MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_021984	TGG	2	6	1198630	1198635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219580
19003	NC_021984	CAT	3	9	1198705	1198713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219580
19004	NC_021984	CTG	2	6	1198823	1198828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219580
19005	NC_021984	GCG	2	6	1198831	1198836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219580
19006	NC_021984	CCA	2	6	1198837	1198842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219580
19007	NC_021984	GAT	2	6	1198883	1198888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219580
19008	NC_021984	GGCGCG	2	12	1198976	1198987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219580
19009	NC_021984	TGC	2	6	1199017	1199022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219580
19010	NC_021984	CGG	2	6	1199068	1199073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219580
19011	NC_021984	CAA	2	6	1199113	1199118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219580
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19013	NC_021984	A	6	6	1199349	1199354	100 %	0 %	0 %	0 %	529222156
19014	NC_021984	T	7	7	1199379	1199385	0 %	100 %	0 %	0 %	529222156
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19043	NC_021984	TTA	2	6	1207555	1207560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219583
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19059	NC_021984	A	6	6	1208169	1208174	100 %	0 %	0 %	0 %	529219583
19060	NC_021984	TA	3	6	1208193	1208198	50 %	50 %	0 %	0 %	529219583
19061	NC_021984	AT	3	6	1208224	1208229	50 %	50 %	0 %	0 %	529219583
19062	NC_021984	ACG	2	6	1208252	1208257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219583
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19091	NC_021984	GC	3	6	1210401	1210406	0 %	0 %	50 %	50 %	529219585
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19104	NC_021984	GGC	2	6	1210948	1210953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219585
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19118	NC_021984	GTAA	2	8	1211642	1211649	50 %	25 %	25 %	0 %	529219586
19119	NC_021984	TGA	2	6	1211801	1211806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219586
19120	NC_021984	TCG	3	9	1211831	1211839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219586
19121	NC_021984	GATC	2	8	1211856	1211863	25 %	25 %	25 %	25 %	529219586
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19123	NC_021984	CTT	2	6	1211940	1211945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219586
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19228	NC_021984	A	6	6	1219595	1219600	100 %	0 %	0 %	0 %	529222157
19229	NC_021984	GCT	2	6	1219609	1219614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222157
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19233	NC_021984	GCA	2	6	1219804	1219809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222157
19234	NC_021984	TGA	2	6	1219818	1219823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222157
19235	NC_021984	GTC	2	6	1219841	1219846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222157
19236	NC_021984	TGT	2	6	1219872	1219877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529222157
19237	NC_021984	CCG	2	6	1220009	1220014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222157
19238	NC_021984	GAT	2	6	1220032	1220037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222157
19239	NC_021984	GGCGC	2	10	1220103	1220112	0 %	0 %	60 %	40 %	529222157
19240	NC_021984	GGGC	2	8	1220213	1220220	0 %	0 %	75 %	25 %	529222157
19241	NC_021984	ACGC	2	8	1220314	1220321	25 %	0 %	25 %	50 %	529222157
19242	NC_021984	ATC	2	6	1220517	1220522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222157
19243	NC_021984	TGG	2	6	1220523	1220528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222157
19244	NC_021984	CGC	2	6	1220547	1220552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222157
19245	NC_021984	T	6	6	1220582	1220587	0 %	100 %	0 %	0 %	529222157
19246	NC_021984	AACC	2	8	1220591	1220598	50 %	0 %	0 %	50 %	529222157
19247	NC_021984	GGT	2	6	1220599	1220604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222157
19248	NC_021984	A	6	6	1220618	1220623	100 %	0 %	0 %	0 %	529222157
19249	NC_021984	TGG	2	6	1220634	1220639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222157
19250	NC_021984	TGG	2	6	1220679	1220684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222157
19251	NC_021984	TGG	2	6	1220757	1220762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222157
19252	NC_021984	CTA	2	6	1220782	1220787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222157
19253	NC_021984	AGG	2	6	1220837	1220842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529222157
19254	NC_021984	GCA	2	6	1220878	1220883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222157
19255	NC_021984	A	7	7	1220921	1220927	100 %	0 %	0 %	0 %	529222157
19256	NC_021984	CGC	2	6	1220950	1220955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222157
19257	NC_021984	TGG	2	6	1220970	1220975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222157
19258	NC_021984	CGA	2	6	1221007	1221012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222157
19259	NC_021984	GCG	2	6	1221039	1221044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222157
19260	NC_021984	TGAA	2	8	1221063	1221070	50 %	25 %	25 %	0 %	529222157
19261	NC_021984	TGGC	2	8	1221071	1221078	0 %	25 %	50 %	25 %	529222157
19262	NC_021984	AAAT	2	8	1221084	1221091	75 %	25 %	0 %	0 %	529222157
19263	NC_021984	GCG	2	6	1221114	1221119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222157
19264	NC_021984	T	6	6	1221131	1221136	0 %	100 %	0 %	0 %	529222157
19265	NC_021984	GC	3	6	1221168	1221173	0 %	0 %	50 %	50 %	529222157
