MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_021984	A	7	7	1036688	1036694	100 %	0 %	0 %	0 %	529222117
16502	NC_021984	TAT	2	6	1036788	1036793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222117
16503	NC_021984	GCA	2	6	1036905	1036910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222117
16504	NC_021984	CAA	2	6	1036928	1036933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529222117
16505	NC_021984	T	6	6	1036939	1036944	0 %	100 %	0 %	0 %	529222117
16506	NC_021984	T	7	7	1037327	1037333	0 %	100 %	0 %	0 %	529222118
16507	NC_021984	AG	3	6	1037375	1037380	50 %	0 %	50 %	0 %	529222118
16508	NC_021984	CAA	2	6	1037409	1037414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529222118
16509	NC_021984	GCA	2	6	1037568	1037573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219460
16510	NC_021984	AATGC	2	10	1037642	1037651	40 %	20 %	20 %	20 %	529219460
16511	NC_021984	GTC	2	6	1037710	1037715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219460
16512	NC_021984	CGCTT	2	10	1037722	1037731	0 %	40 %	20 %	40 %	529219460
16513	NC_021984	TTC	2	6	1037863	1037868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219460
16514	NC_021984	AAT	2	6	1037923	1037928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219460
16515	NC_021984	CG	3	6	1037945	1037950	0 %	0 %	50 %	50 %	529219460
16516	NC_021984	GCGA	2	8	1037951	1037958	25 %	0 %	50 %	25 %	529219460
16517	NC_021984	GCA	2	6	1037982	1037987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219460
16518	NC_021984	TCA	2	6	1038023	1038028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219460
16519	NC_021984	CAG	2	6	1038070	1038075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219460
16520	NC_021984	CG	3	6	1038076	1038081	0 %	0 %	50 %	50 %	529219460
16521	NC_021984	CA	3	6	1038570	1038575	50 %	0 %	0 %	50 %	529222119
16522	NC_021984	CGA	2	6	1038602	1038607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222119
16523	NC_021984	CTG	2	6	1038672	1038677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222119
16524	NC_021984	ATC	2	6	1038696	1038701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222119
16525	NC_021984	TGA	2	6	1038782	1038787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222119
16526	NC_021984	GTAA	2	8	1038832	1038839	50 %	25 %	25 %	0 %	529222119
16527	NC_021984	ACA	2	6	1038899	1038904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529222120
16528	NC_021984	AACC	2	8	1038910	1038917	50 %	0 %	0 %	50 %	529222120
16529	NC_021984	CGT	2	6	1038936	1038941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222120
16530	NC_021984	CTGT	2	8	1038972	1038979	0 %	50 %	25 %	25 %	529222120
16531	NC_021984	CAC	2	6	1039011	1039016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529222120
16532	NC_021984	TAC	2	6	1039032	1039037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222120
16533	NC_021984	G	6	6	1039230	1039235	0 %	0 %	100 %	0 %	529222121
16534	NC_021984	GCA	2	6	1039264	1039269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222121
16535	NC_021984	CTT	2	6	1039303	1039308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222121
16536	NC_021984	AAC	2	6	1039361	1039366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529222121
16537	NC_021984	CAGT	2	8	1039393	1039400	25 %	25 %	25 %	25 %	529222121
16538	NC_021984	GCCGA	2	10	1039487	1039496	20 %	0 %	40 %	40 %	529222121
16539	NC_021984	ATT	2	6	1039545	1039550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222121
16540	NC_021984	GTC	2	6	1039711	1039716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222121
16541	NC_021984	GAA	3	9	1039756	1039764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529222121
16542	NC_021984	GT	3	6	1039882	1039887	0 %	50 %	50 %	0 %	529222121
16543	NC_021984	CTG	2	6	1039951	1039956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222121
16544	NC_021984	A	6	6	1039975	1039980	100 %	0 %	0 %	0 %	529222121
16545	NC_021984	GTG	2	6	1039986	1039991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222121
16546	NC_021984	GCT	2	6	1039992	1039997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222121
16547	NC_021984	TTA	2	6	1039999	1040004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222121
16548	NC_021984	A	6	6	1040018	1040023	100 %	0 %	0 %	0 %	529222121
16549	NC_021984	CTGT	2	8	1040073	1040080	0 %	50 %	25 %	25 %	529222121
16550	NC_021984	ATA	2	6	1040274	1040279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529222121
16551	NC_021984	ATT	2	6	1040369	1040374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219461
