MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021902	ATA	2	6	517251	517256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817219
10002	NC_021902	TCA	2	6	517260	517265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817219
10003	NC_021902	A	7	7	517265	517271	100 %	0 %	0 %	0 %	528817219
10004	NC_021902	GC	3	6	517325	517330	0 %	0 %	50 %	50 %	528817219
10005	NC_021902	GTGAAT	2	12	517350	517361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817219
10006	NC_021902	ATT	2	6	517367	517372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817219
10007	NC_021902	GAT	2	6	517460	517465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817219
10008	NC_021902	TAA	2	6	517580	517585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817220
10009	NC_021902	AT	3	6	517586	517591	50 %	50 %	0 %	0 %	528817220
10010	NC_021902	TCGCG	2	10	517611	517620	0 %	20 %	40 %	40 %	528817220
10011	NC_021902	CGC	2	6	517670	517675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817220
10012	NC_021902	GGT	2	6	517688	517693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817220
10013	NC_021902	TGT	2	6	517703	517708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817220
10014	NC_021902	TTGA	2	8	517725	517732	25 %	50 %	25 %	0 %	528817220
10015	NC_021902	GAT	2	6	517746	517751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817220
10016	NC_021902	GTC	2	6	517864	517869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817220
10017	NC_021902	CGA	2	6	517991	517996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817220
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10019	NC_021902	A	6	6	518061	518066	100 %	0 %	0 %	0 %	528817220
10020	NC_021902	CGT	2	6	518121	518126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817220
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10022	NC_021902	GACG	2	8	518225	518232	25 %	0 %	50 %	25 %	528817220
10023	NC_021902	GATC	2	8	518240	518247	25 %	25 %	25 %	25 %	528817220
10024	NC_021902	TTGA	2	8	518256	518263	25 %	50 %	25 %	0 %	528817220
10025	NC_021902	CCAAA	2	10	518281	518290	60 %	0 %	0 %	40 %	528817220
10026	NC_021902	A	6	6	518344	518349	100 %	0 %	0 %	0 %	528817220
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10030	NC_021902	CTT	3	9	518492	518500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817221
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10032	NC_021902	T	6	6	518562	518567	0 %	100 %	0 %	0 %	528817221
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10041	NC_021902	CGC	2	6	519087	519092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817222
10042	NC_021902	ATAC	2	8	519096	519103	50 %	25 %	0 %	25 %	528817222
10043	NC_021902	CGG	2	6	519255	519260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817222
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10045	NC_021902	GA	3	6	519392	519397	50 %	0 %	50 %	0 %	528817222
10046	NC_021902	CGA	2	6	519401	519406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817222
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10052	NC_021902	CGG	3	9	519676	519684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817223
10053	NC_021902	CAT	2	6	519697	519702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817223
10054	NC_021902	CTG	2	6	519704	519709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817223
10055	NC_021902	ACC	2	6	519723	519728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817223
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10057	NC_021902	ATG	2	6	519749	519754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817223
10058	NC_021902	AATT	2	8	519755	519762	50 %	50 %	0 %	0 %	528817223
10059	NC_021902	TAT	2	6	519767	519772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817223
10060	NC_021902	TTTA	2	8	519779	519786	25 %	75 %	0 %	0 %	528817223
10061	NC_021902	ATA	2	6	519833	519838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817223
10062	NC_021902	ATT	2	6	519854	519859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817223
10063	NC_021902	TATC	2	8	519877	519884	25 %	50 %	0 %	25 %	528817223
10064	NC_021902	CAA	2	6	519898	519903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817223
10065	NC_021902	TA	3	6	519913	519918	50 %	50 %	0 %	0 %	528817223
10066	NC_021902	CGA	2	6	519924	519929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817223
10067	NC_021902	TGT	2	6	519989	519994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817223
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10069	NC_021902	TGG	2	6	520050	520055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817223
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10085	NC_021902	ATC	2	6	520567	520572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817224
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10089	NC_021902	CCG	2	6	520994	520999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817224
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10091	NC_021902	CA	3	6	521081	521086	50 %	0 %	0 %	50 %	528817224
10092	NC_021902	GC	3	6	521100	521105	0 %	0 %	50 %	50 %	528817224
10093	NC_021902	TCG	2	6	521107	521112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817224
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10096	NC_021902	ATTA	2	8	521242	521249	50 %	50 %	0 %	0 %	528817225
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10100	NC_021902	A	6	6	521420	521425	100 %	0 %	0 %	0 %	528817225
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10103	NC_021902	A	6	6	521455	521460	100 %	0 %	0 %	0 %	528817225
10104	NC_021902	TTG	2	6	521481	521486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817225
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10106	NC_021902	T	6	6	521572	521577	0 %	100 %	0 %	0 %	528817225
10107	NC_021902	CCA	2	6	521617	521622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817225
10108	NC_021902	GACC	2	8	521629	521636	25 %	0 %	25 %	50 %	528817225
10109	NC_021902	CAG	2	6	521681	521686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817225
10110	NC_021902	CGC	2	6	521716	521721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817225
