MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021984	GCCAC	2	10	640672	640681	20 %	0 %	20 %	60 %	529219199
10002	NC_021984	GGC	2	6	640897	640902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219199
10003	NC_021984	TAG	2	6	640920	640925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219199
10004	NC_021984	GCG	2	6	640938	640943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219199
10005	NC_021984	ATA	2	6	640952	640957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219199
10006	NC_021984	TCA	2	6	640969	640974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219199
10007	NC_021984	GCA	2	6	641073	641078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219200
10008	NC_021984	ACGA	2	8	641119	641126	50 %	0 %	25 %	25 %	529219200
10009	NC_021984	ATGG	2	8	641173	641180	25 %	25 %	50 %	0 %	529219200
10010	NC_021984	TA	3	6	641181	641186	50 %	50 %	0 %	0 %	529219200
10011	NC_021984	CGG	2	6	641250	641255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219200
10012	NC_021984	CGGA	2	8	641329	641336	25 %	0 %	50 %	25 %	529219200
10013	NC_021984	GGT	2	6	641341	641346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219200
10014	NC_021984	AAC	2	6	641395	641400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529219200
10015	NC_021984	GCCG	2	8	641419	641426	0 %	0 %	50 %	50 %	529219200
10016	NC_021984	CG	4	8	641478	641485	0 %	0 %	50 %	50 %	529219200
10017	NC_021984	TCT	2	6	641489	641494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219200
10018	NC_021984	AAT	2	6	641590	641595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219200
10019	NC_021984	T	6	6	641618	641623	0 %	100 %	0 %	0 %	529219200
10020	NC_021984	CAG	2	6	641644	641649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219200
10021	NC_021984	AGC	2	6	641671	641676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219200
10022	NC_021984	GAA	2	6	641758	641763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219200
10023	NC_021984	CAG	2	6	641800	641805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219200
10024	NC_021984	ATG	2	6	641870	641875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219200
10025	NC_021984	GAA	2	6	641904	641909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219201
10026	NC_021984	TTC	2	6	641919	641924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219201
10027	NC_021984	CCCAG	2	10	641954	641963	20 %	0 %	20 %	60 %	529219201
10028	NC_021984	TAA	2	6	642025	642030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219201
10029	NC_021984	CGA	2	6	642041	642046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219201
10030	NC_021984	GCAGC	2	10	642075	642084	20 %	0 %	40 %	40 %	529219201
10031	NC_021984	CAT	2	6	642188	642193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219201
10032	NC_021984	AAT	2	6	642198	642203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219201
10033	NC_021984	AAT	2	6	642208	642213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219201
10034	NC_021984	CTG	2	6	642252	642257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219201
10035	NC_021984	CCG	2	6	642259	642264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219201
10036	NC_021984	CG	3	6	642318	642323	0 %	0 %	50 %	50 %	529219201
10037	NC_021984	CGC	2	6	642339	642344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219201
10038	NC_021984	CGA	2	6	642491	642496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219201
10039	NC_021984	TTC	2	6	642615	642620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219201
10040	NC_021984	T	6	6	642705	642710	0 %	100 %	0 %	0 %	529219201
10041	NC_021984	GAAAT	2	10	642759	642768	60 %	20 %	20 %	0 %	529219201
10042	NC_021984	TGC	2	6	642800	642805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219201
10043	NC_021984	TTCA	2	8	642837	642844	25 %	50 %	0 %	25 %	529219201
10044	NC_021984	TGG	2	6	642927	642932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219201
10045	NC_021984	CG	3	6	642943	642948	0 %	0 %	50 %	50 %	529219201
10046	NC_021984	CCA	2	6	642953	642958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219201
10047	NC_021984	TAA	2	6	643019	643024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219201
10048	NC_021984	GC	3	6	643031	643036	0 %	0 %	50 %	50 %	529219201
10049	NC_021984	GA	3	6	643061	643066	50 %	0 %	50 %	0 %	529219201
10050	NC_021984	GC	3	6	643088	643093	0 %	0 %	50 %	50 %	529219201
10051	NC_021984	CCGC	2	8	643181	643188	0 %	0 %	25 %	75 %	529219201
10052	NC_021984	GCG	2	6	643248	643253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219201
10053	NC_021984	ATA	2	6	643257	643262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219201
10054	NC_021984	CGC	2	6	643301	643306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219201
10055	NC_021984	TGG	2	6	643313	643318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219201
