MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

< Previous12...2425262728293031323334...150151Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_021984	GTT	2	6	884400	884405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219357
14003	NC_021984	TTG	2	6	884453	884458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219357
14004	NC_021984	GC	3	6	884502	884507	0 %	0 %	50 %	50 %	529219357
14005	NC_021984	CAC	2	6	884530	884535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219357
14006	NC_021984	CCG	2	6	884550	884555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219357
14007	NC_021984	TCT	2	6	884606	884611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219357
14008	NC_021984	ACGC	2	8	884617	884624	25 %	0 %	25 %	50 %	529219357
14009	NC_021984	CGC	3	9	884622	884630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219357
14010	NC_021984	GCA	2	6	884727	884732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219357
14011	NC_021984	GCG	2	6	884747	884752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219357
14012	NC_021984	TGG	2	6	884813	884818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219357
14013	NC_021984	CAC	2	6	884824	884829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219357
14014	NC_021984	AAT	2	6	884857	884862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219357
14015	NC_021984	CGC	2	6	884901	884906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219358
14016	NC_021984	GAA	2	6	884937	884942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219358
14017	NC_021984	CCG	2	6	884957	884962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219358
14018	NC_021984	GCGGCA	2	12	885113	885124	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529219358
14019	NC_021984	CAG	2	6	885168	885173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219358
14020	NC_021984	CGC	2	6	885179	885184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219358
14021	NC_021984	CGA	2	6	885199	885204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219358
14022	NC_021984	CAG	2	6	885207	885212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219358
14023	NC_021984	TTAA	2	8	885256	885263	50 %	50 %	0 %	0 %	529219358
14024	NC_021984	ACC	2	6	885370	885375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219358
14025	NC_021984	GC	3	6	885390	885395	0 %	0 %	50 %	50 %	529219358
14026	NC_021984	CGG	2	6	885398	885403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219358
14027	NC_021984	GAC	2	6	885444	885449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219358
14028	NC_021984	TCA	2	6	885452	885457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219358
14029	NC_021984	AAAC	2	8	885533	885540	75 %	0 %	0 %	25 %	529219359
14030	NC_021984	GGT	2	6	885550	885555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219359
14031	NC_021984	AG	3	6	885605	885610	50 %	0 %	50 %	0 %	529219359
14032	NC_021984	ATC	2	6	885630	885635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219359
14033	NC_021984	GGTA	2	8	885661	885668	25 %	25 %	50 %	0 %	529219359
14034	NC_021984	GAC	2	6	885694	885699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219359
14035	NC_021984	GC	3	6	885712	885717	0 %	0 %	50 %	50 %	529219359
14036	NC_021984	GC	3	6	885719	885724	0 %	0 %	50 %	50 %	529219359
14037	NC_021984	CATC	2	8	885733	885740	25 %	25 %	0 %	50 %	529219359
14038	NC_021984	GTA	2	6	885742	885747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219359
14039	NC_021984	CCAGT	2	10	885811	885820	20 %	20 %	20 %	40 %	529219359
14040	NC_021984	TCT	2	6	885822	885827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219359
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14042	NC_021984	TCG	2	6	885840	885845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219359
14043	NC_021984	GCC	2	6	885884	885889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219359
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14045	NC_021984	AAG	2	6	885921	885926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219359
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14050	NC_021984	TCA	2	6	886257	886262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219359
14051	NC_021984	CAT	2	6	886292	886297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219359
14052	NC_021984	ATC	2	6	886365	886370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219359
14053	NC_021984	CGG	2	6	886466	886471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219359
14054	NC_021984	GCAG	2	8	886587	886594	25 %	0 %	50 %	25 %	529219360
14055	NC_021984	GTT	2	6	886608	886613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219360
14056	NC_021984	GCT	2	6	886663	886668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219360
14057	NC_021984	GCG	2	6	886829	886834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219360
14058	NC_021984	CAG	2	6	886882	886887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219360
14059	NC_021984	CGCAG	2	10	886920	886929	20 %	0 %	40 %	40 %	529219360
14060	NC_021984	CCAG	2	8	886989	886996	25 %	0 %	25 %	50 %	529219360
14061	NC_021984	TCG	2	6	887036	887041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219360
14062	NC_021984	CGA	2	6	887043	887048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219360
14063	NC_021984	CAG	2	6	887074	887079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219360
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14065	NC_021984	CCGCG	2	10	887337	887346	0 %	0 %	40 %	60 %	529219360
14066	NC_021984	TGGC	2	8	887410	887417	0 %	25 %	50 %	25 %	529219360
14067	NC_021984	TTG	2	6	887440	887445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219360
14068	NC_021984	ATTC	2	8	887475	887482	25 %	50 %	0 %	25 %	529219360
14069	NC_021984	CGG	2	6	887516	887521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219360