19266	NC_021984	GCC	2	6	1221185	1221190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222157
19267	NC_021984	GCT	2	6	1221234	1221239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222157
19268	NC_021984	GCGT	2	8	1221402	1221409	0 %	25 %	50 %	25 %	529222157
19269	NC_021984	GGAA	2	8	1221489	1221496	50 %	0 %	50 %	0 %	529219591
19270	NC_021984	ATC	2	6	1221569	1221574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219591
19271	NC_021984	TGC	2	6	1221596	1221601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219591
19272	NC_021984	GGT	2	6	1221678	1221683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219591
19273	NC_021984	TGA	2	6	1221798	1221803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219591
19274	NC_021984	TTC	2	6	1221822	1221827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219591
19275	NC_021984	TAC	2	6	1221834	1221839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219591
19276	NC_021984	TG	3	6	1221846	1221851	0 %	50 %	50 %	0 %	529219591
19277	NC_021984	GACCC	2	10	1221966	1221975	20 %	0 %	20 %	60 %	529222158
19278	NC_021984	CT	3	6	1222080	1222085	0 %	50 %	0 %	50 %	529222158
19279	NC_021984	AGA	2	6	1222100	1222105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529222158
19280	NC_021984	TAA	2	6	1222137	1222142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529222158
19281	NC_021984	GTC	2	6	1222453	1222458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219592
19282	NC_021984	ATT	2	6	1222468	1222473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219592
19283	NC_021984	CAT	2	6	1222501	1222506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219592
19284	NC_021984	CCG	4	12	1222628	1222639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219592
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19286	NC_021984	TGG	2	6	1222722	1222727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219592
19287	NC_021984	ATC	2	6	1222733	1222738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219592
19288	NC_021984	ATA	2	6	1222745	1222750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219592
19289	NC_021984	GCTGC	2	10	1222871	1222880	0 %	20 %	40 %	40 %	529219592
19290	NC_021984	AAAC	2	8	1222887	1222894	75 %	0 %	0 %	25 %	529219592
19291	NC_021984	ATT	2	6	1222939	1222944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219592
19292	NC_021984	CAT	2	6	1222981	1222986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219592
19293	NC_021984	ATG	2	6	1223049	1223054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219592
19294	NC_021984	CTT	2	6	1223169	1223174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219592
19295	NC_021984	T	6	6	1223185	1223190	0 %	100 %	0 %	0 %	529219592
19296	NC_021984	CTT	2	6	1223340	1223345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219592
19297	NC_021984	CGA	2	6	1223457	1223462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219592
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19299	NC_021984	ATA	2	6	1223600	1223605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219592
19300	NC_021984	T	6	6	1223700	1223705	0 %	100 %	0 %	0 %	529219592
19301	NC_021984	A	7	7	1223738	1223744	100 %	0 %	0 %	0 %	529219592
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19303	NC_021984	GGA	2	6	1224228	1224233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219593
19304	NC_021984	GCG	2	6	1224265	1224270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219593
19305	NC_021984	AGC	2	6	1224299	1224304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219593
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19307	NC_021984	GCG	2	6	1224545	1224550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219593
19308	NC_021984	AAG	2	6	1224640	1224645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219594
19309	NC_021984	TGA	2	6	1224668	1224673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219594
19310	NC_021984	GGT	2	6	1224698	1224703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219594
19311	NC_021984	GC	3	6	1224704	1224709	0 %	0 %	50 %	50 %	529219594
19312	NC_021984	CTGG	2	8	1224773	1224780	0 %	25 %	50 %	25 %	529219594
19313	NC_021984	CAT	2	6	1224856	1224861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219594
19314	NC_021984	CGA	2	6	1224872	1224877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219594
19315	NC_021984	ATT	2	6	1225065	1225070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219594
19316	NC_021984	CGT	2	6	1225133	1225138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219594
19317	NC_021984	T	6	6	1225155	1225160	0 %	100 %	0 %	0 %	529219594
19318	NC_021984	GCGT	2	8	1225216	1225223	0 %	25 %	50 %	25 %	529219594
19319	NC_021984	TGG	2	6	1225294	1225299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219594
19320	NC_021984	GCT	2	6	1225333	1225338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219594
19321	NC_021984	CGC	2	6	1225370	1225375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219594
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19323	NC_021984	ACA	3	9	1225447	1225455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219594
19324	NC_021984	GGC	2	6	1225458	1225463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219594
19325	NC_021984	CAG	2	6	1225632	1225637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219594
19326	NC_021984	CAAC	2	8	1225762	1225769	50 %	0 %	0 %	50 %	529219594
19327	NC_021984	GCG	2	6	1225816	1225821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219594
19328	NC_021984	GC	3	6	1225858	1225863	0 %	0 %	50 %	50 %	529219594
19329	NC_021984	ACA	2	6	1225881	1225886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219594