16552	NC_021984	A	6	6	1040424	1040429	100 %	0 %	0 %	0 %	529219461
16553	NC_021984	CGC	2	6	1040488	1040493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219461
16554	NC_021984	CGA	2	6	1040511	1040516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219461
16555	NC_021984	CG	3	6	1040537	1040542	0 %	0 %	50 %	50 %	529219461
16556	NC_021984	TGG	2	6	1040586	1040591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219461
16557	NC_021984	GCAT	2	8	1040608	1040615	25 %	25 %	25 %	25 %	529219461
16558	NC_021984	TGG	2	6	1040760	1040765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219461
16559	NC_021984	ATT	2	6	1040819	1040824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219461
16560	NC_021984	GAA	2	6	1040864	1040869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219461
16561	NC_021984	TAT	2	6	1040875	1040880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219461
16562	NC_021984	GGC	2	6	1041040	1041045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219461
16563	NC_021984	TAA	2	6	1041046	1041051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219461
16564	NC_021984	A	6	6	1041122	1041127	100 %	0 %	0 %	0 %	529219461
16565	NC_021984	GTC	3	9	1041149	1041157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219461
16566	NC_021984	CGTG	2	8	1041217	1041224	0 %	25 %	50 %	25 %	529219461
16567	NC_021984	GGC	2	6	1041391	1041396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219462
16568	NC_021984	AGA	2	6	1041412	1041417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219462
16569	NC_021984	GAA	2	6	1041485	1041490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219462
16570	NC_021984	GCA	3	9	1041556	1041564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219462
16571	NC_021984	TCA	2	6	1041636	1041641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219462
16572	NC_021984	TGG	2	6	1041663	1041668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219462
16573	NC_021984	GGC	2	6	1041713	1041718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219462
16574	NC_021984	GAT	2	6	1041740	1041745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219462
16575	NC_021984	GAA	2	6	1041767	1041772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219462
16576	NC_021984	GTT	2	6	1041788	1041793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219462
16577	NC_021984	TTAACT	2	12	1041801	1041812	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	529219462
16578	NC_021984	GGT	2	6	1041823	1041828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219462
16579	NC_021984	CG	3	6	1041893	1041898	0 %	0 %	50 %	50 %	529219462
16580	NC_021984	CTGCCG	2	12	1041899	1041910	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	529219462
16581	NC_021984	GC	3	6	1041930	1041935	0 %	0 %	50 %	50 %	529219462
16582	NC_021984	TGA	2	6	1041936	1041941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219462
16583	NC_021984	GTA	2	6	1042007	1042012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219462
16584	NC_021984	AAC	2	6	1042013	1042018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219462
16585	NC_021984	GCC	2	6	1042043	1042048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219462
16586	NC_021984	CGG	2	6	1042224	1042229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219462
16587	NC_021984	GAA	2	6	1042393	1042398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219463
16588	NC_021984	TAA	2	6	1042519	1042524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219463
16589	NC_021984	GAT	2	6	1042565	1042570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219463
16590	NC_021984	ATC	2	6	1042600	1042605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219463
16591	NC_021984	GC	3	6	1042633	1042638	0 %	0 %	50 %	50 %	529219463
16592	NC_021984	ATG	2	6	1042640	1042645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219463
16593	NC_021984	TGGT	2	8	1042683	1042690	0 %	50 %	50 %	0 %	529219463
16594	NC_021984	GCG	2	6	1042724	1042729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219463
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16598	NC_021984	GAA	2	6	1043170	1043175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219464
16599	NC_021984	GAA	2	6	1043218	1043223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219464
16600	NC_021984	CAA	2	6	1043229	1043234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219464
16601	NC_021984	CTT	2	6	1043237	1043242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219464
