MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_021984	GCA	2	6	4002908	4002913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221530
64002	NC_021984	CTG	2	6	4002950	4002955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221530
64003	NC_021984	GAA	2	6	4002956	4002961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221530
64004	NC_021984	TGG	2	6	4002972	4002977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221530
64005	NC_021984	GGT	2	6	4002985	4002990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221530
64006	NC_021984	TGCC	2	8	4003026	4003033	0 %	25 %	25 %	50 %	529221530
64007	NC_021984	GCT	2	6	4003099	4003104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221530
64008	NC_021984	TCG	2	6	4003119	4003124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221530
64009	NC_021984	GTG	2	6	4003175	4003180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221530
64010	NC_021984	TTC	3	9	4003205	4003213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221530
64011	NC_021984	ACCG	2	8	4003217	4003224	25 %	0 %	25 %	50 %	529221530
64012	NC_021984	A	6	6	4003226	4003231	100 %	0 %	0 %	0 %	529221530
64013	NC_021984	GACC	2	8	4003303	4003310	25 %	0 %	25 %	50 %	529221530
64014	NC_021984	TGA	2	6	4003401	4003406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221530
64015	NC_021984	CG	3	6	4003459	4003464	0 %	0 %	50 %	50 %	529221530
64016	NC_021984	ATG	2	6	4003467	4003472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221530
64017	NC_021984	TGTGGC	2	12	4003486	4003497	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	529221530
64018	NC_021984	GAAC	2	8	4003501	4003508	50 %	0 %	25 %	25 %	529221530
64019	NC_021984	TGA	2	6	4003531	4003536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221530
64020	NC_021984	GC	3	6	4003560	4003565	0 %	0 %	50 %	50 %	529221530
64021	NC_021984	CGT	2	6	4003652	4003657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221530
64022	NC_021984	TGC	2	6	4003671	4003676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221530
64023	NC_021984	CAT	2	6	4003678	4003683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221530
64024	NC_021984	GAA	2	6	4003690	4003695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221530
64025	NC_021984	GAA	2	6	4003724	4003729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221530
64026	NC_021984	GAT	2	6	4003775	4003780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221530
64027	NC_021984	CGT	2	6	4003865	4003870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221530
64028	NC_021984	GAA	2	6	4003931	4003936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221530
64029	NC_021984	CTCTG	2	10	4003939	4003948	0 %	40 %	20 %	40 %	529221530
64030	NC_021984	GCG	3	9	4003949	4003957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221530
64031	NC_021984	GCG	2	6	4004036	4004041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221530
64032	NC_021984	TGC	2	6	4004070	4004075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221530
64033	NC_021984	TTGA	2	8	4004123	4004130	25 %	50 %	25 %	0 %	529221530
64034	NC_021984	GCTG	2	8	4004131	4004138	0 %	25 %	50 %	25 %	529221530
64035	NC_021984	GC	3	6	4004143	4004148	0 %	0 %	50 %	50 %	529221530
64036	NC_021984	TTC	2	6	4004162	4004167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221530
64037	NC_021984	TGT	2	6	4004223	4004228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221530
64038	NC_021984	GAGC	2	8	4004607	4004614	25 %	0 %	50 %	25 %	529222691
64039	NC_021984	TA	3	6	4004650	4004655	50 %	50 %	0 %	0 %	529222691
64040	NC_021984	ATT	2	6	4004677	4004682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529222691
64041	NC_021984	GAT	2	6	4004739	4004744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222691
64042	NC_021984	TTC	2	6	4004798	4004803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222691
64043	NC_021984	T	7	7	4005290	4005296	0 %	100 %	0 %	0 %	529222692
64044	NC_021984	ACT	2	6	4005323	4005328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222692
64045	NC_021984	AC	3	6	4005329	4005334	50 %	0 %	0 %	50 %	529222692
64046	NC_021984	CAG	2	6	4005359	4005364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222692
64047	NC_021984	TGT	2	6	4005414	4005419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529222692
64048	NC_021984	ACT	2	6	4005522	4005527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222692
64049	NC_021984	ACTT	2	8	4005573	4005580	25 %	50 %	0 %	25 %	529222692
64050	NC_021984	GTAA	2	8	4005586	4005593	50 %	25 %	25 %	0 %	529222692
64051	NC_021984	TTCT	2	8	4005607	4005614	0 %	75 %	0 %	25 %	529222692
64052	NC_021984	TGA	2	6	4005683	4005688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222692
64053	NC_021984	ATA	2	6	4005705	4005710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529222692
64054	NC_021984	CCG	2	6	4006050	4006055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221531
64055	NC_021984	TTTAAC	2	12	4006060	4006071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	529221531
64056	NC_021984	GAG	2	6	4006084	4006089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529221531
64057	NC_021984	TCA	2	6	4006091	4006096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221531
64058	NC_021984	GAT	2	6	4006120	4006125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221531
64059	NC_021984	CTG	2	6	4006141	4006146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221531
64060	NC_021984	TCA	2	6	4006199	4006204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222693
64061	NC_021984	AAGA	2	8	4006308	4006315	75 %	0 %	25 %	0 %	529222693
64062	NC_021984	CT	3	6	4006340	4006345	0 %	50 %	0 %	50 %	529222693
64063	NC_021984	ATCCC	2	10	4006405	4006414	20 %	20 %	0 %	60 %	529222693
