MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_021984	TGGC	2	8	3618076	3618083	0 %	25 %	50 %	25 %	529221265
57502	NC_021984	TGG	2	6	3618104	3618109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221265
57503	NC_021984	CTG	2	6	3618148	3618153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221265
57504	NC_021984	GAA	2	6	3618154	3618159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221265
57505	NC_021984	GTG	2	6	3618169	3618174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221265
57506	NC_021984	CTGA	2	8	3618301	3618308	25 %	25 %	25 %	25 %	529221265
57507	NC_021984	CGC	2	6	3618372	3618377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221265
57508	NC_021984	ACG	2	6	3620510	3620515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221266
57509	NC_021984	TC	3	6	3620526	3620531	0 %	50 %	0 %	50 %	529221266
57510	NC_021984	TCA	2	6	3620537	3620542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221266
57511	NC_021984	CGCTGC	2	12	3620549	3620560	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	529221266
57512	NC_021984	ATTT	2	8	3620566	3620573	25 %	75 %	0 %	0 %	529221266
57513	NC_021984	GCCAGC	2	12	3620575	3620586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529221266
57514	NC_021984	GGC	2	6	3620713	3620718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221266
57515	NC_021984	CAC	2	6	3620748	3620753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221266
57516	NC_021984	CAG	2	6	3620776	3620781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221266
57517	NC_021984	CAG	2	6	3620812	3620817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221266
57518	NC_021984	GC	3	6	3620845	3620850	0 %	0 %	50 %	50 %	529221266
57519	NC_021984	GATGCA	2	12	3620895	3620906	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	529221266
57520	NC_021984	AGC	2	6	3620915	3620920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221266
57521	NC_021984	GATT	2	8	3620930	3620937	25 %	50 %	25 %	0 %	529221266
57522	NC_021984	CG	3	6	3621004	3621009	0 %	0 %	50 %	50 %	529221266
57523	NC_021984	TGA	2	6	3621036	3621041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221266
57524	NC_021984	CGC	2	6	3621048	3621053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221266
57525	NC_021984	CG	3	6	3621062	3621067	0 %	0 %	50 %	50 %	529221266
57526	NC_021984	TGAAAG	2	12	3621206	3621217	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	529221266
57527	NC_021984	GCC	2	6	3621260	3621265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221266
57528	NC_021984	CGC	2	6	3621304	3621309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221266
57529	NC_021984	CAGC	2	8	3621318	3621325	25 %	0 %	25 %	50 %	529221266
57530	NC_021984	GCG	2	6	3621367	3621372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221267
57531	NC_021984	A	6	6	3621420	3621425	100 %	0 %	0 %	0 %	529221267
57532	NC_021984	CGCC	2	8	3621472	3621479	0 %	0 %	25 %	75 %	529221267
57533	NC_021984	CGG	2	6	3621516	3621521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221267
57534	NC_021984	CTG	2	6	3621593	3621598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221267
57535	NC_021984	CAG	2	6	3621619	3621624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221267
57536	NC_021984	CCA	2	6	3621667	3621672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221267
57537	NC_021984	CCT	2	6	3621700	3621705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529221268
57538	NC_021984	GTG	2	6	3621706	3621711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221268
57539	NC_021984	TGCT	2	8	3621723	3621730	0 %	50 %	25 %	25 %	529221268
57540	NC_021984	TCA	2	6	3621785	3621790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221268
57541	NC_021984	AGC	2	6	3621805	3621810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221268
57542	NC_021984	TGA	2	6	3621832	3621837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221268
57543	NC_021984	CAA	2	6	3621876	3621881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529221268
57544	NC_021984	CG	3	6	3621992	3621997	0 %	0 %	50 %	50 %	529221268
57545	NC_021984	CG	3	6	3622019	3622024	0 %	0 %	50 %	50 %	529221268
57546	NC_021984	TCA	2	6	3622063	3622068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221268
57547	NC_021984	CGC	2	6	3622144	3622149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221268
57548	NC_021984	AAG	2	6	3622159	3622164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221268
