MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_021984	TCT	2	6	3583433	3583438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221245
57002	NC_021984	CGG	2	6	3583454	3583459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221245
57003	NC_021984	GAA	2	6	3583478	3583483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221245
57004	NC_021984	A	6	6	3583506	3583511	100 %	0 %	0 %	0 %	529221245
57005	NC_021984	AGT	2	6	3583565	3583570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221245
57006	NC_021984	CAT	2	6	3583628	3583633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221245
57007	NC_021984	A	6	6	3583654	3583659	100 %	0 %	0 %	0 %	529221245
57008	NC_021984	TACC	2	8	3583800	3583807	25 %	25 %	0 %	50 %	529221246
57009	NC_021984	CGT	2	6	3583833	3583838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221246
57010	NC_021984	CAG	2	6	3583927	3583932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221246
57011	NC_021984	GTA	2	6	3584059	3584064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221246
57012	NC_021984	TTC	2	6	3584071	3584076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221246
57013	NC_021984	GAT	2	6	3584077	3584082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221246
57014	NC_021984	ATC	2	6	3584138	3584143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221246
57015	NC_021984	TGCGG	2	10	3584192	3584201	0 %	20 %	60 %	20 %	529221246
57016	NC_021984	CAG	2	6	3584239	3584244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221246
57017	NC_021984	TCG	2	6	3584252	3584257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221246
57018	NC_021984	CAT	2	6	3584272	3584277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221246
57019	NC_021984	GAT	2	6	3584299	3584304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221246
57020	NC_021984	GCG	2	6	3584328	3584333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221246
57021	NC_021984	AGAC	2	8	3584389	3584396	50 %	0 %	25 %	25 %	529221246
57022	NC_021984	CAT	2	6	3584401	3584406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221246
57023	NC_021984	GCC	2	6	3584416	3584421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221246
57024	NC_021984	CCA	2	6	3584499	3584504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221246
57025	NC_021984	CAG	2	6	3584518	3584523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221246
57026	NC_021984	GCA	2	6	3584535	3584540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221246
57027	NC_021984	AGA	2	6	3584596	3584601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221246
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57029	NC_021984	GCC	3	9	3584633	3584641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221246
57030	NC_021984	CCA	2	6	3584766	3584771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221246
57031	NC_021984	CAC	2	6	3584773	3584778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221246
57032	NC_021984	TCA	2	6	3584856	3584861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221246
57033	NC_021984	ACC	2	6	3584915	3584920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221246
57034	NC_021984	AGG	2	6	3584988	3584993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529221246
57035	NC_021984	CTT	2	6	3585012	3585017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221246
57036	NC_021984	CGA	2	6	3585093	3585098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221246
57037	NC_021984	T	6	6	3585106	3585111	0 %	100 %	0 %	0 %	529221246
57038	NC_021984	TCG	2	6	3585143	3585148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221246
57039	NC_021984	GCT	2	6	3585183	3585188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221246
57040	NC_021984	AGT	2	6	3585210	3585215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221246
57041	NC_021984	ATG	2	6	3585221	3585226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221246
57042	NC_021984	TGC	2	6	3586330	3586335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221247
57043	NC_021984	TTG	2	6	3586341	3586346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221247
57044	NC_021984	CG	3	6	3586360	3586365	0 %	0 %	50 %	50 %	529221247
57045	NC_021984	AT	3	6	3586372	3586377	50 %	50 %	0 %	0 %	529221247
57046	NC_021984	GCTT	2	8	3586398	3586405	0 %	50 %	25 %	25 %	529221247
57047	NC_021984	TTC	2	6	3586436	3586441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221247
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57049	NC_021984	TTCA	2	8	3586478	3586485	25 %	50 %	0 %	25 %	529221247
57050	NC_021984	GTT	2	6	3586611	3586616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221248
57051	NC_021984	CAC	2	6	3586618	3586623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221248
57052	NC_021984	TTG	2	6	3586669	3586674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221248
