MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_021902	GGA	2	6	962620	962625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528817670
18003	NC_021902	CGC	2	6	962658	962663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817670
18004	NC_021902	GCT	2	6	962740	962745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817670
18005	NC_021902	ATGGAT	2	12	962750	962761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817670
18006	NC_021902	GC	3	6	962842	962847	0 %	0 %	50 %	50 %	528817670
18007	NC_021902	GCG	2	6	962853	962858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817670
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18009	NC_021902	TTC	2	6	963032	963037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817670
18010	NC_021902	CGG	3	9	963069	963077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817670
18011	NC_021902	GCCAA	2	10	963278	963287	40 %	0 %	20 %	40 %	528817670
18012	NC_021902	TC	3	6	963349	963354	0 %	50 %	0 %	50 %	528817670
18013	NC_021902	GCA	2	6	963357	963362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817670
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18015	NC_021902	AATG	2	8	963493	963500	50 %	25 %	25 %	0 %	528817671
18016	NC_021902	AACG	2	8	963601	963608	50 %	0 %	25 %	25 %	528817671
18017	NC_021902	GCG	2	6	963725	963730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817671
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18022	NC_021902	GAA	3	9	963958	963966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817671
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18033	NC_021902	CTG	2	6	964591	964596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817671
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18056	NC_021902	CGA	2	6	965994	965999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817672
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18119	NC_021902	TAC	2	6	968624	968629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817674
18120	NC_021902	GCAA	2	8	968748	968755	50 %	0 %	25 %	25 %	528817674
18121	NC_021902	CGG	2	6	968841	968846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817674
18122	NC_021902	TAA	2	6	968893	968898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817674
18123	NC_021902	CGCA	2	8	968911	968918	25 %	0 %	25 %	50 %	528817674
18124	NC_021902	CGCC	2	8	968974	968981	0 %	0 %	25 %	75 %	528817674
18125	NC_021902	TGA	2	6	969003	969008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817674
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18131	NC_021902	TGG	2	6	969581	969586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817674
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18358	NC_021902	ATC	2	6	982282	982287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817687
18359	NC_021902	TGG	2	6	982434	982439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817687
18360	NC_021902	GAT	2	6	982555	982560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817687
18361	NC_021902	TTA	2	6	982568	982573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817687
18362	NC_021902	TA	3	6	982971	982976	50 %	50 %	0 %	0 %	528817688
18363	NC_021902	CTG	2	6	983037	983042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817688
18364	NC_021902	ATA	2	6	983256	983261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817688
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18367	NC_021902	TCT	2	6	983302	983307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817688
18368	NC_021902	GATT	2	8	983434	983441	25 %	50 %	25 %	0 %	528817688
18369	NC_021902	T	7	7	983536	983542	0 %	100 %	0 %	0 %	528817688
18370	NC_021902	CCG	2	6	983569	983574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817688
18371	NC_021902	GAT	2	6	984008	984013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817689
18372	NC_021902	TCA	2	6	984050	984055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817689
18373	NC_021902	CTGT	2	8	984086	984093	0 %	50 %	25 %	25 %	528817689
18374	NC_021902	ATT	2	6	984105	984110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817689
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18377	NC_021902	AGC	2	6	984263	984268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817689
18378	NC_021902	T	6	6	984279	984284	0 %	100 %	0 %	0 %	528817689
18379	NC_021902	CGC	2	6	984568	984573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817690
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18386	NC_021902	ACG	2	6	984875	984880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817690
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18401	NC_021902	GGC	2	6	986472	986477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817691
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18423	NC_021902	CTG	2	6	987615	987620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817692
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18457	NC_021902	GC	3	6	988930	988935	0 %	0 %	50 %	50 %	528817692
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18463	NC_021902	TAT	2	6	989302	989307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817692
18464	NC_021902	TGC	2	6	989324	989329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817692
18465	NC_021902	ATG	2	6	989348	989353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817692
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18469	NC_021902	A	7	7	989676	989682	100 %	0 %	0 %	0 %	528817693
18470	NC_021902	CGT	2	6	989722	989727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817693
18471	NC_021902	CGC	2	6	989728	989733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817693
18472	NC_021902	ATGA	2	8	989744	989751	50 %	25 %	25 %	0 %	528817693
18473	NC_021902	GCA	2	6	989823	989828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817693
18474	NC_021902	TGA	2	6	989874	989879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817693
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18477	NC_021902	CAG	2	6	989903	989908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817693
18478	NC_021902	TGA	2	6	989920	989925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817693
18479	NC_021902	ATTGC	2	10	990012	990021	20 %	40 %	20 %	20 %	528817693
18480	NC_021902	GCC	2	6	990080	990085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817693
18481	NC_021902	TGA	2	6	990090	990095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817693
18482	NC_021902	CG	4	8	990119	990126	0 %	0 %	50 %	50 %	528817693
18483	NC_021902	GC	3	6	990174	990179	0 %	0 %	50 %	50 %	528817693
18484	NC_021902	CGG	2	6	990321	990326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817693
18485	NC_021902	AGT	2	6	990334	990339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817693
18486	NC_021902	CAG	2	6	990425	990430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817694
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18488	NC_021902	TGA	2	6	990478	990483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817694
18489	NC_021902	GCA	2	6	990553	990558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817694
18490	NC_021902	CG	3	6	990578	990583	0 %	0 %	50 %	50 %	528817694
18491	NC_021902	CGG	2	6	990676	990681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817694
18492	NC_021902	GCG	2	6	990714	990719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817694
18493	NC_021902	CGGCG	2	10	990760	990769	0 %	0 %	60 %	40 %	528817694
18494	NC_021902	GTC	2	6	990806	990811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817694
18495	NC_021902	CG	3	6	990822	990827	0 %	0 %	50 %	50 %	528817694
18496	NC_021902	GGC	2	6	990869	990874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817694
18497	NC_021902	TGA	2	6	990940	990945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817694
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