MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 55/2053 plasmid

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022126	TAT	2	6	233	238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438801
2	NC_022126	CAG	2	6	337	342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438801
3	NC_022126	TATG	2	8	353	360	25 %	50 %	25 %	0 %	532438801
4	NC_022126	ATT	2	6	362	367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438801
5	NC_022126	ATCC	2	8	386	393	25 %	25 %	0 %	50 %	532438801
6	NC_022126	TAGA	2	8	406	413	50 %	25 %	25 %	0 %	532438801
7	NC_022126	AAT	2	6	414	419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
8	NC_022126	TAA	2	6	440	445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
9	NC_022126	A	6	6	478	483	100 %	0 %	0 %	0 %	532438801
10	NC_022126	A	6	6	495	500	100 %	0 %	0 %	0 %	532438801
11	NC_022126	TTA	2	6	519	524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438801
12	NC_022126	TAA	2	6	545	550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
13	NC_022126	TATT	2	8	564	571	25 %	75 %	0 %	0 %	532438801
14	NC_022126	ATA	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
15	NC_022126	TA	3	6	726	731	50 %	50 %	0 %	0 %	532438801
16	NC_022126	TATGA	2	10	753	762	40 %	40 %	20 %	0 %	532438801
17	NC_022126	TAA	2	6	784	789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
18	NC_022126	ATA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
19	NC_022126	ATC	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438801
20	NC_022126	ATC	2	6	817	822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438801
21	NC_022126	A	6	6	823	828	100 %	0 %	0 %	0 %	532438801
22	NC_022126	TAA	2	6	836	841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
23	NC_022126	GAA	2	6	867	872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438801
24	NC_022126	CAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438801
25	NC_022126	ATT	2	6	927	932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438801
26	NC_022126	TTA	2	6	983	988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438801
27	NC_022126	AGA	2	6	995	1000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438801
28	NC_022126	GAA	2	6	1116	1121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438801
29	NC_022126	AATAT	2	10	1159	1168	60 %	40 %	0 %	0 %	532438801
30	NC_022126	AAT	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438801
31	NC_022126	AAT	2	6	1558	1563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438802
32	NC_022126	TTA	2	6	1565	1570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438802
33	NC_022126	TATTT	2	10	1616	1625	20 %	80 %	0 %	0 %	532438802
34	NC_022126	ATT	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438802
35	NC_022126	AAT	2	6	1646	1651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438802
36	NC_022126	TA	4	8	2331	2338	50 %	50 %	0 %	0 %	532438803
37	NC_022126	TATT	2	8	2374	2381	25 %	75 %	0 %	0 %	532438803
38	NC_022126	GTT	2	6	2384	2389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532438803
39	NC_022126	AAT	2	6	2411	2416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438803
40	NC_022126	CTA	2	6	2986	2991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438804
41	NC_022126	AT	3	6	3018	3023	50 %	50 %	0 %	0 %	532438804
42	NC_022126	GTG	2	6	3042	3047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532438804
43	NC_022126	TCA	2	6	3055	3060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438804
44	NC_022126	GAA	2	6	3115	3120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438804
45	NC_022126	A	6	6	3128	3133	100 %	0 %	0 %	0 %	532438804
46	NC_022126	TTA	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438804
47	NC_022126	TGA	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438804
48	NC_022126	ACAT	2	8	3220	3227	50 %	25 %	0 %	25 %	532438804
49	NC_022126	TTAAAC	2	12	3375	3386	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532438804
50	NC_022126	AAGA	2	8	3454	3461	75 %	0 %	25 %	0 %	532438804
51	NC_022126	TA	3	6	3525	3530	50 %	50 %	0 %	0 %	532438804
52	NC_022126	CAT	2	6	3586	3591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438804
53	NC_022126	AGG	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532438805
54	NC_022126	ACC	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438805
55	NC_022126	AGTA	2	8	3795	3802	50 %	25 %	25 %	0 %	532438805
56	NC_022126	CAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438805
57	NC_022126	TA	3	6	3874	3879	50 %	50 %	0 %	0 %	532438805
58	NC_022126	ATG	2	6	3964	3969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438805
59	NC_022126	T	6	6	4052	4057	0 %	100 %	0 %	0 %	532438805
60	NC_022126	ATA	2	6	4201	4206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438805
61	NC_022126	ACA	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438806
62	NC_022126	TAG	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438806
63	NC_022126	CTC	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532438806
64	NC_022126	CGT	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532438806
65	NC_022126	CCGA	2	8	4606	4613	25 %	0 %	25 %	50 %	532438806
66	NC_022126	CGGA	2	8	4701	4708	25 %	0 %	50 %	25 %	532438806
67	NC_022126	GT	3	6	4774	4779	0 %	50 %	50 %	0 %	532438806
68	NC_022126	G	6	6	4828	4833	0 %	0 %	100 %	0 %	532438806
