MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_021984	ATG	2	6	1138389	1138394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219535
18003	NC_021984	A	6	6	1138407	1138412	100 %	0 %	0 %	0 %	529219535
18004	NC_021984	CTT	2	6	1138510	1138515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219535
18005	NC_021984	GAA	2	6	1138527	1138532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219535
18006	NC_021984	AAG	2	6	1138549	1138554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219535
18007	NC_021984	TTC	2	6	1138563	1138568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219535
18008	NC_021984	GGC	2	6	1138670	1138675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219535
18009	NC_021984	GC	3	6	1138686	1138691	0 %	0 %	50 %	50 %	529219535
18010	NC_021984	A	6	6	1138848	1138853	100 %	0 %	0 %	0 %	529219535
18011	NC_021984	A	6	6	1138996	1139001	100 %	0 %	0 %	0 %	529219535
18012	NC_021984	ATG	2	6	1139033	1139038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219535
18013	NC_021984	GGC	2	6	1139070	1139075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222145
18014	NC_021984	ATT	2	6	1139188	1139193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222145
18015	NC_021984	CGA	2	6	1139235	1139240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222145
18016	NC_021984	TGA	2	6	1139349	1139354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222145
18017	NC_021984	TCAGG	2	10	1139436	1139445	20 %	20 %	40 %	20 %	529222145
18018	NC_021984	GCT	2	6	1139478	1139483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222145
18019	NC_021984	TGAA	2	8	1139567	1139574	50 %	25 %	25 %	0 %	529222145
18020	NC_021984	TGA	2	6	1139631	1139636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222145
18021	NC_021984	GAT	2	6	1139668	1139673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222145
18022	NC_021984	T	6	6	1139685	1139690	0 %	100 %	0 %	0 %	529222145
18023	NC_021984	GTG	2	6	1139710	1139715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222145
18024	NC_021984	GCT	2	6	1139735	1139740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222145
18025	NC_021984	CGC	2	6	1139841	1139846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222145
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18027	NC_021984	TGAA	2	8	1139969	1139976	50 %	25 %	25 %	0 %	529222145
18028	NC_021984	CGG	3	9	1140066	1140074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222146
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18030	NC_021984	A	6	6	1140214	1140219	100 %	0 %	0 %	0 %	529222146
18031	NC_021984	TGG	3	9	1140236	1140244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222146
18032	NC_021984	AAG	2	6	1140344	1140349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529222146
18033	NC_021984	GATT	2	8	1140375	1140382	25 %	50 %	25 %	0 %	529222146
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18035	NC_021984	T	6	6	1140424	1140429	0 %	100 %	0 %	0 %	529222146
18036	NC_021984	GCG	2	6	1140499	1140504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222146
18037	NC_021984	CAT	2	6	1140555	1140560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222146
18038	NC_021984	GCT	2	6	1140603	1140608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222146
18039	NC_021984	GC	4	8	1140709	1140716	0 %	0 %	50 %	50 %	529222146
18040	NC_021984	CGCTGG	2	12	1140815	1140826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529222146
18041	NC_021984	GCG	2	6	1140866	1140871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222146
18042	NC_021984	GA	3	6	1140893	1140898	50 %	0 %	50 %	0 %	529222146
18043	NC_021984	CGCTG	2	10	1140903	1140912	0 %	20 %	40 %	40 %	529222146
18044	NC_021984	TGA	2	6	1140944	1140949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222146
18045	NC_021984	GGC	2	6	1141113	1141118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222147
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18047	NC_021984	A	6	6	1141162	1141167	100 %	0 %	0 %	0 %	529222147
18048	NC_021984	GCGGT	2	10	1141271	1141280	0 %	20 %	60 %	20 %	529222147
18049	NC_021984	CGG	2	6	1141289	1141294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222147
18050	NC_021984	GCTG	2	8	1141296	1141303	0 %	25 %	50 %	25 %	529222147
18051	NC_021984	TTA	2	6	1141379	1141384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222147
18052	NC_021984	AAAAC	2	10	1141385	1141394	80 %	0 %	0 %	20 %	529222147
18053	NC_021984	GCC	2	6	1141402	1141407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222147
18054	NC_021984	CAG	2	6	1141413	1141418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222147
18055	NC_021984	TAAC	2	8	1141472	1141479	50 %	25 %	0 %	25 %	529222147
