MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_022221	GAT	2	6	2974338	2974343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438156
51002	NC_022221	CCG	2	6	2974344	2974349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438156
51003	NC_022221	ATA	2	6	2974363	2974368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438156
51004	NC_022221	A	6	6	2974477	2974482	100 %	0 %	0 %	0 %	537438156
51005	NC_022221	GCG	2	6	2974512	2974517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438156
51006	NC_022221	GCC	2	6	2974524	2974529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438156
51007	NC_022221	GCA	2	6	2974545	2974550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438156
51008	NC_022221	CTG	2	6	2974570	2974575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438156
51009	NC_022221	GTC	2	6	2974592	2974597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438156
51010	NC_022221	AGA	2	6	2975215	2975220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438157
51011	NC_022221	GGA	2	6	2975368	2975373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438157
51012	NC_022221	GTG	2	6	2975509	2975514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438157
51013	NC_022221	ATA	2	6	2975542	2975547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438157
51014	NC_022221	TTC	2	6	2975577	2975582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438157
51015	NC_022221	GGCTGC	2	12	2975593	2975604	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537438157
51016	NC_022221	GAA	2	6	2975626	2975631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438157
51017	NC_022221	TTC	2	6	2975661	2975666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438157
51018	NC_022221	CGT	2	6	2975715	2975720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438157
51019	NC_022221	CCA	2	6	2975753	2975758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438157
51020	NC_022221	TCT	2	6	2975828	2975833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438158
51021	NC_022221	CTG	2	6	2975909	2975914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438158
51022	NC_022221	TTAAT	2	10	2976078	2976087	40 %	60 %	0 %	0 %	537438158
51023	NC_022221	GC	3	6	2976181	2976186	0 %	0 %	50 %	50 %	537438158
51024	NC_022221	GC	3	6	2976189	2976194	0 %	0 %	50 %	50 %	537438158
51025	NC_022221	TGA	2	6	2976226	2976231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438158
51026	NC_022221	TAC	2	6	2976310	2976315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438158
51027	NC_022221	GCG	2	6	2976339	2976344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438158
51028	NC_022221	AGA	2	6	2976355	2976360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438158
51029	NC_022221	GTCA	2	8	2976368	2976375	25 %	25 %	25 %	25 %	537438158
51030	NC_022221	CACC	2	8	2976400	2976407	25 %	0 %	0 %	75 %	537438158
51031	NC_022221	CTG	2	6	2976467	2976472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438158
51032	NC_022221	CGC	2	6	2976593	2976598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438158
51033	NC_022221	GCA	2	6	2976624	2976629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438158
51034	NC_022221	TGT	2	6	2976823	2976828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438159
51035	NC_022221	ACA	2	6	2976931	2976936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438159
51036	NC_022221	GCT	2	6	2976944	2976949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438159
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51038	NC_022221	TTG	2	6	2977036	2977041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438159
51039	NC_022221	ATT	2	6	2977050	2977055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438159
51040	NC_022221	TGC	2	6	2977084	2977089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438159
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51042	NC_022221	TGG	2	6	2977234	2977239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438159
51043	NC_022221	GGC	2	6	2977248	2977253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438159
51044	NC_022221	CGTCG	2	10	2977287	2977296	0 %	20 %	40 %	40 %	537438159
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51047	NC_022221	ATT	2	6	2977440	2977445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438159
51048	NC_022221	GAAC	2	8	2977472	2977479	50 %	0 %	25 %	25 %	537438159
51049	NC_022221	ATC	2	6	2977482	2977487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438159
51050	NC_022221	ATC	3	9	2977539	2977547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438159
51051	NC_022221	GCG	2	6	2977555	2977560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438159
51052	NC_022221	CGG	2	6	2977567	2977572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438159
51053	NC_022221	GCT	2	6	2977577	2977582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438159
51054	NC_022221	TGA	2	6	2977600	2977605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438159
51055	NC_022221	TGC	2	6	2977627	2977632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438159
51056	NC_022221	AG	3	6	2977655	2977660	50 %	0 %	50 %	0 %	537438159
51057	NC_022221	TTA	2	6	2977690	2977695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438159
51058	NC_022221	CCG	2	6	2977718	2977723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438159
51059	NC_022221	CAT	3	9	2977733	2977741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438159
51060	NC_022221	GCG	2	6	2977749	2977754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438159
51061	NC_022221	TGA	2	6	2977768	2977773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438159