19330	NC_021984	GAA	2	6	1225938	1225943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219594
19331	NC_021984	GAT	2	6	1225955	1225960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219594
19332	NC_021984	CTG	2	6	1226028	1226033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219594
19333	NC_021984	ATG	2	6	1226063	1226068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219594
19334	NC_021984	GAA	2	6	1226113	1226118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219595
19335	NC_021984	CTGG	2	8	1226218	1226225	0 %	25 %	50 %	25 %	529219595
19336	NC_021984	CGG	2	6	1226247	1226252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219595
19337	NC_021984	GGA	2	6	1226295	1226300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219595
19338	NC_021984	CGGG	2	8	1226302	1226309	0 %	0 %	75 %	25 %	529219595
19339	NC_021984	GC	3	6	1226397	1226402	0 %	0 %	50 %	50 %	529219595
19340	NC_021984	CGT	2	6	1226417	1226422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219595
19341	NC_021984	GAA	2	6	1226452	1226457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219595
19342	NC_021984	CGG	2	6	1226520	1226525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219595
19343	NC_021984	TGA	2	6	1226586	1226591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219595
19344	NC_021984	CGA	2	6	1226655	1226660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219595
19345	NC_021984	TAT	2	6	1226673	1226678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219595
19346	NC_021984	GGA	2	6	1226787	1226792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219595
19347	NC_021984	TGGC	2	8	1226802	1226809	0 %	25 %	50 %	25 %	529219595
19348	NC_021984	CAG	2	6	1226818	1226823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219595
19349	NC_021984	GCA	2	6	1226842	1226847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219596
19350	NC_021984	A	6	6	1226859	1226864	100 %	0 %	0 %	0 %	529219596
19351	NC_021984	ACA	2	6	1226890	1226895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219596
19352	NC_021984	ACA	2	6	1226899	1226904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219596
19353	NC_021984	CGC	2	6	1226955	1226960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219596
19354	NC_021984	CAG	2	6	1226990	1226995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219596
19355	NC_021984	TA	3	6	1227215	1227220	50 %	50 %	0 %	0 %	529219596
19356	NC_021984	CGA	2	6	1227289	1227294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219596
19357	NC_021984	CCA	2	6	1227316	1227321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219596
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19359	NC_021984	GC	3	6	1227399	1227404	0 %	0 %	50 %	50 %	529219596
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19385	NC_021984	TGC	2	6	1228793	1228798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219597
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19452	NC_021984	CAGC	2	8	1232711	1232718	25 %	0 %	25 %	50 %	529219602
19453	NC_021984	GTT	2	6	1232778	1232783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219602
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19456	NC_021984	CGT	2	6	1232978	1232983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219602
19457	NC_021984	T	6	6	1233045	1233050	0 %	100 %	0 %	0 %	529219602
19458	NC_021984	TCA	2	6	1233062	1233067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219602
19459	NC_021984	GA	3	6	1233116	1233121	50 %	0 %	50 %	0 %	529219602
19460	NC_021984	ACAA	2	8	1233201	1233208	75 %	0 %	0 %	25 %	529219602
19461	NC_021984	CGC	2	6	1233710	1233715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219603
19462	NC_021984	ATC	2	6	1233777	1233782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219603
19463	NC_021984	AC	4	8	1233853	1233860	50 %	0 %	0 %	50 %	529219603
19464	NC_021984	A	7	7	1233872	1233878	100 %	0 %	0 %	0 %	529219603
19465	NC_021984	GC	3	6	1233886	1233891	0 %	0 %	50 %	50 %	529219603
19466	NC_021984	AGC	2	6	1233945	1233950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219603
19467	NC_021984	CGC	2	6	1233958	1233963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219603
19468	NC_021984	CGG	2	6	1234021	1234026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219603
19469	NC_021984	CCG	2	6	1234069	1234074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219603
19470	NC_021984	TAA	2	6	1234084	1234089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219603
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19472	NC_021984	ATG	2	6	1234119	1234124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219603
19473	NC_021984	TCG	2	6	1234186	1234191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219603
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19486	NC_021984	CGA	2	6	1234766	1234771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219603
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19491	NC_021984	AG	3	6	1234887	1234892	50 %	0 %	50 %	0 %	529219603
19492	NC_021984	T	6	6	1234952	1234957	0 %	100 %	0 %	0 %	529219603
19493	NC_021984	T	6	6	1234961	1234966	0 %	100 %	0 %	0 %	529219603
19494	NC_021984	TTAA	2	8	1236670	1236677	50 %	50 %	0 %	0 %	529219604
19495	NC_021984	TTA	2	6	1236689	1236694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219604
19496	NC_021984	GCG	2	6	1236827	1236832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219604
19497	NC_021984	CGG	2	6	1236864	1236869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219604
19498	NC_021984	CAGAG	2	10	1236923	1236932	40 %	0 %	40 %	20 %	529219604
19499	NC_021984	ATG	2	6	1236953	1236958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219604
19500	NC_021984	T	6	6	1236961	1236966	0 %	100 %	0 %	0 %	529219604

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