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14071	NC_021984	GCC	3	9	887662	887670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219361
14072	NC_021984	TGGT	2	8	887800	887807	0 %	50 %	50 %	0 %	529219361
14073	NC_021984	CGG	2	6	887825	887830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219361
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14076	NC_021984	GAC	2	6	887981	887986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219361
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14078	NC_021984	CG	4	8	888015	888022	0 %	0 %	50 %	50 %	529219361
14079	NC_021984	CAG	2	6	888087	888092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219361
14080	NC_021984	CGA	2	6	888143	888148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219361
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14082	NC_021984	GC	3	6	888338	888343	0 %	0 %	50 %	50 %	529219361
14083	NC_021984	CA	3	6	888371	888376	50 %	0 %	0 %	50 %	529219361
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14086	NC_021984	GAGCC	2	10	888491	888500	20 %	0 %	40 %	40 %	529219361
14087	NC_021984	CTG	2	6	888543	888548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219361
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14089	NC_021984	CTGG	2	8	888560	888567	0 %	25 %	50 %	25 %	529219361
14090	NC_021984	TCG	2	6	888652	888657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219361
14091	NC_021984	CGG	3	9	888671	888679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219361
14092	NC_021984	CG	3	6	888761	888766	0 %	0 %	50 %	50 %	529219361
14093	NC_021984	CAG	2	6	888837	888842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219361
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14101	NC_021984	TGC	2	6	891310	891315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219362
14102	NC_021984	GAAC	2	8	891368	891375	50 %	0 %	25 %	25 %	529219362
14103	NC_021984	GAT	2	6	891390	891395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219362
14104	NC_021984	TCT	2	6	891410	891415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219362
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14106	NC_021984	ATT	2	6	891525	891530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219362
14107	NC_021984	GC	4	8	891542	891549	0 %	0 %	50 %	50 %	529219362
14108	NC_021984	CGC	3	9	891547	891555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219362
14109	NC_021984	GGCTTT	2	12	891564	891575	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	529219362
14110	NC_021984	CAT	2	6	891618	891623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219362
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14113	NC_021984	GCG	2	6	891847	891852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219362
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14120	NC_021984	TCT	2	6	892593	892598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222069
14121	NC_021984	GAT	2	6	892622	892627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222069
14122	NC_021984	ATTT	2	8	892647	892654	25 %	75 %	0 %	0 %	529222069
14123	NC_021984	TGG	2	6	892702	892707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222069
14124	NC_021984	GGT	2	6	892781	892786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222069
14125	NC_021984	TGG	2	6	892810	892815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222069
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14128	NC_021984	GAT	2	6	892898	892903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222069
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14133	NC_021984	TCT	2	6	893164	893169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222069
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14150	NC_021984	CAT	2	6	894107	894112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219363
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14231	NC_021984	CGGG	2	8	902689	902696	0 %	0 %	75 %	25 %	529219365
14232	NC_021984	GAT	2	6	902714	902719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219365
14233	NC_021984	A	6	6	902733	902738	100 %	0 %	0 %	0 %	529219365
14234	NC_021984	ACA	2	6	902792	902797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219365
14235	NC_021984	ATT	2	6	902835	902840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219365
14236	NC_021984	GCA	2	6	902903	902908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219365
14237	NC_021984	TTG	2	6	902922	902927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219365
14238	NC_021984	AC	3	6	902966	902971	50 %	0 %	0 %	50 %	529219365
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14240	NC_021984	CGT	2	6	903032	903037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219365
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14242	NC_021984	AGCG	2	8	903150	903157	25 %	0 %	50 %	25 %	529219365
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14354	NC_021984	CGA	2	6	909153	909158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219373
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14480	NC_021984	CGAT	2	8	913915	913922	25 %	25 %	25 %	25 %	529219376
14481	NC_021984	GCT	2	6	913950	913955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219376
14482	NC_021984	GCT	2	6	913979	913984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219376
14483	NC_021984	A	6	6	914015	914020	100 %	0 %	0 %	0 %	529219376
14484	NC_021984	TGC	2	6	914023	914028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219376
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14487	NC_021984	GCC	2	6	914304	914309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219377
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14491	NC_021984	GCT	2	6	914536	914541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219378
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