10111	NC_021902	ACCAG	2	10	521742	521751	40 %	0 %	20 %	40 %	528817225
10112	NC_021902	CAG	2	6	521753	521758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817225
10113	NC_021902	CAG	2	6	521840	521845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817225
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10117	NC_021902	CGA	2	6	522022	522027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817225
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10119	NC_021902	TAA	2	6	522107	522112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817225
10120	NC_021902	ATG	2	6	522207	522212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817225
10121	NC_021902	TGG	2	6	522349	522354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817225
10122	NC_021902	GTT	2	6	522360	522365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817225
10123	NC_021902	GCC	2	6	522396	522401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817225
10124	NC_021902	CGG	3	9	522454	522462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817225
10125	NC_021902	CGG	2	6	522528	522533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817225
10126	NC_021902	ATC	2	6	522534	522539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817225
10127	NC_021902	CTA	2	6	522562	522567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817225
10128	NC_021902	TTG	2	6	522617	522622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817225
10129	NC_021902	CGG	2	6	522706	522711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817225
10130	NC_021902	CTG	2	6	522737	522742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817225
10131	NC_021902	AAT	2	6	522812	522817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817225
10132	NC_021902	T	7	7	522823	522829	0 %	100 %	0 %	0 %	528817225
10133	NC_021902	T	6	6	523407	523412	0 %	100 %	0 %	0 %	528817226
10134	NC_021902	T	7	7	523429	523435	0 %	100 %	0 %	0 %	528817226
10135	NC_021902	TAT	2	6	523489	523494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817226
10136	NC_021902	ATC	2	6	523531	523536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817226
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10138	NC_021902	CTG	2	6	523572	523577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817226
10139	NC_021902	TCAC	2	8	523598	523605	25 %	25 %	0 %	50 %	528817226
10140	NC_021902	TCA	2	6	523694	523699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817226
10141	NC_021902	TAA	2	6	523742	523747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817226
10142	NC_021902	T	8	8	523770	523777	0 %	100 %	0 %	0 %	528817226
10143	NC_021902	CA	3	6	523837	523842	50 %	0 %	0 %	50 %	528817227
10144	NC_021902	CAC	2	6	523854	523859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817227
10145	NC_021902	CAA	2	6	523863	523868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817227
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10147	NC_021902	CAG	2	6	523884	523889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817227
10148	NC_021902	TTG	2	6	523896	523901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817227
10149	NC_021902	TAACA	2	10	523921	523930	60 %	20 %	0 %	20 %	528817227
10150	NC_021902	TA	4	8	523965	523972	50 %	50 %	0 %	0 %	528817227
10151	NC_021902	CGC	2	6	524008	524013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817227
10152	NC_021902	CGT	2	6	524041	524046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817227
10153	NC_021902	C	6	6	524124	524129	0 %	0 %	0 %	100 %	528817227
10154	NC_021902	CGC	2	6	524149	524154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817227
10155	NC_021902	CGC	2	6	524176	524181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817227
10156	NC_021902	CGC	2	6	524200	524205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817227
10157	NC_021902	CGT	2	6	524209	524214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817227
10158	NC_021902	TTA	2	6	524234	524239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817227
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10160	NC_021902	GCC	2	6	524321	524326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817227
10161	NC_021902	CGC	2	6	524344	524349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817227
10162	NC_021902	TGGC	2	8	524477	524484	0 %	25 %	50 %	25 %	528817227
10163	NC_021902	CGC	2	6	524512	524517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817227
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10167	NC_021902	CCG	2	6	524856	524861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817227
10168	NC_021902	GCC	2	6	524911	524916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817227
10169	NC_021902	GCA	2	6	524919	524924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817227
10170	NC_021902	TCG	3	9	524972	524980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817227
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10172	NC_021902	GCC	2	6	525007	525012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817227
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10175	NC_021902	CGC	2	6	525087	525092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817227
10176	NC_021902	CTGG	2	8	525118	525125	0 %	25 %	50 %	25 %	528817227
10177	NC_021902	CGGT	2	8	525126	525133	0 %	25 %	50 %	25 %	528817227
10178	NC_021902	ATA	2	6	525136	525141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817227
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10183	NC_021902	TTA	2	6	525490	525495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817228
10184	NC_021902	A	7	7	525543	525549	100 %	0 %	0 %	0 %	528817228
10185	NC_021902	ATA	2	6	525599	525604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817228
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10187	NC_021902	GGC	2	6	525696	525701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817228
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10191	NC_021902	TCG	2	6	525856	525861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817228
