MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58002	NC_021984	GCC	2	6	3646764	3646769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221280
58003	NC_021984	GAC	2	6	3646784	3646789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221280
58004	NC_021984	CTGC	2	8	3646799	3646806	0 %	25 %	25 %	50 %	529221280
58005	NC_021984	CGG	3	9	3646924	3646932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221281
58006	NC_021984	GCG	2	6	3646942	3646947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221281
58007	NC_021984	TGG	2	6	3646966	3646971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221281
58008	NC_021984	GA	3	6	3646978	3646983	50 %	0 %	50 %	0 %	529221281
58009	NC_021984	GCCC	2	8	3647032	3647039	0 %	0 %	25 %	75 %	529221281
58010	NC_021984	ACG	2	6	3647045	3647050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221281
58011	NC_021984	GC	3	6	3647111	3647116	0 %	0 %	50 %	50 %	529221281
58012	NC_021984	T	6	6	3647162	3647167	0 %	100 %	0 %	0 %	529221281
58013	NC_021984	TGCGC	2	10	3647212	3647221	0 %	20 %	40 %	40 %	529221281
58014	NC_021984	GCA	3	9	3647257	3647265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221281
58015	NC_021984	CCG	2	6	3647283	3647288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221281
58016	NC_021984	ATT	2	6	3647300	3647305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221281
58017	NC_021984	CAC	2	6	3647310	3647315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221281
58018	NC_021984	CAC	2	6	3647351	3647356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221281
58019	NC_021984	ACG	2	6	3647469	3647474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221281
58020	NC_021984	CG	3	6	3647491	3647496	0 %	0 %	50 %	50 %	529221281
58021	NC_021984	CCA	2	6	3647521	3647526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221281
58022	NC_021984	TACCAG	2	12	3647555	3647566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	529221281
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58025	NC_021984	GCC	2	6	3647675	3647680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221281
58026	NC_021984	GCG	2	6	3647692	3647697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221281
58027	NC_021984	CAG	2	6	3647702	3647707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221281
58028	NC_021984	GGT	2	6	3647729	3647734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221281
58029	NC_021984	CCGCGC	2	12	3647773	3647784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221281
58030	NC_021984	GC	3	6	3647805	3647810	0 %	0 %	50 %	50 %	529221281
58031	NC_021984	AAC	2	6	3647813	3647818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529221281
58032	NC_021984	CGG	2	6	3647838	3647843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221281
58033	NC_021984	AAT	2	6	3647845	3647850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221281
58034	NC_021984	GC	4	8	3647854	3647861	0 %	0 %	50 %	50 %	529221281
58035	NC_021984	GA	3	6	3647895	3647900	50 %	0 %	50 %	0 %	529221281
58036	NC_021984	GGC	2	6	3647907	3647912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221281
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58038	NC_021984	AT	3	6	3648268	3648273	50 %	50 %	0 %	0 %	529221282
58039	NC_021984	AAG	2	6	3648296	3648301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221282
58040	NC_021984	A	7	7	3648314	3648320	100 %	0 %	0 %	0 %	529221282
58041	NC_021984	CGT	2	6	3648374	3648379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221282
58042	NC_021984	AAC	2	6	3648386	3648391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529221282
58043	NC_021984	GCCAC	2	10	3648396	3648405	20 %	0 %	20 %	60 %	529221282
58044	NC_021984	TGT	2	6	3648417	3648422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221282
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58050	NC_021984	GACTG	2	10	3649376	3649385	20 %	20 %	40 %	20 %	529221283
58051	NC_021984	AAG	2	6	3649386	3649391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221283
58052	NC_021984	A	6	6	3649394	3649399	100 %	0 %	0 %	0 %	529221283
58053	NC_021984	CGC	2	6	3649423	3649428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221283
58054	NC_021984	CTA	2	6	3649446	3649451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221283
58055	NC_021984	TTC	2	6	3649467	3649472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221283
58056	NC_021984	ATGC	2	8	3649565	3649572	25 %	25 %	25 %	25 %	529221283
58057	NC_021984	GGC	2	6	3649577	3649582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221283
58058	NC_021984	GCG	2	6	3649583	3649588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221283
58059	NC_021984	GAT	2	6	3649676	3649681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221283
58060	NC_021984	ATG	2	6	3649700	3649705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221283
58061	NC_021984	ACCT	2	8	3649856	3649863	25 %	25 %	0 %	50 %	529221283
58062	NC_021984	GAC	2	6	3650003	3650008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221283
58063	NC_021984	GGTCA	2	10	3650066	3650075	20 %	20 %	40 %	20 %	529221283
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58066	NC_021984	CGA	2	6	3650176	3650181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221283
