MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 2468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021845	TTAA	2	8	664	671	50 %	50 %	0 %	0 %	525937633
2	NC_021845	ATG	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937633
3	NC_021845	AT	3	6	873	878	50 %	50 %	0 %	0 %	525937633
4	NC_021845	GCC	2	6	948	953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937633
5	NC_021845	TGC	2	6	1032	1037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937633
6	NC_021845	TTA	2	6	1083	1088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937633
7	NC_021845	CTC	2	6	1106	1111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937633
8	NC_021845	TTA	2	6	1144	1149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937633
9	NC_021845	TCC	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937633
10	NC_021845	AAAGT	2	10	1203	1212	60 %	20 %	20 %	0 %	525937633
11	NC_021845	TTC	2	6	1292	1297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937633
12	NC_021845	GTT	2	6	1450	1455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937633
13	NC_021845	GAT	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937633
14	NC_021845	CAAT	2	8	1618	1625	50 %	25 %	0 %	25 %	525937634
15	NC_021845	GTC	2	6	1673	1678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937634
16	NC_021845	TCA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937634
17	NC_021845	TA	3	6	1769	1774	50 %	50 %	0 %	0 %	525937634
18	NC_021845	TGCT	2	8	1835	1842	0 %	50 %	25 %	25 %	525937634
19	NC_021845	CAC	2	6	1864	1869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937634
20	NC_021845	AT	3	6	1889	1894	50 %	50 %	0 %	0 %	525937634
21	NC_021845	ATA	2	6	1925	1930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937634
22	NC_021845	CAA	2	6	1958	1963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937634
23	NC_021845	ACA	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937634
24	NC_021845	TATC	2	8	2038	2045	25 %	50 %	0 %	25 %	525937634
25	NC_021845	GCA	2	6	2056	2061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937634
26	NC_021845	CAG	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937634
27	NC_021845	TTA	2	6	2115	2120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937634
28	NC_021845	GTT	2	6	2411	2416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937635
29	NC_021845	ATCC	2	8	2456	2463	25 %	25 %	0 %	50 %	525937635
30	NC_021845	AGC	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937635
31	NC_021845	CGG	2	6	2694	2699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937635
32	NC_021845	A	6	6	2707	2712	100 %	0 %	0 %	0 %	525937635
33	NC_021845	GCTG	2	8	2748	2755	0 %	25 %	50 %	25 %	525937635
34	NC_021845	ACA	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937635
35	NC_021845	AAC	2	6	2860	2865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937635
36	NC_021845	AGG	2	6	2892	2897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937635
37	NC_021845	TCA	3	9	2900	2908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937635
38	NC_021845	GATA	2	8	3014	3021	50 %	25 %	25 %	0 %	525937635
39	NC_021845	TAG	2	6	3049	3054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937635
40	NC_021845	TTA	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937635
41	NC_021845	ACATC	2	10	3170	3179	40 %	20 %	0 %	40 %	525937635
42	NC_021845	CTG	2	6	3236	3241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937635
43	NC_021845	CGT	2	6	3250	3255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937635
44	NC_021845	ATCC	2	8	3294	3301	25 %	25 %	0 %	50 %	525937635
45	NC_021845	A	6	6	3304	3309	100 %	0 %	0 %	0 %	525937635
46	NC_021845	GA	3	6	3313	3318	50 %	0 %	50 %	0 %	525937635
47	NC_021845	ATA	2	6	3351	3356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937635
48	NC_021845	GAAAC	2	10	3444	3453	60 %	0 %	20 %	20 %	525937635
49	NC_021845	AT	3	6	3539	3544	50 %	50 %	0 %	0 %	525937635
50	NC_021845	CCAG	2	8	3549	3556	25 %	0 %	25 %	50 %	525937635
51	NC_021845	TAA	2	6	3587	3592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937635
52	NC_021845	ACG	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937635
53	NC_021845	ATG	2	6	3646	3651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937635
54	NC_021845	ATT	2	6	3782	3787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937636
55	NC_021845	TGTA	2	8	3798	3805	25 %	50 %	25 %	0 %	525937636
56	NC_021845	CTG	2	6	3827	3832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937636
57	NC_021845	GGA	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937636
58	NC_021845	TTA	2	6	4052	4057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937637
59	NC_021845	TGA	2	6	4068	4073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937637
60	NC_021845	ATC	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
61	NC_021845	ATT	2	6	4146	4151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937637
62	NC_021845	TCA	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
63	NC_021845	ACCAAC	2	12	4166	4177	50 %	0 %	0 %	50 %	525937637
64	NC_021845	ATT	2	6	4266	4271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937637
65	NC_021845	TAA	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937637
66	NC_021845	AT	3	6	4512	4517	50 %	50 %	0 %	0 %	525937637
67	NC_021845	CTG	2	6	4700	4705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937637
68	NC_021845	ATC	3	9	4889	4897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