18056	NC_021984	TAAA	2	8	1141544	1141551	75 %	25 %	0 %	0 %	529222147
18057	NC_021984	AAT	2	6	1141587	1141592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529222147
18058	NC_021984	A	7	7	1141687	1141693	100 %	0 %	0 %	0 %	529222147
18059	NC_021984	GAT	2	6	1141695	1141700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222147
18060	NC_021984	TGG	2	6	1141727	1141732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222147
18061	NC_021984	TGA	2	6	1141818	1141823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222147
18062	NC_021984	ATA	2	6	1141847	1141852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529222147
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18064	NC_021984	AAT	2	6	1142167	1142172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529222148
18065	NC_021984	CGG	2	6	1142232	1142237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222148
18066	NC_021984	TTG	2	6	1142284	1142289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529222148
18067	NC_021984	TTTC	2	8	1142346	1142353	0 %	75 %	0 %	25 %	529222148
18068	NC_021984	CTT	2	6	1142402	1142407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222148
18069	NC_021984	TCCC	2	8	1142420	1142427	0 %	25 %	0 %	75 %	529222148
18070	NC_021984	CG	3	6	1142448	1142453	0 %	0 %	50 %	50 %	529222148
18071	NC_021984	TC	3	6	1142454	1142459	0 %	50 %	0 %	50 %	529222148
18072	NC_021984	GAT	2	6	1142532	1142537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222148
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18084	NC_021984	GTA	2	6	1143016	1143021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222149
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18089	NC_021984	GGC	2	6	1143282	1143287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222149
18090	NC_021984	GC	3	6	1143290	1143295	0 %	0 %	50 %	50 %	529222149
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18099	NC_021984	CAGC	2	8	1144056	1144063	25 %	0 %	25 %	50 %	529219536
18100	NC_021984	GC	3	6	1144062	1144067	0 %	0 %	50 %	50 %	529219536
18101	NC_021984	TAA	2	6	1144102	1144107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219536
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18115	NC_021984	GGC	2	6	1144746	1144751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219537
18116	NC_021984	AATT	2	8	1144772	1144779	50 %	50 %	0 %	0 %	529219537
18117	NC_021984	CAGC	2	8	1144799	1144806	25 %	0 %	25 %	50 %	529219537
18118	NC_021984	AG	3	6	1144860	1144865	50 %	0 %	50 %	0 %	529219537
18119	NC_021984	TGC	2	6	1144957	1144962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219537
18120	NC_021984	TGA	2	6	1144983	1144988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219537
18121	NC_021984	ATGG	2	8	1145010	1145017	25 %	25 %	50 %	0 %	529219537
18122	NC_021984	CCG	2	6	1145128	1145133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219537
18123	NC_021984	CTG	2	6	1147287	1147292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219538
18124	NC_021984	CGT	2	6	1147299	1147304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219538
18125	NC_021984	GCGG	2	8	1147361	1147368	0 %	0 %	75 %	25 %	529219538
18126	NC_021984	T	7	7	1147409	1147415	0 %	100 %	0 %	0 %	529219538
18127	NC_021984	CG	3	6	1147524	1147529	0 %	0 %	50 %	50 %	529219538
18128	NC_021984	GTG	2	6	1147545	1147550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219538
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18134	NC_021984	CGC	2	6	1147756	1147761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219538
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18138	NC_021984	CTG	2	6	1148064	1148069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219539
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18147	NC_021984	TGGC	2	8	1148258	1148265	0 %	25 %	50 %	25 %	529219539
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18183	NC_021984	GGCA	2	8	1151794	1151801	25 %	0 %	50 %	25 %	529219540
18184	NC_021984	TCA	2	6	1151838	1151843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219540
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18200	NC_021984	CTC	2	6	1153502	1153507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529219542
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18202	NC_021984	CAGC	2	8	1153535	1153542	25 %	0 %	25 %	50 %	529219542
18203	NC_021984	TCGG	2	8	1153578	1153585	0 %	25 %	50 %	25 %	529219542
18204	NC_021984	TAAT	2	8	1153606	1153613	50 %	50 %	0 %	0 %	529219542
18205	NC_021984	GAT	2	6	1153696	1153701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219542
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18207	NC_021984	GCG	2	6	1153781	1153786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219542