10056	NC_021984	GC	3	6	643341	643346	0 %	0 %	50 %	50 %	529219201
10057	NC_021984	ATG	2	6	643362	643367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219201
10058	NC_021984	TC	3	6	643421	643426	0 %	50 %	0 %	50 %	529219201
10059	NC_021984	TTTCGC	2	12	643469	643480	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529219201
10060	NC_021984	GCG	2	6	643502	643507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219201
10061	NC_021984	AGGC	2	8	643520	643527	25 %	0 %	50 %	25 %	529219201
10062	NC_021984	TTC	2	6	643578	643583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219201
10063	NC_021984	A	6	6	643610	643615	100 %	0 %	0 %	0 %	529219201
10064	NC_021984	GCC	2	6	643702	643707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219201
10065	NC_021984	A	6	6	643725	643730	100 %	0 %	0 %	0 %	529219201
10066	NC_021984	TGG	2	6	643851	643856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219202
10067	NC_021984	TTG	2	6	643895	643900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219202
10068	NC_021984	GGGC	2	8	643914	643921	0 %	0 %	75 %	25 %	529219202
10069	NC_021984	CAG	2	6	643958	643963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219202
10070	NC_021984	GC	3	6	643981	643986	0 %	0 %	50 %	50 %	529219202
10071	NC_021984	CCG	2	6	644029	644034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219202
10072	NC_021984	CCG	2	6	644091	644096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219202
10073	NC_021984	CAG	2	6	644114	644119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219202
10074	NC_021984	GCG	2	6	644134	644139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219202
10075	NC_021984	TCG	2	6	644140	644145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219202
10076	NC_021984	CAGG	2	8	644147	644154	25 %	0 %	50 %	25 %	529219202
10077	NC_021984	CGA	2	6	644250	644255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219202
10078	NC_021984	TGC	2	6	644287	644292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219202
10079	NC_021984	ATA	2	6	644319	644324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219202
10080	NC_021984	GCG	2	6	644327	644332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219202
10081	NC_021984	CTGTC	2	10	644430	644439	0 %	40 %	20 %	40 %	529219202
10082	NC_021984	CCA	2	6	644488	644493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219202
10083	NC_021984	CGG	2	6	644510	644515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219202
10084	NC_021984	ATG	2	6	644541	644546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219202
10085	NC_021984	CGC	2	6	644551	644556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219202
10086	NC_021984	GAT	2	6	644621	644626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219202
10087	NC_021984	CCG	2	6	644665	644670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219202
10088	NC_021984	GCT	2	6	644678	644683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219202
10089	NC_021984	CAT	2	6	644686	644691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219202
10090	NC_021984	GGC	2	6	644732	644737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219202
10091	NC_021984	GGT	2	6	644738	644743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219202
10092	NC_021984	ACC	2	6	644793	644798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219202
10093	NC_021984	T	7	7	644804	644810	0 %	100 %	0 %	0 %	529219202
10094	NC_021984	GCG	2	6	644817	644822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219202
10095	NC_021984	TGA	2	6	644849	644854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219203
10096	NC_021984	CGCT	2	8	644921	644928	0 %	25 %	25 %	50 %	529219203
10097	NC_021984	ATA	2	6	644974	644979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219203
10098	NC_021984	GCGCG	2	10	644991	645000	0 %	0 %	60 %	40 %	529219203
10099	NC_021984	ACG	2	6	645123	645128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219203
10100	NC_021984	TGG	2	6	645167	645172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219203
10101	NC_021984	CTGCG	2	10	645175	645184	0 %	20 %	40 %	40 %	529219203
10102	NC_021984	GGC	2	6	645187	645192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219203
10103	NC_021984	GCG	2	6	645193	645198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219203
10104	NC_021984	GCG	2	6	645242	645247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219203
10105	NC_021984	GC	3	6	645300	645305	0 %	0 %	50 %	50 %	529219203
10106	NC_021984	TCC	2	6	645307	645312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529219203
10107	NC_021984	GAC	2	6	645394	645399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219203
10108	NC_021984	CGG	2	6	645567	645572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219203