16602	NC_021984	GAA	2	6	1043299	1043304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219464
16603	NC_021984	GAA	2	6	1043329	1043334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219464
16604	NC_021984	CAC	2	6	1043346	1043351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219464
16605	NC_021984	CCA	2	6	1043382	1043387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219464
16606	NC_021984	TAAT	2	8	1044826	1044833	50 %	50 %	0 %	0 %	529219465
16607	NC_021984	TTG	2	6	1044910	1044915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219465
16608	NC_021984	TTA	2	6	1045151	1045156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219465
16609	NC_021984	GACG	2	8	1045286	1045293	25 %	0 %	50 %	25 %	529219465
16610	NC_021984	CGC	2	6	1045384	1045389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219465
16611	NC_021984	GA	3	6	1045481	1045486	50 %	0 %	50 %	0 %	529219465
16612	NC_021984	CAGG	2	8	1045496	1045503	25 %	0 %	50 %	25 %	529219465
16613	NC_021984	ATT	2	6	1045539	1045544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219465
16614	NC_021984	CGT	2	6	1045567	1045572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219465
16615	NC_021984	TTC	2	6	1045574	1045579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219465
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16961	NC_021984	GTT	2	6	1065333	1065338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219480
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16964	NC_021984	CT	3	6	1065887	1065892	0 %	50 %	0 %	50 %	529219481
16965	NC_021984	GAC	2	6	1065973	1065978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219481
16966	NC_021984	GC	3	6	1065999	1066004	0 %	0 %	50 %	50 %	529219481
16967	NC_021984	AGC	2	6	1066128	1066133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219481
16968	NC_021984	GCCA	2	8	1066190	1066197	25 %	0 %	25 %	50 %	529219481
16969	NC_021984	CAGC	2	8	1066222	1066229	25 %	0 %	25 %	50 %	529219481
16970	NC_021984	GCC	2	6	1066256	1066261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219481
16971	NC_021984	CGCGT	2	10	1066306	1066315	0 %	20 %	40 %	40 %	529219481
16972	NC_021984	GGCA	2	8	1066330	1066337	25 %	0 %	50 %	25 %	529219481
16973	NC_021984	GTT	2	6	1066450	1066455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219481
16974	NC_021984	ATG	2	6	1066481	1066486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219481
16975	NC_021984	TTG	2	6	1066490	1066495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219481
16976	NC_021984	ATT	2	6	1066529	1066534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219481
16977	NC_021984	CGC	2	6	1066602	1066607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219481
16978	NC_021984	ATG	2	6	1066616	1066621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219481
16979	NC_021984	GC	3	6	1066659	1066664	0 %	0 %	50 %	50 %	529219481
16980	NC_021984	TTGC	2	8	1066688	1066695	0 %	50 %	25 %	25 %	529219481
16981	NC_021984	ATC	2	6	1066721	1066726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219481
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16984	NC_021984	TCCT	2	8	1066831	1066838	0 %	50 %	0 %	50 %	529219481
16985	NC_021984	GC	3	6	1066840	1066845	0 %	0 %	50 %	50 %	529219481
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16988	NC_021984	ATG	2	6	1066986	1066991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219482
16989	NC_021984	TCG	2	6	1066996	1067001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219482
16990	NC_021984	TGC	2	6	1067029	1067034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219482
16991	NC_021984	CT	3	6	1067103	1067108	0 %	50 %	0 %	50 %	529219482
16992	NC_021984	TATC	2	8	1067150	1067157	25 %	50 %	0 %	25 %	529219482
16993	NC_021984	TCA	2	6	1067162	1067167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219482
16994	NC_021984	ATT	2	6	1067210	1067215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219482
16995	NC_021984	CGG	2	6	1067233	1067238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219482
16996	NC_021984	TGC	2	6	1067263	1067268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219482
16997	NC_021984	CGG	2	6	1067318	1067323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219482
16998	NC_021984	GC	4	8	1067346	1067353	0 %	0 %	50 %	50 %	529219482
16999	NC_021984	TGG	2	6	1067476	1067481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219482
17000	NC_021984	GCC	2	6	1067515	1067520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219482

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