69	NC_022126	CGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438806
70	NC_022126	TCA	2	6	4875	4880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438806
71	NC_022126	CCG	2	6	4942	4947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532438806
72	NC_022126	ACGG	2	8	4996	5003	25 %	0 %	50 %	25 %	532438806
73	NC_022126	CT	3	6	6894	6899	0 %	50 %	0 %	50 %	532438807
74	NC_022126	T	6	6	6924	6929	0 %	100 %	0 %	0 %	532438807
75	NC_022126	TTC	2	6	6963	6968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438807
76	NC_022126	AAC	2	6	6969	6974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438807
77	NC_022126	TGC	2	6	7010	7015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532438807
78	NC_022126	ACC	2	6	7030	7035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438807
79	NC_022126	CAA	2	6	7087	7092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438807
80	NC_022126	CAA	2	6	7110	7115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438807
81	NC_022126	AAT	2	6	7140	7145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438807
82	NC_022126	CATC	2	8	7195	7202	25 %	25 %	0 %	50 %	532438807
83	NC_022126	CAC	2	6	7208	7213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438807
84	NC_022126	A	8	8	7221	7228	100 %	0 %	0 %	0 %	532438807
85	NC_022126	TACA	2	8	7248	7255	50 %	25 %	0 %	25 %	532438807
86	NC_022126	CCA	2	6	7356	7361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438808
87	NC_022126	TAA	2	6	7377	7382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438808
88	NC_022126	GCT	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532438808
89	NC_022126	T	6	6	7423	7428	0 %	100 %	0 %	0 %	532438808
90	NC_022126	CAC	2	6	7505	7510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438808
91	NC_022126	GAT	2	6	7532	7537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438808
92	NC_022126	TGA	2	6	7543	7548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438808
93	NC_022126	ACC	2	6	7587	7592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438808
94	NC_022126	ATAG	2	8	7652	7659	50 %	25 %	25 %	0 %	532438808
95	NC_022126	CTTGA	2	10	7673	7682	20 %	40 %	20 %	20 %	532438808
96	NC_022126	TCC	2	6	7802	7807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532438808
97	NC_022126	CCA	2	6	7860	7865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438808
98	NC_022126	AAG	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438808
99	NC_022126	CTT	2	6	8046	8051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438809
100	NC_022126	ATC	2	6	8056	8061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438809
101	NC_022126	CTTT	2	8	8219	8226	0 %	75 %	0 %	25 %	532438809
102	NC_022126	AACT	2	8	8247	8254	50 %	25 %	0 %	25 %	532438809
103	NC_022126	TA	3	6	8315	8320	50 %	50 %	0 %	0 %	532438809
104	NC_022126	ATAAA	2	10	8342	8351	80 %	20 %	0 %	0 %	532438809
105	NC_022126	TAGG	2	8	8370	8377	25 %	25 %	50 %	0 %	532438809
106	NC_022126	ATTC	2	8	8412	8419	25 %	50 %	0 %	25 %	532438809
107	NC_022126	AAC	2	6	8459	8464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438809
108	NC_022126	T	6	6	8494	8499	0 %	100 %	0 %	0 %	532438809
109	NC_022126	ATTT	2	8	8517	8524	25 %	75 %	0 %	0 %	532438810
110	NC_022126	AAT	2	6	8549	8554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438810
111	NC_022126	CTTTT	2	10	8588	8597	0 %	80 %	0 %	20 %	532438810
112	NC_022126	TAA	2	6	8606	8611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438810
113	NC_022126	T	6	6	8659	8664	0 %	100 %	0 %	0 %	532438810
114	NC_022126	TC	3	6	8693	8698	0 %	50 %	0 %	50 %	532438810
115	NC_022126	ACA	2	6	8722	8727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438810
116	NC_022126	TAA	2	6	8770	8775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438810
117	NC_022126	CTG	2	6	8788	8793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532438810
118	NC_022126	AT	3	6	8804	8809	50 %	50 %	0 %	0 %	532438810
119	NC_022126	TCACA	2	10	8884	8893	40 %	20 %	0 %	40 %	532438810
120	NC_022126	ACA	2	6	9228	9233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438811
121	NC_022126	TG	3	6	9234	9239	0 %	50 %	50 %	0 %	532438811
122	NC_022126	CAA	2	6	9369	9374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438811
123	NC_022126	GCA	2	6	9410	9415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438811
124	NC_022126	CTTTA	2	10	9466	9475	20 %	60 %	0 %	20 %	532438811
125	NC_022126	TCC	2	6	9500	9505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532438811
126	NC_022126	TACC	2	8	9513	9520	25 %	25 %	0 %	50 %	532438811
127	NC_022126	CAG	2	6	9546	9551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438811
128	NC_022126	T	7	7	9573	9579	0 %	100 %	0 %	0 %	532438811
129	NC_022126	TGC	2	6	9658	9663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532438811
130	NC_022126	TTAC	2	8	9692	9699	25 %	50 %	0 %	25 %	532438811
131	NC_022126	T	6	6	9733	9738	0 %	100 %	0 %	0 %	532438811
132	NC_022126	T	7	7	9835	9841	0 %	100 %	0 %	0 %	532438811
133	NC_022126	CTA	2	6	10081	10086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438812
134	NC_022126	AT	3	6	10113	10118	50 %	50 %	0 %	0 %	532438812
135	NC_022126	GTG	2	6	10137	10142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532438812
136	NC_022126	TCA	2	6	10150	10155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438812
