MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60001	NC_021984	AAG	2	6	3767406	3767411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221368
60002	NC_021984	CG	3	6	3767441	3767446	0 %	0 %	50 %	50 %	529221368
60003	NC_021984	ACC	2	6	3767480	3767485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221368
60004	NC_021984	CGA	2	6	3767518	3767523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221368
60005	NC_021984	TTC	2	6	3767549	3767554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221368
60006	NC_021984	GC	4	8	3767835	3767842	0 %	0 %	50 %	50 %	529221369
60007	NC_021984	GCGTT	2	10	3767846	3767855	0 %	40 %	40 %	20 %	529221369
60008	NC_021984	CAA	3	9	3767857	3767865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529221369
60009	NC_021984	ACG	2	6	3767937	3767942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221369
60010	NC_021984	CAT	2	6	3767947	3767952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221369
60011	NC_021984	TAGC	2	8	3768023	3768030	25 %	25 %	25 %	25 %	529221369
60012	NC_021984	CAC	2	6	3768031	3768036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221369
60013	NC_021984	TCT	2	6	3768101	3768106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221369
60014	NC_021984	TGT	2	6	3768147	3768152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221369
60015	NC_021984	GC	4	8	3768192	3768199	0 %	0 %	50 %	50 %	529221369
60016	NC_021984	CGG	2	6	3768232	3768237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221369
60017	NC_021984	ATC	2	6	3768257	3768262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221369
60018	NC_021984	ACG	2	6	3768292	3768297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221369
60019	NC_021984	CGCT	2	8	3768311	3768318	0 %	25 %	25 %	50 %	529221369
60020	NC_021984	GGT	2	6	3768325	3768330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221369
60021	NC_021984	CCG	2	6	3768374	3768379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221369
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60023	NC_021984	AGAA	2	8	3768496	3768503	75 %	0 %	25 %	0 %	529221369
60024	NC_021984	GCC	3	9	3768545	3768553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221369
60025	NC_021984	TAACAA	2	12	3768576	3768587	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	529221369
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60028	NC_021984	GAA	2	6	3768808	3768813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221369
60029	NC_021984	AGT	2	6	3768864	3768869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221369
60030	NC_021984	ACG	2	6	3768879	3768884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221369
60031	NC_021984	CAC	2	6	3768976	3768981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221369
60032	NC_021984	A	6	6	3769022	3769027	100 %	0 %	0 %	0 %	529221369
60033	NC_021984	ATA	2	6	3769076	3769081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221369
60034	NC_021984	ACA	2	6	3769179	3769184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529221369
60035	NC_021984	AAT	2	6	3769195	3769200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221369
60036	NC_021984	GCG	2	6	3769230	3769235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221369
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60040	NC_021984	GC	3	6	3769418	3769423	0 %	0 %	50 %	50 %	529221369
60041	NC_021984	AGA	2	6	3769470	3769475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221369
60042	NC_021984	TTA	2	6	3769625	3769630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221369
60043	NC_021984	TAT	2	6	3769981	3769986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221370
60044	NC_021984	TTA	2	6	3770000	3770005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221370
60045	NC_021984	GGC	2	6	3770086	3770091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221370
60046	NC_021984	GCCC	2	8	3770121	3770128	0 %	0 %	25 %	75 %	529221370
60047	NC_021984	CGC	2	6	3770153	3770158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221370
60048	NC_021984	GC	3	6	3770176	3770181	0 %	0 %	50 %	50 %	529221370
60049	NC_021984	TGA	2	6	3770199	3770204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221370
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60051	NC_021984	AACG	2	8	3770378	3770385	50 %	0 %	25 %	25 %	529221370
60052	NC_021984	A	6	6	3770412	3770417	100 %	0 %	0 %	0 %	529221370
60053	NC_021984	GCT	2	6	3770428	3770433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221370
60054	NC_021984	GGC	2	6	3770437	3770442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221370
60055	NC_021984	CAG	2	6	3770467	3770472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221370
60056	NC_021984	CAG	2	6	3770561	3770566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221370
60057	NC_021984	CGA	2	6	3770608	3770613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221370
60058	NC_021984	GAA	2	6	3770743	3770748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221370
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60060	NC_021984	TGA	2	6	3770886	3770891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221370
60061	NC_021984	GCA	3	9	3770905	3770913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221370
60062	NC_021984	CGG	2	6	3770932	3770937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221370
60063	NC_021984	GCC	2	6	3770949	3770954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221370
60064	NC_021984	GCA	2	6	3770962	3770967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221370
60065	NC_021984	AAG	2	6	3771003	3771008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221370
60066	NC_021984	GCC	3	9	3771021	3771029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221370
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60069	NC_021984	GGC	2	6	3771164	3771169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221370
60070	NC_021984	TGG	2	6	3771243	3771248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221370
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60072	NC_021984	CAG	2	6	3771359	3771364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221370
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60116	NC_021984	GC	3	6	3773278	3773283	0 %	0 %	50 %	50 %	529221372
