MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021984	TGG	3	9	826172	826180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222061
13002	NC_021984	CCCA	2	8	826219	826226	25 %	0 %	0 %	75 %	529222061
13003	NC_021984	GCC	2	6	826330	826335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222061
13004	NC_021984	GGC	2	6	826446	826451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222061
13005	NC_021984	GC	3	6	826471	826476	0 %	0 %	50 %	50 %	529222061
13006	NC_021984	GCG	2	6	826584	826589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222061
13007	NC_021984	CGC	2	6	826644	826649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222061
13008	NC_021984	GCC	2	6	826650	826655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222061
13009	NC_021984	GGCA	2	8	826739	826746	25 %	0 %	50 %	25 %	529222061
13010	NC_021984	GAT	2	6	826765	826770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222061
13011	NC_021984	TTAA	2	8	826774	826781	50 %	50 %	0 %	0 %	529222061
13012	NC_021984	TAA	2	6	826924	826929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529222061
13013	NC_021984	CCGGC	2	10	827019	827028	0 %	0 %	40 %	60 %	529219321
13014	NC_021984	GAT	2	6	827065	827070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219321
13015	NC_021984	CAG	2	6	827128	827133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219321
13016	NC_021984	CGA	2	6	827142	827147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219321
13017	NC_021984	GCG	2	6	827243	827248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219321
13018	NC_021984	TAA	2	6	827293	827298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219321
13019	NC_021984	GGC	2	6	827303	827308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219321
13020	NC_021984	GTT	2	6	827325	827330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219321
13021	NC_021984	CAG	2	6	827332	827337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219321
13022	NC_021984	TCA	2	6	827339	827344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219321
13023	NC_021984	CGG	2	6	827370	827375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219321
13024	NC_021984	CGG	2	6	827412	827417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219321
13025	NC_021984	CGC	2	6	827419	827424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219321
13026	NC_021984	TGG	2	6	827426	827431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219321
13027	NC_021984	CG	3	6	827500	827505	0 %	0 %	50 %	50 %	529219321
13028	NC_021984	TGAG	2	8	827541	827548	25 %	25 %	50 %	0 %	529219321
13029	NC_021984	TGG	2	6	827562	827567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219321
13030	NC_021984	CGG	2	6	827581	827586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219321
13031	NC_021984	CAG	2	6	827608	827613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219321
13032	NC_021984	TTC	2	6	827641	827646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219321
13033	NC_021984	CAT	2	6	827653	827658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219321
13034	NC_021984	GAG	2	6	827666	827671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219321
13035	NC_021984	TGC	2	6	827681	827686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219321
13036	NC_021984	CCGAT	2	10	827813	827822	20 %	20 %	20 %	40 %	529219321
13037	NC_021984	GCA	2	6	827913	827918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219321
13038	NC_021984	AGA	2	6	827951	827956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219321
13039	NC_021984	CGG	2	6	828015	828020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219321
13040	NC_021984	ATG	2	6	828079	828084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219321
13041	NC_021984	AGCTG	2	10	828183	828192	20 %	20 %	40 %	20 %	529219321
13042	NC_021984	GAACC	2	10	828234	828243	40 %	0 %	20 %	40 %	529219321
13043	NC_021984	GCG	2	6	828270	828275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219321
13044	NC_021984	GCC	2	6	828301	828306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219321
13045	NC_021984	TCC	2	6	828371	828376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529219321
13046	NC_021984	AGC	2	6	828377	828382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219321
13047	NC_021984	TAA	2	6	828418	828423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219321
13048	NC_021984	GC	3	6	828426	828431	0 %	0 %	50 %	50 %	529219321
13049	NC_021984	GCC	2	6	828447	828452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219321
13050	NC_021984	TCT	2	6	828462	828467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219321
13051	NC_021984	AC	3	6	828511	828516	50 %	0 %	0 %	50 %	529219321
13052	NC_021984	CGT	2	6	828576	828581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219321
13053	NC_021984	AG	3	6	828669	828674	50 %	0 %	50 %	0 %	529219321
13054	NC_021984	GAC	2	6	828721	828726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219321
13055	NC_021984	GTA	2	6	828742	828747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219321
13056	NC_021984	CGC	2	6	828777	828782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219321
13057	NC_021984	ATT	2	6	828811	828816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219321
13058	NC_021984	TCA	2	6	829035	829040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219321
13059	NC_021984	GGCA	2	8	829045	829052	25 %	0 %	50 %	25 %	529219321
13060	NC_021984	A	6	6	829064	829069	100 %	0 %	0 %	0 %	529219321
13061	NC_021984	AGC	2	6	829115	829120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219321
13062	NC_021984	A	7	7	829166	829172	100 %	0 %	0 %	0 %	529219321
13063	NC_021984	ATAG	2	8	829338	829345	50 %	25 %	25 %	0 %	529219321
13064	NC_021984	GC	3	6	829383	829388	0 %	0 %	50 %	50 %	529219321
13065	NC_021984	ATA	2	6	829401	829406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219321
13066	NC_021984	GCA	2	6	829542	829547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219321
13067	NC_021984	GCC	2	6	829562	829567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219321
13068	NC_021984	ATA	2	6	829571	829576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219321
13069	NC_021984	GGC	2	6	829606	829611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219321
13070	NC_021984	TGC	2	6	829638	829643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219321
13071	NC_021984	CGAG	2	8	829644	829651	25 %	0 %	50 %	25 %	529219321
13072	NC_021984	CAT	2	6	829705	829710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219321
