MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021902	CGGA	2	8	651068	651075	25 %	0 %	50 %	25 %	528817335
12502	NC_021902	TAT	2	6	651076	651081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817335
12503	NC_021902	CA	3	6	651139	651144	50 %	0 %	0 %	50 %	528817335
12504	NC_021902	GCA	2	6	651205	651210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817335
12505	NC_021902	GCA	2	6	651226	651231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817335
12506	NC_021902	CTGG	2	8	651319	651326	0 %	25 %	50 %	25 %	528817335
12507	NC_021902	AAAC	2	8	651334	651341	75 %	0 %	0 %	25 %	528817335
12508	NC_021902	CAA	2	6	651368	651373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817335
12509	NC_021902	ATT	2	6	651605	651610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817336
12510	NC_021902	T	7	7	651799	651805	0 %	100 %	0 %	0 %	528817336
12511	NC_021902	ATT	2	6	651808	651813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817336
12512	NC_021902	CCAG	2	8	652294	652301	25 %	0 %	25 %	50 %	528817337
12513	NC_021902	TCG	2	6	652353	652358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817337
12514	NC_021902	CGA	2	6	652440	652445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817337
12515	NC_021902	AGCC	2	8	652539	652546	25 %	0 %	25 %	50 %	528817337
12516	NC_021902	CTT	2	6	652555	652560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817337
12517	NC_021902	CCA	2	6	652597	652602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817337
12518	NC_021902	TGG	2	6	652627	652632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817337
12519	NC_021902	AGA	2	6	652646	652651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817337
12520	NC_021902	GCA	2	6	652696	652701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817337
12521	NC_021902	CTG	2	6	652718	652723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817337
12522	NC_021902	CAG	2	6	652736	652741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817337
12523	NC_021902	CAA	2	6	652812	652817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817337
12524	NC_021902	GCG	2	6	652844	652849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817337
12525	NC_021902	CATCG	2	10	652865	652874	20 %	20 %	20 %	40 %	528817337
12526	NC_021902	A	6	6	652936	652941	100 %	0 %	0 %	0 %	528817338
12527	NC_021902	TG	3	6	652943	652948	0 %	50 %	50 %	0 %	528817338
12528	NC_021902	CGC	2	6	652980	652985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817338
12529	NC_021902	CTG	2	6	652999	653004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817338
12530	NC_021902	CGC	2	6	653025	653030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817338
12531	NC_021902	CGA	2	6	653044	653049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817338
12532	NC_021902	CAGC	2	8	653122	653129	25 %	0 %	25 %	50 %	528817338
12533	NC_021902	CGC	2	6	653160	653165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817338
12534	NC_021902	TCAA	2	8	653198	653205	50 %	25 %	0 %	25 %	528817338
12535	NC_021902	TTA	2	6	653249	653254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817338
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12539	NC_021902	GCT	2	6	653421	653426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817338
12540	NC_021902	AAT	2	6	653444	653449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817338
12541	NC_021902	TGC	2	6	653598	653603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817338
12542	NC_021902	CAG	3	9	653623	653631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817338
12543	NC_021902	GAT	2	6	653644	653649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817338
12544	NC_021902	CGCGG	2	10	653658	653667	0 %	0 %	60 %	40 %	528817338
12545	NC_021902	CCA	2	6	653697	653702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817338
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12551	NC_021902	TAA	2	6	653941	653946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817338
12552	NC_021902	CCA	2	6	653949	653954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817338
12553	NC_021902	ATA	2	6	653978	653983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817338
12554	NC_021902	TTG	2	6	653996	654001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817338
12555	NC_021902	CTG	2	6	654004	654009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817338
12556	NC_021902	GGT	2	6	654057	654062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817338
12557	NC_021902	TCA	2	6	654065	654070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817338
12558	NC_021902	TTTCC	2	10	654129	654138	0 %	60 %	0 %	40 %	528817338
12559	NC_021902	CAC	2	6	654229	654234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817338
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12561	NC_021902	AGCG	2	8	654341	654348	25 %	0 %	50 %	25 %	528817338
12562	NC_021902	CG	3	6	654381	654386	0 %	0 %	50 %	50 %	528817338
12563	NC_021902	TGC	2	6	654390	654395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817338
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12566	NC_021902	A	7	7	654911	654917	100 %	0 %	0 %	0 %	528817339
12567	NC_021902	GCG	2	6	654975	654980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817339
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12569	NC_021902	GCG	2	6	655341	655346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817339
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12571	NC_021902	CGCC	2	8	655432	655439	0 %	0 %	25 %	75 %	528817339
12572	NC_021902	CGG	2	6	655463	655468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817339
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12741	NC_021902	GAT	2	6	665633	665638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817349
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12743	NC_021902	TTA	2	6	665876	665881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817350
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12755	NC_021902	TGA	2	6	666449	666454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817351
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12769	NC_021902	T	6	6	667164	667169	0 %	100 %	0 %	0 %	528817352
12770	NC_021902	T	7	7	667208	667214	0 %	100 %	0 %	0 %	528817352
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12854	NC_021902	AT	3	6	672170	672175	50 %	50 %	0 %	0 %	528817359
12855	NC_021902	T	6	6	672178	672183	0 %	100 %	0 %	0 %	528817359
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12979	NC_021902	G	6	6	683513	683518	0 %	0 %	100 %	0 %	528817373
12980	NC_021902	GTT	2	6	683619	683624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817373
12981	NC_021902	TCA	2	6	683625	683630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817373
12982	NC_021902	CGCATC	2	12	683659	683670	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528817373
12983	NC_021902	CCT	2	6	683724	683729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528817373
12984	NC_021902	TCA	2	6	683923	683928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817374
12985	NC_021902	CAGC	2	8	683974	683981	25 %	0 %	25 %	50 %	528817374
12986	NC_021902	TGT	2	6	684081	684086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817374
12987	NC_021902	CAC	2	6	684106	684111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817374
12988	NC_021902	CCA	2	6	684264	684269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817375
12989	NC_021902	TG	3	6	684345	684350	0 %	50 %	50 %	0 %	528817375
12990	NC_021902	CAC	2	6	684355	684360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817375
12991	NC_021902	TTC	2	6	684493	684498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817375
12992	NC_021902	AAT	2	6	684688	684693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817376
12993	NC_021902	CGT	2	6	684705	684710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817376
12994	NC_021902	TAA	2	6	684746	684751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817376
12995	NC_021902	TGA	2	6	684788	684793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817376
12996	NC_021902	TCA	2	6	684801	684806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817376
12997	NC_021902	GCA	2	6	684812	684817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817376
12998	NC_021902	CGG	2	6	684822	684827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817376
12999	NC_021902	TCA	2	6	684887	684892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817376
13000	NC_021902	GTT	2	6	684928	684933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817376

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