MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021984	GC	3	6	1004596	1004601	0 %	0 %	50 %	50 %	529219431
16002	NC_021984	CCG	2	6	1004605	1004610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219431
16003	NC_021984	CAG	3	9	1004672	1004680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219431
16004	NC_021984	AAT	2	6	1004687	1004692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219431
16005	NC_021984	CGA	2	6	1004698	1004703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219431
16006	NC_021984	G	6	6	1004749	1004754	0 %	0 %	100 %	0 %	529219431
16007	NC_021984	GCC	2	6	1004766	1004771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219431
16008	NC_021984	ATC	2	6	1004790	1004795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219431
16009	NC_021984	AAT	2	6	1004885	1004890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219431
16010	NC_021984	GTG	2	6	1004895	1004900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219431
16011	NC_021984	T	6	6	1004928	1004933	0 %	100 %	0 %	0 %	529219431
16012	NC_021984	T	6	6	1004969	1004974	0 %	100 %	0 %	0 %	529219431
16013	NC_021984	TGAA	2	8	1004997	1005004	50 %	25 %	25 %	0 %	529219431
16014	NC_021984	AAG	2	6	1005006	1005011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219431
16015	NC_021984	TAA	2	6	1005046	1005051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219431
16016	NC_021984	A	6	6	1005050	1005055	100 %	0 %	0 %	0 %	529219431
16017	NC_021984	CCGC	2	8	1005090	1005097	0 %	0 %	25 %	75 %	529219431
16018	NC_021984	CGC	2	6	1005115	1005120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219431
16019	NC_021984	CGC	2	6	1005124	1005129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219431
16020	NC_021984	AG	3	6	1005134	1005139	50 %	0 %	50 %	0 %	529219431
16021	NC_021984	CAG	2	6	1005218	1005223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219431
16022	NC_021984	TAA	2	6	1005227	1005232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219431
16023	NC_021984	CG	3	6	1005233	1005238	0 %	0 %	50 %	50 %	529219431
16024	NC_021984	GC	3	6	1005424	1005429	0 %	0 %	50 %	50 %	529219431
16025	NC_021984	AG	3	6	1005460	1005465	50 %	0 %	50 %	0 %	529219431
16026	NC_021984	TGC	2	6	1005491	1005496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219431
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16028	NC_021984	CAGCC	2	10	1005510	1005519	20 %	0 %	20 %	60 %	529219431
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16030	NC_021984	CAT	2	6	1005798	1005803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219432
16031	NC_021984	CAA	2	6	1005815	1005820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219432
16032	NC_021984	GAA	2	6	1005881	1005886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219432
16033	NC_021984	ATA	2	6	1005937	1005942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219432
16034	NC_021984	GC	3	6	1005957	1005962	0 %	0 %	50 %	50 %	529219432
16035	NC_021984	GC	3	6	1006027	1006032	0 %	0 %	50 %	50 %	529219432
16036	NC_021984	CGC	2	6	1006070	1006075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219432
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16038	NC_021984	TCCA	2	8	1006321	1006328	25 %	25 %	0 %	50 %	529219432
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16042	NC_021984	GC	3	6	1006571	1006576	0 %	0 %	50 %	50 %	529219432
16043	NC_021984	TCGCC	2	10	1006969	1006978	0 %	20 %	20 %	60 %	529219433
16044	NC_021984	GCA	2	6	1006979	1006984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219433
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16047	NC_021984	TCG	2	6	1007215	1007220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219433
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16049	NC_021984	CGG	2	6	1007383	1007388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219433
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16051	NC_021984	TGTAC	2	10	1007458	1007467	20 %	40 %	20 %	20 %	529219433
16052	NC_021984	CGG	2	6	1007468	1007473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219433
16053	NC_021984	CAT	2	6	1007546	1007551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219433
16054	NC_021984	CG	5	10	1007565	1007574	0 %	0 %	50 %	50 %	529219433
16055	NC_021984	TGA	2	6	1007618	1007623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219433
16056	NC_021984	CGAA	2	8	1007633	1007640	50 %	0 %	25 %	25 %	529219433
16057	NC_021984	GCG	2	6	1007674	1007679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219433
16058	NC_021984	CTG	2	6	1007724	1007729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219433
16059	NC_021984	GCT	2	6	1007767	1007772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219433
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16061	NC_021984	CG	3	6	1007829	1007834	0 %	0 %	50 %	50 %	529219433
16062	NC_021984	TAA	2	6	1007861	1007866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219433
16063	NC_021984	CTG	2	6	1007976	1007981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219434
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16065	NC_021984	GGCCG	2	10	1008021	1008030	0 %	0 %	60 %	40 %	529219434
16066	NC_021984	CG	3	6	1008087	1008092	0 %	0 %	50 %	50 %	529219434
16067	NC_021984	TCG	2	6	1008109	1008114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219434
16068	NC_021984	GCTTC	2	10	1008128	1008137	0 %	40 %	20 %	40 %	529219434
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16071	NC_021984	CTT	2	6	1008455	1008460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219434
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16082	NC_021984	GC	3	6	1008853	1008858	0 %	0 %	50 %	50 %	529219435
16083	NC_021984	CAACG	2	10	1008879	1008888	40 %	0 %	20 %	40 %	529219435
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16100	NC_021984	CGG	2	6	1009813	1009818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219436
16101	NC_021984	TCG	2	6	1009884	1009889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219436
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16103	NC_021984	TACG	2	8	1010002	1010009	25 %	25 %	25 %	25 %	529219436
