MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021984	CTG	3	9	699719	699727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222047
11002	NC_021984	CTG	2	6	699782	699787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222047
11003	NC_021984	GCT	2	6	699835	699840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222047
11004	NC_021984	ATC	2	6	699851	699856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222047
11005	NC_021984	CGG	2	6	699864	699869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222047
11006	NC_021984	GATGGC	2	12	699874	699885	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	529222047
11007	NC_021984	CTG	2	6	699886	699891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222047
11008	NC_021984	CT	3	6	699949	699954	0 %	50 %	0 %	50 %	529222047
11009	NC_021984	TGG	2	6	699969	699974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222047
11010	NC_021984	GCGG	2	8	700054	700061	0 %	0 %	75 %	25 %	529222047
11011	NC_021984	CGG	2	6	700135	700140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222047
11012	NC_021984	TGC	2	6	700185	700190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222047
11013	NC_021984	ACA	2	6	700209	700214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529222047
11014	NC_021984	TGA	2	6	700227	700232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222047
11015	NC_021984	GGC	2	6	700237	700242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222047
11016	NC_021984	CGG	2	6	700249	700254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222047
11017	NC_021984	CGC	2	6	700273	700278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222047
11018	NC_021984	GAG	2	6	700286	700291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529222047
11019	NC_021984	TAC	2	6	700322	700327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222047
11020	NC_021984	G	6	6	700355	700360	0 %	0 %	100 %	0 %	529222047
11021	NC_021984	CTG	2	6	700361	700366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222047
11022	NC_021984	GGGC	2	8	700375	700382	0 %	0 %	75 %	25 %	529222047
11023	NC_021984	TGG	2	6	700392	700397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222047
11024	NC_021984	CCG	3	9	700408	700416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222047
11025	NC_021984	TTA	2	6	700456	700461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219238
11026	NC_021984	CTG	2	6	700477	700482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219238
11027	NC_021984	GCT	2	6	700494	700499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219238
11028	NC_021984	CGA	2	6	700535	700540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219238
11029	NC_021984	TGC	2	6	700649	700654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219238
11030	NC_021984	GGT	2	6	700734	700739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219238
11031	NC_021984	GAC	2	6	700756	700761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219238
11032	NC_021984	GC	3	6	700862	700867	0 %	0 %	50 %	50 %	529219238
11033	NC_021984	GGC	2	6	700983	700988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219238
11034	NC_021984	CGC	2	6	702020	702025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219239
11035	NC_021984	TGTT	2	8	702114	702121	0 %	75 %	25 %	0 %	529219239
11036	NC_021984	GC	3	6	702193	702198	0 %	0 %	50 %	50 %	529219239
11037	NC_021984	CCG	2	6	702252	702257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219239
11038	NC_021984	CAG	2	6	702281	702286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219239
11039	NC_021984	AAT	3	9	702377	702385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219239
11040	NC_021984	CAG	2	6	702458	702463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219239
11041	NC_021984	GATC	2	8	702493	702500	25 %	25 %	25 %	25 %	529219239
11042	NC_021984	TCCAGT	2	12	702546	702557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	529219239
11043	NC_021984	CGC	2	6	702573	702578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219239
11044	NC_021984	GTC	2	6	702590	702595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219239
11045	NC_021984	TA	3	6	703381	703386	50 %	50 %	0 %	0 %	529222048
11046	NC_021984	TAT	2	6	703389	703394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222048
11047	NC_021984	T	8	8	703431	703438	0 %	100 %	0 %	0 %	529222048
11048	NC_021984	CAA	2	6	703447	703452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529222048
11049	NC_021984	TGC	2	6	703468	703473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222048
11050	NC_021984	AAG	2	6	703486	703491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529222048
11051	NC_021984	AGG	2	6	703492	703497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529222048
