MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_021902	GAT	2	6	797720	797725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817503
15003	NC_021902	TCG	2	6	797728	797733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817503
15004	NC_021902	GC	3	6	797740	797745	0 %	0 %	50 %	50 %	528817503
15005	NC_021902	AGGC	2	8	797769	797776	25 %	0 %	50 %	25 %	528817503
15006	NC_021902	CGA	2	6	797953	797958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817503
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15008	NC_021902	CAG	2	6	797984	797989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817503
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15010	NC_021902	ATC	2	6	798009	798014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817503
15011	NC_021902	CGT	3	9	798124	798132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817504
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15053	NC_021902	GCC	2	6	799700	799705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817506
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15061	NC_021902	CGGCG	2	10	800194	800203	0 %	0 %	60 %	40 %	528817506
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15120	NC_021902	CCAG	2	8	803871	803878	25 %	0 %	25 %	50 %	528817511
15121	NC_021902	CG	3	6	803889	803894	0 %	0 %	50 %	50 %	528817511
15122	NC_021902	TCA	2	6	803946	803951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817511
15123	NC_021902	CGA	2	6	803973	803978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817511
15124	NC_021902	ATTC	2	8	803988	803995	25 %	50 %	0 %	25 %	528817511
15125	NC_021902	CGCC	2	8	804015	804022	0 %	0 %	25 %	75 %	528817511
15126	NC_021902	CAG	2	6	804136	804141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817511
15127	NC_021902	GAT	2	6	804163	804168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817511
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15129	NC_021902	TTC	2	6	804227	804232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817511
15130	NC_021902	GAT	2	6	804265	804270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817511
15131	NC_021902	CG	3	6	804276	804281	0 %	0 %	50 %	50 %	528817511
15132	NC_021902	AGA	2	6	804289	804294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817511
15133	NC_021902	CTTG	2	8	804345	804352	0 %	50 %	25 %	25 %	528817511
15134	NC_021902	CGCC	2	8	804360	804367	0 %	0 %	25 %	75 %	528817511
15135	NC_021902	GC	3	6	804369	804374	0 %	0 %	50 %	50 %	528817511
15136	NC_021902	CCA	2	6	804381	804386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817511
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15140	NC_021902	TGA	2	6	804522	804527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817511
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15142	NC_021902	GCT	2	6	804636	804641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817511
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15144	NC_021902	CGA	2	6	804708	804713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817511
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15151	NC_021902	CGG	3	9	805262	805270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817512
15152	NC_021902	GCG	2	6	805306	805311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817512
15153	NC_021902	GCT	2	6	805424	805429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817512
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15155	NC_021902	T	6	6	805734	805739	0 %	100 %	0 %	0 %	528817512
15156	NC_021902	A	7	7	806073	806079	100 %	0 %	0 %	0 %	528817513
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15161	NC_021902	TCA	2	6	806488	806493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817513
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15169	NC_021902	CGT	2	6	806817	806822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817513
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15234	NC_021902	GCG	2	6	810280	810285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817514
15235	NC_021902	GCG	2	6	810314	810319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817514
15236	NC_021902	GTT	2	6	810336	810341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817514
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15238	NC_021902	ACA	2	6	810465	810470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817514
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15240	NC_021902	CCG	2	6	810568	810573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817514
15241	NC_021902	GACGC	2	10	810610	810619	20 %	0 %	40 %	40 %	528817514
15242	NC_021902	AG	3	6	810687	810692	50 %	0 %	50 %	0 %	528817514
15243	NC_021902	CAA	2	6	810726	810731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817514
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15245	NC_021902	CAA	2	6	810801	810806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817514
15246	NC_021902	GCT	2	6	810960	810965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817514
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15248	NC_021902	GCT	2	6	810990	810995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817514