69	NC_021845	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937637
70	NC_021845	AAT	2	6	5036	5041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937637
71	NC_021845	ATT	2	6	5075	5080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937637
72	NC_021845	ATC	2	6	5183	5188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
73	NC_021845	TCT	2	6	5220	5225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937637
74	NC_021845	TCA	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
75	NC_021845	CCT	2	6	5257	5262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937637
76	NC_021845	CTC	2	6	5264	5269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937637
77	NC_021845	CTG	3	9	5279	5287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937637
78	NC_021845	TC	3	6	5312	5317	0 %	50 %	0 %	50 %	525937637
79	NC_021845	CAT	2	6	5380	5385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
80	NC_021845	A	6	6	5441	5446	100 %	0 %	0 %	0 %	525937637
81	NC_021845	CCTG	2	8	5469	5476	0 %	25 %	25 %	50 %	525937637
82	NC_021845	AATA	2	8	5519	5526	75 %	25 %	0 %	0 %	525937637
83	NC_021845	AT	3	6	5551	5556	50 %	50 %	0 %	0 %	525937637
84	NC_021845	GCC	2	6	5605	5610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937637
85	NC_021845	CAT	2	6	5656	5661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
86	NC_021845	CATT	2	8	5740	5747	25 %	50 %	0 %	25 %	525937637
87	NC_021845	TCA	2	6	5880	5885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
88	NC_021845	TTTA	2	8	5918	5925	25 %	75 %	0 %	0 %	525937637
89	NC_021845	GTC	2	6	5954	5959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937637
90	NC_021845	TGA	2	6	6032	6037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937637
91	NC_021845	TTAT	2	8	6239	6246	25 %	75 %	0 %	0 %	525937638
92	NC_021845	TTG	2	6	6282	6287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937638
93	NC_021845	CAGT	2	8	6377	6384	25 %	25 %	25 %	25 %	525937638
94	NC_021845	ATA	2	6	6404	6409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937638
95	NC_021845	CTG	2	6	6448	6453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937638
96	NC_021845	ATT	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937638
97	NC_021845	GCC	2	6	6536	6541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937638
98	NC_021845	T	6	6	6633	6638	0 %	100 %	0 %	0 %	525937638
99	NC_021845	CTT	2	6	6654	6659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937638
100	NC_021845	TAG	2	6	6689	6694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937638
101	NC_021845	TCA	2	6	6704	6709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937638
102	NC_021845	ATC	2	6	6775	6780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937638
103	NC_021845	ATCA	2	8	6799	6806	50 %	25 %	0 %	25 %	525937638
104	NC_021845	AAG	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937638
105	NC_021845	T	7	7	6830	6836	0 %	100 %	0 %	0 %	525937638
106	NC_021845	CCTG	2	8	6881	6888	0 %	25 %	25 %	50 %	525937638
107	NC_021845	CTG	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937638
108	NC_021845	T	6	6	7071	7076	0 %	100 %	0 %	0 %	525937638
109	NC_021845	ATC	2	6	7087	7092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937638
110	NC_021845	CAT	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937638
111	NC_021845	CAT	3	9	7374	7382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937639
112	NC_021845	ATTT	2	8	7444	7451	25 %	75 %	0 %	0 %	525937639
113	NC_021845	CAT	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937639
114	NC_021845	T	6	6	7639	7644	0 %	100 %	0 %	0 %	525937640
115	NC_021845	GAA	2	6	7703	7708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937640
116	NC_021845	GTAAAG	2	12	7724	7735	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525937640
117	NC_021845	AAG	2	6	7764	7769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937640
118	NC_021845	CTA	2	6	7808	7813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937640
119	NC_021845	TCT	2	6	7837	7842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937640
120	NC_021845	GAA	2	6	8008	8013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937640
121	NC_021845	TGTTTG	2	12	8039	8050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937640
122	NC_021845	CAC	2	6	8093	8098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937640
123	NC_021845	TGC	2	6	8148	8153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937640
124	NC_021845	AGA	2	6	8185	8190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937640
125	NC_021845	ACC	2	6	8247	8252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937640
126	NC_021845	TCA	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937640
127	NC_021845	TCA	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937640
128	NC_021845	AC	4	8	8388	8395	50 %	0 %	0 %	50 %	525937640
129	NC_021845	AGA	2	6	8620	8625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937640
130	NC_021845	AGA	2	6	8649	8654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937640
131	NC_021845	GAT	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937641
132	NC_021845	ATTT	2	8	8874	8881	25 %	75 %	0 %	0 %	525937641
133	NC_021845	CGTTT	2	10	8897	8906	0 %	60 %	20 %	20 %	525937641
134	NC_021845	AAC	2	6	8938	8943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937641
135	NC_021845	T	8	8	9012	9019	0 %	100 %	0 %	0 %	525937641
136	NC_021845	AAT	2	6	9029	9034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937641