16104	NC_021984	ATC	2	6	1010117	1010122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219436
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16106	NC_021984	CAGC	2	8	1010163	1010170	25 %	0 %	25 %	50 %	529219436
16107	NC_021984	GC	3	6	1010332	1010337	0 %	0 %	50 %	50 %	529219436
16108	NC_021984	GGCCG	2	10	1010369	1010378	0 %	0 %	60 %	40 %	529219436
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16111	NC_021984	GTG	2	6	1010519	1010524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219436
16112	NC_021984	TGA	2	6	1010535	1010540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219436
16113	NC_021984	GGC	2	6	1010541	1010546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219436
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16116	NC_021984	GCG	3	9	1010601	1010609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219436
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16118	NC_021984	ATA	3	9	1010628	1010636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219436
16119	NC_021984	TCA	2	6	1010647	1010652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219436
16120	NC_021984	CGA	2	6	1010770	1010775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219437
16121	NC_021984	AAAT	2	8	1010834	1010841	75 %	25 %	0 %	0 %	529219437
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16123	NC_021984	GCA	2	6	1010930	1010935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219437
16124	NC_021984	CAT	2	6	1010942	1010947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219437
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16126	NC_021984	CAT	2	6	1011015	1011020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219437
16127	NC_021984	T	6	6	1011599	1011604	0 %	100 %	0 %	0 %	529219438
16128	NC_021984	T	7	7	1011606	1011612	0 %	100 %	0 %	0 %	529219438
16129	NC_021984	A	6	6	1011640	1011645	100 %	0 %	0 %	0 %	529219438
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16133	NC_021984	CGG	2	6	1011806	1011811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219438
16134	NC_021984	GGAG	2	8	1011828	1011835	25 %	0 %	75 %	0 %	529219438
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16200	NC_021984	GTA	2	6	1015606	1015611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219442
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16215	NC_021984	TGA	2	6	1016352	1016357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219443
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16219	NC_021984	GTC	2	6	1016657	1016662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219443
16220	NC_021984	T	6	6	1016709	1016714	0 %	100 %	0 %	0 %	529219443
16221	NC_021984	GCG	2	6	1016715	1016720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219443
16222	NC_021984	TC	3	6	1016735	1016740	0 %	50 %	0 %	50 %	529219443
16223	NC_021984	CG	3	6	1016781	1016786	0 %	0 %	50 %	50 %	529219443
16224	NC_021984	AGC	2	6	1016820	1016825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219443
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16228	NC_021984	A	8	8	1017196	1017203	100 %	0 %	0 %	0 %	529219444
16229	NC_021984	CGC	2	6	1017238	1017243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219444
16230	NC_021984	GCG	2	6	1017276	1017281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219444
16231	NC_021984	TGGC	2	8	1017381	1017388	0 %	25 %	50 %	25 %	529219444
16232	NC_021984	GCG	2	6	1017391	1017396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219444
16233	NC_021984	GC	3	6	1017399	1017404	0 %	0 %	50 %	50 %	529219444
16234	NC_021984	CAT	2	6	1017459	1017464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219444
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16352	NC_021984	CACCGT	2	12	1023439	1023450	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	529219452
16353	NC_021984	CATGA	2	10	1023473	1023482	40 %	20 %	20 %	20 %	529219452
16354	NC_021984	AATG	2	8	1023509	1023516	50 %	25 %	25 %	0 %	529219452
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16466	NC_021984	CG	3	6	1030557	1030562	0 %	0 %	50 %	50 %	529219458
16467	NC_021984	TGA	2	6	1030600	1030605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219458
16468	NC_021984	GCG	2	6	1030665	1030670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219458
16469	NC_021984	GGT	2	6	1030689	1030694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219458
16470	NC_021984	GGC	2	6	1030701	1030706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219458
16471	NC_021984	CAG	2	6	1030722	1030727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219458
16472	NC_021984	CGCA	2	8	1030736	1030743	25 %	0 %	25 %	50 %	529219458
16473	NC_021984	GAAAAA	2	12	1030899	1030910	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	529219458
16474	NC_021984	GCC	2	6	1030917	1030922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219458
16475	NC_021984	A	6	6	1030946	1030951	100 %	0 %	0 %	0 %	529219458
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16481	NC_021984	A	6	6	1035331	1035336	100 %	0 %	0 %	0 %	529219459
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16491	NC_021984	ATT	2	6	1035762	1035767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219459
16492	NC_021984	GCG	2	6	1035785	1035790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219459
16493	NC_021984	CGA	2	6	1035951	1035956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219459
16494	NC_021984	CGC	2	6	1036029	1036034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219459
16495	NC_021984	TGC	2	6	1036121	1036126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219459
16496	NC_021984	GAAGG	2	10	1036368	1036377	40 %	0 %	60 %	0 %	529222117
16497	NC_021984	ACG	2	6	1036388	1036393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222117
16498	NC_021984	GTG	2	6	1036437	1036442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222117
16499	NC_021984	AGG	2	6	1036558	1036563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529222117
16500	NC_021984	AGT	2	6	1036674	1036679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222117

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