137	NC_022126	GAA	2	6	10210	10215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532438812
138	NC_022126	A	6	6	10223	10228	100 %	0 %	0 %	0 %	532438812
139	NC_022126	TTA	2	6	10231	10236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438812
140	NC_022126	TGA	2	6	10249	10254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438812
141	NC_022126	ACAT	2	8	10315	10322	50 %	25 %	0 %	25 %	532438812
142	NC_022126	TTAAAC	2	12	10470	10481	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532438812
143	NC_022126	AAGA	2	8	10549	10556	75 %	0 %	25 %	0 %	532438812
144	NC_022126	TA	3	6	10620	10625	50 %	50 %	0 %	0 %	532438812
145	NC_022126	CAT	2	6	10681	10686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438812
146	NC_022126	TCA	2	6	10951	10956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438813
147	NC_022126	TAG	2	6	10984	10989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438813
148	NC_022126	ATT	2	6	11055	11060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438813
149	NC_022126	CTTA	2	8	11138	11145	25 %	50 %	0 %	25 %	532438813
150	NC_022126	ATC	2	6	11147	11152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438813
151	NC_022126	GCA	2	6	11229	11234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532438813
152	NC_022126	CAT	2	6	11245	11250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438813
153	NC_022126	T	7	7	11296	11302	0 %	100 %	0 %	0 %	532438813
154	NC_022126	TGA	2	6	11430	11435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438813
155	NC_022126	T	6	6	11503	11508	0 %	100 %	0 %	0 %	532438813
156	NC_022126	AAT	2	6	11516	11521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438813
157	NC_022126	AGTA	2	8	11626	11633	50 %	25 %	25 %	0 %	532438813
158	NC_022126	TTC	2	6	11681	11686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
159	NC_022126	ATT	2	6	11733	11738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438813
160	NC_022126	TGT	2	6	11754	11759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532438813
161	NC_022126	TTC	2	6	11801	11806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
162	NC_022126	ACC	2	6	11918	11923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438813
163	NC_022126	AC	3	6	11932	11937	50 %	0 %	0 %	50 %	532438813
164	NC_022126	T	6	6	11939	11944	0 %	100 %	0 %	0 %	532438813
165	NC_022126	CCA	2	6	12057	12062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532438813
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168	NC_022126	CAA	2	6	12181	12186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438813
169	NC_022126	AAT	2	6	12191	12196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438813
170	NC_022126	TCT	2	6	12213	12218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
171	NC_022126	TCCA	2	8	12362	12369	25 %	25 %	0 %	50 %	532438813
172	NC_022126	ATT	3	9	12432	12440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438813
173	NC_022126	CTT	2	6	12466	12471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
174	NC_022126	AAC	2	6	12560	12565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532438813
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179	NC_022126	TAG	2	6	12776	12781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438813
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181	NC_022126	TCT	2	6	12828	12833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
182	NC_022126	TTC	2	6	12932	12937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532438813
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197	NC_022126	TAGA	2	8	13981	13988	50 %	25 %	25 %	0 %	532438815
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249	NC_022126	TTAC	2	8	16583	16590	25 %	50 %	0 %	25 %	532438818
250	NC_022126	GTA	2	6	16607	16612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438818
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252	NC_022126	CAT	2	6	16719	16724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438818
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255	NC_022126	AAAC	2	8	16767	16774	75 %	0 %	0 %	25 %	532438818
256	NC_022126	A	7	7	16828	16834	100 %	0 %	0 %	0 %	532438818
257	NC_022126	AAAGTT	2	12	16877	16888	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532438818
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261	NC_022126	TACA	2	8	17084	17091	50 %	25 %	0 %	25 %	532438819
262	NC_022126	ATG	2	6	17113	17118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532438819
263	NC_022126	ATA	2	6	17131	17136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438819
264	NC_022126	CTA	2	6	17210	17215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532438819
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266	NC_022126	TAA	2	6	17265	17270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532438819
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303	NC_022126	T	6	6	20150	20155	0 %	100 %	0 %	0 %	532438821
304	NC_022126	AT	3	6	20161	20166	50 %	50 %	0 %	0 %	532438821
305	NC_022126	ATT	2	6	20180	20185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532438821
306	NC_022126	GTTT	2	8	20193	20200	0 %	75 %	25 %	0 %	532438821
307	NC_022126	ATTCA	2	10	20207	20216	40 %	40 %	0 %	20 %	532438821

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.