18208	NC_021984	CAT	2	6	1153801	1153806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219542
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18211	NC_021984	GC	3	6	1154013	1154018	0 %	0 %	50 %	50 %	529219542
18212	NC_021984	CG	3	6	1154512	1154517	0 %	0 %	50 %	50 %	529219543
18213	NC_021984	TGA	2	6	1154525	1154530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219543
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18216	NC_021984	A	6	6	1154757	1154762	100 %	0 %	0 %	0 %	529219543
18217	NC_021984	AGC	2	6	1154825	1154830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219543
18218	NC_021984	GC	3	6	1154841	1154846	0 %	0 %	50 %	50 %	529219543
18219	NC_021984	GCC	2	6	1154978	1154983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219543
18220	NC_021984	GC	3	6	1155025	1155030	0 %	0 %	50 %	50 %	529219543
18221	NC_021984	TGA	2	6	1155035	1155040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219543
18222	NC_021984	AGGGCG	2	12	1155073	1155084	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	529219543
18223	NC_021984	T	6	6	1155107	1155112	0 %	100 %	0 %	0 %	529219543
18224	NC_021984	TGA	2	6	1155161	1155166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219543
18225	NC_021984	AT	3	6	1155206	1155211	50 %	50 %	0 %	0 %	529219543
18226	NC_021984	GAC	2	6	1155239	1155244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219543
18227	NC_021984	TGGG	2	8	1155256	1155263	0 %	25 %	75 %	0 %	529219543
18228	NC_021984	CAC	2	6	1155332	1155337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219543
18229	NC_021984	CGG	2	6	1155341	1155346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219543
18230	NC_021984	ATC	2	6	1155387	1155392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219543
18231	NC_021984	TG	3	6	1155516	1155521	0 %	50 %	50 %	0 %	529219543
18232	NC_021984	CGG	2	6	1155599	1155604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219543
18233	NC_021984	GTG	2	6	1155609	1155614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219543
18234	NC_021984	CGA	2	6	1155641	1155646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219543
18235	NC_021984	CAT	2	6	1155709	1155714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219543
18236	NC_021984	CGC	2	6	1155748	1155753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219544
18237	NC_021984	CTT	2	6	1155784	1155789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219544
18238	NC_021984	GTG	2	6	1155848	1155853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219544
18239	NC_021984	AAGG	2	8	1155860	1155867	50 %	0 %	50 %	0 %	529219544
18240	NC_021984	TGG	2	6	1155960	1155965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219544
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18242	NC_021984	GTGC	2	8	1156052	1156059	0 %	25 %	50 %	25 %	529219544
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18245	NC_021984	GAG	2	6	1156157	1156162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219544
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18249	NC_021984	CTG	2	6	1156381	1156386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219545
18250	NC_021984	CG	3	6	1156419	1156424	0 %	0 %	50 %	50 %	529219545
18251	NC_021984	GGC	2	6	1156449	1156454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219545
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18254	NC_021984	GGCA	2	8	1156650	1156657	25 %	0 %	50 %	25 %	529219545
18255	NC_021984	AG	3	6	1156678	1156683	50 %	0 %	50 %	0 %	529219545
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18259	NC_021984	CGA	2	6	1156800	1156805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219545
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18309	NC_021984	TTCT	2	8	1159121	1159128	0 %	75 %	0 %	25 %	529219546
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18320	NC_021984	CGC	3	9	1159718	1159726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219546
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18327	NC_021984	CT	3	6	1161020	1161025	0 %	50 %	0 %	50 %	529219547
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18331	NC_021984	GC	3	6	1161167	1161172	0 %	0 %	50 %	50 %	529219547
18332	NC_021984	CAG	2	6	1161196	1161201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219547
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18334	NC_021984	GCGG	2	8	1161310	1161317	0 %	0 %	75 %	25 %	529219547
18335	NC_021984	T	6	6	1161330	1161335	0 %	100 %	0 %	0 %	529219547
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18337	NC_021984	TGT	2	6	1161398	1161403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219547
18338	NC_021984	CAG	2	6	1161424	1161429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219547
