MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021984	ACA	2	6	857594	857599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219340
13502	NC_021984	A	6	6	857622	857627	100 %	0 %	0 %	0 %	529219340
13503	NC_021984	TGG	2	6	857633	857638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219340
13504	NC_021984	ATA	2	6	857804	857809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219340
13505	NC_021984	CGT	2	6	857850	857855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219340
13506	NC_021984	TTAAA	2	10	857888	857897	60 %	40 %	0 %	0 %	529219340
13507	NC_021984	TCC	2	6	857953	857958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529219340
13508	NC_021984	GCA	2	6	858033	858038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219340
13509	NC_021984	GCT	2	6	858153	858158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219340
13510	NC_021984	ATG	2	6	858460	858465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219341
13511	NC_021984	TGCC	2	8	858512	858519	0 %	25 %	25 %	50 %	529219341
13512	NC_021984	TCG	2	6	858551	858556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219341
13513	NC_021984	CTT	2	6	858685	858690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219341
13514	NC_021984	AGC	2	6	858692	858697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219341
13515	NC_021984	ATCT	2	8	858729	858736	25 %	50 %	0 %	25 %	529219341
13516	NC_021984	GC	3	6	858806	858811	0 %	0 %	50 %	50 %	529219341
13517	NC_021984	ATT	2	6	858856	858861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219341
13518	NC_021984	GAT	2	6	858865	858870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219341
13519	NC_021984	CCG	2	6	858875	858880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219341
13520	NC_021984	GCG	2	6	858901	858906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219341
13521	NC_021984	TGG	2	6	858908	858913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219341
13522	NC_021984	GAACC	2	10	859139	859148	40 %	0 %	20 %	40 %	529219341
13523	NC_021984	A	6	6	859198	859203	100 %	0 %	0 %	0 %	529219341
13524	NC_021984	A	7	7	859252	859258	100 %	0 %	0 %	0 %	529219341
13525	NC_021984	AAG	2	6	859304	859309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219341
13526	NC_021984	AGC	2	6	859334	859339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219341
13527	NC_021984	TTA	2	6	859740	859745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219342
13528	NC_021984	TGT	2	6	859774	859779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219342
13529	NC_021984	ATT	2	6	859787	859792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219342
13530	NC_021984	CAG	2	6	860007	860012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219342
13531	NC_021984	TCG	2	6	860031	860036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219342
13532	NC_021984	CTT	2	6	860048	860053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219342
13533	NC_021984	A	8	8	860093	860100	100 %	0 %	0 %	0 %	529219342
13534	NC_021984	TCA	2	6	860113	860118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219342
13535	NC_021984	TGA	2	6	860128	860133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219342
13536	NC_021984	TGA	2	6	860158	860163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219342
13537	NC_021984	AAC	2	6	860200	860205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219342
13538	NC_021984	GGC	2	6	860271	860276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219342
13539	NC_021984	TAA	2	6	860314	860319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219342
13540	NC_021984	GGAA	2	8	860377	860384	50 %	0 %	50 %	0 %	529219342
13541	NC_021984	AGA	2	6	860437	860442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219342
13542	NC_021984	CG	3	6	860450	860455	0 %	0 %	50 %	50 %	529219342
13543	NC_021984	AAGGC	2	10	860475	860484	40 %	0 %	40 %	20 %	529219342
13544	NC_021984	TGG	2	6	860503	860508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219342
13545	NC_021984	GAA	2	6	860518	860523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219342
13546	NC_021984	CTG	2	6	860555	860560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219342
13547	NC_021984	CTT	2	6	860583	860588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219342
13548	NC_021984	TCG	2	6	860632	860637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219342
13549	NC_021984	AGAAC	2	10	860788	860797	60 %	0 %	20 %	20 %	529219342
13550	NC_021984	GCA	3	9	860995	861003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219343
13551	NC_021984	CCA	2	6	861059	861064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219343
13552	NC_021984	AGC	2	6	861084	861089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219343
13553	NC_021984	ATT	2	6	861116	861121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219343
13554	NC_021984	CGC	2	6	861182	861187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219343
13555	NC_021984	ATCTT	2	10	861251	861260	20 %	60 %	0 %	20 %	529219343
13556	NC_021984	AAT	2	6	861292	861297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219343
13557	NC_021984	TCA	2	6	861347	861352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219343
13558	NC_021984	GC	3	6	861514	861519	0 %	0 %	50 %	50 %	529219343
13559	NC_021984	CTGA	2	8	861541	861548	25 %	25 %	25 %	25 %	529219343
13560	NC_021984	CTGA	2	8	861682	861689	25 %	25 %	25 %	25 %	529219343
13561	NC_021984	ACG	2	6	861697	861702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219343
13562	NC_021984	GAAATG	2	12	861753	861764	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	529219344
13563	NC_021984	ATT	2	6	861780	861785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219344
