MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_022221	CTG	2	6	2914549	2914554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438104
50002	NC_022221	CAC	2	6	2914585	2914590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438104
50003	NC_022221	CG	3	6	2914591	2914596	0 %	0 %	50 %	50 %	537438104
50004	NC_022221	CCG	2	6	2914682	2914687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438104
50005	NC_022221	TCCT	2	8	2914771	2914778	0 %	50 %	0 %	50 %	537438104
50006	NC_022221	TCA	2	6	2914820	2914825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438104
50007	NC_022221	CGC	2	6	2914845	2914850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438104
50008	NC_022221	GATT	2	8	2914905	2914912	25 %	50 %	25 %	0 %	537438104
50009	NC_022221	GTG	2	6	2914915	2914920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438104
50010	NC_022221	CCA	2	6	2915034	2915039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438104
50011	NC_022221	CGG	2	6	2915073	2915078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438104
50012	NC_022221	T	6	6	2915128	2915133	0 %	100 %	0 %	0 %	537438104
50013	NC_022221	GCC	2	6	2915147	2915152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438104
50014	NC_022221	ACC	2	6	2915207	2915212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438104
50015	NC_022221	CAT	2	6	2915247	2915252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438104
50016	NC_022221	TCG	2	6	2915318	2915323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438104
50017	NC_022221	CTC	2	6	2915352	2915357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438105
50018	NC_022221	AGCGC	2	10	2915486	2915495	20 %	0 %	40 %	40 %	537438105
50019	NC_022221	TGC	2	6	2915578	2915583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438105
50020	NC_022221	CGG	2	6	2915612	2915617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438105
50021	NC_022221	ACG	2	6	2915626	2915631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438105
50022	NC_022221	CG	3	6	2915662	2915667	0 %	0 %	50 %	50 %	537438105
50023	NC_022221	GCC	3	9	2915686	2915694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438105
50024	NC_022221	GCCA	2	8	2915706	2915713	25 %	0 %	25 %	50 %	537438105
50025	NC_022221	TGA	2	6	2915719	2915724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438105
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50032	NC_022221	ACG	2	6	2916073	2916078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438105
50033	NC_022221	CTGGCG	2	12	2916091	2916102	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537438105
50034	NC_022221	C	6	6	2916161	2916166	0 %	0 %	0 %	100 %	537438105
50035	NC_022221	GC	3	6	2916181	2916186	0 %	0 %	50 %	50 %	537438105
50036	NC_022221	CCCATT	2	12	2916205	2916216	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	537438105
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50042	NC_022221	GGC	2	6	2916619	2916624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438106
50043	NC_022221	ATC	2	6	2916630	2916635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438106
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50050	NC_022221	GGCGG	2	10	2916883	2916892	0 %	0 %	80 %	20 %	537438106
50051	NC_022221	TGA	2	6	2916950	2916955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438106
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50054	NC_022221	A	6	6	2917061	2917066	100 %	0 %	0 %	0 %	537438106
50055	NC_022221	GCGAC	2	10	2917076	2917085	20 %	0 %	40 %	40 %	537438106
50056	NC_022221	TGGC	2	8	2917108	2917115	0 %	25 %	50 %	25 %	537438106
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50089	NC_022221	CGATC	2	10	2919031	2919040	20 %	20 %	20 %	40 %	537438109
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50116	NC_022221	TGT	2	6	2921312	2921317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438111
50117	NC_022221	ATC	2	6	2921362	2921367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438111
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50225	NC_022221	GC	5	10	2926206	2926215	0 %	0 %	50 %	50 %	537438118
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50232	NC_022221	TAA	2	6	2927023	2927028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438119
50233	NC_022221	T	6	6	2927143	2927148	0 %	100 %	0 %	0 %	537438119
50234	NC_022221	GCG	2	6	2927187	2927192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438119
50235	NC_022221	AAAT	2	8	2927268	2927275	75 %	25 %	0 %	0 %	537438119
50236	NC_022221	CCG	2	6	2927329	2927334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438119
50237	NC_022221	CAA	2	6	2927407	2927412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438119
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50239	NC_022221	CAC	2	6	2927503	2927508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438119
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50241	NC_022221	TCA	2	6	2927576	2927581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438119
50242	NC_022221	CAGCTC	2	12	2927654	2927665	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	537438120
50243	NC_022221	GCG	2	6	2927686	2927691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438120
50244	NC_022221	GTCG	2	8	2927749	2927756	0 %	25 %	50 %	25 %	537438120
50245	NC_022221	GCCC	2	8	2927767	2927774	0 %	0 %	25 %	75 %	537438120
50246	NC_022221	CCA	2	6	2927830	2927835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438120
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50254	NC_022221	GTC	2	6	2928074	2928079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438120
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50262	NC_022221	CG	3	6	2928597	2928602	0 %	0 %	50 %	50 %	537438120