10192	NC_021902	GCG	3	9	525869	525877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817228
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10197	NC_021902	CGT	2	6	526105	526110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817229
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10200	NC_021902	AAG	2	6	526243	526248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817229
10201	NC_021902	CGT	3	9	526440	526448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817229
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10206	NC_021902	TCG	2	6	526628	526633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817229
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10210	NC_021902	AGC	2	6	526883	526888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817229
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10212	NC_021902	CTT	2	6	526926	526931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817229
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10220	NC_021902	ATG	2	6	527248	527253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817230
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10222	NC_021902	ATC	2	6	527271	527276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817230
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10225	NC_021902	GTA	2	6	527560	527565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817232
10226	NC_021902	TCA	2	6	527573	527578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817232
10227	NC_021902	T	6	6	527598	527603	0 %	100 %	0 %	0 %	528817232
10228	NC_021902	GCT	2	6	527658	527663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817232
10229	NC_021902	ATA	2	6	527672	527677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817232
10230	NC_021902	CGT	2	6	527707	527712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817232
10231	NC_021902	AAT	2	6	527754	527759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817232
10232	NC_021902	CTTT	2	8	527769	527776	0 %	75 %	0 %	25 %	528817232
10233	NC_021902	ATA	2	6	527797	527802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817232
10234	NC_021902	CAG	2	6	527814	527819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817232
10235	NC_021902	ACC	2	6	527842	527847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817232
10236	NC_021902	ATA	2	6	527869	527874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817232
10237	NC_021902	GAT	2	6	527881	527886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817232
10238	NC_021902	T	6	6	527925	527930	0 %	100 %	0 %	0 %	528817232
10239	NC_021902	T	7	7	527955	527961	0 %	100 %	0 %	0 %	528817232
10240	NC_021902	CGA	2	6	528033	528038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817232
10241	NC_021902	CGC	2	6	528051	528056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817232
10242	NC_021902	CGCAG	2	10	528190	528199	20 %	0 %	40 %	40 %	528817232
10243	NC_021902	AACAA	2	10	528266	528275	80 %	0 %	0 %	20 %	528817232
10244	NC_021902	TGAA	2	8	528326	528333	50 %	25 %	25 %	0 %	528817232
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10246	NC_021902	T	6	6	528596	528601	0 %	100 %	0 %	0 %	528817232
10247	NC_021902	AGA	2	6	528618	528623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817232
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10261	NC_021902	AT	3	6	529138	529143	50 %	50 %	0 %	0 %	528817233
10262	NC_021902	ATG	2	6	529150	529155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817233
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10267	NC_021902	TA	3	6	529299	529304	50 %	50 %	0 %	0 %	528817233
10268	NC_021902	ACA	2	6	529423	529428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817233
10269	NC_021902	CG	3	6	529511	529516	0 %	0 %	50 %	50 %	528817233
10270	NC_021902	CGAT	2	8	529627	529634	25 %	25 %	25 %	25 %	528817233
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10312	NC_021902	TGC	2	6	531767	531772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817237
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10344	NC_021902	GGT	2	6	533411	533416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817239
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10357	NC_021902	CGG	3	9	533961	533969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817240
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10359	NC_021902	TCT	2	6	534036	534041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817240
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10475	NC_021902	A	6	6	540805	540810	100 %	0 %	0 %	0 %	528817250
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10479	NC_021902	ATTT	2	8	541228	541235	25 %	75 %	0 %	0 %	528817251
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10482	NC_021902	CAC	2	6	541568	541573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817252
10483	NC_021902	CTT	2	6	541672	541677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817252
10484	NC_021902	GTT	2	6	541703	541708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817252
10485	NC_021902	CTT	2	6	541735	541740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817252
10486	NC_021902	GTGGAG	2	12	541806	541817	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	528817252
10487	NC_021902	GTA	2	6	541821	541826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817252
10488	NC_021902	GCA	2	6	541930	541935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817252
10489	NC_021902	GCG	2	6	541970	541975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817252
10490	NC_021902	CAGCGC	2	12	541976	541987	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528817252
10491	NC_021902	GCG	2	6	541996	542001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817252
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10493	NC_021902	CCG	2	6	542140	542145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817252
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10498	NC_021902	CG	3	6	542241	542246	0 %	0 %	50 %	50 %	528817252
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