64064	NC_021984	TC	3	6	4006445	4006450	0 %	50 %	0 %	50 %	529222693
64065	NC_021984	ATG	2	6	4006486	4006491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222693
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64067	NC_021984	ATC	2	6	4006598	4006603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222693
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64069	NC_021984	T	6	6	4007013	4007018	0 %	100 %	0 %	0 %	529221532
64070	NC_021984	TGG	2	6	4007061	4007066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221532
64071	NC_021984	CTGT	2	8	4007198	4007205	0 %	50 %	25 %	25 %	529221532
64072	NC_021984	GT	3	6	4007275	4007280	0 %	50 %	50 %	0 %	529221532
64073	NC_021984	AG	3	6	4007302	4007307	50 %	0 %	50 %	0 %	529221532
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64077	NC_021984	TCA	2	6	4007869	4007874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221533
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64085	NC_021984	AAG	2	6	4009044	4009049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221535
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64089	NC_021984	GGCA	2	8	4009293	4009300	25 %	0 %	50 %	25 %	529221535
64090	NC_021984	A	6	6	4009418	4009423	100 %	0 %	0 %	0 %	529221535
64091	NC_021984	CGG	2	6	4009464	4009469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221535
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64096	NC_021984	GCA	2	6	4009615	4009620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221535
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64104	NC_021984	AT	3	6	4009926	4009931	50 %	50 %	0 %	0 %	529221536
64105	NC_021984	TAA	2	6	4009994	4009999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221536
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64112	NC_021984	CCCGC	2	10	4010311	4010320	0 %	0 %	20 %	80 %	529221536
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64114	NC_021984	CGC	2	6	4010460	4010465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221536
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64233	NC_021984	TAA	2	6	4017506	4017511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221542
64234	NC_021984	A	6	6	4017538	4017543	100 %	0 %	0 %	0 %	529221542
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64334	NC_021984	TGC	3	9	4025434	4025442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221545
64335	NC_021984	CGG	2	6	4025516	4025521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221545
64336	NC_021984	ATG	2	6	4025587	4025592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221545
64337	NC_021984	CTG	2	6	4025616	4025621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221545
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64339	NC_021984	CGC	2	6	4025654	4025659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221545
64340	NC_021984	CGC	2	6	4025664	4025669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221545
64341	NC_021984	CAT	2	6	4025684	4025689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221545
64342	NC_021984	CGT	2	6	4025699	4025704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221545
64343	NC_021984	CCG	2	6	4025798	4025803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221545
64344	NC_021984	GAT	2	6	4025813	4025818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221545
64345	NC_021984	TGA	2	6	4025854	4025859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221545
64346	NC_021984	AG	3	6	4025897	4025902	50 %	0 %	50 %	0 %	529221545
64347	NC_021984	GCA	3	9	4025942	4025950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221545
64348	NC_021984	CGC	2	6	4026022	4026027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221545
64349	NC_021984	CCG	2	6	4026093	4026098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221545
64350	NC_021984	GC	3	6	4026124	4026129	0 %	0 %	50 %	50 %	529221545
64351	NC_021984	GCC	2	6	4026175	4026180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221545
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64353	NC_021984	ATT	2	6	4026267	4026272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221545
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64373	NC_021984	GCA	2	6	4027220	4027225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222696
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64382	NC_021984	CGG	2	6	4027453	4027458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222696
64383	NC_021984	CGG	2	6	4027606	4027611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222696
64384	NC_021984	GTT	2	6	4027676	4027681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529222696
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64452	NC_021984	GGC	2	6	4031292	4031297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221548
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64454	NC_021984	GC	3	6	4031362	4031367	0 %	0 %	50 %	50 %	529221548
64455	NC_021984	CTG	2	6	4031376	4031381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221548
64456	NC_021984	TGG	2	6	4031392	4031397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221548
64457	NC_021984	CGG	2	6	4031450	4031455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221548
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64459	NC_021984	CTG	3	9	4031511	4031519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221548
64460	NC_021984	GCTGGT	2	12	4031522	4031533	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	529221548
64461	NC_021984	CGCTG	2	10	4031561	4031570	0 %	20 %	40 %	40 %	529221548
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64492	NC_021984	ATA	2	6	4035098	4035103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221549
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