MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021984	CGG	2	6	244	249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
2	NC_021984	ACCA	2	8	356	363	50 %	0 %	0 %	50 %	529218782
3	NC_021984	TGG	2	6	366	371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218782
4	NC_021984	GAT	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
5	NC_021984	A	6	6	381	386	100 %	0 %	0 %	0 %	529218782
6	NC_021984	CGG	2	6	391	396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
7	NC_021984	T	6	6	435	440	0 %	100 %	0 %	0 %	529218782
8	NC_021984	GC	3	6	465	470	0 %	0 %	50 %	50 %	529218782
9	NC_021984	CTG	2	6	554	559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
10	NC_021984	CGC	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
11	NC_021984	A	6	6	606	611	100 %	0 %	0 %	0 %	529218782
12	NC_021984	GATC	2	8	667	674	25 %	25 %	25 %	25 %	529218782
13	NC_021984	CGC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
14	NC_021984	CCG	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
15	NC_021984	TGG	2	6	822	827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218782
16	NC_021984	CCG	3	9	855	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
17	NC_021984	GCC	2	6	869	874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
18	NC_021984	CTG	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
19	NC_021984	GCT	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
20	NC_021984	CT	3	6	995	1000	0 %	50 %	0 %	50 %	529218782
21	NC_021984	TTC	2	6	1017	1022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218782
22	NC_021984	CGA	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218782
23	NC_021984	AAC	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218782
24	NC_021984	GAT	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
25	NC_021984	GGC	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
26	NC_021984	CGC	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
27	NC_021984	GGT	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218782
28	NC_021984	TCC	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218782
29	NC_021984	TG	3	6	1307	1312	0 %	50 %	50 %	0 %	529218782
30	NC_021984	GC	3	6	1326	1331	0 %	0 %	50 %	50 %	529218782
31	NC_021984	CCG	2	6	1336	1341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
32	NC_021984	GCT	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
33	NC_021984	TGT	2	6	1426	1431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218782
34	NC_021984	TTC	2	6	1472	1477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218782
35	NC_021984	AATATC	2	12	1496	1507	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	529218782
36	NC_021984	TCT	2	6	1526	1531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218782
37	NC_021984	TGG	2	6	1548	1553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218782
38	NC_021984	ACG	2	6	1560	1565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218782
39	NC_021984	CCA	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218782
40	NC_021984	CGG	2	6	1645	1650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
41	NC_021984	CGG	2	6	1654	1659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
42	NC_021984	GAA	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218782
43	NC_021984	GCG	2	6	1728	1733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
44	NC_021984	ATC	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218782
45	NC_021984	TTG	2	6	1878	1883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218782
46	NC_021984	TCG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
47	NC_021984	ACT	2	6	1986	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218782
48	NC_021984	CGC	3	9	2008	2016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
49	NC_021984	CTG	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
50	NC_021984	TGA	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
51	NC_021984	CT	3	6	2144	2149	0 %	50 %	0 %	50 %	529218782
52	NC_021984	TC	3	6	2182	2187	0 %	50 %	0 %	50 %	529218782
53	NC_021984	GC	3	6	2204	2209	0 %	0 %	50 %	50 %	529218782
54	NC_021984	CG	3	6	2235	2240	0 %	0 %	50 %	50 %	529218782
55	NC_021984	GAC	2	6	2402	2407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218782
56	NC_021984	GCC	2	6	2414	2419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
57	NC_021984	TGA	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
58	NC_021984	AGGTA	2	10	2443	2452	40 %	20 %	40 %	0 %	529218782
59	NC_021984	TAT	2	6	2576	2581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218782
60	NC_021984	TGC	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
61	NC_021984	ATG	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
62	NC_021984	CGG	3	9	2631	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
63	NC_021984	CAG	2	6	3677	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218783
64	NC_021984	T	8	8	3687	3694	0 %	100 %	0 %	0 %	529218783
65	NC_021984	TGA	2	6	3730	3735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218783
66	NC_021984	GCA	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218783
67	NC_021984	CG	3	6	3830	3835	0 %	0 %	50 %	50 %	529218783
68	NC_021984	CGG	2	6	3928	3933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
69	NC_021984	GCG	2	6	3966	3971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
70	NC_021984	CGGCG	2	10	4012	4021	0 %	0 %	60 %	40 %	529218783
71	NC_021984	GTC	2	6	4058	4063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218783
72	NC_021984	CG	3	6	4074	4079	0 %	0 %	50 %	50 %	529218783
73	NC_021984	GGC	2	6	4121	4126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
74	NC_021984	TGA	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218783
75	NC_021984	GAA	2	6	4199	4204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218783
76	NC_021984	GCC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218783
77	NC_021984	CTA	2	6	4273	4278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218783
