MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021902	GCAG	2	8	823616	823623	25 %	0 %	50 %	25 %	528817530
15502	NC_021902	GAC	2	6	823634	823639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817530
15503	NC_021902	TGA	2	6	823642	823647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817530
15504	NC_021902	ACC	2	6	823673	823678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817530
15505	NC_021902	GCT	2	6	823690	823695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817530
15506	NC_021902	TCG	2	6	823800	823805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817530
15507	NC_021902	AGC	3	9	823823	823831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817530
15508	NC_021902	CGC	2	6	823854	823859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817530
15509	NC_021902	GCA	2	6	823879	823884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817530
15510	NC_021902	CCG	2	6	823928	823933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817530
15511	NC_021902	CGG	2	6	823962	823967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817530
15512	NC_021902	ATC	2	6	823973	823978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817530
15513	NC_021902	TTC	2	6	824010	824015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817530
15514	NC_021902	GC	3	6	824032	824037	0 %	0 %	50 %	50 %	528817530
15515	NC_021902	GC	3	6	824057	824062	0 %	0 %	50 %	50 %	528817530
15516	NC_021902	GC	3	6	824064	824069	0 %	0 %	50 %	50 %	528817530
15517	NC_021902	TGCG	2	8	824260	824267	0 %	25 %	50 %	25 %	528817530
15518	NC_021902	GCC	2	6	824279	824284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817530
15519	NC_021902	CTGAC	2	10	824334	824343	20 %	20 %	20 %	40 %	528817530
15520	NC_021902	CCG	2	6	824367	824372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817530
15521	NC_021902	GAA	2	6	824408	824413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817530
15522	NC_021902	CGC	2	6	824421	824426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817530
15523	NC_021902	CGC	2	6	824560	824565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817531
15524	NC_021902	GAAT	2	8	824596	824603	50 %	25 %	25 %	0 %	528817531
15525	NC_021902	GCT	2	6	824750	824755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817531
15526	NC_021902	GC	3	6	824827	824832	0 %	0 %	50 %	50 %	528817531
15527	NC_021902	TGG	2	6	824845	824850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817531
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15529	NC_021902	TGG	2	6	824869	824874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817531
15530	NC_021902	CCG	2	6	824899	824904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817531
15531	NC_021902	GGC	3	9	824912	824920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817531
15532	NC_021902	CGC	2	6	824926	824931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817531
15533	NC_021902	CGG	2	6	824935	824940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817531
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15537	NC_021902	CGG	3	9	825046	825054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817531
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15539	NC_021902	CTA	2	6	825071	825076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817531
15540	NC_021902	GCG	2	6	825106	825111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817531
15541	NC_021902	GTCA	2	8	825181	825188	25 %	25 %	25 %	25 %	528817531
15542	NC_021902	TTG	2	6	825229	825234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817531
15543	NC_021902	AG	3	6	825275	825280	50 %	0 %	50 %	0 %	528817531
15544	NC_021902	A	6	6	825298	825303	100 %	0 %	0 %	0 %	528817531
15545	NC_021902	GTG	2	6	825354	825359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817531
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15547	NC_021902	TGA	2	6	825404	825409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817531
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15549	NC_021902	CG	3	6	825534	825539	0 %	0 %	50 %	50 %	528817531
15550	NC_021902	CGT	2	6	825558	825563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817531
15551	NC_021902	CGG	3	9	825681	825689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817532
15552	NC_021902	GCG	2	6	825767	825772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817532
15553	NC_021902	GCA	2	6	825862	825867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817532
15554	NC_021902	GCT	2	6	825907	825912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817532
15555	NC_021902	GGT	2	6	825928	825933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817532
15556	NC_021902	AGC	2	6	825995	826000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817532
15557	NC_021902	CG	3	6	826001	826006	0 %	0 %	50 %	50 %	528817532
15558	NC_021902	GGC	2	6	826058	826063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817532
15559	NC_021902	CGA	2	6	826105	826110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817532