10109	NC_021984	GC	3	6	645573	645578	0 %	0 %	50 %	50 %	529219203
10110	NC_021984	ATCGAC	2	12	645664	645675	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	529219203
10111	NC_021984	TCG	2	6	645749	645754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219203
10112	NC_021984	ACGGCA	2	12	645812	645823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219203
10113	NC_021984	ATTG	2	8	645825	645832	25 %	50 %	25 %	0 %	529219203
10114	NC_021984	CGC	2	6	645850	645855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219203
10115	NC_021984	GTT	2	6	645881	645886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219203
10116	NC_021984	CAT	2	6	645970	645975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219203
10117	NC_021984	TTA	2	6	646293	646298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219204
10118	NC_021984	AAAC	2	8	646300	646307	75 %	0 %	0 %	25 %	529219204
10119	NC_021984	TTA	2	6	646338	646343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219204
10120	NC_021984	GGC	2	6	646411	646416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219204
10121	NC_021984	AGC	2	6	646425	646430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219204
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10230	NC_021984	AGAT	2	8	651888	651895	50 %	25 %	25 %	0 %	529219210
10231	NC_021984	CTG	2	6	651977	651982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219210
10232	NC_021984	CTG	2	6	652025	652030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219210
10233	NC_021984	TC	3	6	652039	652044	0 %	50 %	0 %	50 %	529219210
10234	NC_021984	TGC	2	6	652045	652050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219210
10235	NC_021984	GCG	2	6	652106	652111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219210
10236	NC_021984	ATCT	2	8	652136	652143	25 %	50 %	0 %	25 %	529219210
10237	NC_021984	GC	3	6	652203	652208	0 %	0 %	50 %	50 %	529219210
10238	NC_021984	CGC	2	6	652230	652235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219210
10239	NC_021984	CTG	2	6	652247	652252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219210
10240	NC_021984	TGA	2	6	652351	652356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219210
10241	NC_021984	GCA	2	6	652363	652368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219210
10242	NC_021984	GAA	2	6	652388	652393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219210
10243	NC_021984	GCGA	2	8	652418	652425	25 %	0 %	50 %	25 %	529219210
10244	NC_021984	AGA	2	6	652426	652431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219210
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10248	NC_021984	ATTGGC	2	12	652712	652723	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529219210
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10251	NC_021984	GTT	2	6	652927	652932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219210
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10253	NC_021984	CTG	2	6	652952	652957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219210
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10256	NC_021984	CAT	2	6	653042	653047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219210
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10260	NC_021984	GTT	2	6	653201	653206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219211
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10264	NC_021984	CCG	2	6	653418	653423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219211
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10271	NC_021984	AT	3	6	654164	654169	50 %	50 %	0 %	0 %	529219212
10272	NC_021984	ATT	2	6	654329	654334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219212
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10277	NC_021984	AT	3	6	654580	654585	50 %	50 %	0 %	0 %	529219212
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10348	NC_021984	GCG	2	6	658440	658445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219215
10349	NC_021984	GTCG	2	8	658558	658565	0 %	25 %	50 %	25 %	529219215
10350	NC_021984	GGTAAT	2	12	658606	658617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219215
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10352	NC_021984	CCA	2	6	658704	658709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219215
10353	NC_021984	GCGG	2	8	658710	658717	0 %	0 %	75 %	25 %	529219215
10354	NC_021984	CG	3	6	658729	658734	0 %	0 %	50 %	50 %	529219215
10355	NC_021984	GCA	2	6	658782	658787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219215
10356	NC_021984	ACC	3	9	659042	659050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219215
10357	NC_021984	GC	3	6	659089	659094	0 %	0 %	50 %	50 %	529219215
10358	NC_021984	CGC	2	6	659100	659105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219215
10359	NC_021984	GGC	2	6	659191	659196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219215