60117	NC_021984	CAT	2	6	3773287	3773292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221372
60118	NC_021984	CCG	2	6	3773316	3773321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221372
60119	NC_021984	CCA	2	6	3773326	3773331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221372
60120	NC_021984	CG	3	6	3773360	3773365	0 %	0 %	50 %	50 %	529221372
60121	NC_021984	ACA	2	6	3773401	3773406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529221372
60122	NC_021984	GA	3	6	3773602	3773607	50 %	0 %	50 %	0 %	529221372
60123	NC_021984	CAC	2	6	3773714	3773719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221372
60124	NC_021984	CTC	2	6	3773849	3773854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529221372
60125	NC_021984	GA	3	6	3773863	3773868	50 %	0 %	50 %	0 %	529221372
60126	NC_021984	GTT	2	6	3773896	3773901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221372
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60129	NC_021984	CAT	2	6	3774292	3774297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221373
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60132	NC_021984	CAA	2	6	3774445	3774450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529221373
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60135	NC_021984	GCA	2	6	3774647	3774652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221374
60136	NC_021984	GCG	2	6	3774659	3774664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221374
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60145	NC_021984	TGA	2	6	3775796	3775801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221375
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60147	NC_021984	GGT	2	6	3775893	3775898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221375
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60214	NC_021984	GGCGC	2	10	3780038	3780047	0 %	0 %	60 %	40 %	529222655
60215	NC_021984	CTGAT	2	10	3780054	3780063	20 %	40 %	20 %	20 %	529222655
60216	NC_021984	CTG	2	6	3780068	3780073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222655
60217	NC_021984	TGG	2	6	3780102	3780107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222655
60218	NC_021984	GAT	2	6	3780118	3780123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222655
60219	NC_021984	GGTCTG	2	12	3780131	3780142	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	529222655
60220	NC_021984	GTA	2	6	3780163	3780168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222655
60221	NC_021984	CAA	2	6	3780239	3780244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529221378
60222	NC_021984	GGCCA	2	10	3780250	3780259	20 %	0 %	40 %	40 %	529221378
60223	NC_021984	GCC	2	6	3780303	3780308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221378
60224	NC_021984	AGAA	2	8	3780335	3780342	75 %	0 %	25 %	0 %	529221378
60225	NC_021984	CTG	2	6	3780362	3780367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221378
60226	NC_021984	CGAC	2	8	3780407	3780414	25 %	0 %	25 %	50 %	529221378
60227	NC_021984	A	6	6	3780421	3780426	100 %	0 %	0 %	0 %	529221378
60228	NC_021984	ATC	2	6	3780448	3780453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221378
60229	NC_021984	CAAA	2	8	3780461	3780468	75 %	0 %	0 %	25 %	529221378
60230	NC_021984	CGC	2	6	3780469	3780474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221378
60231	NC_021984	AGCAG	2	10	3780504	3780513	40 %	0 %	40 %	20 %	529221378
60232	NC_021984	GGCGCA	2	12	3780531	3780542	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529221378
60233	NC_021984	ATC	2	6	3780628	3780633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221378
60234	NC_021984	GCT	2	6	3780652	3780657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221378
60235	NC_021984	AGG	2	6	3780696	3780701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529221378
60236	NC_021984	AGC	2	6	3780749	3780754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221379
60237	NC_021984	GCC	2	6	3780813	3780818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221379
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60241	NC_021984	CGCT	2	8	3780877	3780884	0 %	25 %	25 %	50 %	529221379
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60250	NC_021984	ATCG	2	8	3781665	3781672	25 %	25 %	25 %	25 %	529221380
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60252	NC_021984	CAT	2	6	3781802	3781807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221380
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60254	NC_021984	GTG	2	6	3781878	3781883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221380
60255	NC_021984	GAA	2	6	3781893	3781898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221380
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60261	NC_021984	CTG	2	6	3782145	3782150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221380
60262	NC_021984	TGC	2	6	3782156	3782161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221380
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60271	NC_021984	CTG	2	6	3782544	3782549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221380
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60332	NC_021984	GAAGC	2	10	3785430	3785439	40 %	0 %	40 %	20 %	529221383
60333	NC_021984	A	6	6	3785547	3785552	100 %	0 %	0 %	0 %	529221383
60334	NC_021984	TAC	2	6	3785844	3785849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221384
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60336	NC_021984	TCG	2	6	3785888	3785893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221384
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60339	NC_021984	TGG	2	6	3785964	3785969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221384
60340	NC_021984	TGGT	2	8	3785980	3785987	0 %	50 %	50 %	0 %	529221384
60341	NC_021984	TGG	2	6	3786008	3786013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221384
60342	NC_021984	C	6	6	3786110	3786115	0 %	0 %	0 %	100 %	529221384
60343	NC_021984	GGC	2	6	3786126	3786131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221384
60344	NC_021984	GCG	2	6	3786157	3786162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221384
60345	NC_021984	A	7	7	3786216	3786222	100 %	0 %	0 %	0 %	529221384
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