MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021984	CG	4	8	941416	941423	0 %	0 %	50 %	50 %	529219404
15002	NC_021984	GCC	2	6	941573	941578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219404
15003	NC_021984	GGT	2	6	941617	941622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219404
15004	NC_021984	ATA	2	6	941658	941663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219404
15005	NC_021984	CGT	2	6	941671	941676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219404
15006	NC_021984	GCG	2	6	941677	941682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219404
15007	NC_021984	GCGATT	2	12	941684	941695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529219404
15008	NC_021984	CG	3	6	941709	941714	0 %	0 %	50 %	50 %	529219404
15009	NC_021984	TGT	2	6	941727	941732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219404
15010	NC_021984	GGTG	2	8	941737	941744	0 %	25 %	75 %	0 %	529219404
15011	NC_021984	CTTT	2	8	941818	941825	0 %	75 %	0 %	25 %	529219404
15012	NC_021984	GGC	2	6	941842	941847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219404
15013	NC_021984	CGG	2	6	941898	941903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219404
15014	NC_021984	TCGCGC	2	12	941919	941930	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	529219404
15015	NC_021984	GAAG	2	8	941975	941982	50 %	0 %	50 %	0 %	529219404
15016	NC_021984	CGGCG	2	10	941983	941992	0 %	0 %	60 %	40 %	529219404
15017	NC_021984	GGC	2	6	942049	942054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219404
15018	NC_021984	AACGCA	2	12	942080	942091	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	529219404
15019	NC_021984	CGT	2	6	942178	942183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219405
15020	NC_021984	T	7	7	942192	942198	0 %	100 %	0 %	0 %	529219405
15021	NC_021984	TTG	2	6	942211	942216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219405
15022	NC_021984	GCC	2	6	942252	942257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219405
15023	NC_021984	GTC	2	6	942266	942271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219405
15024	NC_021984	GCC	2	6	942334	942339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219405
15025	NC_021984	TGG	2	6	942419	942424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219405
15026	NC_021984	GCA	2	6	942429	942434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219405
15027	NC_021984	TAT	3	9	942496	942504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219405
15028	NC_021984	TATTGG	2	12	942537	942548	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	529219405
15029	NC_021984	CGC	2	6	942566	942571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219405
15030	NC_021984	AT	4	8	942718	942725	50 %	50 %	0 %	0 %	529219405
15031	NC_021984	CCAT	2	8	942740	942747	25 %	25 %	0 %	50 %	529219405
15032	NC_021984	GTCA	2	8	942781	942788	25 %	25 %	25 %	25 %	529219405
15033	NC_021984	A	6	6	942964	942969	100 %	0 %	0 %	0 %	529219405
15034	NC_021984	TGC	2	6	942992	942997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219405
15035	NC_021984	GGCCT	2	10	943091	943100	0 %	20 %	40 %	40 %	529219405
15036	NC_021984	TGT	2	6	945785	945790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529222077
15037	NC_021984	TAA	2	6	945809	945814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529222077
15038	NC_021984	CAT	2	6	945856	945861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222077
15039	NC_021984	TTG	2	6	945991	945996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529222077
15040	NC_021984	TGA	2	6	946228	946233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219406
15041	NC_021984	TTC	2	6	946262	946267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219406
15042	NC_021984	CGAG	2	8	946282	946289	25 %	0 %	50 %	25 %	529219406
15043	NC_021984	GGA	2	6	946678	946683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219407
15044	NC_021984	TGTT	2	8	946779	946786	0 %	75 %	25 %	0 %	529219407
15045	NC_021984	CTGT	2	8	946796	946803	0 %	50 %	25 %	25 %	529219407
15046	NC_021984	TCT	2	6	946915	946920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219407
15047	NC_021984	GC	3	6	946953	946958	0 %	0 %	50 %	50 %	529219407
15048	NC_021984	GGCTC	2	10	947012	947021	0 %	20 %	40 %	40 %	529219407
15049	NC_021984	CG	3	6	947152	947157	0 %	0 %	50 %	50 %	529219407
15050	NC_021984	CGG	2	6	947329	947334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219407
15051	NC_021984	GAA	2	6	947392	947397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219407
15052	NC_021984	GAT	2	6	947606	947611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219407
15053	NC_021984	GCC	2	6	947632	947637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219407
15054	NC_021984	ACG	2	6	947682	947687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219407
15055	NC_021984	GTC	2	6	947750	947755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219407
15056	NC_021984	GAT	2	6	947762	947767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219407
15057	NC_021984	CG	3	6	947819	947824	0 %	0 %	50 %	50 %	529219407
15058	NC_021984	CGA	2	6	947847	947852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219407
15059	NC_021984	GCT	2	6	947893	947898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219407
15060	NC_021984	GGCA	2	8	947943	947950	25 %	0 %	50 %	25 %	529219407
15061	NC_021984	TAC	2	6	948012	948017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219407