137	NC_021845	AGA	2	6	9044	9049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937641
138	NC_021845	TCCCA	2	10	9052	9061	20 %	20 %	0 %	60 %	525937641
139	NC_021845	TCA	3	9	9091	9099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937641
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144	NC_021845	ACC	2	6	9405	9410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937641
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147	NC_021845	CTG	2	6	9455	9460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937641
148	NC_021845	AATT	2	8	9464	9471	50 %	50 %	0 %	0 %	525937641
149	NC_021845	GGT	2	6	9515	9520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937641
150	NC_021845	ATT	2	6	9600	9605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937641
151	NC_021845	T	7	7	9638	9644	0 %	100 %	0 %	0 %	525937641
152	NC_021845	A	8	8	9668	9675	100 %	0 %	0 %	0 %	525937641
153	NC_021845	TAC	2	6	9686	9691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937641
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155	NC_021845	TC	3	6	9883	9888	0 %	50 %	0 %	50 %	525937642
156	NC_021845	ATA	2	6	9898	9903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937642
157	NC_021845	ACA	2	6	9910	9915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937642
158	NC_021845	TCA	2	6	9937	9942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937642
159	NC_021845	TC	4	8	10009	10016	0 %	50 %	0 %	50 %	525937642
160	NC_021845	TTA	2	6	10061	10066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937642
161	NC_021845	GTCA	2	8	10083	10090	25 %	25 %	25 %	25 %	525937642
162	NC_021845	T	7	7	10091	10097	0 %	100 %	0 %	0 %	525937642
163	NC_021845	AT	3	6	10141	10146	50 %	50 %	0 %	0 %	525937642
164	NC_021845	TAAA	2	8	10219	10226	75 %	25 %	0 %	0 %	525937643
165	NC_021845	TACA	2	8	10236	10243	50 %	25 %	0 %	25 %	525937643
166	NC_021845	TTG	2	6	10295	10300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937643
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170	NC_021845	T	6	6	10538	10543	0 %	100 %	0 %	0 %	525937643
171	NC_021845	ATG	2	6	10615	10620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937643
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173	NC_021845	CTC	2	6	10728	10733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937643
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175	NC_021845	AAG	2	6	10794	10799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937643
176	NC_021845	ATA	2	6	10857	10862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937643
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186	NC_021845	TCTT	2	8	11632	11639	0 %	75 %	0 %	25 %	525937644
187	NC_021845	CCT	2	6	11649	11654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937644
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232	NC_021845	CTGATG	2	12	14016	14027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525937645
233	NC_021845	GAAAC	2	10	14154	14163	60 %	0 %	20 %	20 %	525937645
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247	NC_021845	CTC	2	6	15026	15031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937646
248	NC_021845	GTA	2	6	15034	15039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937646
249	NC_021845	TTC	2	6	15094	15099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937646
250	NC_021845	CCT	2	6	15166	15171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937646
251	NC_021845	GTT	2	6	15258	15263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937646
252	NC_021845	ACCG	2	8	15306	15313	25 %	0 %	25 %	50 %	525937646
253	NC_021845	CCG	2	6	15346	15351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937646
254	NC_021845	TTA	2	6	15359	15364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937646
255	NC_021845	GCA	2	6	15459	15464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937646
256	NC_021845	GTT	2	6	15627	15632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937646
257	NC_021845	TCC	2	6	15660	15665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937646
258	NC_021845	AGA	2	6	15699	15704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937646
259	NC_021845	AGC	2	6	15764	15769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937646
260	NC_021845	AACC	2	8	15787	15794	50 %	0 %	0 %	50 %	525937646
261	NC_021845	TGTT	2	8	15804	15811	0 %	75 %	25 %	0 %	525937646
262	NC_021845	TGC	2	6	15825	15830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937646
263	NC_021845	TAC	2	6	15845	15850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937646
264	NC_021845	TTC	2	6	15873	15878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937646
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268	NC_021845	AGT	2	6	16529	16534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937646
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385	NC_021845	ATA	2	6	22731	22736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937651
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387	NC_021845	ACCA	2	8	22850	22857	50 %	0 %	0 %	50 %	525937651
388	NC_021845	CAT	2	6	22915	22920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937651
389	NC_021845	TCAG	2	8	22935	22942	25 %	25 %	25 %	25 %	525937651
390	NC_021845	T	6	6	23002	23007	0 %	100 %	0 %	0 %	525937651
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392	NC_021845	TA	3	6	23176	23181	50 %	50 %	0 %	0 %	525937651
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