57053	NC_021984	CTT	2	6	3586710	3586715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221248
57054	NC_021984	ACAT	2	8	3586727	3586734	50 %	25 %	0 %	25 %	529221248
57055	NC_021984	GATA	2	8	3586740	3586747	50 %	25 %	25 %	0 %	529221248
57056	NC_021984	TTG	2	6	3586751	3586756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221248
57057	NC_021984	ACGAAT	2	12	3586759	3586770	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	529221248
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57059	NC_021984	CCCA	2	8	3586907	3586914	25 %	0 %	0 %	75 %	529221248
57060	NC_021984	AGAA	2	8	3587204	3587211	75 %	0 %	25 %	0 %	529221249
57061	NC_021984	TCA	2	6	3587234	3587239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221249
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57063	NC_021984	GTGC	2	8	3587368	3587375	0 %	25 %	50 %	25 %	529221249
57064	NC_021984	GGATG	2	10	3587450	3587459	20 %	20 %	60 %	0 %	529221249
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57067	NC_021984	GA	3	6	3587510	3587515	50 %	0 %	50 %	0 %	529221249
57068	NC_021984	CCG	2	6	3587531	3587536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221249
57069	NC_021984	CTC	2	6	3587566	3587571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529221249
57070	NC_021984	CTGA	2	8	3587578	3587585	25 %	25 %	25 %	25 %	529221249
57071	NC_021984	CGCC	2	8	3587654	3587661	0 %	0 %	25 %	75 %	529221249
57072	NC_021984	TTC	2	6	3587695	3587700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221249
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57075	NC_021984	T	6	6	3587845	3587850	0 %	100 %	0 %	0 %	529221249
57076	NC_021984	CGCCAG	2	12	3587857	3587868	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529221249
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57078	NC_021984	CGC	2	6	3587920	3587925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221249
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57082	NC_021984	CG	3	6	3588036	3588041	0 %	0 %	50 %	50 %	529221249
57083	NC_021984	CGC	2	6	3588070	3588075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221249
57084	NC_021984	CAGG	2	8	3588079	3588086	25 %	0 %	50 %	25 %	529221249
57085	NC_021984	TCC	2	6	3588092	3588097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529221249
57086	NC_021984	CGCC	2	8	3588153	3588160	0 %	0 %	25 %	75 %	529221249
57087	NC_021984	GCC	4	12	3588166	3588177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221249
57088	NC_021984	CTG	2	6	3588211	3588216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221249
57089	NC_021984	AGC	2	6	3588218	3588223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221249
57090	NC_021984	CCAGCG	2	12	3588225	3588236	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529221249
57091	NC_021984	TGCCC	2	10	3588237	3588246	0 %	20 %	20 %	60 %	529221249
57092	NC_021984	CGG	2	6	3588271	3588276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221249
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57099	NC_021984	ACGCC	2	10	3588453	3588462	20 %	0 %	20 %	60 %	529221249
57100	NC_021984	CCG	2	6	3588477	3588482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221249
57101	NC_021984	TTC	2	6	3588511	3588516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221249
57102	NC_021984	CAT	2	6	3588529	3588534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221249
57103	NC_021984	T	6	6	3588630	3588635	0 %	100 %	0 %	0 %	529221249
57104	NC_021984	GCG	2	6	3588639	3588644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221249
57105	NC_021984	GC	3	6	3588669	3588674	0 %	0 %	50 %	50 %	529221249
57106	NC_021984	CG	3	6	3588682	3588687	0 %	0 %	50 %	50 %	529221249
57107	NC_021984	CAT	2	6	3588736	3588741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221249
57108	NC_021984	CTGACG	2	12	3588828	3588839	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529222625
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57110	NC_021984	GCG	2	6	3588892	3588897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222625
57111	NC_021984	CAACTG	2	12	3588912	3588923	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	529222625
57112	NC_021984	TGC	2	6	3588926	3588931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222625
57113	NC_021984	TCAA	2	8	3588967	3588974	50 %	25 %	0 %	25 %	529222625
57114	NC_021984	GCC	2	6	3588984	3588989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222625
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57116	NC_021984	TGA	2	6	3589058	3589063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222625
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57222	NC_021984	CAC	2	6	3595511	3595516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221253
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57226	NC_021984	A	7	7	3595713	3595719	100 %	0 %	0 %	0 %	529221253