15062	NC_021984	TCA	2	6	948213	948218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222078
15063	NC_021984	GTG	2	6	948609	948614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222079
15064	NC_021984	AGC	2	6	948626	948631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222079
15065	NC_021984	GGC	2	6	948674	948679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222079
15066	NC_021984	CAG	2	6	948691	948696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222079
15067	NC_021984	GTC	4	12	948700	948711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222079
15068	NC_021984	CTC	2	6	948721	948726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529222079
15069	NC_021984	CGA	2	6	948848	948853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222080
15070	NC_021984	GCAG	2	8	948857	948864	25 %	0 %	50 %	25 %	529222080
15071	NC_021984	GCG	2	6	948880	948885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222080
15072	NC_021984	GATT	2	8	948924	948931	25 %	50 %	25 %	0 %	529222080
15073	NC_021984	CCCG	2	8	948935	948942	0 %	0 %	25 %	75 %	529222080
15074	NC_021984	T	6	6	948999	949004	0 %	100 %	0 %	0 %	529222081
15075	NC_021984	CTG	2	6	949044	949049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222081
15076	NC_021984	GCT	2	6	949103	949108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222081
15077	NC_021984	GTC	2	6	949119	949124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222081
15078	NC_021984	T	6	6	949155	949160	0 %	100 %	0 %	0 %	529222081
15079	NC_021984	TAT	2	6	949235	949240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222081
15080	NC_021984	ATC	2	6	949258	949263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222081
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15082	NC_021984	CCT	2	6	949316	949321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529222081
15083	NC_021984	GA	3	6	949326	949331	50 %	0 %	50 %	0 %	529222081
15084	NC_021984	TCA	2	6	949426	949431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222081
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15086	NC_021984	CGG	2	6	949577	949582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222081
15087	NC_021984	TTC	2	6	949636	949641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222081
15088	NC_021984	GTC	2	6	949674	949679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222081
15089	NC_021984	GC	3	6	949697	949702	0 %	0 %	50 %	50 %	529222081
15090	NC_021984	TCA	2	6	949703	949708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222081
15091	NC_021984	TCA	2	6	949727	949732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222081
15092	NC_021984	CAT	2	6	949739	949744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222081
15093	NC_021984	GCTT	2	8	949748	949755	0 %	50 %	25 %	25 %	529222081
15094	NC_021984	ATCA	2	8	949761	949768	50 %	25 %	0 %	25 %	529222081
15095	NC_021984	GCG	2	6	949784	949789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222081
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15100	NC_021984	AAT	2	6	950136	950141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529222081
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15102	NC_021984	AAC	2	6	950169	950174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529222081
15103	NC_021984	GCG	2	6	950206	950211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222081
15104	NC_021984	TAAA	2	8	950253	950260	75 %	25 %	0 %	0 %	529222081
15105	NC_021984	AAG	2	6	950286	950291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529222081
15106	NC_021984	TAT	2	6	950414	950419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222081
15107	NC_021984	CAT	2	6	950462	950467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222081
15108	NC_021984	TG	3	6	950473	950478	0 %	50 %	50 %	0 %	529222081
15109	NC_021984	CTGC	2	8	950555	950562	0 %	25 %	25 %	50 %	529222081
15110	NC_021984	GTG	2	6	950572	950577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222081
15111	NC_021984	A	6	6	950672	950677	100 %	0 %	0 %	0 %	529222081
15112	NC_021984	GGC	2	6	950682	950687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222081
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15117	NC_021984	AATA	2	8	951060	951067	75 %	25 %	0 %	0 %	529219408
15118	NC_021984	GA	3	6	951069	951074	50 %	0 %	50 %	0 %	529219408
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15120	NC_021984	CGT	2	6	951106	951111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219408
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15485	NC_021984	TCT	2	6	971790	971795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222100
15486	NC_021984	T	6	6	971815	971820	0 %	100 %	0 %	0 %	529222100
15487	NC_021984	ATC	2	6	971912	971917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222100
15488	NC_021984	T	6	6	971959	971964	0 %	100 %	0 %	0 %	529222100
15489	NC_021984	TCA	2	6	971969	971974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222100
15490	NC_021984	GTT	2	6	972025	972030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529222100
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15493	NC_021984	AATAT	2	10	972110	972119	60 %	40 %	0 %	0 %	529222100
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15495	NC_021984	ATC	2	6	972169	972174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222100
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15498	NC_021984	AAAG	2	8	973014	973021	75 %	0 %	25 %	0 %	529222101
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