13564	NC_021984	G	6	6	861791	861796	0 %	0 %	100 %	0 %	529219344
13565	NC_021984	GTAA	2	8	861831	861838	50 %	25 %	25 %	0 %	529219344
13566	NC_021984	GAT	2	6	861866	861871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219344
13567	NC_021984	GGCA	2	8	861899	861906	25 %	0 %	50 %	25 %	529219344
13568	NC_021984	ATC	2	6	861921	861926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219344
13569	NC_021984	CGC	2	6	861943	861948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219344
13570	NC_021984	CAA	2	6	861954	861959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219344
13571	NC_021984	CTG	2	6	861960	861965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219344
13572	NC_021984	TAT	2	6	862040	862045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219344
13573	NC_021984	ATG	2	6	862066	862071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219344
13574	NC_021984	TCT	2	6	862099	862104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219344
13575	NC_021984	TAA	2	6	862142	862147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219344
13576	NC_021984	GTG	2	6	862153	862158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219344
13577	NC_021984	GGA	2	6	862241	862246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219344
13578	NC_021984	ATA	2	6	862300	862305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219344
13579	NC_021984	GTG	2	6	862308	862313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219344
13580	NC_021984	TGTC	2	8	862399	862406	0 %	50 %	25 %	25 %	529219344
13581	NC_021984	ATG	2	6	862410	862415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219344
13582	NC_021984	CTGG	2	8	862430	862437	0 %	25 %	50 %	25 %	529219344
13583	NC_021984	GAA	2	6	862491	862496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219344
13584	NC_021984	A	6	6	862592	862597	100 %	0 %	0 %	0 %	529219344
13585	NC_021984	TGA	2	6	862642	862647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222063
13586	NC_021984	T	6	6	862719	862724	0 %	100 %	0 %	0 %	529222063
13587	NC_021984	CAG	2	6	862737	862742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222063
13588	NC_021984	AG	3	6	862834	862839	50 %	0 %	50 %	0 %	529222063
13589	NC_021984	AGTT	2	8	862858	862865	25 %	50 %	25 %	0 %	529222063
13590	NC_021984	ATCT	2	8	862948	862955	25 %	50 %	0 %	25 %	529222063
13591	NC_021984	ATT	2	6	863050	863055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222063
13592	NC_021984	ATG	2	6	863089	863094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222063
13593	NC_021984	TGC	2	6	863150	863155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222063
13594	NC_021984	CTGG	2	8	864203	864210	0 %	25 %	50 %	25 %	529219345
13595	NC_021984	GAA	2	6	864233	864238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219345
13596	NC_021984	AAAACC	2	12	864247	864258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219345
13597	NC_021984	TGG	2	6	864271	864276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219345
13598	NC_021984	TAT	2	6	864334	864339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219345
13599	NC_021984	CTG	2	6	864340	864345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219345
13600	NC_021984	ACT	2	6	864384	864389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219345
13601	NC_021984	TTC	2	6	864493	864498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219345
13602	NC_021984	TGG	2	6	864505	864510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219345
13603	NC_021984	CCA	2	6	864656	864661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219345
13604	NC_021984	TGG	2	6	864745	864750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219345
13605	NC_021984	CAA	2	6	864798	864803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219345
13606	NC_021984	AGTA	2	8	864957	864964	50 %	25 %	25 %	0 %	529219345
13607	NC_021984	GAT	2	6	864965	864970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219346
13608	NC_021984	CTGA	2	8	865050	865057	25 %	25 %	25 %	25 %	529219346
13609	NC_021984	CAGCC	2	10	865228	865237	20 %	0 %	20 %	60 %	529219346
13610	NC_021984	CAA	2	6	865279	865284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219346
13611	NC_021984	GAAC	2	8	865406	865413	50 %	0 %	25 %	25 %	529219346
13612	NC_021984	TTC	2	6	865488	865493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219346
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13614	NC_021984	TTA	2	6	865627	865632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219346
13615	NC_021984	GCA	2	6	865661	865666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219346
13616	NC_021984	TGG	2	6	865696	865701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219346
13617	NC_021984	TA	3	6	865711	865716	50 %	50 %	0 %	0 %	529219346
13618	NC_021984	TGA	2	6	865760	865765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219346
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13620	NC_021984	TGA	2	6	865817	865822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219346
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13983	NC_021984	TCA	2	6	883609	883614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219356
13984	NC_021984	CGCGC	2	10	883634	883643	0 %	0 %	40 %	60 %	529219356
13985	NC_021984	TGT	2	6	883644	883649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219356
13986	NC_021984	CGT	2	6	883741	883746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219356
13987	NC_021984	CGA	2	6	883765	883770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219356
13988	NC_021984	GAAA	2	8	883862	883869	75 %	0 %	25 %	0 %	529219356
13989	NC_021984	GGC	2	6	883877	883882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219356
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