10360	NC_021984	GAT	2	6	659272	659277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219215
10361	NC_021984	CTG	2	6	659284	659289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219215
10362	NC_021984	CGC	2	6	659317	659322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219215
10363	NC_021984	ATC	2	6	659359	659364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219215
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10365	NC_021984	CG	4	8	659451	659458	0 %	0 %	50 %	50 %	529219215
10366	NC_021984	GCA	2	6	659496	659501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219215
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10369	NC_021984	CTTG	2	8	659633	659640	0 %	50 %	25 %	25 %	529219215
10370	NC_021984	GC	3	6	659964	659969	0 %	0 %	50 %	50 %	529219216
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10374	NC_021984	GCA	2	6	660240	660245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219216
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10390	NC_021984	GTAC	2	8	660671	660678	25 %	25 %	25 %	25 %	529219216
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10392	NC_021984	GTTT	2	8	660719	660726	0 %	75 %	25 %	0 %	529219216
10393	NC_021984	CTG	2	6	660729	660734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219216
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10425	NC_021984	TAA	2	6	662501	662506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219218
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10438	NC_021984	CG	3	6	663125	663130	0 %	0 %	50 %	50 %	529219218
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10447	NC_021984	T	6	6	663566	663571	0 %	100 %	0 %	0 %	529219219
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10450	NC_021984	CT	3	6	663733	663738	0 %	50 %	0 %	50 %	529219219
10451	NC_021984	T	6	6	663747	663752	0 %	100 %	0 %	0 %	529219219
10452	NC_021984	GCT	2	6	663795	663800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219219
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10466	NC_021984	GATG	2	8	664512	664519	25 %	25 %	50 %	0 %	529219219
10467	NC_021984	ATG	2	6	664552	664557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219219
10468	NC_021984	TGG	2	6	664604	664609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219219
10469	NC_021984	A	6	6	664642	664647	100 %	0 %	0 %	0 %	529219219
10470	NC_021984	CCA	2	6	664670	664675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219219
10471	NC_021984	TCG	2	6	664944	664949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219220
10472	NC_021984	AACT	2	8	664987	664994	50 %	25 %	0 %	25 %	529219220
10473	NC_021984	CCAG	2	8	665032	665039	25 %	0 %	25 %	50 %	529219220
10474	NC_021984	AT	3	6	665118	665123	50 %	50 %	0 %	0 %	529219220
10475	NC_021984	ATC	2	6	665160	665165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219220
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10477	NC_021984	CGC	2	6	665210	665215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219220
10478	NC_021984	GTC	2	6	665276	665281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219220
10479	NC_021984	CGC	2	6	665284	665289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219220
10480	NC_021984	TCA	2	6	665455	665460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219220
10481	NC_021984	T	6	6	665474	665479	0 %	100 %	0 %	0 %	529219220
10482	NC_021984	TCG	2	6	665574	665579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219220
10483	NC_021984	TAG	2	6	665580	665585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219220
10484	NC_021984	GC	3	6	665601	665606	0 %	0 %	50 %	50 %	529219220
10485	NC_021984	CCG	2	6	665647	665652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219220
10486	NC_021984	AAT	2	6	665672	665677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219220
10487	NC_021984	GTGA	2	8	665692	665699	25 %	25 %	50 %	0 %	529219220
10488	NC_021984	GCA	2	6	665761	665766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219220
10489	NC_021984	CAG	2	6	665801	665806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219220
10490	NC_021984	TGA	2	6	665827	665832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219220
10491	NC_021984	AGA	2	6	665908	665913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219220
10492	NC_021984	AG	3	6	665915	665920	50 %	0 %	50 %	0 %	529219220
10493	NC_021984	CTG	2	6	665957	665962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219220
10494	NC_021984	GTG	2	6	666039	666044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219220
10495	NC_021984	TCA	2	6	666162	666167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219221
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10500	NC_021984	CG	3	6	666533	666538	0 %	0 %	50 %	50 %	529219221

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