78	NC_021984	CTG	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218783
79	NC_021984	CGC	2	6	4411	4416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218783
80	NC_021984	GATG	2	8	4501	4508	25 %	25 %	50 %	0 %	529218783
81	NC_021984	CAGC	2	8	4510	4517	25 %	0 %	25 %	50 %	529218783
82	NC_021984	GGA	2	6	4537	4542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218783
83	NC_021984	CCG	2	6	4549	4554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218783
84	NC_021984	CTGA	2	8	4568	4575	25 %	25 %	25 %	25 %	529218783
85	NC_021984	GCG	2	6	4586	4591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
86	NC_021984	ACA	2	6	4609	4614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218783
87	NC_021984	GCG	2	6	4661	4666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
88	NC_021984	AAAG	2	8	4748	4755	75 %	0 %	25 %	0 %	529218783
89	NC_021984	GCT	2	6	4822	4827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218783
90	NC_021984	CAT	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218783
91	NC_021984	CTGC	2	8	4838	4845	0 %	25 %	25 %	50 %	529218783
92	NC_021984	GCC	2	6	4853	4858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218783
93	NC_021984	TGA	3	9	4869	4877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218783
94	NC_021984	TG	3	6	5016	5021	0 %	50 %	50 %	0 %	529218784
95	NC_021984	TCA	2	6	5031	5036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218784
96	NC_021984	AAT	2	6	5096	5101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218784
97	NC_021984	TCA	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218784
98	NC_021984	CG	3	6	5119	5124	0 %	0 %	50 %	50 %	529218784
99	NC_021984	T	6	6	5126	5131	0 %	100 %	0 %	0 %	529218784
100	NC_021984	ACC	2	6	5145	5150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218784
101	NC_021984	TCA	2	6	5169	5174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218784
102	NC_021984	TTC	2	6	5208	5213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218784
103	NC_021984	CAC	3	9	5252	5260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218784
104	NC_021984	CG	3	6	5338	5343	0 %	0 %	50 %	50 %	529218784
105	NC_021984	AG	3	6	5420	5425	50 %	0 %	50 %	0 %	529218784
106	NC_021984	TGT	2	6	5436	5441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218784
107	NC_021984	CAAAAT	2	12	5446	5457	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	529218784
108	NC_021984	CGT	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218784
109	NC_021984	GCG	2	6	5623	5628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218784
110	NC_021984	GCT	2	6	5656	5661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218784
111	NC_021984	AATCAG	2	12	5741	5752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	529218784
112	NC_021984	CG	3	6	5839	5844	0 %	0 %	50 %	50 %	529218785
113	NC_021984	CGC	2	6	5846	5851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218785
114	NC_021984	ACC	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218785
115	NC_021984	CAA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218785
116	NC_021984	TGA	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218785
117	NC_021984	A	6	6	6134	6139	100 %	0 %	0 %	0 %	529218785
118	NC_021984	CGA	2	6	6169	6174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218785
119	NC_021984	CAG	2	6	6305	6310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218785
120	NC_021984	ATC	2	6	6315	6320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218785
121	NC_021984	GAT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218785
122	NC_021984	ACG	2	6	6403	6408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218785
123	NC_021984	GCCA	2	8	6532	6539	25 %	0 %	25 %	50 %	529218785
124	NC_021984	GAT	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218785
125	NC_021984	GCG	2	6	6730	6735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218785
126	NC_021984	GC	3	6	6757	6762	0 %	0 %	50 %	50 %	529218785
127	NC_021984	CGA	2	6	6808	6813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218785
128	NC_021984	GCC	2	6	6881	6886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218785
129	NC_021984	AGG	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218785
130	NC_021984	ATG	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218785
131	NC_021984	GCG	2	6	7008	7013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218785
132	NC_021984	CCGCG	2	10	7052	7061	0 %	0 %	40 %	60 %	529218785
133	NC_021984	GCC	2	6	7094	7099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218785
134	NC_021984	TGAA	2	8	7158	7165	50 %	25 %	25 %	0 %	529218785
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162	NC_021984	TGA	2	6	8782	8787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218787
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264	NC_021984	GGC	2	6	14494	14499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218791
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375	NC_021984	CG	3	6	23499	23504	0 %	0 %	50 %	50 %	529218797
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381	NC_021984	A	7	7	23814	23820	100 %	0 %	0 %	0 %	529218797
382	NC_021984	GGC	2	6	23846	23851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218797
383	NC_021984	TGAA	2	8	24313	24320	50 %	25 %	25 %	0 %	529218798
384	NC_021984	TGT	2	6	24368	24373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218798
385	NC_021984	TAC	2	6	24390	24395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218798
386	NC_021984	CGGTA	2	10	24408	24417	20 %	20 %	40 %	20 %	529218798
387	NC_021984	CTGTT	2	10	24447	24456	0 %	60 %	20 %	20 %	529218798
388	NC_021984	TGG	2	6	24527	24532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218798
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491	NC_021984	AAC	2	6	29475	29480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218802
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