11052	NC_021984	TA	3	6	703509	703514	50 %	50 %	0 %	0 %	529222048
11053	NC_021984	T	6	6	703546	703551	0 %	100 %	0 %	0 %	529222048
11054	NC_021984	AAT	2	6	703568	703573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529222048
11055	NC_021984	AGG	2	6	703582	703587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529222048
11056	NC_021984	GAT	2	6	703607	703612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222048
11057	NC_021984	AATA	2	8	703643	703650	75 %	25 %	0 %	0 %	529222048
11058	NC_021984	TA	3	6	703733	703738	50 %	50 %	0 %	0 %	529222048
11059	NC_021984	GAT	2	6	703754	703759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222048
11060	NC_021984	AGC	2	6	704372	704377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222049
11061	NC_021984	CAGC	2	8	704412	704419	25 %	0 %	25 %	50 %	529222049
11062	NC_021984	GCG	2	6	704420	704425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222049
11063	NC_021984	CGG	2	6	704445	704450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222049
11064	NC_021984	GCC	2	6	704453	704458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222049
11065	NC_021984	TCA	2	6	704462	704467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222049
11066	NC_021984	CCAC	2	8	704481	704488	25 %	0 %	0 %	75 %	529222049
11067	NC_021984	A	6	6	704630	704635	100 %	0 %	0 %	0 %	529222050
11068	NC_021984	GGC	2	6	704683	704688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222050
11069	NC_021984	CGC	2	6	704781	704786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222050
11070	NC_021984	ACA	2	6	704810	704815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529222050
11071	NC_021984	TGGT	2	8	704850	704857	0 %	50 %	50 %	0 %	529222050
11072	NC_021984	CCA	2	6	704925	704930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529222050
11073	NC_021984	AGC	2	6	704955	704960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222050
11074	NC_021984	GCC	2	6	705047	705052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222050
11075	NC_021984	TTTG	2	8	705100	705107	0 %	75 %	25 %	0 %	529222051
11076	NC_021984	CGT	2	6	705110	705115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222051
11077	NC_021984	CG	3	6	705124	705129	0 %	0 %	50 %	50 %	529222051
11078	NC_021984	TGA	2	6	705160	705165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222051
11079	NC_021984	GAC	2	6	705175	705180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222051
11080	NC_021984	CTGG	2	8	705196	705203	0 %	25 %	50 %	25 %	529222051
11081	NC_021984	ATC	2	6	705272	705277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222051
11082	NC_021984	CTAT	2	8	705297	705304	25 %	50 %	0 %	25 %	529222051
11083	NC_021984	TGGT	2	8	705382	705389	0 %	50 %	50 %	0 %	529222051
11084	NC_021984	AAG	2	6	708601	708606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529222052
11085	NC_021984	ACC	2	6	708688	708693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529222052
11086	NC_021984	TCGG	2	8	711090	711097	0 %	25 %	50 %	25 %	529222053
11087	NC_021984	TCA	2	6	711153	711158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222053
11088	NC_021984	TGG	2	6	711476	711481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219240
11089	NC_021984	AG	3	6	711537	711542	50 %	0 %	50 %	0 %	529219240
11090	NC_021984	GAA	2	6	711580	711585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219240
11091	NC_021984	GCG	2	6	711607	711612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219240
11092	NC_021984	CGG	2	6	711657	711662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219240
11093	NC_021984	ATTGT	2	10	711664	711673	20 %	60 %	20 %	0 %	529219240
11094	NC_021984	CTG	2	6	711706	711711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219240
11095	NC_021984	AAC	2	6	711724	711729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219240
11096	NC_021984	ATCA	2	8	711787	711794	50 %	25 %	0 %	25 %	529219240
11097	NC_021984	CTT	2	6	711900	711905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219240
11098	NC_021984	GCAG	2	8	711966	711973	25 %	0 %	50 %	25 %	529219240
11099	NC_021984	GAT	2	6	711976	711981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219240
11100	NC_021984	CAG	2	6	712030	712035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219240
11101	NC_021984	AG	3	6	712167	712172	50 %	0 %	50 %	0 %	529219240
11102	NC_021984	TACGC	2	10	712191	712200	20 %	20 %	20 %	40 %	529219240
11103	NC_021984	GCG	3	9	712223	712231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219240
11104	NC_021984	GATGC	2	10	712249	712258	20 %	20 %	40 %	20 %	529219240
11105	NC_021984	CGC	2	6	712316	712321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219240