57549	NC_021984	CGC	2	6	3622196	3622201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221268
57550	NC_021984	CGC	2	6	3622217	3622222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221268
57551	NC_021984	AGA	2	6	3622235	3622240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221268
57552	NC_021984	GTC	2	6	3622242	3622247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221268
57553	NC_021984	TCG	2	6	3622321	3622326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221268
57554	NC_021984	ATTT	2	8	3622358	3622365	25 %	75 %	0 %	0 %	529221268
57555	NC_021984	GCG	2	6	3622388	3622393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221268
57556	NC_021984	AGAT	2	8	3622394	3622401	50 %	25 %	25 %	0 %	529221268
57557	NC_021984	CAC	2	6	3622414	3622419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221268
57558	NC_021984	A	6	6	3622443	3622448	100 %	0 %	0 %	0 %	529221268
57559	NC_021984	ACC	2	6	3622450	3622455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221268
57560	NC_021984	CG	3	6	3622507	3622512	0 %	0 %	50 %	50 %	529221268
57561	NC_021984	CG	3	6	3622523	3622528	0 %	0 %	50 %	50 %	529221268
57562	NC_021984	GCG	2	6	3622558	3622563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221268
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57566	NC_021984	CAC	2	6	3622687	3622692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221269
57567	NC_021984	TGC	2	6	3622706	3622711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221269
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57569	NC_021984	CAG	2	6	3622819	3622824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221269
57570	NC_021984	ACTT	2	8	3622836	3622843	25 %	50 %	0 %	25 %	529221269
57571	NC_021984	CCG	2	6	3622857	3622862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221269
57572	NC_021984	ACC	2	6	3622952	3622957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221269
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57575	NC_021984	TGGCG	2	10	3623149	3623158	0 %	20 %	60 %	20 %	529221269
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57577	NC_021984	CAG	2	6	3623179	3623184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221269
57578	NC_021984	GCT	2	6	3623202	3623207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221269
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57581	NC_021984	TGC	2	6	3623397	3623402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221269
57582	NC_021984	CTA	2	6	3623406	3623411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221269
57583	NC_021984	TAAG	2	8	3623465	3623472	50 %	25 %	25 %	0 %	529221269
57584	NC_021984	CAG	2	6	3623518	3623523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221269
57585	NC_021984	CAC	2	6	3623587	3623592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221269
57586	NC_021984	CG	3	6	3623601	3623606	0 %	0 %	50 %	50 %	529221269
57587	NC_021984	TCC	2	6	3623609	3623614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529221269
57588	NC_021984	ACC	2	6	3623645	3623650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221269
57589	NC_021984	CGG	2	6	3623700	3623705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221269
57590	NC_021984	ATCA	2	8	3623725	3623732	50 %	25 %	0 %	25 %	529221269
57591	NC_021984	AG	3	6	3623803	3623808	50 %	0 %	50 %	0 %	529221269
57592	NC_021984	CAG	2	6	3623848	3623853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221269
57593	NC_021984	GC	4	8	3623887	3623894	0 %	0 %	50 %	50 %	529221269
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57601	NC_021984	GGC	2	6	3624145	3624150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221269
57602	NC_021984	GAC	3	9	3624168	3624176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221269
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57604	NC_021984	GC	5	10	3624301	3624310	0 %	0 %	50 %	50 %	529221269
57605	NC_021984	GCC	2	6	3624317	3624322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221269
57606	NC_021984	AAT	2	6	3624361	3624366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221269
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57611	NC_021984	CG	4	8	3624616	3624623	0 %	0 %	50 %	50 %	529221269
57612	NC_021984	CGGTT	2	10	3624630	3624639	0 %	40 %	40 %	20 %	529221269
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57730	NC_021984	ATG	2	6	3631354	3631359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221274
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