15249	NC_021902	CTG	2	6	811067	811072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817514
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15251	NC_021902	CTG	2	6	811135	811140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817514
15252	NC_021902	GCA	2	6	811177	811182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817514
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15254	NC_021902	GTAA	2	8	811258	811265	50 %	25 %	25 %	0 %	528817514
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15258	NC_021902	ATGT	2	8	811746	811753	25 %	50 %	25 %	0 %	528817515
15259	NC_021902	CTGAA	2	10	811820	811829	40 %	20 %	20 %	20 %	528817515
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15262	NC_021902	CCG	4	12	812025	812036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817516
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15272	NC_021902	T	6	6	812522	812527	0 %	100 %	0 %	0 %	528817516
15273	NC_021902	TA	3	6	812537	812542	50 %	50 %	0 %	0 %	528817516
15274	NC_021902	CAA	3	9	812554	812562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817516
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15278	NC_021902	ATA	2	6	812673	812678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817516
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15288	NC_021902	CTG	2	6	813282	813287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817517
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15311	NC_021902	AT	3	6	814227	814232	50 %	50 %	0 %	0 %	528817517
15312	NC_021902	TCA	2	6	814239	814244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817517
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15340	NC_021902	TGTT	2	8	815953	815960	0 %	75 %	25 %	0 %	528817519
15341	NC_021902	TCT	2	6	815977	815982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817519
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15346	NC_021902	CGATG	2	10	816147	816156	20 %	20 %	40 %	20 %	528817519
15347	NC_021902	CG	3	6	816170	816175	0 %	0 %	50 %	50 %	528817519
15348	NC_021902	CTG	2	6	816222	816227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817519
15349	NC_021902	TTG	2	6	816286	816291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817519
15350	NC_021902	GAT	2	6	816303	816308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817519
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15352	NC_021902	TGC	2	6	816373	816378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817519
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15354	NC_021902	GCTC	2	8	816642	816649	0 %	25 %	25 %	50 %	528817520
15355	NC_021902	CCG	2	6	816690	816695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817520
15356	NC_021902	TGATC	2	10	816725	816734	20 %	40 %	20 %	20 %	528817520
15357	NC_021902	GCCA	2	8	816747	816754	25 %	0 %	25 %	50 %	528817520
15358	NC_021902	CG	3	6	816799	816804	0 %	0 %	50 %	50 %	528817520
15359	NC_021902	CGTG	2	8	816811	816818	0 %	25 %	50 %	25 %	528817520
15360	NC_021902	A	7	7	816832	816838	100 %	0 %	0 %	0 %	528817520
15361	NC_021902	CGG	2	6	816992	816997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817520
15362	NC_021902	CG	3	6	817022	817027	0 %	0 %	50 %	50 %	528817520
15363	NC_021902	CAA	2	6	817133	817138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817520
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15375	NC_021902	GGC	2	6	817607	817612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817520
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15377	NC_021902	CGT	2	6	817711	817716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817520
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15391	NC_021902	CGA	2	6	818235	818240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817521
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15418	NC_021902	CGG	2	6	819746	819751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817522
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15482	NC_021902	CTC	2	6	822723	822728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528817529
15483	NC_021902	GGAT	2	8	822815	822822	25 %	25 %	50 %	0 %	528817529
15484	NC_021902	CGC	2	6	822843	822848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817529
15485	NC_021902	CGG	2	6	822912	822917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817529
15486	NC_021902	CTG	2	6	822958	822963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817529
15487	NC_021902	GGCT	2	8	822966	822973	0 %	25 %	50 %	25 %	528817529
15488	NC_021902	TCGCT	2	10	822998	823007	0 %	40 %	20 %	40 %	528817529
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15490	NC_021902	ATG	2	6	823108	823113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817529
15491	NC_021902	CT	3	6	823197	823202	0 %	50 %	0 %	50 %	528817529
15492	NC_021902	GGTG	2	8	823203	823210	0 %	25 %	75 %	0 %	528817529
15493	NC_021902	GCT	2	6	823212	823217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817529
15494	NC_021902	CGG	2	6	823245	823250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817529
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