57227	NC_021984	ATC	2	6	3595742	3595747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221254
57228	NC_021984	TCT	2	6	3595761	3595766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221254
57229	NC_021984	GCC	2	6	3595787	3595792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221254
57230	NC_021984	CTTCT	2	10	3595904	3595913	0 %	60 %	0 %	40 %	529221254
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57232	NC_021984	GA	3	6	3596011	3596016	50 %	0 %	50 %	0 %	529221254
57233	NC_021984	GTC	2	6	3596055	3596060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221254
57234	NC_021984	CGGG	2	8	3596249	3596256	0 %	0 %	75 %	25 %	529221255
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57240	NC_021984	CACTT	2	10	3596682	3596691	20 %	40 %	0 %	40 %	529221255
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57264	NC_021984	CGC	2	6	3604016	3604021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221256
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57345	NC_021984	GCG	2	6	3608986	3608991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221260
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57349	NC_021984	CTGC	2	8	3609086	3609093	0 %	25 %	25 %	50 %	529221260
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57447	NC_021984	GAAC	2	8	3615750	3615757	50 %	0 %	25 %	25 %	529221265
57448	NC_021984	GTA	2	6	3615773	3615778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221265
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57452	NC_021984	GC	4	8	3615961	3615968	0 %	0 %	50 %	50 %	529221265
57453	NC_021984	GCC	2	6	3616036	3616041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221265
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57455	NC_021984	ACG	2	6	3616100	3616105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221265
57456	NC_021984	A	6	6	3616114	3616119	100 %	0 %	0 %	0 %	529221265
57457	NC_021984	GTCGCT	2	12	3616128	3616139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221265
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57460	NC_021984	AGC	2	6	3616325	3616330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221265
57461	NC_021984	TGAAC	2	10	3616413	3616422	40 %	20 %	20 %	20 %	529221265
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57463	NC_021984	CCT	2	6	3616484	3616489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529221265
57464	NC_021984	GCG	2	6	3616496	3616501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221265
57465	NC_021984	CGG	2	6	3616526	3616531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221265
57466	NC_021984	ACGCC	2	10	3616628	3616637	20 %	0 %	20 %	60 %	529221265
57467	NC_021984	GCT	2	6	3616641	3616646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221265
57468	NC_021984	GAA	2	6	3616660	3616665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221265
57469	NC_021984	TGA	2	6	3616691	3616696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221265
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57471	NC_021984	GC	3	6	3616704	3616709	0 %	0 %	50 %	50 %	529221265
57472	NC_021984	CTGG	2	8	3616731	3616738	0 %	25 %	50 %	25 %	529221265
57473	NC_021984	CTG	2	6	3616780	3616785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221265
57474	NC_021984	AGC	2	6	3616796	3616801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221265
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57479	NC_021984	CTG	3	9	3617209	3617217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221265
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57482	NC_021984	CGA	2	6	3617289	3617294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221265
57483	NC_021984	TGA	2	6	3617297	3617302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221265
57484	NC_021984	GTT	2	6	3617307	3617312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221265
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57487	NC_021984	GC	3	6	3617513	3617518	0 %	0 %	50 %	50 %	529221265
57488	NC_021984	GCT	2	6	3617532	3617537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221265
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57491	NC_021984	CTG	2	6	3617674	3617679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221265
57492	NC_021984	CCG	3	9	3617680	3617688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221265
57493	NC_021984	TCCGC	2	10	3617792	3617801	0 %	20 %	20 %	60 %	529221265
57494	NC_021984	CGT	2	6	3617854	3617859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221265
57495	NC_021984	GGC	2	6	3617866	3617871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221265
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57497	NC_021984	TGC	2	6	3617927	3617932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221265
57498	NC_021984	CTGG	2	8	3617937	3617944	0 %	25 %	50 %	25 %	529221265
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