 %	537438184
51610	NC_022221	GC	4	8	3005607	3005614	0 %	0 %	50 %	50 %	537438184
51611	NC_022221	CGC	2	6	3005628	3005633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438184
51612	NC_022221	TCA	2	6	3005693	3005698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438184
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51614	NC_022221	CTG	2	6	3005915	3005920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438184
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51616	NC_022221	CAG	2	6	3005977	3005982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438184
51617	NC_022221	CGT	2	6	3006198	3006203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438184
51618	NC_022221	CTGA	2	8	3006208	3006215	25 %	25 %	25 %	25 %	537438184
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51633	NC_022221	GC	3	6	3006913	3006918	0 %	0 %	50 %	50 %	537438184
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51847	NC_022221	CGCC	2	8	3018079	3018086	0 %	0 %	25 %	75 %	537438195
51848	NC_022221	CGC	2	6	3018091	3018096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438195
51849	NC_022221	T	7	7	3018117	3018123	0 %	100 %	0 %	0 %	537438195
51850	NC_022221	GC	3	6	3018150	3018155	0 %	0 %	50 %	50 %	537438195
51851	NC_022221	TTG	2	6	3018201	3018206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438195
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51853	NC_022221	CCGA	2	8	3018246	3018253	25 %	0 %	25 %	50 %	537438195
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51861	NC_022221	CG	3	6	3018476	3018481	0 %	0 %	50 %	50 %	537438195
51862	NC_022221	GCA	2	6	3018637	3018642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438195
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