50263	NC_022221	ATA	2	6	2928687	2928692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438120
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50317	NC_022221	TGC	2	6	2931187	2931192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438122
50318	NC_022221	A	6	6	2931220	2931225	100 %	0 %	0 %	0 %	537438122
50319	NC_022221	TCA	2	6	2931785	2931790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438123
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50322	NC_022221	CAGGC	2	10	2931957	2931966	20 %	0 %	40 %	40 %	537438123
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50324	NC_022221	CCG	2	6	2931985	2931990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438123
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50329	NC_022221	CGC	2	6	2932115	2932120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438123
50330	NC_022221	CGC	2	6	2932160	2932165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438123
50331	NC_022221	GAC	2	6	2932181	2932186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438123
50332	NC_022221	ACG	2	6	2932313	2932318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438123
50333	NC_022221	GGC	2	6	2932326	2932331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438123
50334	NC_022221	ACT	2	6	2932362	2932367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438123
50335	NC_022221	TCA	2	6	2932380	2932385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438123
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50338	NC_022221	CCCA	2	8	2932473	2932480	25 %	0 %	0 %	75 %	537438123
50339	NC_022221	ACCGA	2	10	2932563	2932572	40 %	0 %	20 %	40 %	537438123
50340	NC_022221	GGA	2	6	2932648	2932653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438123
50341	NC_022221	ATC	2	6	2932656	2932661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438123
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50343	NC_022221	ATC	3	9	2932727	2932735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438124
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50345	NC_022221	ATC	2	6	2932847	2932852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438124
50346	NC_022221	TC	3	6	2932863	2932868	0 %	50 %	0 %	50 %	537438124
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50348	NC_022221	CTCGC	2	10	2932901	2932910	0 %	20 %	20 %	60 %	537438124
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50461	NC_022221	TC	3	6	2937872	2937877	0 %	50 %	0 %	50 %	537438129
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50464	NC_022221	TC	3	6	2937923	2937928	0 %	50 %	0 %	50 %	537438129
50465	NC_022221	TAA	2	6	2938005	2938010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438129
50466	NC_022221	ATC	2	6	2938033	2938038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438129
50467	NC_022221	GC	3	6	2938106	2938111	0 %	0 %	50 %	50 %	537438129
50468	NC_022221	AAAGC	2	10	2938168	2938177	60 %	0 %	20 %	20 %	537438129
50469	NC_022221	CGA	2	6	2938208	2938213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438129
50470	NC_022221	GATA	2	8	2938235	2938242	50 %	25 %	25 %	0 %	537438129
50471	NC_022221	CAT	2	6	2938250	2938255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438129
50472	NC_022221	AGCC	2	8	2938339	2938346	25 %	0 %	25 %	50 %	537438129
50473	NC_022221	TG	3	6	2938408	2938413	0 %	50 %	50 %	0 %	537438129
50474	NC_022221	GCC	2	6	2938489	2938494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438129
50475	NC_022221	GCT	3	9	2938508	2938516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438129
50476	NC_022221	TCA	2	6	2938621	2938626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438129
50477	NC_022221	TTG	2	6	2938639	2938644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438129
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50480	NC_022221	CAA	2	6	2938731	2938736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438129
50481	NC_022221	T	6	6	2938740	2938745	0 %	100 %	0 %	0 %	537438129
50482	NC_022221	GGC	2	6	2938764	2938769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438129
50483	NC_022221	TTC	2	6	2938803	2938808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438129
50484	NC_022221	GACC	2	8	2938824	2938831	25 %	0 %	25 %	50 %	537438129
50485	NC_022221	GCG	2	6	2938860	2938865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438129
50486	NC_022221	CG	3	6	2938864	2938869	0 %	0 %	50 %	50 %	537438129
50487	NC_022221	GCCA	2	8	2938915	2938922	25 %	0 %	25 %	50 %	537438129
50488	NC_022221	GCC	2	6	2939002	2939007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438129
50489	NC_022221	GCC	2	6	2939032	2939037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438129
50490	NC_022221	TGT	2	6	2939119	2939124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438129
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50492	NC_022221	TGC	2	6	2939236	2939241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438129
50493	NC_022221	T	6	6	2939261	2939266	0 %	100 %	0 %	0 %	537438129
50494	NC_022221	CCAGT	2	10	2939299	2939308	20 %	20 %	20 %	40 %	537438129
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50496	NC_022221	CTG	2	6	2939454	2939459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438129
50497	NC_022221	ATG	2	6	2939502	2939507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438129
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50499	NC_022221	GGA	2	6	2939572	2939577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438129
50500	NC_022221	T	6	6	2939642	2939647	0 %	100 %	0 %	0 %	537438129

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