11106	NC_021984	GCC	2	6	712419	712424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222054
11107	NC_021984	TGA	2	6	712478	712483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222054
11108	NC_021984	TC	3	6	712512	712517	0 %	50 %	0 %	50 %	529222054
11109	NC_021984	GCG	2	6	712814	712819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222054
11110	NC_021984	ATT	2	6	712926	712931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222054
11111	NC_021984	CGG	2	6	712958	712963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222054
11112	NC_021984	CG	3	6	713127	713132	0 %	0 %	50 %	50 %	529219241
11113	NC_021984	CTT	2	6	713201	713206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219241
11114	NC_021984	CAA	2	6	713213	713218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219241
11115	NC_021984	TCA	2	6	713264	713269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219241
11116	NC_021984	CCG	2	6	713311	713316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219241
11117	NC_021984	GAT	2	6	713319	713324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219241
11118	NC_021984	GCG	2	6	713341	713346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219241
11119	NC_021984	GGC	3	9	713351	713359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219241
11120	NC_021984	CGG	2	6	713555	713560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219242
11121	NC_021984	CG	3	6	713618	713623	0 %	0 %	50 %	50 %	529219242
11122	NC_021984	CTG	2	6	713653	713658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219242
11123	NC_021984	CCG	3	9	713670	713678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219242
11124	NC_021984	AATA	2	8	713722	713729	75 %	25 %	0 %	0 %	529219242
11125	NC_021984	GGGC	2	8	713751	713758	0 %	0 %	75 %	25 %	529219242
11126	NC_021984	TGC	2	6	713846	713851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219242
11127	NC_021984	GGC	2	6	713959	713964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219242
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11129	NC_021984	CGT	2	6	714036	714041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219242
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11133	NC_021984	CGT	2	6	714465	714470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219242
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11140	NC_021984	GGC	2	6	714654	714659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219242
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11148	NC_021984	CG	3	6	715155	715160	0 %	0 %	50 %	50 %	529219242
11149	NC_021984	CGG	2	6	715212	715217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219242
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11152	NC_021984	CA	4	8	715438	715445	50 %	0 %	0 %	50 %	529219243
11153	NC_021984	CAG	2	6	715469	715474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219243
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11161	NC_021984	CGA	2	6	715867	715872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219243
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11191	NC_021984	TCG	2	6	717234	717239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222055
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11203	NC_021984	TAC	2	6	718220	718225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219245
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11215	NC_021984	ACG	2	6	718800	718805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219245
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11220	NC_021984	GGT	2	6	719132	719137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219245
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11226	NC_021984	CCAGCG	2	12	719566	719577	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529219245
11227	NC_021984	GCAA	2	8	719667	719674	50 %	0 %	25 %	25 %	529219245
11228	NC_021984	CAG	2	6	719742	719747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219246
11229	NC_021984	GACA	2	8	719763	719770	50 %	0 %	25 %	25 %	529219246
11230	NC_021984	GGC	2	6	719775	719780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219246
11231	NC_021984	CCAG	2	8	719786	719793	25 %	0 %	25 %	50 %	529219246
11232	NC_021984	GTT	2	6	719805	719810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219246
11233	NC_021984	AAG	2	6	719823	719828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219246
11234	NC_021984	GA	3	6	719835	719840	50 %	0 %	50 %	0 %	529219246
11235	NC_021984	GTG	2	6	719890	719895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219246
11236	NC_021984	GCGCG	2	10	719999	720008	0 %	0 %	60 %	40 %	529219246
11237	NC_021984	GC	3	6	720043	720048	0 %	0 %	50 %	50 %	529219246
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