18339	NC_021984	CCG	2	6	1161469	1161474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219547
18340	NC_021984	GCA	2	6	1161483	1161488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219547
18341	NC_021984	GCC	2	6	1161659	1161664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219547
18342	NC_021984	G	6	6	1161681	1161686	0 %	0 %	100 %	0 %	529219547
18343	NC_021984	GTC	2	6	1161841	1161846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219548
18344	NC_021984	TCA	2	6	1161983	1161988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219548
18345	NC_021984	GTC	2	6	1162003	1162008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219548
18346	NC_021984	CGG	2	6	1162017	1162022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219548
18347	NC_021984	T	6	6	1162030	1162035	0 %	100 %	0 %	0 %	529219548
18348	NC_021984	CCG	2	6	1162121	1162126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219548
18349	NC_021984	GAA	2	6	1162141	1162146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219548
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18351	NC_021984	CAC	2	6	1162180	1162185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219548
18352	NC_021984	GCTCA	2	10	1162264	1162273	20 %	20 %	20 %	40 %	529219548
18353	NC_021984	TCT	2	6	1162445	1162450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219548
18354	NC_021984	CGC	2	6	1162506	1162511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219548
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18381	NC_021984	GCC	2	6	1164262	1164267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219551
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18451	NC_021984	CGCT	2	8	1167395	1167402	0 %	25 %	25 %	50 %	529219554
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18463	NC_021984	ATG	2	6	1167858	1167863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219554
18464	NC_021984	TGC	2	6	1167864	1167869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219554
18465	NC_021984	CAC	2	6	1167998	1168003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219554
18466	NC_021984	GAT	2	6	1168046	1168051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219555
18467	NC_021984	TTG	2	6	1168083	1168088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219555
18468	NC_021984	ACG	2	6	1168118	1168123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219555
18469	NC_021984	GCG	2	6	1168154	1168159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219555
18470	NC_021984	CTGC	2	8	1168175	1168182	0 %	25 %	25 %	50 %	529219555
18471	NC_021984	TTTTG	2	10	1168201	1168210	0 %	80 %	20 %	0 %	529219555
18472	NC_021984	GGA	3	9	1168288	1168296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219555
18473	NC_021984	CAT	2	6	1168394	1168399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219555
18474	NC_021984	TCG	2	6	1168428	1168433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219555
18475	NC_021984	GCG	2	6	1168442	1168447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219555
18476	NC_021984	CGA	2	6	1168495	1168500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219555
18477	NC_021984	GCA	2	6	1168518	1168523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219555
18478	NC_021984	TAG	2	6	1168534	1168539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219555
18479	NC_021984	GAG	2	6	1168553	1168558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219555
18480	NC_021984	GAG	2	6	1168605	1168610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219555
18481	NC_021984	CT	3	6	1168615	1168620	0 %	50 %	0 %	50 %	529219555
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18490	NC_021984	CGC	2	6	1169045	1169050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219556
18491	NC_021984	GC	3	6	1169111	1169116	0 %	0 %	50 %	50 %	529219556
18492	NC_021984	TCA	2	6	1169152	1169157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219556
18493	NC_021984	CGG	2	6	1169240	1169245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219556
18494	NC_021984	CAG	2	6	1169262	1169267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219556
18495	NC_021984	T	6	6	1169331	1169336	0 %	100 %	0 %	0 %	529219556
18496	NC_021984	AGG	2	6	1169352	1169357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219556
18497	NC_021984	ACC	2	6	1169452	1169457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219556
18498	NC_021984	CG	3	6	1169472	1169477	0 %	0 %	50 %	50 %	529219556
18499	NC_021984	AAT	2	6	1169511	1169516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219556
18500	NC_021984	TGC	2	6	1169518	1169523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219556

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