51062	NC_022221	CGC	2	6	2977803	2977808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438159
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51065	NC_022221	AGG	2	6	2977987	2977992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438159
51066	NC_022221	GA	3	6	2978044	2978049	50 %	0 %	50 %	0 %	537438159
51067	NC_022221	CTG	2	6	2978070	2978075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438159
51068	NC_022221	TCG	2	6	2978083	2978088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438159
51069	NC_022221	GCA	2	6	2978090	2978095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438159
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51072	NC_022221	T	6	6	2978232	2978237	0 %	100 %	0 %	0 %	537438160
51073	NC_022221	ATG	2	6	2978238	2978243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438160
51074	NC_022221	ATC	2	6	2978244	2978249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438160
51075	NC_022221	ACGGC	2	10	2978803	2978812	20 %	0 %	40 %	40 %	537438161
51076	NC_022221	CGG	2	6	2978855	2978860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438161
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51079	NC_022221	CTG	2	6	2979051	2979056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438161
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51081	NC_022221	CCG	3	9	2979120	2979128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438161
51082	NC_022221	TTG	2	6	2979154	2979159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438161
51083	NC_022221	ATG	2	6	2979162	2979167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438161
51084	NC_022221	TCG	2	6	2979229	2979234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438161
51085	NC_022221	TGC	2	6	2979244	2979249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438161
51086	NC_022221	CGGCG	2	10	2979278	2979287	0 %	0 %	60 %	40 %	537438161
51087	NC_022221	CCG	2	6	2979310	2979315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438161
51088	NC_022221	TGGC	2	8	2979348	2979355	0 %	25 %	50 %	25 %	537438161
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51097	NC_022221	GC	3	6	2979682	2979687	0 %	0 %	50 %	50 %	537438161
51098	NC_022221	GGTAAA	2	12	2979726	2979737	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	537438161
51099	NC_022221	CAA	2	6	2979749	2979754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438161
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51102	NC_022221	ATC	2	6	2979855	2979860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438161
51103	NC_022221	GAT	2	6	2979863	2979868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438161
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51105	NC_022221	CT	3	6	2980215	2980220	0 %	50 %	0 %	50 %	537438162
51106	NC_022221	CCA	2	6	2980239	2980244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438162
51107	NC_022221	ATT	2	6	2980258	2980263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438162
51108	NC_022221	TAC	2	6	2980349	2980354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438162
51109	NC_022221	GCA	2	6	2980365	2980370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438162
51110	NC_022221	GGCG	2	8	2980458	2980465	0 %	0 %	75 %	25 %	537438162
51111	NC_022221	CTA	2	6	2980488	2980493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438162
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51114	NC_022221	CGTAC	2	10	2980560	2980569	20 %	20 %	20 %	40 %	537438162
51115	NC_022221	CCG	2	6	2980580	2980585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438162
51116	NC_022221	TGA	2	6	2980634	2980639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438162
51117	NC_022221	AGA	2	6	2980668	2980673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438162
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51119	NC_022221	GCA	2	6	2980712	2980717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438162
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51122	NC_022221	GCG	3	9	2980780	2980788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438162
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51124	NC_022221	ACC	3	9	2980819	2980827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438162
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51130	NC_022221	GT	3	6	2981155	2981160	0 %	50 %	50 %	0 %	537438162
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51229	NC_022221	A	7	7	2986166	2986172	100 %	0 %	0 %	0 %	537438168
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51232	NC_022221	CGG	2	6	2986272	2986277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438168
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51338	NC_022221	A	6	6	2991353	2991358	100 %	0 %	0 %	0 %	537438172
51339	NC_022221	CG	3	6	2991422	2991427	0 %	0 %	50 %	50 %	537438172
51340	NC_022221	TCA	2	6	2991457	2991462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438172
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51342	NC_022221	CGG	2	6	2991563	2991568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438172
51343	NC_022221	GCA	2	6	2991577	2991582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438172
51344	NC_022221	CACC	2	8	2991586	2991593	25 %	0 %	0 %	75 %	537438172
51345	NC_022221	GGCG	2	8	2991604	2991611	0 %	0 %	75 %	25 %	537438172
51346	NC_022221	GCCCA	2	10	2991856	2991865	20 %	0 %	20 %	60 %	537438173
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51348	NC_022221	GCT	2	6	2991978	2991983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438173
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