13073	NC_021984	GCG	2	6	829731	829736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219321
13074	NC_021984	ATA	2	6	829758	829763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219321
13075	NC_021984	TCA	2	6	830211	830216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219322
13076	NC_021984	TTA	2	6	830340	830345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219322
13077	NC_021984	GAA	2	6	830371	830376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219322
13078	NC_021984	ACTA	2	8	830386	830393	50 %	25 %	0 %	25 %	529219322
13079	NC_021984	GAA	2	6	830529	830534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219322
13080	NC_021984	ATT	2	6	830539	830544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219322
13081	NC_021984	CG	3	6	830571	830576	0 %	0 %	50 %	50 %	529219322
13082	NC_021984	CGC	2	6	830615	830620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219322
13083	NC_021984	CG	3	6	830771	830776	0 %	0 %	50 %	50 %	529219322
13084	NC_021984	CTGG	2	8	830958	830965	0 %	25 %	50 %	25 %	529219323
13085	NC_021984	CGG	2	6	831071	831076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219323
13086	NC_021984	GCG	2	6	831115	831120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219323
13087	NC_021984	TGA	2	6	831131	831136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219323
13088	NC_021984	GCTG	2	8	831195	831202	0 %	25 %	50 %	25 %	529219323
13089	NC_021984	GCC	2	6	831225	831230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219323
13090	NC_021984	GCTG	2	8	831242	831249	0 %	25 %	50 %	25 %	529219323
13091	NC_021984	CTC	2	6	831258	831263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529219323
13092	NC_021984	GC	3	6	831395	831400	0 %	0 %	50 %	50 %	529219323
13093	NC_021984	CCGGC	2	10	831419	831428	0 %	0 %	40 %	60 %	529219323
13094	NC_021984	CCG	2	6	831444	831449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219323
13095	NC_021984	CAG	2	6	831472	831477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219323
13096	NC_021984	GAC	2	6	831563	831568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219324
13097	NC_021984	TGA	2	6	831571	831576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219324
13098	NC_021984	TGG	2	6	831592	831597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219324
13099	NC_021984	TTG	2	6	831618	831623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219324
13100	NC_021984	GCA	2	6	831656	831661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219324
13101	NC_021984	CG	3	6	831668	831673	0 %	0 %	50 %	50 %	529219324
13102	NC_021984	CGCTG	2	10	831703	831712	0 %	20 %	40 %	40 %	529219324
13103	NC_021984	TCA	2	6	831836	831841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219324
13104	NC_021984	CGC	2	6	831889	831894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219324
13105	NC_021984	TGA	2	6	831914	831919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219324
13106	NC_021984	ATA	2	6	831940	831945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219324
13107	NC_021984	ATG	2	6	832036	832041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219324
13108	NC_021984	AGG	2	6	832291	832296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219324
13109	NC_021984	AGC	2	6	832381	832386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219324
13110	NC_021984	TCCAG	2	10	832405	832414	20 %	20 %	20 %	40 %	529219324
13111	NC_021984	CAT	2	6	832443	832448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219324
13112	NC_021984	GCG	2	6	832468	832473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219324
13113	NC_021984	TCGCG	2	10	832519	832528	0 %	20 %	40 %	40 %	529219324
13114	NC_021984	GCC	2	6	832538	832543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219324
13115	NC_021984	CGG	2	6	832567	832572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219324
13116	NC_021984	CGA	2	6	832630	832635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219324
13117	NC_021984	GA	3	6	832696	832701	50 %	0 %	50 %	0 %	529219324
13118	NC_021984	GGAAA	2	10	832891	832900	60 %	0 %	40 %	0 %	529219324
13119	NC_021984	GAAT	2	8	832936	832943	50 %	25 %	25 %	0 %	529219324
13120	NC_021984	GCA	2	6	832958	832963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219324
13121	NC_021984	GCG	3	9	832978	832986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219324
13122	NC_021984	GCA	2	6	832991	832996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219324
13123	NC_021984	CGA	2	6	833078	833083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219324
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13127	NC_021984	CTG	2	6	833388	833393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219324
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13132	NC_021984	GGCG	2	8	833766	833773	0 %	0 %	75 %	25 %	529219325
13133	NC_021984	GCAG	2	8	833912	833919	25 %	0 %	50 %	25 %	529219325
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13226	NC_021984	CGCGT	2	10	842045	842054	0 %	20 %	40 %	40 %	529219329
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13228	NC_021984	CTG	3	9	842112	842120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219330
13229	NC_021984	CTAC	2	8	842129	842136	25 %	25 %	0 %	50 %	529219330
13230	NC_021984	T	6	6	842192	842197	0 %	100 %	0 %	0 %	529219330
13231	NC_021984	TGC	2	6	842206	842211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219330
13232	NC_021984	A	7	7	842237	842243	100 %	0 %	0 %	0 %	529219330
13233	NC_021984	TGA	2	6	842245	842250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219330
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13235	NC_021984	T	8	8	842429	842436	0 %	100 %	0 %	0 %	529219330
13236	NC_021984	TGG	3	9	842440	842448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219330
13237	NC_021984	CGC	2	6	842465	842470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219330
13238	NC_021984	CGG	2	6	842498	842503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219330
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13240	NC_021984	TAT	2	6	842510	842515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219330
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13272	NC_021984	TATT	2	8	843999	844006	25 %	75 %	0 %	0 %	529219331
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13353	NC_021984	GC	3	6	850540	850545	0 %	0 %	50 %	50 %	529219335
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13363	NC_021984	GGA	2	6	850910	850915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219335
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