15560	NC_021902	CTGG	2	8	826150	826157	0 %	25 %	50 %	25 %	528817532
15561	NC_021902	GGC	2	6	826166	826171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817532
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15565	NC_021902	CGC	2	6	826495	826500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817533
15566	NC_021902	GC	3	6	826504	826509	0 %	0 %	50 %	50 %	528817533
15567	NC_021902	TGA	2	6	826550	826555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817533
15568	NC_021902	GCA	2	6	826583	826588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817533
15569	NC_021902	GC	3	6	826602	826607	0 %	0 %	50 %	50 %	528817533
15570	NC_021902	CCAG	2	8	826618	826625	25 %	0 %	25 %	50 %	528817533
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15578	NC_021902	GACC	2	8	826841	826848	25 %	0 %	25 %	50 %	528817533
15579	NC_021902	GCA	2	6	826865	826870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817533
15580	NC_021902	TC	3	6	826954	826959	0 %	50 %	0 %	50 %	528817533
15581	NC_021902	GGA	2	6	827066	827071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528817533
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15584	NC_021902	GCTG	2	8	827161	827168	0 %	25 %	50 %	25 %	528817533
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15589	NC_021902	ACT	2	6	827381	827386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817533
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15598	NC_021902	GCTGGT	2	12	827795	827806	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	528817533
15599	NC_021902	CCGT	2	8	827816	827823	0 %	25 %	25 %	50 %	528817533
15600	NC_021902	GCG	2	6	827940	827945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817533
15601	NC_021902	TTA	2	6	827988	827993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817533
15602	NC_021902	TTGCC	2	10	828004	828013	0 %	40 %	20 %	40 %	528817533
15603	NC_021902	GCT	2	6	828026	828031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817533
15604	NC_021902	GAA	2	6	828035	828040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817533
15605	NC_021902	GGT	2	6	828044	828049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817533
15606	NC_021902	TGA	2	6	828086	828091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817533
15607	NC_021902	T	7	7	828106	828112	0 %	100 %	0 %	0 %	528817533
15608	NC_021902	CGTC	2	8	828358	828365	0 %	25 %	25 %	50 %	528817534
15609	NC_021902	TGTT	2	8	828793	828800	0 %	75 %	25 %	0 %	528817535
15610	NC_021902	ACAA	2	8	828843	828850	75 %	0 %	0 %	25 %	528817535
15611	NC_021902	ATG	2	6	828873	828878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817536
15612	NC_021902	TGC	2	6	828890	828895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817536
15613	NC_021902	TGA	2	6	828959	828964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817536
15614	NC_021902	ACC	2	6	828970	828975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817536
15615	NC_021902	GCG	2	6	828985	828990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817536
15616	NC_021902	CGC	2	6	829106	829111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817536
15617	NC_021902	ATCTT	2	10	829165	829174	20 %	60 %	0 %	20 %	528817536
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15619	NC_021902	AGC	2	6	829229	829234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817536
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15621	NC_021902	GTA	2	6	829308	829313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817536
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15625	NC_021902	ATCG	2	8	829758	829765	25 %	25 %	25 %	25 %	528817537
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15730	NC_021902	GGT	2	6	834967	834972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817540
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15858	NC_021902	TCA	2	6	842112	842117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817548
15859	NC_021902	ATTG	2	8	842128	842135	25 %	50 %	25 %	0 %	528817548
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15970	NC_021902	TCA	2	6	848356	848361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817554
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15972	NC_021902	CAT	2	6	848415	848420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817554
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15977	NC_021902	TTA	2	6	848695	848700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817554
15978	NC_021902	CG	3	6	848701	848706	0 %	0 %	50 %	50 %	528817554
15979	NC_021902	CAGC	2	8	848843	848850	25 %	0 %	25 %	50 %	528817554
15980	NC_021902	CGA	2	6	848855	848860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817554
15981	NC_021902	CG	3	6	848978	848983	0 %	0 %	50 %	50 %	528817554
15982	NC_021902	CCA	2	6	849065	849070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817554
15983	NC_021902	TTC	2	6	849078	849083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817554
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