58067	NC_021984	CCA	2	6	3650203	3650208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221283
58068	NC_021984	CAT	2	6	3650215	3650220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221283
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58070	NC_021984	ATCC	2	8	3650262	3650269	25 %	25 %	0 %	50 %	529221283
58071	NC_021984	A	6	6	3650291	3650296	100 %	0 %	0 %	0 %	529221283
58072	NC_021984	CAC	2	6	3650345	3650350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221283
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58075	NC_021984	CGT	2	6	3650428	3650433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221283
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58081	NC_021984	TGGC	2	8	3651135	3651142	0 %	25 %	50 %	25 %	529222631
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58084	NC_021984	A	6	6	3651196	3651201	100 %	0 %	0 %	0 %	529222631
58085	NC_021984	ACC	2	6	3651274	3651279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529222631
58086	NC_021984	TCG	2	6	3651329	3651334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222631
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58088	NC_021984	CGC	2	6	3651507	3651512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222631
58089	NC_021984	ACTA	2	8	3651579	3651586	50 %	25 %	0 %	25 %	529222631
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58097	NC_021984	TTGCC	2	10	3652153	3652162	0 %	40 %	20 %	40 %	529221285
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58100	NC_021984	AGC	2	6	3652249	3652254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221285
58101	NC_021984	GTC	2	6	3652272	3652277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221285
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58104	NC_021984	TAC	2	6	3652395	3652400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221285
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58106	NC_021984	CCAG	2	8	3652461	3652468	25 %	0 %	25 %	50 %	529221285
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58113	NC_021984	AGCG	2	8	3652983	3652990	25 %	0 %	50 %	25 %	529221285
58114	NC_021984	GCG	2	6	3653025	3653030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221285
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58116	NC_021984	CGA	2	6	3653093	3653098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221285
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58233	NC_021984	CGT	2	6	3659802	3659807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221290
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58335	NC_021984	CTGCC	2	10	3666150	3666159	0 %	20 %	20 %	60 %	529221297
58336	NC_021984	CA	3	6	3666198	3666203	50 %	0 %	0 %	50 %	529221297
58337	NC_021984	CG	3	6	3666209	3666214	0 %	0 %	50 %	50 %	529221297
58338	NC_021984	T	7	7	3666273	3666279	0 %	100 %	0 %	0 %	529221298
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58345	NC_021984	CTG	2	6	3666659	3666664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221299
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58465	NC_021984	CTG	2	6	3672754	3672759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221301
58466	NC_021984	CAA	2	6	3672823	3672828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529221301
58467	NC_021984	CGG	2	6	3672849	3672854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221301
58468	NC_021984	TAT	2	6	3672909	3672914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221301
58469	NC_021984	CGC	2	6	3672920	3672925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221301
58470	NC_021984	GC	3	6	3672927	3672932	0 %	0 %	50 %	50 %	529221301
58471	NC_021984	ATC	2	6	3672933	3672938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221301
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58480	NC_021984	A	6	6	3675036	3675041	100 %	0 %	0 %	0 %	529222636
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58483	NC_021984	TAC	2	6	3675129	3675134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222636
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58485	NC_021984	T	6	6	3675183	3675188	0 %	100 %	0 %	0 %	529222636
58486	NC_021984	GGAA	2	8	3675220	3675227	50 %	0 %	50 %	0 %	529222636
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58490	NC_021984	TGA	2	6	3675477	3675482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222637
58491	NC_021984	TGA	2	6	3675506	3675511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222637
58492	NC_021984	ACC	2	6	3675599	3675604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529222637
58493	NC_021984	CCCG	2	8	3675629	3675636	0 %	0 %	25 %	75 %	529222638
58494	NC_021984	CCA	2	6	3675663	3675668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529222638
58495	NC_021984	CAG	2	6	3675669	3675674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222638
58496	NC_021984	A	6	6	3675676	3675681	100 %	0 %	0 %	0 %	529222638
58497	NC_021984	GAT	2	6	3675745	3675750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222638
58498	NC_021984	GGA	2	6	3675756	3675761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529222638
58499	NC_021984	GTCT	2	8	3675972	3675979	0 %	50 %	25 %	25 %	529221302
58500	NC_021984	GGC	2	6	3676004	3676009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221302

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